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猪Mighty基因的克隆与组织表达分析 被引量:6
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作者 张志强 李宏基 +6 位作者 王伟杰 韩立强 王静 武宇晓 臧猛 台玉磊 杨国宇 《江西农业学报》 CAS 2009年第2期1-4,共4页
Mighty基因是在骨骼肌中发现的一个新颖的肌形成前期因子。基于电子延伸序列,本试验成功克隆出了Mighty基因,其全长874 bp,开放阅读框为579 bp,编码有193个氨基酸,提交GenBank(EU559709)。同时,试验采取半定量RT-PCR法,以18S rRNA为内标... Mighty基因是在骨骼肌中发现的一个新颖的肌形成前期因子。基于电子延伸序列,本试验成功克隆出了Mighty基因,其全长874 bp,开放阅读框为579 bp,编码有193个氨基酸,提交GenBank(EU559709)。同时,试验采取半定量RT-PCR法,以18S rRNA为内标,研究了Mighty基因在仔猪18个组织中的分布和mRNA的表达水平。 展开更多
关键词 MIGHTY RT—PCR 基因克隆 组织表达 分布
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COL1A1和COL1A2基因生信分析及其在梅花鹿不同组织中的表达谱
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作者 杨远青 廖朝美 +5 位作者 杨红 王正刚 袁超 杨洋 周明帅 赵佳福 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第3期656-663,共8页
【目的】探明COL1A1(Collagen type I alpha 1 chain,I型胶原蛋白α1链)和COL1A2(Collagen type I alpha 2 chain,I型胶原蛋白α2链)基因在梅花鹿不同组织中的表达谱,解析其对梅花鹿组织发育的影响,为影响梅花鹿重要经济性状的候选基因... 【目的】探明COL1A1(Collagen type I alpha 1 chain,I型胶原蛋白α1链)和COL1A2(Collagen type I alpha 2 chain,I型胶原蛋白α2链)基因在梅花鹿不同组织中的表达谱,解析其对梅花鹿组织发育的影响,为影响梅花鹿重要经济性状的候选基因筛选提供依据。【方法】采用RT-qPCR方法检测COL1A1和COL1A2基因在雄性梅花鹿心脏、肝脏和脾脏等16个组织器官中的表达水平;结合NetPhos 3.1、Motif Search和ProtParam等系列软件预测分析COL1A1和COL1A2基因的生物信息及其在梅花鹿不同组织中的表达谱,并在此基础上构建COL1A1和COL1A2氨基酸序列的系统发育进化树。【结果】COL1A1和COL1A2基因CDS区分别编码1463和1364个氨基酸,理论PI分别为5.60和9.19,COL1A1和COL1A2均是一种具有信号肽和磷酸化位点的亲水性稳定蛋白质;二者蛋白二级及三级结构均以无规则卷曲构成;与其他动物相比,鹿COL1A1和COL1A2基因均与反刍动物山羊、绵羊和牛的同源性最高,其中,鹿COL1A1基因与山羊、牛、绵羊的同源性分别为99.5%、99.5%和99.2%,鹿COL1A2基因与牛、绵羊、山羊的同源性分别为99.1%、99.0%和98.9%,亲缘关系最近。RT-qPCR结果显示,COL1A1和COL1A2基因在梅花鹿不同组织中均有表达,其中COL1A1基因在心脏、背最长肌和腿肌中的表达较高,显著高于其他组织,COL1A2基因在心脏、肝脏、肾脏和瓣胃中的表达较高,均显著高于其他组织;此外,COL1A1在肌肉组织中的表达较高,COL1A2较低;二者在其余组织中的表达具有一高一低,相互协同的作用趋势。【结论】COL1A1和COL1A2可能通过相互协同共同维持组织结构及组织发育,相关结果为后续深入研究COL1A1和COL1A2影响梅花鹿生长发育奠定基础。 展开更多
关键词 COL1A1 COL1A2 梅花鹿 组织表达 生物信息学分析
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microRNA的生物学功能及其在动物肌肉和脂肪组织中表达的研究进展 被引量:6
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作者 李志娟 高士争 赵素梅 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2012年第7期102-107,共6页
