任意引物PCR及其应用研究进展 被引量：7

1

作者 刘纯杰 张兆山 《生物技术通讯》 CAS 2003年第4期320-323,共4页

任意引物PCR技术又称为随机扩增多态性DNA技术,它是在PCR技术基础上发展起来的一项分子检测技术。它具有简便、快速,一套引物可用于多个物种的分析,不需预知分析对象的核酸序列,可以显示差异表达基因等特点,已广泛应用于病原微生物的分... 任意引物PCR技术又称为随机扩增多态性DNA技术,它是在PCR技术基础上发展起来的一项分子检测技术。它具有简便、快速,一套引物可用于多个物种的分析,不需预知分析对象的核酸序列,可以显示差异表达基因等特点,已广泛应用于病原微生物的分型鉴定、物种亲源关系分析、遗传育种研究和特异表达基因的克隆与鉴定等方面。 展开更多

关键词 任意引物pcr 随机扩增多态性DNA 分子检测 表达基因

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随机引物PCR技术在个体认定及亲权鉴定中的应用 被引量：1

2

作者 童大跃 伍新尧 +4 位作者 郭语彬 李芳 徐平 区敬华 林达 《生物技术通讯》 CAS 2000年第4期254-256,共3页

随机引物PCR技术 (AP -PCR)检测人DNA指纹图用于法医学个体认定及亲权鉴定是一个非常有效和经济的方法。应用该技术对 10 0例无关个体AP -PCR的DNA指纹进行频率分析和 10个肯定亲生关系的家庭进行亲权鉴定 ,结果该技术的个体识别力非常... 随机引物PCR技术 (AP -PCR)检测人DNA指纹图用于法医学个体认定及亲权鉴定是一个非常有效和经济的方法。应用该技术对 10 0例无关个体AP -PCR的DNA指纹进行频率分析和 10个肯定亲生关系的家庭进行亲权鉴定 ,结果该技术的个体识别力非常高 ,亲权鉴定时的非父排除率也很高 ,且操作简便、快速 。 展开更多

关键词 DNA指纹 随机引物pcr 亲权鉴定 个体识别

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随机引物PCR技术及其在动物医学中应用的研究进展

3

作者 沈学怀 张丹俊 +6 位作者 潘孝成 赵瑞宏 胡小苗 戴银 侯红艳 周学利 朱传民 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第10期62-68,共7页

随机引物PCR技术(AP-PCR)是一种建立在PCR基础上的新的DNA多态性检测技术,其特点是利用随机寡核苷酸引物扩增基因组DNA片段,在无需预知研究对象的情况下对其进行基因特征的分析,具有简便、高效、实用等优点,现已广泛应用于分子生物学的... 随机引物PCR技术(AP-PCR)是一种建立在PCR基础上的新的DNA多态性检测技术,其特点是利用随机寡核苷酸引物扩增基因组DNA片段,在无需预知研究对象的情况下对其进行基因特征的分析,具有简便、高效、实用等优点,现已广泛应用于分子生物学的多个领域。文章主要对AP-PCR技术的原理、优缺点、研究近况及其在动物医学中的应用等作一综述。 展开更多

关键词 随机引物pcr 研究进展 动物医学 应用

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随意引物PCR用于口腔链球菌基因分型的初步研究 被引量：6

4

作者 潘亚萍 王红杨 +1 位作者 林长坤 孙开来 《牙体牙髓牙周病学杂志》 CAS 1998年第2期77-79,共3页

目的：探讨口腔链球菌基因分型，比较细菌相互间基因差异。方法：设计２对１０碱基随意引物，提取变链球菌、血链球菌染色体ＤＮＡ，分别用一对引物进行ＰＣＲ扩增。结果：变链球菌、血链球菌扩增的ＤＮＡ基因片段有较大区别。设计不同... 目的：探讨口腔链球菌基因分型，比较细菌相互间基因差异。方法：设计２对１０碱基随意引物，提取变链球菌、血链球菌染色体ＤＮＡ，分别用一对引物进行ＰＣＲ扩增。结果：变链球菌、血链球菌扩增的ＤＮＡ基因片段有较大区别。设计不同序列引物，扩增的ＤＮＡ片段亦不同，可以分辨不同的基因位点。结论：随意引物ＰＣＲ检测方法稳定。 展开更多

