番茄黄化曲叶病毒抗病基因的分子鉴定与分析 被引量：4

1

作者 刘榛 张延安 化娟莉 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2013年第4期1498-1502,共5页

本研究对来自10个国家,国内27家单位抗黄化曲叶病毒病的239个番茄品种进行抗病基因的分子鉴定并分析,结果表明:Ty-1和Ty-3a是当前番茄抗黄化曲叶病毒病育种中利用的主要基因,携带复合基因的杂种也主要是这两对基因的利用。

关键词 番茄黄化曲叶病毒病 抗病基因 ty-1 ty-3a

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番茄Ty-2、Ty-3和I-2基因多重PCR鉴定技术 被引量：3

2

作者 孔凡慧 李帅 +4 位作者 赵婷婷 李冬艳 许向阳 姜景彬 李景富 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期184-189,共6页

本研究利用分别与抗番茄黄化曲叶病毒病(tomato yellow leaf curl virus disease,TYLCVD)基因Ty-2、Ty-3紧密连锁的共显性分子标记T0302、P6-25,与抗番茄枯萎病(Fusarium vascular wilt)基因I-2紧密连锁的显性标记Z1063,建立了能同时鉴... 本研究利用分别与抗番茄黄化曲叶病毒病(tomato yellow leaf curl virus disease,TYLCVD)基因Ty-2、Ty-3紧密连锁的共显性分子标记T0302、P6-25,与抗番茄枯萎病(Fusarium vascular wilt)基因I-2紧密连锁的显性标记Z1063,建立了能同时鉴定番茄Ty-2、Ty-3和I-2基因的多重PCR技术。利用该技术对24份番茄材料进行基因型鉴定,其结果与田间接种鉴定结果吻合率达91.7%。该体系简易快捷、无需酶切,只需一次PCR即可完成鉴定工作,不失为番茄多基因聚合育种、抗性资源鉴定的有效工具。 展开更多

关键词 番茄 多重PCR技术 多重PCR ty-2 ty-3 I-2

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番茄抗病基因Sw-5和Ty-3a的多重PCR检测体系的建立 被引量：3

3

作者 金凤媚 薛俊 +2 位作者 宋建 王姝 张越 《北方园艺》 CAS 北大核心 2017年第11期115-118,共4页

以含有斑萎病毒和黄化曲叶病毒抗病基因和感病基因的番茄为试材,采用多重PCR方法,建立番茄抗斑萎病毒Sw?5和抗番茄黄化曲叶病毒的Ty?3a基因同时扩增的体系,以期为番茄分子标记抗病育种提供更省时、省力、经济的方法。结果表明:多重PCR... 以含有斑萎病毒和黄化曲叶病毒抗病基因和感病基因的番茄为试材,采用多重PCR方法,建立番茄抗斑萎病毒Sw?5和抗番茄黄化曲叶病毒的Ty?3a基因同时扩增的体系,以期为番茄分子标记抗病育种提供更省时、省力、经济的方法。结果表明:多重PCR扩增的特异性片段与单引物扩增片段完全一致,与Sw?5基因紧密连锁的SCAR标记,在抗病基因型中可扩增出574bp的条带,感病基因型中扩增出464bp的条带;与Ty?3a基因紧密连锁的SCAR标记,在抗病基因型中可扩增出630bp的条带,感病基因型中扩增出320bp的条带,多重PCR体系可在同一PCR反应体系中对2个抗病基因进行筛选鉴定及苗期早期辅助选育。 展开更多

关键词 番茄斑萎病毒(TSWV) 番茄黄化曲叶病毒 Sw-5 ty-3a 多重PCR

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番茄回交后代群体Ty-1和Ty-3的PCR鉴定 被引量：1