microRNA是一类长18~24核苷酸的短序列非编码RNA,通过抑制目的mRNA的翻译或降解,负性调控转录后基因表达。microRNA参与调控细胞增殖、死亡、神经分化、免疫调控和疾病发生等生物学过程,影响着动物的生长、发育及抗病能力。针对microRN... microRNA是一类长18~24核苷酸的短序列非编码RNA,通过抑制目的mRNA的翻译或降解,负性调控转录后基因表达。microRNA参与调控细胞增殖、死亡、神经分化、免疫调控和疾病发生等生物学过程,影响着动物的生长、发育及抗病能力。针对microRNA的特点、调控机制、分析方法及在动物肌肉和脂肪组织中的最新研究进行了综述,为利用microRNA技术对动物肌肉与脂肪相关疾病的诊断、治疗提供新的思路。 展开更多
关键词 MICRORNA 作用机制 组织表达
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家蚕细胞周期素家族基因的克隆及结构特征与表达分析 被引量:4
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作者 刘丽华 李兵 沈卫德 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期754-758,共5页
细胞周期素(cyclin)是推进细胞周期进程最主要的调控因子之一,并与个体发育及肿瘤形成等有关。为研究细胞周期素家族基因在家蚕组织中的表达情况,利用家蚕基因组数据库信息设计引物克隆了家蚕细胞周期素家族的5个基因,对基因序列结构的... 细胞周期素(cyclin)是推进细胞周期进程最主要的调控因子之一,并与个体发育及肿瘤形成等有关。为研究细胞周期素家族基因在家蚕组织中的表达情况,利用家蚕基因组数据库信息设计引物克隆了家蚕细胞周期素家族的5个基因,对基因序列结构的分析结果表明,cyclinA、cyclinB、cyclinB3基因分别有7个外显子,cyclinE基因有8个外显子,cyclinL1基因只有1个外显子;cyclinA及cyclinE基因存在较多的剪切方式,cyclinA主要包含大小为2 141和2 173 bp的2种转录本,其变化在第7外显子,cyclinE则含有1 422、1 290及1 194 bp等大小不同的序列,变化集中于第5~7外显子,而cyclinB、cyclinB3及cyclinL1基因则相对稳定。克隆的家蚕细胞周期素家族基因的组织表达存在差异:cyclinA基因只在精巢中表达,cyclinB3基因只在精巢和卵巢中有明显的表达,cyclinE基因在丝腺、脑、脂肪体、中肠、马氏管、精巢、卵巢及血液8种组织都有表达,cyclinB和cy-clinL1基因在除丝腺或血液外的其他7种组织检测到表达。研究结果为进一步探究不同细胞周期素在昆虫蜕皮、变态等生理过程中的功能提供了参考。 展开更多
关键词 家蚕 细胞周期素 基因克隆 基因结构 组织表达
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绵羊生殖道中ghrelin基因的克隆及其表达 被引量:4
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作者 吕东媛 曹贵方 +1 位作者 李淑凤 赵鹏伟 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期244-248,共5页
从雌性绵羊输卵管、子宫体、子宫颈、阴道组织中提取总RNA,根据已获得的绵羊ghrelin基因cDNA序列设计特异性引物,采用RT-PCR方法扩增出了绵羊ghrelin基因;将扩增产物克隆于pMD19-T载体后进行测序。以β-肌动蛋白(β-actin)基因作为内参... 从雌性绵羊输卵管、子宫体、子宫颈、阴道组织中提取总RNA,根据已获得的绵羊ghrelin基因cDNA序列设计特异性引物,采用RT-PCR方法扩增出了绵羊ghrelin基因;将扩增产物克隆于pMD19-T载体后进行测序。以β-肌动蛋白(β-actin)基因作为内参,采用半定量RT-PCR法扩增ghrelin基因,经琼脂糖凝胶电泳后,应用凝胶成像分析系统计算雌性绵羊不同生殖道组织中ghrelin基因的表达量。结果显示,从雌性绵羊生殖道各组织均扩增出了233 bp的ghrelin基因片段;ghrelin基因在子宫体的表达量最高,输卵管内次之,子宫颈和阴道内最低。表明,ghrelin对雌性绵羊生殖系统的调节及生殖激素的分泌等具有重要作用。 展开更多
关键词 GHRELIN 绵羊 Β-肌动蛋白 组织表达
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ALDH1、SOX2表达与卵巢浆液性肿瘤预后相关性 被引量:2
6
作者 崔艳超 李勤 +2 位作者 崔艳平 王夏 姜虹 《中国计划生育学杂志》 2022年第6期1294-1299,共6页