关键词 随意引物 pcr 口腔科 链球菌 基因分型

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重症监护病房甲氧西林耐药金黄色葡萄球菌的分子流行病学调查 被引量：5

5

作者 熊薇 王洪波 涂敏 《中国实用内科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期373-375,共3页

目的了解重症监护病房(ICU)甲氧西林耐药金黄色葡萄球菌(MRSA)的分子流行病学特点。方法采用随机引物聚合酶链反应(AP-PCR)法对2004年华中科技大学同济医学院附属同济医院ICU病房分离的25株MRSA作同源性分析。结果25株MRSA的AP-PCR图谱... 目的了解重症监护病房(ICU)甲氧西林耐药金黄色葡萄球菌(MRSA)的分子流行病学特点。方法采用随机引物聚合酶链反应(AP-PCR)法对2004年华中科技大学同济医学院附属同济医院ICU病房分离的25株MRSA作同源性分析。结果25株MRSA的AP-PCR图谱有7种类型(A^G型),主要型别为A型10株、B型6株、C型3株、D型3株及E、F、G型各1株。结论医院获得性MRSA是多重耐药菌,在ICU病房流行的MRSA菌株主要是A、B基因型。 展开更多

关键词 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 随机引物聚合酶链反应 (AP-pcr)

原文传递

几种典型藻华生物的分子分类学分析 被引量：5

6

作者 侯建军 赖红艳 +1 位作者 黄邦钦 刘绍平 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期711-719,共9页

通过PCR克隆测序、rDNA序列分析、随机PCR引物扩增结合DGGE技术等三个层次的分子分类水平对厦门海域的典型藻华生物进行分子生物学分析。结果表明,基于DGGE检测的18S rDNA序列过于保守,分类的精确度不高;AP-PCR则是基于基因组的差异进... 通过PCR克隆测序、rDNA序列分析、随机PCR引物扩增结合DGGE技术等三个层次的分子分类水平对厦门海域的典型藻华生物进行分子生物学分析。结果表明,基于DGGE检测的18S rDNA序列过于保守,分类的精确度不高;AP-PCR则是基于基因组的差异进行分析,结果较为精确和全面;而rDNA序列分析相对可靠,尤其是针对ITS的长度和全序列分析以及28S rDNA的D1、D2区的序列分析,可以提供更为准确的分类信息,并可为设计检测探针提供基础。据此对分离自厦门海域的3种典型甲藻及其相关藻株建立了系统进化树。针对23株甲藻ITS序列建立的系统进化树显示Takayama pulchella(AY764179)和Karlodinium micrum的距离最近,并能够把Akashiwo属、Karenia属、Gyrodinium属、Karlodinium属、Takayama属与Gymnodinium属等区分开。用28S rDNA序列建立的系统发育树只能把Karlodinium属、Karenia属和Takayama属区分开,但不能很好地把无纹环沟藻与Akashiwo属和Gymnodinium等的藻区分开。 展开更多

关键词 藻华生物 分子分类学 核糖体DNA 变形梯度凝胶电泳 随机引物pcr

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去甲二氢愈创木酸对恶性胶质瘤细胞基因组甲基化水平的影响及其意义 被引量：2

7

作者 姚莉 卞修武 +1 位作者 张树辉 陈自强 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期251-253,共3页

目的　探讨去甲二氢愈创木酸 (NDGA)诱导人恶性胶质瘤细胞系SHG 44细胞分化过程中基因组甲基化状态改变及其意义。方法　合成甲基化敏感性AP PCR引物 ,用AP PCR方法检测SHG 44细胞基因组甲基化状态 ,观察NDGA诱导该细胞分化过程中甲基... 目的　探讨去甲二氢愈创木酸 (NDGA)诱导人恶性胶质瘤细胞系SHG 44细胞分化过程中基因组甲基化状态改变及其意义。方法　合成甲基化敏感性AP PCR引物 ,用AP PCR方法检测SHG 44细胞基因组甲基化状态 ,观察NDGA诱导该细胞分化过程中甲基化水平的变化。结果　对照组基因组DNA经MspⅠ酶解后AP PCR扩增片段比HpaⅡ酶解后的扩增片段小 ,几乎未见存留大片段 ,至少有 3个片段与HpaⅡ酶解片段不同。同一时相点HpaⅡ酶解后扩增产物相比 ,NDGA处理后基因组DNAMspⅠ酶解后的扩增产物量较少、条带较多 ,且随时相点延长产物量逐渐增加 ,条带增多。结论　NDGA诱导人恶性胶质瘤细胞系SHG 44细胞分化过程中基因组甲基化状态增高 。 展开更多