4

作者 强薇 黄婷婷 刘维信 《青岛农业大学学报（自然科学版）》 2013年第2期110-113,共4页

利用PCR反应体系,对番茄回交群体共862株进行番茄黄化曲叶病毒病(Tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)抗性基因Ty-1和Ty-3的鉴定。试验结果表明:44个BF1代分离群体中含有TYLCV抗性基因Ty-1的有43个,共387株,其中3个分离群体共49株中... 利用PCR反应体系,对番茄回交群体共862株进行番茄黄化曲叶病毒病(Tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)抗性基因Ty-1和Ty-3的鉴定。试验结果表明:44个BF1代分离群体中含有TYLCV抗性基因Ty-1的有43个,共387株,其中3个分离群体共49株中含有纯合Ty-1基因;含有TYLCV抗性基因Ty-3基因的分离群体有34个,共221株;同时含有TYLCV抗性基因Ty-1及Ty-3基因的材料有31个分离群体,共198株,本次试验使用的标记能够有效筛选出含有TYLCV抗性基因Ty-1和Ty-3的植株,为分子辅助育种提供参考依据。 展开更多

关键词 番茄黄化曲叶病毒 ty-1 ty-3 抗性基因

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番茄Ty-1、Ty-3和Mi基因的多重PCR体系建立及应用 被引量：1

5

作者 王明琦 邰连赛 +2 位作者 陈火英 刘杨 王新华 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2018年第14期4671-4677,共7页

本研究利用10份番茄材料,筛选出能够鉴定番茄抗黄化曲叶病基因Ty-1的双SNP标记,Ty-3基因的SCAR1标记和抗根结线虫病Mi基因的SCAR2标记。应用以上分子标记构建出同时检测番茄Ty-1、Ty-3和Mi基因的多重PCR体系。结果表明,多重PCR扩增结果... 本研究利用10份番茄材料,筛选出能够鉴定番茄抗黄化曲叶病基因Ty-1的双SNP标记,Ty-3基因的SCAR1标记和抗根结线虫病Mi基因的SCAR2标记。应用以上分子标记构建出同时检测番茄Ty-1、Ty-3和Mi基因的多重PCR体系。结果表明,多重PCR扩增结果与单引物PCR扩增结果一致,使用该体系只需1次PCR反应及琼脂糖凝胶电泳便可快速、准确地对番茄3种基因的基因型进行检测。对96份番茄材料的分子检测结果与田间鉴定结果吻合度达到94%以上。使用该体系无需PCR产物酶切反应,可大大缩短分子检测的时间,节省检测成本,检测结果能够有效地辅助番茄抗病育种工作。 展开更多

关键词 番茄 ty-1 ty-3 MI 多重PCR

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番茄抗黄化曲叶病毒基因Ty-3的SCAR标记及应用 被引量：2

6

作者 董盼盼 赵美爱 +2 位作者 管聪 王富 王辉 《北方园艺》 CAS 北大核心 2013年第23期119-122,共4页

以49份番茄材料为试材,利用特异引物对5份抗病纯合番茄材料(基因型Ty-3/Ty-3)和5份感病纯合番茄材料(基因型ty-3/ty-3)进行PCR扩增,同时对25份番茄高代自交系和14份番茄杂交一代材料进行检测,并用田间自然发病的方法对这些材料的抗性进... 以49份番茄材料为试材,利用特异引物对5份抗病纯合番茄材料(基因型Ty-3/Ty-3)和5份感病纯合番茄材料(基因型ty-3/ty-3)进行PCR扩增,同时对25份番茄高代自交系和14份番茄杂交一代材料进行检测,并用田间自然发病的方法对这些材料的抗性进行验证。结果表明:经PCR扩增,抗病纯合番茄产生了630bp的片段,而感病纯合材料扩增出320bp的片段;该标记能够区分抗病材料、感病材料及杂合抗病材料,是与番茄黄化曲叶病毒病(TYLCV)病抗病基因Ty-3紧密连锁的共显性标记;25份番茄高代自交系中,有4份材料基因型是Ty-3/Ty-3,有7份材料基因型是Ty-3/ty-3,14份材料不含抗病基因Ty-3;14份番茄杂交一代材料中,有4份材料基因型是Ty-3/Ty-3,5份材料基因型是Ty-3/ty-3,5份材料不含抗病基因Ty-3;田间试验表明,分子鉴定与田间发病鉴定的吻合度达78.6%以上;在抗番茄黄化曲叶病毒病育种中,可用PCR方法快速筛选亲本抗性材料,提高育种效率。 展开更多