目的:探讨乙醛脱氢酶1(ALDH1)、性别决定区Y框蛋白2(SOX2)在卵巢浆液性肿瘤组织中的表达及与患者预后关系。方法:选取2017年6月--2018年6月在本院手术治疗的卵巢浆液性肿瘤患者79例,收集患者一般资料及临床病理参数,术中收集患者病理组... 目的:探讨乙醛脱氢酶1(ALDH1)、性别决定区Y框蛋白2(SOX2)在卵巢浆液性肿瘤组织中的表达及与患者预后关系。方法:选取2017年6月--2018年6月在本院手术治疗的卵巢浆液性肿瘤患者79例,收集患者一般资料及临床病理参数,术中收集患者病理组织标本,根据病理结果分为卵巢浆液性癌组(恶性组,54例),卵巢交界性浆液性肿瘤组(交界性组,15例),卵巢浆液性囊腺瘤组(良性组,10例),免疫组织化学染色法检测组织中ALDH1、SOX2蛋白表达情况,随访患者3年,分析ALDH1、SOX2表达水平与患者临床病理参数关系及影响患者预后的因素;Pearson法分析组织中ALDH1与SOX2表达相关性;Kaplan-Meier法分析不同ALDH1、SOX2表达水平与患者生存时间关系。结果:ALDH1、SOX2蛋白在卵巢浆液性癌组织中均呈高表达,ALDH1蛋白在恶性组、交界性组、良性组病理组织中高表达率(66.7%、46.8%、20.0%),SOX2蛋白高表达率(83.3%、26.7%、20.0%)均逐渐降低(P<0.05);病理组织中ALDH1与SOX2表达呈正相关(P<0.05)。经单因素分析显示,FIGO分期、淋巴结有无转移、盆腔侵犯、大网膜转移、Ki-67、ALDH1、SOX2蛋白表达均与患者预后有关(P<0.05);Kaplan-Meier分析显示,ALDH1蛋白、SOX2蛋白高表达组患者3年累积生存率均低于低表达组(P=0.000)。结论:ALDH1、SOX2在卵巢浆液性癌组织中均呈高表达且表达正相关,表达水平与患者病情发展密切相关,对预测患者预后有一定参考价值。 展开更多
关键词 卵巢浆液性肿瘤 乙醛脱氢酶 性别决定区Y框蛋白2 组织中表达 生存预后
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牦牛PLIN2基因的克隆及其在卵巢不同发情阶段的表达 被引量:3
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作者 蔡雯祎 陈通 +5 位作者 石仙 陈伟明 胡嘉嘉 熊显荣 兰道亮 李键 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第3期782-789,共8页
试验旨在研究牦牛PLIN2基因的序列特征和表达特性,并分析其表达与不同发情时期的卵巢的相关性。根据GenBank中已知的普通牛序列,设计克隆引物,经RT-PCR扩增得到牦牛PLIN2基因序列。RT-PCR检测PLIN2基因在各个组织中的表达量,实时荧光定... 试验旨在研究牦牛PLIN2基因的序列特征和表达特性,并分析其表达与不同发情时期的卵巢的相关性。根据GenBank中已知的普通牛序列,设计克隆引物,经RT-PCR扩增得到牦牛PLIN2基因序列。RT-PCR检测PLIN2基因在各个组织中的表达量,实时荧光定量PCR分析卵巢不同发情时期的表达量。结果表明,牦牛PLIN2基因的编码区长为1 353bp,共编码450个氨基酸,为无跨膜结构的非分泌蛋白。与GenBank中已知的普通牛序列同源性达到99.4%,表明PLIN2基因在进化过程中相当保守。在牦牛的各个组织中PLIN2分布广泛,但不同组织中的表达有差异,卵巢、乳腺、胃和肾脏中相对较多,而肺脏中几乎没有表达。实时荧光定量PCR结果显示,在卵巢的不同发情时期PLIN2都有表达,且在黄体期的表达量最高,表明PLIN2基因在牦牛发情周期中起着不可忽视的作用。 展开更多
关键词 牦牛 PLIN2基因 克隆 组织表达 实时荧光定量PCR
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雌性骆驼生殖组织β-防御素-1基因的克隆及其组织表达量的检测 被引量:2
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作者 唐博 曹贵方 +1 位作者 锡林高娃 任秀娟 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期515-518,共4页
从雌性骆驼输卵管、子宫、子宫颈、阴道组织中提取总RNA,根据已发表的骆驼β-防御素-1基因的cDNA序列设计合成引物,采用RT-PCR扩增出了骆驼β-防御素-1基因;将扩增产物克隆于pBlueselectT载体后进行了序列分析。以β-肌动蛋白(β-actin... 从雌性骆驼输卵管、子宫、子宫颈、阴道组织中提取总RNA,根据已发表的骆驼β-防御素-1基因的cDNA序列设计合成引物,采用RT-PCR扩增出了骆驼β-防御素-1基因;将扩增产物克隆于pBlueselectT载体后进行了序列分析。以β-肌动蛋白(β-actin)基因作为内参,对扩增的β-防御素-1基因进行琼脂糖凝胶电泳后,应用凝胶成像分析系统,推断出了不同组织中β-防御素-1基因的表达量。结果,从雌性骆驼生殖各组织上皮均获得了203 bp的β-防御素-1基因的扩增片段,且β-防御素-1基因在雌性骆驼生殖道各组织内的表达量不同。结果表明,β-防御素-1在雌性骆驼生殖组织的先天免疫中起重要作用。 展开更多
关键词 β-防御素-1基因 骆驼 β-肌动蛋白基因基因 组织表达
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从江香猪和大白猪不同组织中GYS1、GYS2基因表达水平的研究 被引量:1