关键词 去甲二氢愈创木酸 胶质瘤 基因甲基化 甲基化敏感性 AP-pcr

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人小细胞肺癌多药耐药细胞H446/CDDP基因组DNA甲基化状态的变化 被引量：4

8

作者 郭芮伶 吴国明 +4 位作者 李海东 潘峰 李文碧 戢福云 钱桂生 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第23期2533-2535,共3页

目的探讨基因组DNA甲基化状态与人小细胞肺癌(small cell lung cancer,SCLC)H446/CDDP细胞获得性多药耐药的关系。方法分别提取人SCLC多药耐药细胞H446/CDDP及其亲代细胞H446的基因组DNA,应用甲基化敏感性随机引物PCR(MS-AP-PCR)方法检... 目的探讨基因组DNA甲基化状态与人小细胞肺癌(small cell lung cancer,SCLC)H446/CDDP细胞获得性多药耐药的关系。方法分别提取人SCLC多药耐药细胞H446/CDDP及其亲代细胞H446的基因组DNA,应用甲基化敏感性随机引物PCR(MS-AP-PCR)方法检测其甲基化状态。结果 H446/CDDP细胞经酶解后的扩增谱带较H446细胞明显增多,且荧光强度较强,表明其基因组DNA甲基化水平较亲代细胞明显增高。结论 H446/CDDP细胞多药耐药性的获得可能与其基因组DNA甲基化水平增高有关。 展开更多

关键词 人小细胞肺癌 多药耐药 DNA甲基化 甲基化敏感性随机引物pcr法

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随机引物PCR法在变形链球菌基因分型中的初步应用 被引量：5

9

作者 刘加荣 边专 +1 位作者 樊明文 聂敏 《口腔医学研究》 CAS CSCD 2003年第2期92-94,共3页

目的 :研究利用随机引物PCR法来对口腔变形链球菌进行基因分型。方法 :采用两组针对变形链球菌的随机引物 ,于不同的反应体系中 ,对变形链球菌群 (血清型c、e、f、d、g)及 3个临床分离株进行PCR扩增 ,并对变形链球菌的电泳图谱进行分析 ... 目的 :研究利用随机引物PCR法来对口腔变形链球菌进行基因分型。方法 :采用两组针对变形链球菌的随机引物 ,于不同的反应体系中 ,对变形链球菌群 (血清型c、e、f、d、g)及 3个临床分离株进行PCR扩增 ,并对变形链球菌的电泳图谱进行分析 ,鉴定其基因型的多态性。结果 :运用两组随机引物均可鉴别不同血清型的变形链球菌 ,对同一血清型的链球菌还可鉴别其不同的基因型。结论 :两组随机引物均能对变形链球菌进行基因分型。随机引物PCR法简便、快速、分辨率较高 ,是鉴定变形链球菌基因型的有效方法。 展开更多

关键词 口腔变形链球菌 基因分型 随机引物pcr法 电泳图谱

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肺癌病人肿瘤组织DNA高甲基化片段的筛选 被引量：3

10

作者 刘晋祎 安倩 +3 位作者 张建军 雷文东 程书钧 高燕宁 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第4期389-394,共6页