关键词 番茄黄化曲叶病毒SCAR ty-3 苗期鉴定 田间鉴定

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番茄Ty-3、I-2和Mi基因多重PCR体系的建立与应用 被引量：2

7

作者 李冬艳 薛东齐 +2 位作者 李景富 许向阳 姜景彬 《东北农业科学》 2016年第2期39-43,共5页

本研究利用已知基因型的番茄材料,筛选出抗番茄黄化曲叶病Ty-3基因紧密连锁的分子标记SCAR1、抗枯萎病I-2基因紧密连锁的分子标记SCAR2和抗根结线虫病Mi基因紧密连锁的分子标记SCAR3,并应用这3个分子标记建立能同时鉴定Ty-3、I-2和Mi基... 本研究利用已知基因型的番茄材料,筛选出抗番茄黄化曲叶病Ty-3基因紧密连锁的分子标记SCAR1、抗枯萎病I-2基因紧密连锁的分子标记SCAR2和抗根结线虫病Mi基因紧密连锁的分子标记SCAR3,并应用这3个分子标记建立能同时鉴定Ty-3、I-2和Mi基因的多重PCR体系。经多次验证,扩增的特异性片段与单引物扩增片段一致,其结果准确可靠,可用于同时对3个抗病基因的鉴定。利用该体系对300份番茄材料进行种质资源筛选,结果表明分子检测结果与接种鉴定结果几乎吻合。本研究建立的多重PCR方法简易、高效、快速,为番茄抗病材料的筛选、分子标记辅助聚合育种工作奠定了基础。 展开更多

关键词 ty-3 I-2 MI 多重PCR 聚合育种

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番茄抗病基因Ty-3的SCAR标记及检测 被引量：1

8

作者 张子君 刘文奇 +2 位作者 李海涛 马小青 邹庆道 《园艺与种苗》 CAS 2014年第4期26-28,共3页

[目的]通过建立与番茄黄化曲叶病毒病抗病基因Ty-3紧密连锁的SCAR标记,以提高抗病材料选育效率与准确性。[方法]设计特异引物对相关材料进行PCR扩增,获得与抗病基因Ty-3连锁的SCAR分子标记。[结果]利用该标记检测抗病纯合材料(Ty-3/Ty-3... [目的]通过建立与番茄黄化曲叶病毒病抗病基因Ty-3紧密连锁的SCAR标记,以提高抗病材料选育效率与准确性。[方法]设计特异引物对相关材料进行PCR扩增,获得与抗病基因Ty-3连锁的SCAR分子标记。[结果]利用该标记检测抗病纯合材料(Ty-3/Ty-3)、感病材料(ty-3/ty-3)分别产生600 bp、320 bp片段,抗病杂合材料(Ty-3/ty-3)产生600 bp与320 bp 2条片段;利用该标记对7份田间表现抗病的番茄F1代杂交种进行检测,有4份含有抗病基因Ty-3,3份未检出;选择经济性状优良、含有抗病基因Ty-3的F1代杂交种自交得到F2群体28个单株,利用该标记对单株进行检测,得到抗病纯合单株7个,抗病杂合单株13个,感病单株8个。[结论]该标记是与抗病基因Ty-3紧密连锁的共显性标记,可用于番茄抗病基因Ty-3的鉴定与抗病材料的筛选。 展开更多

关键词 番茄黄化曲叶病毒病 ty-3 分子标记

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多重PCR技术鉴定番茄Ty-3a和Tm-2~a基因 被引量：1

9

作者 王涛 张子君 +3 位作者 马小青 朱华 张逸鸣 邹庆道 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2018年第21期7063-7067,共5页