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作者 龙清孟 周迪 +6 位作者 毛世明 李平 李俊 谭晓山 陈大芳 龚菲 熊胜利 《畜牧与兽医》 北大核心 2019年第9期6-10,共5页
旨在研究糖原合成酶(GS)基因mRNA在从江香猪和大白猪表达情况,探究肌肉类型糖原合成酶(GYS1)和肝脏类型糖原合成酶(GYS2)基因表达规律。以大白猪和从江香猪为试验动物,分别提取心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胃、大肠、小肠、背最长肌... 旨在研究糖原合成酶(GS)基因mRNA在从江香猪和大白猪表达情况,探究肌肉类型糖原合成酶(GYS1)和肝脏类型糖原合成酶(GYS2)基因表达规律。以大白猪和从江香猪为试验动物,分别提取心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胃、大肠、小肠、背最长肌、脂肪10个组织的总RNA,设计各自实时荧光定量引物,以猪GAPDH基因作为内参基因,应用实时定量PCR技术检测GYS1和GYS2基因不同组织中mRNA的相对表达量。结果发现:GYS1基因在大白猪和从江香猪所检测的组织中均有表达,在背最长肌中的表达量最高,且在大白猪背最长肌中表达量显著高于从江香猪(P<0.05);GYS2基因在肝脏中表达量最高,其他组织中几乎不表达,具有肝脏组织特异性,且发现在从江香猪肝脏中表达量显著低于大白猪(P<0.05)。本研究为GYS1和GYS2基因后续真核表达的研究提供了理论依据。 展开更多
关键词 从江香猪 GYS1 GYS2 组织表达
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鸡CPT1A基因的生物信息学分析和组织表达谱构建 被引量:1
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作者 田慧慧 孙君卫 +5 位作者 马向飞 郭玉洁 李东华 孙桂荣 康相涛 闫峰宾 《畜牧与兽医》 北大核心 2020年第12期110-115,共6页
旨在探索鸡肉碱棕榈酰转移酶1A(CPT1A)基因的生物学特征,研究其表达的组织和时空差异。通过生物信息学软件对CPT1A序列进行分析和功能预测,利用荧光定量PCR技术检测该基因在12周固始鸡腹脂、皮脂、胸肌、腿肌和肝中的表达量,以及在不同... 旨在探索鸡肉碱棕榈酰转移酶1A(CPT1A)基因的生物学特征,研究其表达的组织和时空差异。通过生物信息学软件对CPT1A序列进行分析和功能预测,利用荧光定量PCR技术检测该基因在12周固始鸡腹脂、皮脂、胸肌、腿肌和肝中的表达量,以及在不同时期(6周,12周,22周和30周)固始鸡胸肌中的表达量。结果显示,鸡CPT1A蛋白无信号肽,有两个跨膜结构域。鸡与斑马鱼CPT1A基因的亲缘关系最远,与小鼠、人、猪、山羊、奶牛的亲缘关系较近。CPT1A基因在12周固始鸡肝脏组织中表达量最高,胸肌和腿肌次之,腹脂和皮脂中表达量较低,在不同发育阶段中固始鸡胸肌中表达量相对较高的为12周和6周,22周次之,30周则表达量最低。试验结果为进一步研究鸡CPT1A基因调控鸡脂质代谢的分子机制提供理论基础。 展开更多
关键词 固始鸡 生物信息学分析 CPT1A基因 脂代谢 组织表达
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SPLUNC1基因在2种绵羊不同组织器官中差异表达分析
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作者 李珂儿 李劼 +2 位作者 李增强 魏立翔 孙延鸣 《畜牧与兽医》 北大核心 2021年第7期89-94,共6页
SPLUNC1是抗病原微生物感染的关键蛋白。为研究SPLUNC1基因在2种绵羊不同组织器官中的差异表达情况,试验选取健康新疆阿勒泰羊5只,多胎萨福克羊5只,放血处死后分别采集气管、支气管、肺脏、胃、食管、结肠、心脏、脾脏、皮肤,提取RNA,... SPLUNC1是抗病原微生物感染的关键蛋白。为研究SPLUNC1基因在2种绵羊不同组织器官中的差异表达情况,试验选取健康新疆阿勒泰羊5只,多胎萨福克羊5只,放血处死后分别采集气管、支气管、肺脏、胃、食管、结肠、心脏、脾脏、皮肤,提取RNA,反转录合成cDNA。以cDNA为模板,扩增SPLUNC1基因748 bp特征片段,克隆至pMD19-T载体中,提取质粒。以梯度稀释的质粒为模板,建立SPLUNC1基因转录本拷贝数的绝对定量标准曲线,对2种绵羊各组织器官中SPLUNC1的mRNA初始拷贝数进行定量分析。结果表明:阿勒泰羊标准曲线扩增效率(E)为97%,回归系数(R^(2))为0.9990,SPLUNC1 mRNA初始拷贝数从高至低依次为气管、支气管、肺脏、脾脏、食管、心脏、胃、结肠、皮肤。萨福克羊标准曲线扩增效率(E)为99%,回归系数(R^(2))为0.9989,SPLUNC1 mRNA初始拷贝数从高至低依次为气管、支气管、肺脏、脾脏、心脏、食管、胃、结肠、皮肤。2种绵羊的气管SPLUNC1 mRNA表达量均显著高于其他各组织(P<0.05),皮肤表达量最低。新疆阿勒泰羊的9种组织器官该基因表达量均显著高于多胎萨福克羊(P<0.05)。上述结果说明绵羊的SPLUNC1基因的分布具有组织器官特异性,为揭示绵羊抗感染的分子调控机制提供一定参考。 展开更多