关于DNA甲基化在肿瘤中的作用的研究 ,大多集中在研究已知的抑癌基因启动子区的异常高甲基化。而一些未知的参与肿瘤发生的基因也可能受甲基化调控 ,寻找这些与肿瘤相关的基因 ,对深入了解肿瘤发生的机制具有重要意义。利用甲基化敏感... 关于DNA甲基化在肿瘤中的作用的研究 ,大多集中在研究已知的抑癌基因启动子区的异常高甲基化。而一些未知的参与肿瘤发生的基因也可能受甲基化调控 ,寻找这些与肿瘤相关的基因 ,对深入了解肿瘤发生的机制具有重要意义。利用甲基化敏感性随机引物PCR(Methylation SensitiveArbitrarilyPrimedPCR ,MS AP PCR) ,检查了肺癌组织中基因组范围内CpG岛高甲基化情况 ,分离到 8个高甲基化片段 (hypermethylatedDNAfragment,HMDF)。通过克隆、测序和Blast、NewCpGseek软件分析 ,发现所有的片段均为典型的CpG岛 ,有 4个片段与人 2、7、9、10号染色体上的同源性为 99%～ 10 0 % ,但只有 1个是已知的基因。进一步利用NeuralNetworkPromoterPrediction、TSSG和TSSW等软件对其余 7个片段可能的生物学意义进行了分析 ,结果有 4个片段是候选的启动子区 ,提示它们可能源于新基因。所获得的高甲基化片段可能是中国人肺癌发生过程中特有的表遗传学改变。 展开更多

关键词 肺癌 DNA甲基化 表遗传学改变 甲基化敏感性随机引物pcr

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应用AP-PCR法分析去甲二氢愈创木酸对胶质瘤细胞基因组甲基化状态的影响

11

作者 姚莉 卞修武 +2 位作者 张树辉 陈自强 梁晓俐 《癌变．畸变．突变》 CAS CSCD 2004年第2期81-82,85,共3页

背景与目的 :应用甲基化敏感性AP_PCR法探讨去甲二氢愈创木酸(NDGA)诱导人恶性胶质瘤细胞系SHG -44细胞分化过程中基因组甲基化状态改变。材料与方法 :用甲基化敏感性AP_PCR方法检测SHG -44细胞基因组甲基化状态。结果 :经NDGA处理后 ,... 背景与目的 :应用甲基化敏感性AP_PCR法探讨去甲二氢愈创木酸(NDGA)诱导人恶性胶质瘤细胞系SHG -44细胞分化过程中基因组甲基化状态改变。材料与方法 :用甲基化敏感性AP_PCR方法检测SHG -44细胞基因组甲基化状态。结果 :经NDGA处理后 ,胶质瘤细胞基因组甲基化水平增高。 结论 展开更多

关键词 甲基化敏感性AP-pcr 基因组甲基化 去甲二氢愈创木酸 胶质瘤 诱导分化

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利用AP-PCR对柔嫩艾美球虫不同地理株及其杂交株多态性的研究

12

作者 赵权 张西臣 +3 位作者 张伟信 李建华 高明 秦建华 《中国兽医科技》 CSCD 北大核心 2005年第3期207-210,共4页

用随机引物PCR(AP-PCR)技术对鸡柔嫩艾美球虫(Eimeria tenella)黑龙江株(H)、山东株(S)及黑龙江株与山东株的杂交株(F1)进行了研究,同时对2个不同地理株的子代株与亲代株和F1株的亲缘关系进行了分析.结果,鸡柔嫩艾美球虫不同地理株之间... 用随机引物PCR(AP-PCR)技术对鸡柔嫩艾美球虫(Eimeria tenella)黑龙江株(H)、山东株(S)及黑龙江株与山东株的杂交株(F1)进行了研究,同时对2个不同地理株的子代株与亲代株和F1株的亲缘关系进行了分析.结果,鸡柔嫩艾美球虫不同地理株之间以及同一地理株的亲代与子代之间存在DNA多态性;并且不同地理株间的种内变异程度较大(Si=0.6423～0.6370);同一地理株亲代与子代之间的亲缘关系也稍有改变,但其变异程度不大(Si=0.9830～0.9811).对F1株的AP-PCR分析发现,F1株与H株、S株的相似值分别为0.6929、0.6825,介于H株与S株相似值和传代株间的相似值之间.结果表明,F1株既具有两亲本株的遗传性状,又发生了变异. 展开更多

关键词 柔嫩艾美球虫 AP—pcr DNA多态性

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应用AP-PCR技术绘制肺炎克雷伯菌多态性图谱

13

作者 高大威 《中国卫生检验杂志》 CAS 2001年第2期142-143,共2页

以一条含１０ｂｐ的随机引物对４５株肺炎克雷伯菌的ＤＮＡ进行ＡＰ－ＰＣＲ扩增，得到不同的图谱，通过菌株间相 似系数计算，绘制出表达菌株亲缘关系的系统树，表明该技术可应用于细菌检测和流行病学调查。