本研究利用与抗番茄黄化曲叶病毒病(tomato yellow leaf curl virus, TYLCV)基因Ty-3a紧密连锁的共显性分子标记P6-25和抗番茄烟草花叶病毒病(tomato mosaic virus, ToMV)基因Tm-2~a的功能性显性分子标记,建立了可同时筛选番茄Ty-3a和Tm... 本研究利用与抗番茄黄化曲叶病毒病(tomato yellow leaf curl virus, TYLCV)基因Ty-3a紧密连锁的共显性分子标记P6-25和抗番茄烟草花叶病毒病(tomato mosaic virus, ToMV)基因Tm-2~a的功能性显性分子标记,建立了可同时筛选番茄Ty-3a和Tm-2~a基因的多重PCR技术,扩增的特异性片段与常规PCR扩增片段完全吻合。其中P6-25标记在纯合和杂合抗病材料中分别扩增出630 bp、630 bp和320 bp的特异片段,在感病材料中扩增出320 bp的特异片段;Tm-2~a的功能性标记只能在抗病材料中扩增出472 bp的特异片段。利用该技术对19份番茄材料进行基因型鉴定,结果稳定可靠。本研究建立的多重PCR体系提高了抗病基因Ty-3a和Tm-2~a的鉴定效率,为番茄多基因聚合育种提供了技术支持。 展开更多

关键词 番茄 多重PCR ty-3a Tm-2a

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番茄抗黄化曲叶病毒基因Ty-3的AFLP标记 被引量：1

10

作者 姜景彬 刘晓东 +2 位作者 许向阳 陈秀玲 李景富 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期103-107,共5页

以感病材料10981为父本(P1),抗病材料10032为母本(P2),通过自交、杂交和回交,获得P1、P2两个亲本和F1、F2、BC1及BC2群体,接种鉴定各世代发病情况。选用288对Eco RⅠ/MseⅠ引物组合对P1、P2两个亲本,F1和F2代群体进行AFLP分析。卡方测... 以感病材料10981为父本(P1),抗病材料10032为母本(P2),通过自交、杂交和回交,获得P1、P2两个亲本和F1、F2、BC1及BC2群体,接种鉴定各世代发病情况。选用288对Eco RⅠ/MseⅠ引物组合对P1、P2两个亲本,F1和F2代群体进行AFLP分析。卡方测验结果表明,抗源材料10032对黄化曲叶病毒的抗性表现为单基因显性遗传。经AFLP引物筛选及遗传连锁分析,获得与抗病基因Ty-3紧密连锁的标记E40/M49,遗传距离为3.4 cM。该研究可为番茄抗TYLCV分子标记辅助选择和抗TYLCV育种奠定基础。 展开更多

关键词 番茄黄化曲叶病毒 ty-3 AFLP 遗传距离

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多重PCR技术鉴定番茄Ty-2和Ty-3基因及田间验证 被引量：17

11

作者 许爽 褚云霞 +3 位作者 张辉 万延慧 朱龙英 朱为民 《分子植物育种》 CAS CSCD 2009年第5期954-958,共5页

本研究采用多重PCR方法对与抗番茄黄化曲叶病毒病(tomato yellow leafcurl virus,TYLCV)的Ty-2和Ty-3基因紧密连锁的共显性SCAR标记进行扩增筛选,不同基因型(Ty-2/Ty-2,Ty-2/ty-2,ty-2/ty-2,ty-3/ty-3)的材料扩增出不同长度的特异片段,... 本研究采用多重PCR方法对与抗番茄黄化曲叶病毒病(tomato yellow leafcurl virus,TYLCV)的Ty-2和Ty-3基因紧密连锁的共显性SCAR标记进行扩增筛选,不同基因型(Ty-2/Ty-2,Ty-2/ty-2,ty-2/ty-2,ty-3/ty-3)的材料扩增出不同长度的特异片段,建立了一种快速检测抗TYLCV基因的技术。利用该技术对22份番茄材料进行检测,同时利用普通PCR对上述材料进行检测,两者结果完全吻合。最后用田间自然发病的方法在大田对这些材料抗性进行验证,符合率达86.4%。 展开更多

关键词 番茄 多重PCR 番茄黄化曲叶病毒病 ty-2 ty-3田间验证

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番茄种质资源黄化曲叶病毒病抗性的鉴定与评价 被引量：8

12

作者 米国全 陈梦莹 +5 位作者 史艳艳 王裔娜 韩娅楠 程志芳 韩永平 王晋华 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2017年第5期77-83,共7页