关键词 多胎萨福克羊 阿勒泰羊 SPLUNC1基因 实时定量PCR 组织表达
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贵州黑山羊LYRM1基因生物信息学及组织表达分析
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作者 杨洋 陈浩林 徐敏 《畜牧与兽医》 北大核心 2020年第9期1-6,共6页
采用RT-PCR的方法对贵州黑山羊LYRM1基因进行了克隆,并对该基因的编码区序列进行生物信息学分析,利用qRT-PCR的方法检测LYRM1基因在贵州黑山羊不同组织中mRNA的相对表达量以及在不同月龄的时序表达。结果:黑山羊LYRM1基因的编码区全长36... 采用RT-PCR的方法对贵州黑山羊LYRM1基因进行了克隆,并对该基因的编码区序列进行生物信息学分析,利用qRT-PCR的方法检测LYRM1基因在贵州黑山羊不同组织中mRNA的相对表达量以及在不同月龄的时序表达。结果:黑山羊LYRM1基因的编码区全长369 bp,编码122个氨基酸,编码蛋白分子质量为14.4 kDa,理论等电点为9.73,不稳定系数为49.48,为不稳定蛋白;与GenBank数据库中提供的山羊LYRM1基因的编码区序列匹配度为99%,存在2个碱基的突变,分别为第177位和242位;通过LYRM1基因系统进化树得知,黑山羊与牛的进化距离较近,与斑马鱼进化距离较远。qRT-PCR结果显示LYRM1基因在贵州黑山羊7个组织中均有表达,在脂肪组织的表达量最高,背最长肌中的表达量最低;时序表达结果表明,LYRM1基因在黑山羊脂肪组织的整体表达趋势为先增加再减少,6月龄的表达量最高,7日龄最低。本试验成功克隆了黑山羊LYRM1基因编码区并进行了生物信息学分析,且检测了其在黑山羊不同组织中的表达以及在脂肪组织中的时序表达,为深入研究LYRM1基因功能奠定基础。 展开更多
关键词 黑山羊 LYRM1基因 克隆 QRT-PCR 组织表达
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皮肤再生膜的生物相容性系列研究 被引量:45
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作者 宁丽 薛淼 +7 位作者 黄海宁 孙皎 李亦文 顾国珍 钱云芳 孟爱英 李昌本 赵寿元 《中国修复重建外科杂志》 CAS CSCD 2000年第1期44-48,共5页
目的 对医用丝素蛋白皮肤再生膜进行一系列生物学试验和生物相容性研究。方法 将医用丝素蛋白皮肤再生膜材料按国际标准化组织标准要求制备浸提液,进行急性全身毒性试验、皮肤原发刺激试验、细胞毒性试验,以及Ⅰ型胶原、纤维连接蛋白m... 目的 对医用丝素蛋白皮肤再生膜进行一系列生物学试验和生物相容性研究。方法 将医用丝素蛋白皮肤再生膜材料按国际标准化组织标准要求制备浸提液,进行急性全身毒性试验、皮肤原发刺激试验、细胞毒性试验,以及Ⅰ型胶原、纤维连接蛋白mRNA基因表达等试验。综合分析评价其生物相容性。结果 医用丝素蛋白皮肤再生膜的急性全身毒性试验、皮肤原发刺激试验、细胞毒性试验,以及Ⅰ型胶原、纤维连接蛋白mRNA基因表达等试验,都显示阴性结果。结论 从整体。 展开更多
关键词 皮肤再生膜 基因表达 生物相容性 组织工程
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胞吐作用调节蛋白SCRN1在结肠癌中的表达及意义 被引量:2
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作者 朱元庆 樊军卫 +1 位作者 任雷 滕木俭 《中国现代普通外科进展》 CAS 2013年第6期432-437,共6页
目的:探讨胞吐作用调节蛋白SCRN1在结肠癌发生发展中的意义。方法:应用激光捕获显微切割(LCM)-基因芯片技术及长标签基因表达系列(longSAGE)分析建立纯化的结肠癌实质细胞转录组数据库,筛选结肠癌肿瘤相关基因SCRN1,应用定量聚合酶链反... 目的:探讨胞吐作用调节蛋白SCRN1在结肠癌发生发展中的意义。方法:应用激光捕获显微切割(LCM)-基因芯片技术及长标签基因表达系列(longSAGE)分析建立纯化的结肠癌实质细胞转录组数据库,筛选结肠癌肿瘤相关基因SCRN1,应用定量聚合酶链反应(PCR)技术检测15例结肠癌中SCRNl mRNA表达,应用组织芯片和免疫组织化学技术检测173例正常结肠黏膜、结肠癌和54例转移淋巴结中SCRNl蛋白表达。结果:SCRNl mRNA在80%(12/15)的结肠癌组织中表达上调2倍以上。SCRN1在结肠癌及转移淋巴结中的表达高于正常黏膜,与AJCC分期(P<0.01)、淋巴转移(P<0.01)显著相关。SCRN1表达高低与患者术后5年无瘤生存率(P>0.05)和总体生存率(P>0.05)无明显相关性,SCRN1不是影响无瘤生存和总体生存的独立预后因素。结论:SCRN1表达增高可能是结肠癌发生发展过程中的重要分子事件。 展开更多