关键词 分型 肺炎克雷伯菌 随机引物pcr 系统树

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嗜盐菌Halobacterium species NRC-1不同盐浓度下基因表达差异分析

14

作者 李鑫 刘军 《微生物学杂志》 CAS CSCD 2009年第4期62-66,共5页

用RNA随机起始PCR(RAP-PCR)技术分析了盐杆菌NRC-1(Halobacterium NRC-1)不同NaCl盐度下基因表达的差异。81条引物用于比较17%、30%两种盐度下基因表达的差异,每条引物平均可以产生10条以上扩增条带,共得到15条在2种盐度下差异表达的条... 用RNA随机起始PCR(RAP-PCR)技术分析了盐杆菌NRC-1(Halobacterium NRC-1)不同NaCl盐度下基因表达的差异。81条引物用于比较17%、30%两种盐度下基因表达的差异,每条引物平均可以产生10条以上扩增条带,共得到15条在2种盐度下差异表达的条带,这些差异扩增条带的获得将有助从分子水平上了解Halobacterium NRC-1在高盐环境下的适应机制。 展开更多

关键词 差异表达 盐杆菌NRC-1 RNA随机起始pcr

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连云港沿海5种贝类生物的遗传多样性分析 被引量：3

15

作者 胡虹 金国虔 +2 位作者 吴梧桐 李萍 叶波平 《药物生物技术》 CAS CSCD 2006年第6期418-421,共4页

利用随机引物多聚酶链式反应(AP-PCR)技术对来自江苏省连云港海区5种重要的水产贝类(文蛤、青蛤、杂色蛤仔、四角蛤蜊和缢蛏)的遗传多样性进行了分析。由选取的28条随机引物共扩增出482个DNA片段,遗传多态性高达100%,而帘蛤科内的3种贝... 利用随机引物多聚酶链式反应(AP-PCR)技术对来自江苏省连云港海区5种重要的水产贝类(文蛤、青蛤、杂色蛤仔、四角蛤蜊和缢蛏)的遗传多样性进行了分析。由选取的28条随机引物共扩增出482个DNA片段,遗传多态性高达100%,而帘蛤科内的3种贝类的遗传多态性平均为91%。利用NTSYSpc生物学软件计算出5种贝类种间的遗传相似系数和相对遗传距离,聚类分析(UPGAM)结果表明:5种贝类在系统进化上的关系较远,它们可聚类为3组,它们的平均遗传相似系数为0.520,其中Ⅰ组有文蛤和青蛤,组内遗传相似系数为0.570;Ⅱ组有四角蛤蜊,它与Ⅰ组的遗传相似系数为0.561;Ⅲ组有杂色蛤仔和缢蛏,组内的遗传相似系数为0.544。 展开更多

关键词 贝类 基因组DNA 任意引物多聚酶链式反应 遗传多样性

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五种海桑属植物的遗传多样性分析 被引量：3

16

作者 蔡春海 金国虔 +3 位作者 于凌杰 吴梧桐 李萍 叶波平 《药物生物技术》 CAS CSCD 2005年第4期232-235,共4页

利用AP-PCR技术对来自于海南东寨港红树林自然保护区的5种海桑属植物的遗传多态性进行了分析。由选用的46条随机引物共扩增出908个DNA片段,其中有403个DNA片段分别为不同种海桑所特有的,占总扩增条带数的44.4%,呈现出较高的多态性,它们... 利用AP-PCR技术对来自于海南东寨港红树林自然保护区的5种海桑属植物的遗传多态性进行了分析。由选用的46条随机引物共扩增出908个DNA片段,其中有403个DNA片段分别为不同种海桑所特有的,占总扩增条带数的44.4%,呈现出较高的多态性,它们是海桑属植物不同种间潜在的分子标记。以NT- SYSpc分析软件对这5种海桑属植物进行了聚类分析,结果表明:5种海桑属植物可聚类为3个组,其中Ⅰ组有海桑和拟海桑,Ⅱ组有无瓣海桑和海南海桑,Ⅲ组仅包括卵叶海桑一种,与传统的植物分类学研究结果略有不同,其原因有待进一步认识。 展开更多

关键词 海桑属植物 任意引物多聚酶链式反应 遗传多样性

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