鉴于目前商业番茄品种黄化曲叶病毒病抗性难以甄别,对86份番茄种质的番茄黄化曲叶病毒(TYLCV)抗性基因进行PCR检测并进行田间抗病性鉴定。结果表明,目前抗TYLCV番茄种质抗性基因主要是Ty-1/ty-1和Ty-1/ty-1+Ty-3a/ty-3,2种类型抗病种质... 鉴于目前商业番茄品种黄化曲叶病毒病抗性难以甄别,对86份番茄种质的番茄黄化曲叶病毒(TYLCV)抗性基因进行PCR检测并进行田间抗病性鉴定。结果表明,目前抗TYLCV番茄种质抗性基因主要是Ty-1/ty-1和Ty-1/ty-1+Ty-3a/ty-3,2种类型抗病种质(19份、23份)分别占总抗病种质(61份)的31.15%和37.70%。在仅含有Ty-1基因的25个番茄种质中,有80.00%田间表现抗病,而同时含有Ty-1和Ty-3a 2个基因的26个番茄种质中,田间抗病率达100%,说明抗性基因具有累加效应。通过抗性基因PCR方式进行抗病检测,准确率达到81.40%。同时推荐了M-17号、达丽等25份抗TYLCV番茄优良品种。 展开更多

关键词 番茄黄化曲叶病毒 ty-1基因 ty-2基因 ty-3基因 抗性鉴定

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TY-3探空火箭突起物气动加热计算 被引量：2

13

作者 程养民 《固体火箭技术》 EI CAS CSCD 北大核心 2003年第2期1-3,共3页

采用平面斜激波理论、锥形流动理论、普朗特 迈耶膨胀流动理论和有关气动加热的理论方法,对TY 3探空火箭的尾翼前缘、气流导流块两突起物处的气动加热情况进行计算,计算结果与飞行实验结果作了比较,证明所采取的防热设计是有效的。

关键词 ty-3探空火箭 突起物 气动加热 计算 防热设计 无控火箭

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番茄黄化曲叶病毒病抗性基因Ty-3a分子标记的筛选及定位 被引量：1

14

作者 姚祝平 叶青静 +6 位作者 王荣青 周国治 阮美颖 李志邈 万红建 程远 杨悦俭 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期595-600,共6页

本研究利用番茄黄化曲叶病毒病高感染株系7969-19-1-1-3及其高抗番茄黄化曲叶病毒病的株系Z3(Ty-3a)构建了包含1 404个单株的F2分离群体,并利用分子标记技术对其进行了分析。研究结果显示,在348对SSR、CAPS、SNP、Indel以及RFLP引物中,... 本研究利用番茄黄化曲叶病毒病高感染株系7969-19-1-1-3及其高抗番茄黄化曲叶病毒病的株系Z3(Ty-3a)构建了包含1 404个单株的F2分离群体,并利用分子标记技术对其进行了分析。研究结果显示,在348对SSR、CAPS、SNP、Indel以及RFLP引物中,在双亲间有68对引物扩增出多态性差异,利用获得的68对引物对抗感池进行筛选,获得了7对多态性的标记C2_At3g56230、X38、H5、C4、TGS2216、X1和H12。为了进一步缩小区间,利用F2群体的1 404个单株进行连锁分析。在C2_At3g56230-H12区间寻找新的标记,最后将Ty-3a定位于标记TGS12660和TY3a-P19之间,2个标记的之间的物理距离约为29.7 kb,遗传距离约为0.3 c M。研究结果可为进一步克隆Ty-3a基因和分子标记辅助选择培养抗番茄黄化曲叶病毒番茄新品种奠定基础。 展开更多

关键词 番茄 分子标记 ty-3a基因 抗番茄黄化曲叶病毒病基因

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TY-3火箭电气系统电磁兼容性设计 被引量：2

15

作者 彭勤素 伏川惠 +1 位作者 陈轶博 王懿 《固体火箭技术》 EI CAS CSCD 北大核心 2001年第3期71-74,共4页

针对 TY-3微重力试验火箭电气系统在测试中出现的供电干扰、长线干扰、脱落干扰等各种干扰因素进行了电磁兼容性分析 ,提出了改进的电路设计方案 ,通过了地面综合试验的验证和飞行试验的考核。