关键词 结肠肿瘤 SCRNl基因 基因表达 组织芯片
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超重人群皮下和网膜脂肪组织中脂联素基因表达的研究 被引量:1
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作者 班东杰 赵紫琴 +2 位作者 雒蓉 杜秉权 李钊 《天津医药》 CAS 北大核心 2008年第12期916-918,共3页
目的:探讨脂联素(APN)在皮下(SC)和网膜(OM)脂肪组织中的mRNA表达水平与肥胖的关系。方法:实时荧光定量PCR法检测48例超重[体质量指数(BMI)≥25kg/m2)]和40例正常体质量人群(BMI<25kg/m2)腹部SC和OM脂肪组织中APN mRNA的表达,并测定... 目的:探讨脂联素(APN)在皮下(SC)和网膜(OM)脂肪组织中的mRNA表达水平与肥胖的关系。方法:实时荧光定量PCR法检测48例超重[体质量指数(BMI)≥25kg/m2)]和40例正常体质量人群(BMI<25kg/m2)腹部SC和OM脂肪组织中APN mRNA的表达,并测定血糖、胆固醇和HOMA-IR等生化指标。结果:在整体人群中,OM脂肪组织APN mRNA表达量均明显高于SC脂肪组织(P<0.05);OM脂肪组织APN mRNA表达量与BMI、腰臀比(WHR)和胆固醇(TC)水平呈负相关(r分别为-0.249、-0.143、-0.148,P<0.05);SC脂肪组织APN mRNA表达量与BMI、WHR、TC和三酰甘油(TG)水平呈负相关(r分别为-0.281、-0.180、-0.247、-0.172,P<0.05),并与同一个体的OM脂肪组织APN mRNA表达量呈正相关(r=0.192,P<0.05)。结论:APN的基因表达量内脏高于外周,提示循环APN可能主要来源于内脏脂肪组织。 展开更多
关键词 脂联素 基因表达 皮下组织 网膜 脂肪组织 肥胖症
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黄颡鱼脑P-450芳香化酶基因的克隆和组织表达 被引量:9
16
作者 徐跑 俞菊华 +1 位作者 李建林 夏德全 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期591-598,共8页
P-450芳香化酶(P450arom)是催化雄激素生物合成雌激素的关键酶.本文采用RT-PCR和RACE法,首次分离和克隆了黄颡鱼脑P450 芳香化酶基因HP450aromB, 并使用荧光实时定量RT-PCR对其组织表达进行了研究.结果表明HP450aromB cDNA全长2080 bp(... P-450芳香化酶(P450arom)是催化雄激素生物合成雌激素的关键酶.本文采用RT-PCR和RACE法,首次分离和克隆了黄颡鱼脑P450 芳香化酶基因HP450aromB, 并使用荧光实时定量RT-PCR对其组织表达进行了研究.结果表明HP450aromB cDNA全长2080 bp(不包括poly(A)), 5′端非翻译区有25 bp,3′端555 bp(不包含poly(A)),阅读框(open reading frame, ORF)1500 bp,编码 500个氨基酸,推测的蛋白质分子量为56 kDa.同源性分析显示,HP450aromB的氨基酸序列与其它鱼脑P450arom具有70%以上的同源性,与其它鱼卵巢P450arom为60%左右同源,与人胚盘和鸡卵巢P450arom 则为50%左右同源;但芳香化酶高保守区包括I-螺旋区,芳香化酶特异保守区II及血红素结合区III和其它鱼芳香化酶相比同源性分别为83%~96%,78%~86%和85%~100%.系统发育分析表明HP450aromB与鱼类脑P450arom属于同一分支的,并且也显示了黄颡鱼和鲶鱼分类地位最近,这和传统的分类一致.实时定量RT-PCR研究显示,HP450arom B在前脑,下丘脑,垂体、卵巢、精巢均有表达,在肝脏没表达,表达量脑部高于性腺,但雌雄鱼脑部HP450arom B的表达总量没显著差异. 展开更多
关键词 黄颡鱼 P450芳香化酶 cDNA末端快速扩增法 系统发育 组织表达
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Rice Expression Database(RED):An integrated RNA-Seq-derived gene expression database for rice 被引量:16
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作者 Lin Xia Dong Zou +7 位作者 Jian Sang Xingjian Xu Hongyan Yin Mengwei Li Shuangyang Wu Songnian Hu Lili Hao Zhang Zhang 《Journal of Genetics and Genomics》 SCIE CAS CSCD 2017年第5期235-241,共7页
