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水稻Xa21基因在水稻和玉米中的比较物理定位 被引量：9
1
作者 鄢慧民 宋运淳 +2 位作者 李立家 李霞 付彬英 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 1999年第3期249-253,共5页
比较基因组分析证明，禾本科不同种基因组间存在广泛的同线性和共线性。对水稻（ＯｒｙｚａｓａｔｉｖａＬ．）这一模式植物与其它禾本科植物基因的原位杂交比较定位可以揭示禾本科植物基因组结构的共同特点和进化规律。利用含Ｘａ２１... 比较基因组分析证明，禾本科不同种基因组间存在广泛的同线性和共线性。对水稻（ＯｒｙｚａｓａｔｉｖａＬ．）这一模式植物与其它禾本科植物基因的原位杂交比较定位可以揭示禾本科植物基因组结构的共同特点和进化规律。利用含Ｘａ２１基因的ｐＢ８２２作探针筛选水稻的细菌人工染色体（ＢＡＣ）文库，建立了一个包含３个ＢＡＣ克隆的重叠群。用生物素标记其中一个ＢＡＣ克隆，对水稻“广陆矮４号”和玉米自交系黄早四进行了染色体荧光原位杂交。同时，用ｐＢ８２２也作了原位杂交检测。在水稻第１１染色体长臂中间检出了杂交信号，信号与着丝粒的百分距离约为２４。在玉米的第１、３和第８染色体长臂观察到杂交信号，表明玉米基因组中具有三个Ｘａ２１的同源序列座位。ＢＡＣＦＩＳＨ的信号检出率达在４０％以上，大大高于质粒探针ｐＢ８２２的检出率（１５％），而且可在同源染色体和姊妹染色单体上同时检出杂交信号的比例较高，证明了利用ＢＡＣ克隆荧光原位杂交进行比较物理定位的可行性和优越性。在ＢＡＣＦＩＳＨ中必须用相应基因组的ＣｏｔⅠＤＮＡ封阻，以排除重复序列的干扰。 展开更多
关键词 水稻 FISH XA21 比较物理定位
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水稻Xa-5基因在水稻和玉米中的比较物理定位 被引量：6
2
作者 覃瑞 魏文辉 +1 位作者 金危危 宋运淳 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期367-370,共4页
比较基因组分析证明 ,玉米和水稻基因组间存在广泛的同线性和共线性。对水稻和玉米基因的原位杂交定位可以揭示禾本科植物基因组结构的共同特点和进化规律。用与 Xa- 5连锁的 RG556及RG556筛选出的 BAC克隆 4 4 B4作探针对水稻广陆矮四... 比较基因组分析证明 ,玉米和水稻基因组间存在广泛的同线性和共线性。对水稻和玉米基因的原位杂交定位可以揭示禾本科植物基因组结构的共同特点和进化规律。用与 Xa- 5连锁的 RG556及RG556筛选出的 BAC克隆 4 4 B4作探针对水稻广陆矮四号和玉米自交系黄早四进行了原位杂交 ,在水稻第 5号染色体短臂和玉米第 8号染色体长臂检出了杂交信号 ,信号与着丝粒百分距离分别为 4 8.85、4 7.35、 63.0 5。 BAC- FISH信号检出率 ( 4 1% )大大高于 RFL P探针 RG556( 8% )的检出率。 BAC- FISH需要 Cot- 1DNA的封阻。取材于稻兜的根尖经低温处理后能促进姊妹染色单体的分开 。 展开更多
关键词 BACFISH 原位杂交 比较物理定位 水稻 玉米 基因定位 水稻Xa-5基因 比较基因组分析
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RTSV和Glh在药用野生稻中的物理定位
3
作者 黄思罗 覃瑞 +3 位作者 傅彬英 金危危 何光存 宋运淳 《武汉植物学研究》 CSCD 2001年第5期353-356,T001,共5页
药用野生稻具有多种抗病虫性 ,是水稻品种改良重要的种质资源之一。本研究采用与栽培稻遗传图第 4连锁群中与 RTSV和 Glh紧密连锁的 RFLP标记 RZ2 6 2及其筛选出来的 BAC克隆作探针 ,对药用野生稻进行荧光原位杂交 ,供试探针均被定位于... 药用野生稻具有多种抗病虫性 ,是水稻品种改良重要的种质资源之一。本研究采用与栽培稻遗传图第 4连锁群中与 RTSV和 Glh紧密连锁的 RFLP标记 RZ2 6 2及其筛选出来的 BAC克隆作探针 ,对药用野生稻进行荧光原位杂交 ,供试探针均被定位于药用野生稻第 4染色体短臂的中部 ,百分距分别为 74.86± 3 .72和 73 .98± 4.44,信号检出率为 7.6 %和45 .1 %。 BAC克隆和 RFL P标记探针杂交位置几乎一致 ,说明在栽培稻和野生稻中 RFLP标记 RZ2 6 2都存在同一 BAC克隆的大插入片段中 ,药用野生稻与抗性基因 RTSV和 Glh的同源顺序就在第 4染色体信号出现的相应位置 ,从而为作物育种开发和利用野生资源的抗性基因提供了理论依据。 展开更多
关键词 药用野生稻 BAC-FISH 比较物理定位 RTSV Glh 抗性基因 栽培稻
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与Pi-2(t)基因连锁的栽培稻BAC克隆在药用野生稻和栽培稻中的比较物理定位
4
作者 李霞 李宗芸 +2 位作者 覃瑞 何光存 宋运淳 《武汉大学学报（理学版）》 CAS CSCD 北大核心 2001年第4期503-507,共5页
用栽培稻遗传图第 6连锁群中与 Pi- 2 ( t)紧密连锁的 RFL P标记 RG64及其筛选出来的 BAC克隆3 8D17作为探针 ,对药用野生稻和栽培稻进行荧光原位杂交 ( FISH) ,供试探针 RG64及 BAC克隆 3 8D17均被定位于药用野生稻和栽培稻第 6染色体 ... 用栽培稻遗传图第 6连锁群中与 Pi- 2 ( t)紧密连锁的 RFL P标记 RG64及其筛选出来的 BAC克隆3 8D17作为探针 ,对药用野生稻和栽培稻进行荧光原位杂交 ( FISH) ,供试探针 RG64及 BAC克隆 3 8D17均被定位于药用野生稻和栽培稻第 6染色体 .药用野生稻杂交信号的百分距离分别为 4 4 .87± 5 .3 3和 4 6.5 0± 4 .5 7,而栽培稻则为 3 5 .85± 3 .0 6和 3 6.0 5± 2 .4 4 ,信号检出率相应地为 7.14 %、4 2 .5 3 %、8.0 9%和 4 0 .78% .BAC克隆和RFL P探针杂交位置几乎一致 ,由此推知 ,与抗性基因 Pi- 2 ( t)连锁的 BAC克隆在药用野生稻中的同源顺序就在第6染色体杂交信号出现的相应位置 .在未封阻的情况下 ,药用野生稻多个染色体上具有信号 ,这表明它和栽培稻的Cot- DNA重复序列在一定的程度上具有同源性 .文中讨论了栽培稻 BAC克隆对药用野生稻原位杂交物理作图的可行性和 Cot- DNA的制备所涉及的一些技术问题 . 展开更多
关键词 药用野生稻 细菌人工染色体-荧光原位杂交 比较物理定位 Pi-2(t)基因 栽培稻 BAC克隆
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