关键词 探控火箭 电气系统控制 干扰 电磁兼容性 ty-3微重力试验火箭 供电干扰 长线干扰

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与番茄黄化曲叶病毒病抗病基因Ty-3紧密连锁标记的比较与分析

16

作者 王辉 董盼盼 +1 位作者 李文丽 王富 《江苏农业科学》 北大核心 2016年第12期71-73,共3页

以番茄黄化曲叶病毒病(tomato yellow leaf curf virus,简称TYLCD)抗病纯合基因型(Ty-3/Ty-3)材料A45、感病纯合基因型(ty-3/ty-3)材料A39及其构建的F2代分离群体(145个单株)为试验材料,采用接种鉴定的方法,同时进行TYLCV抗性遗传分析,... 以番茄黄化曲叶病毒病(tomato yellow leaf curf virus,简称TYLCD)抗病纯合基因型(Ty-3/Ty-3)材料A45、感病纯合基因型(ty-3/ty-3)材料A39及其构建的F2代分离群体(145个单株)为试验材料,采用接种鉴定的方法,同时进行TYLCV抗性遗传分析,比较P6-25、UF_TY3-P23、UF_TY3-P19等3个标记与Ty-3基因的连锁程度。结果显示,番茄黄化曲叶病毒病抗性遗传符合1对显性基因控制;P6-25、UF_TY3-P23、UF_TY3-P19等3个标记与抗病基因Ty-3间的遗传距离分别为15.2、14.5、10.3 c M;利用分子标记UF_TY3-P19可提高黄化曲叶病毒病抗性材料的效率。 展开更多

关键词 番茄 黄化曲叶病毒病 ty-3基因 分子标记

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番茄新品种黄化曲叶病毒病抗性基因Ty1、Ty3的分子标记 被引量：5

17

作者 刘燕 尚春明 +4 位作者 高振江 王伟 周刚 郑于莉 姚慧静 《北方农业学报》 2018年第1期33-35,共3页

试验选取与番茄黄化曲叶病毒病抗性基因Ty1和Ty3的紧密连锁的引物,利用SCAR标记对包头市农业科学研究所选育的番茄新品种TY191、TY192、TY196以及2016年参加全国区域试验的44个番茄新品种进行抗性基因Ty1和Ty3的鉴定。试验结果表明,番... 试验选取与番茄黄化曲叶病毒病抗性基因Ty1和Ty3的紧密连锁的引物,利用SCAR标记对包头市农业科学研究所选育的番茄新品种TY191、TY192、TY196以及2016年参加全国区域试验的44个番茄新品种进行抗性基因Ty1和Ty3的鉴定。试验结果表明,番茄新品种TY191、TY192、TY196同时含有Ty1和Ty3抗性基因,与其他参试新品种相比有较强优势。 展开更多

关键词 番茄 ty191 ty192 ty196 黄化曲叶病毒病抗性基因 ty1 ty3

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CAPS标记在番茄抗黄化曲叶病毒病基因Ty1和Ty3遗传关系分析上的应用 被引量：4

18

作者 刘榛 张延安 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期92-96,共5页

以分别携带有Ty1/Ty1.Ty3a/Ty3a和Ty1/Ty1.Ty3/Ty3的番茄材料09(1)和09(2)为亲本的F2群体的89个单株为研究对象,利用分子标记的方法对F2群体所有单株的抗病基因型进行检测。结果发现,明显发生交换的单株有6个,占到F2群体89个单株的6.74... 以分别携带有Ty1/Ty1.Ty3a/Ty3a和Ty1/Ty1.Ty3/Ty3的番茄材料09(1)和09(2)为亲本的F2群体的89个单株为研究对象,利用分子标记的方法对F2群体所有单株的抗病基因型进行检测。结果发现,明显发生交换的单株有6个,占到F2群体89个单株的6.74%。表明Ty1位点与Ty3位点之间属于不完全连锁关系且连锁较紧密,为番茄抗病基因Ty1和Ty3(或Ty3a)的聚合育种提供一定的理论依据。 展开更多

关键词 番茄黄化曲叶病毒病 ty1 ty3 抗病基因 连锁

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不同地理种群二化螟Ty3/gypsy反转座子天冬氨酰蛋白酶(AP)基因序列的克隆与分析