Rice is one of the most important stable food as well as a monocotyledonous model organism for the plant research community.Here,we present RED(Rice Expression Database;http://expression.ic4r.org),an integrated dat... Rice is one of the most important stable food as well as a monocotyledonous model organism for the plant research community.Here,we present RED(Rice Expression Database;http://expression.ic4r.org),an integrated database of rice gene expression profiles derived entirely from RNA-Seq data.RED features a comprehensive collection of 284 high-quality RNA-Seq experiments,integrates a large number of gene expression profiles and covers a wide range of rice growth stages as well as various treatments.Based on massive expression profiles,RED provides a list of housekeeping and tissue-specific genes and dynamically constructs co-expression networks for gene(s) of interest.Besides,it provides user-friendly web interfaces for querying,browsing and visualizing expression profiles of concerned genes.Together,as a core resource in BIG Data Center,RED bears great utility for characterizing the function of rice genes and better understanding important biological processes and mechanisms underlying complex agronomic traits in rice. 展开更多
关键词 Rice expression database expression profiles Housekeeping gene tissue-specific gene Co-expression network
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MXR7基因的克隆及其在人正常和肿瘤组织中的表达 被引量:11
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作者 周学平 王红阳 +3 位作者 杨广顺 陈正军 李宝安 吴孟超 《中华实验外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 1999年第2期144-146,F004,共4页
进行MXR7基因cDNA的克隆鉴定并检测其在人正常组织和肿瘤组织中的表达。方法以人肝癌组织的cDNA为模板,应用PCR方法合成MXR7基因cDNA,连接于融合蛋白表达载体pGEX-5X-1,构建成符合读框的融合基因;... 进行MXR7基因cDNA的克隆鉴定并检测其在人正常组织和肿瘤组织中的表达。方法以人肝癌组织的cDNA为模板,应用PCR方法合成MXR7基因cDNA,连接于融合蛋白表达载体pGEX-5X-1,构建成符合读框的融合基因;应用Northernblot对正常人12种不同组织和术前做治疗的7例非肝脏肿瘤组织及30例肝癌和癌旁肝组织、12例正常肝组织中MXR7基因的表达进行检测。结果MXR7mRNA在人肝脏等12种正常组织及7例其它部位肿瘤组织中均不表达;在人肝癌中呈高表达,而癌旁肝组织中呈低表达,其阳性表达率分别为76.7%和13.3%。结论MXR7.基因在人肝癌组织中的高水平表达具有普遍性和特异性,提示MXR7基因可以作为肝癌的生物学标志物。 展开更多
关键词 肝肿瘤 MXR7基因 基因克隆 基因表达
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肥胖及2型糖尿病患者脂肪组织视黄醇结合蛋白4 mRNA的表达及调控 被引量:8