19

作者 李晓欢 罗光华 +1 位作者 韩召军 方继朝 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期530-537,共8页

【目的】Ty3/gypsy反转座子是广泛存在于生物体内的一类反转座子。反转座子上的天冬氨酰蛋白酶(aspartic protease,AP)基因是反转座子发生转座所需的一个重要基因。但由于该基因家族成员间变异较大,较难利用简并引物克隆得到该基因,所... 【目的】Ty3/gypsy反转座子是广泛存在于生物体内的一类反转座子。反转座子上的天冬氨酰蛋白酶(aspartic protease,AP)基因是反转座子发生转座所需的一个重要基因。但由于该基因家族成员间变异较大,较难利用简并引物克隆得到该基因,所以对该基因家族成员的研究很少。【方法】本研究采用PCR方法克隆了二化螟Ty3/gypsy反转座子的AP基因序列,并对其序列特征和地理种群变异进行了分析。【结果】克隆获得的二化螟Chilo suppressalis(Walker)Ty3/gypsy反转座子中的AP基因具有独立的开放阅读框(open reading frame,ORF),长528 bp,编码的蛋白含175个氨基酸残基(GenBank登录号:KF886014)。Conserved Domain Search在线工具分析显示,该蛋白中含有一个特异的Asp_protease_2保守功能域。从7个二化螟不同地理种群中共克隆获得70份AP基因拷贝。对同一基因座位上的AP序列多重比对分析,发现共存在46处碱基替换,其中碱基转换(transition)有31处,碱基颠换(transversion)有15处,70份拷贝中有69份拷贝是完整的ORF,能编码完整的蛋白。从碱基替换形式看,A→G的变异形式出现最多,有15处;其次是T→C的变异形式,有11处;其余的变异形式都很少。对比这7个不同地理种群,没有发现碱基的替换存在明显的地理区划差异。【结论】碱基的替换形式与二化螟所处的地理区域无明显相关性。本研究对于认识反转座子序列的变异特点有所帮助。 展开更多

关键词 二化螟 反转座子 ty3 GYPSY 天冬氨酰蛋白酶 基因克隆 序列分析

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桂花LTR类反转录转座子RT序列的克隆及分析 被引量：14

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作者 王庆竹 李慧平 +1 位作者 文晓鹏 范付华 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期309-320,共12页

克隆获得桂花Ty1-copia和Ty3-gypsy类反转录转座子反转录酶(reverse transcriptase,RT)序列,并对其序列变化特点进行分析,以期为桂花基因组进化和多样性研究提供依据。根据Ty1-copia和Ty3-gypsy类反转录转座子RT保守区设计简并引物,以... 克隆获得桂花Ty1-copia和Ty3-gypsy类反转录转座子反转录酶(reverse transcriptase,RT)序列,并对其序列变化特点进行分析,以期为桂花基因组进化和多样性研究提供依据。根据Ty1-copia和Ty3-gypsy类反转录转座子RT保守区设计简并引物,以桂花叶片基因组DNA为模板,通过PCR扩增,分别得到260和430 bp左右的目标条带,经回收、克隆、测序及相关生物信息学软件进行序列分析后,获得49条Ty1-copia类反转录转座子RT序列和20条Ty3-gypsy类反转录转座子RT序列。通过核苷酸聚类,Ty1-copia类反转录转座子RT序列分为4类。这些序列长度为255~271 bp,序列相似性为32.0%~96.9%。翻译成氨基酸后,有2条序列出现移码突变,16条序列出现终止密码子突变。Ty3-gypsy类反转录转座子RT序列也分为4类。序列长度为408~449 bp,相似性为54.7%~98.8%。有8条序列发生移码突变,10条序列发生终止密码子突变。经反转录转座子RT氨基酸序列比对,桂花与梅花、李、枣等可能有共同的起源。桂花Ty1-copia和Ty3-gypsy类反转录转座子RT序列具有高度异质性;系统进化树分析表明,桂花与不同物种间可能存在反转录转座子的横向传递。 展开更多

关键词 桂花 反转录转座子 ty1-copia ty3-gypsy 反转录酶 异质性

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