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作者 刘晓华 魏丽 +3 位作者 王玲艳 祝超瑜 包玉倩 贾伟平 《中华医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第18期1251-1254,共4页
目的 研究肥胖及2型糖尿病患者皮下和腹内脂肪组织视黄醇结合蛋白4(RBP4)mRNA的表达差异,并探讨影响其表达调控的因素.方法 选取2007年1-6月因非代谢性疾病而接受腹部择期手术的正常体重正常糖调节、单纯肥胖、2型糖尿病患者各9例,取... 目的 研究肥胖及2型糖尿病患者皮下和腹内脂肪组织视黄醇结合蛋白4(RBP4)mRNA的表达差异,并探讨影响其表达调控的因素.方法 选取2007年1-6月因非代谢性疾病而接受腹部择期手术的正常体重正常糖调节、单纯肥胖、2型糖尿病患者各9例,取皮下和腹内脂肪组织,用RT-PCR法检测RBP4 mRNA的表达,并在体外对正常体重正常糖调节者腹内脂肪组织分别与一定浓度的胰岛素、地塞米松、棕榈酸、肿瘤坏死因子-α、吡咯列酮共培养,用RT-PCR法检测药物对腹内脂肪组织RBP4 mRNA表达的变化.结果 肥胖和2型糖尿病患者腹内脂肪RBP4 mRNA的表达均显著高于正常体重正常糖调节者(分别为2.10±1.84和1.54±0.46比0.75±0.28,P<0.01和P<0.05),并明显高于相应的皮下脂肪组织;3组人群间皮下脂肪组织RBP4 mRNA的表达差异无统计学意义(1.05±0.15比0.99±0.14比1.13±0.07,P>0.05);药物胰岛素、地塞米松、吡咯列酮、棕榈酸能显著上调RBP4 mRNA的表达,与对照组相比,分别上升了2.13、0.84、2.04、4.88倍;肿瘤坏死因子-α显著下调RBP4 mRNA的表达,较对照组下降了38%.结论 肥胖和2型糖尿病患者腹内脂肪组织RBP4 mRNA的表达显著上升,正常体重正常糖调节者腹内脂肪组织RBP4 mRNA的表达受胰岛素、地塞米松等多种参与糖脂代谢及胰岛素抵抗因素的调控. 展开更多
关键词 脂肪组织 胰岛素抗体 视黄醇结合蛋白4
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甘草黄酮对运动大鼠体内糖及脂肪组织RBP4mRNA表达的影响 被引量:8
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作者 黄东 卜凯 阳毅 《中国实验方剂学杂志》 CAS 北大核心 2014年第2期124-128,共5页
目的:本研究通过运动前补充甘草黄酮,观察力竭运动大鼠血糖、肝糖原、肌糖原及脂肪组织视黄醇结合蛋白4(RBP4)表达的影响。方法:SD雄性大鼠50只,随机分为5组,每组10只,分别为安静对照组,运动对照组,运动ig低剂量甘草黄酮组(MGFL),运动i... 目的:本研究通过运动前补充甘草黄酮,观察力竭运动大鼠血糖、肝糖原、肌糖原及脂肪组织视黄醇结合蛋白4(RBP4)表达的影响。方法:SD雄性大鼠50只,随机分为5组,每组10只,分别为安静对照组,运动对照组,运动ig低剂量甘草黄酮组(MGFL),运动ig中剂量甘草黄酮组(MGFM),运动ig高剂量甘草黄酮组(MGFH)。每天在运动前30 min ig 1次,连续ig 6周,6 d/周,低、中、高3组的ig剂量分别为4,8,12 g·kg-1·d-1,对照组ig等量生理盐水。6周力竭训练结束后,处死大鼠。根据试剂盒的方法测定大鼠血清血糖、肝糖原、肌糖原的含量并且通过逆转录聚合酶链式反应测定大鼠附睾脂肪组织视黄醇结合蛋白4表达。结果:力竭游泳训练导致大鼠血糖、肌糖原和肝糖原含量在运动对照组和MGF低、中、高剂量组降低(P<0.05或P<0.01),血糖含量分别降低至(4.81±0.24),(5.31±0.12),(5.78±0.22),(5.92±0.18)mmol·L-1,但血糖含量在MGF各组高于运动对照组,MGFH组血糖含量与运动对照组比较有显著性差异(P<0.05);肌糖原含量分别降低至(0.91±0.16),(0.98±0.14),(1.34±0.12),(1.46±0.23)mg·g-1,其中MGFM,MGFH组与运动对照组比较有显著性差异(P<0.05);肝糖原含量分别降低至(6.21±1.10),(8.92±1.11),(9.18±1.13),(10.16±1.16)mg·g-1,MGF各组肝糖原含量分别高于运动对照组(P<0.05或P<0.01)。力竭游泳运动和MGF各组导致大鼠附睾脂肪组织RBP4 mRNA表达水平分别升高至(1.430±0.123),(1.101±0.103),(0.962±0.112),(0.926±0.101),其中运动对照组RBP4 mRNA表达水平与安静对照组比较有显著性差异(P<0.05),其中MGFM和MGFH组大鼠附睾脂肪组织RBP4 mRNA表达水平降低,与运动对照比较有显著性差异(P<0.05)。结论:补充甘草黄酮后可以维持长时间运动过程中大鼠体内糖储备、血糖浓度的相对稳定和下调RBP4 mRNA表达水平,从而有利于提高机体的运动能力。 展开更多
关键词 甘草黄酮 力竭运动 糖储备 脂肪组织表达
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