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题名甘蔗TB1基因的克隆与生物信息学分析
被引量：5
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作者
李旭娟
林秀琴
刘洪博
李纯佳
徐超华
刘新龙
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机构
云南省农业科学院甘蔗研究所云南省甘蔗遗传改良重点实验室
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出处
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2015年第11期1978-1985,共8页
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基金
国家自然科学基金(No.31360359)
云南省中青年学术技术带头人后备人才(No.2014HB038)
+2 种基金
云南省攻关项目(No.2012BB014)
经济作物种质资源发掘与创新利用(No.2013BAD01B03-15)
云南省应用基础研究计划青年项目(No.2015FD063)
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文摘
以负调控禾本科植物分蘖的关键基因TB1为研究对象,根据水稻、玉米、高粱TB1同源基因保守序列设计引物,使用RT-PCR方法和RACE技术从甘蔗茎尖处克隆到该基因的同源基因Sc TB1。Sc TB1 c DNA全长1 668 bp,包含274 bp的5′UTR,1 149 bp的CDS和245 bp的3′UTR。生物信息学分析表明该基因可编码382个氨基酸残基,编码产物含有保守的SP区、TCP区和R区,属于TCP家族转录因子。其分子量为40.7 ku,理论等电点为8.55,蛋白亚细胞定位预测其主要定位于细胞质。系统进化分析表明Sc TB1属于CYC/TB1亚族蛋白,与高粱TB1和玉米TB1聚为一个亚类。根据序列的保守性和预测结果可推测Sc TB1很可能也参与了甘蔗分蘖性状的调控。
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关键词
甘蔗
分蘖
tb1基因
克隆
生物信息学分析
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Keywords
Sugarcane
Tillering
tb1 gene
Cloning
Bioinformatics analysis
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分类号
S566.1
[农业科学—作物学]
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题名云南不同来源四路糯玉米waxy和tb1基因分析
被引量：2
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作者
武晓阳
隆文杰
陈丹
周国雁
杜娟
伍少云
蔡青
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机构
云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室
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出处
《安徽农业科学》
CAS
2020年第6期25-29,共5页
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基金
科技部、财政部国家科技基础条件平台国家农作物种质资源平台云南子平台(NICGR2018-030)
云南省博士后定向资助(云人社通〔2018〕168号)。
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文摘
[目的]为四路糯资源的保护、研究与开发利用特异资源提供科学依据。[方法]对8份云南不同来源的四路糯资源材料进行糯性基因waxy、分蘖基因tb1的测序及SSR分子标记分析,探讨不同来源四路糯的形成规律。[结果]试验所用糯玉米具有共同的突变类型wx-D10,即waxy基因第10外显子15-bp的缺失;检测控制分蘖的tb1基因发现,在四路糯中保留了2类不同的等位基因,并发现具有杂合基因型的植株存在;进一步利用40对SSR标记检测不同来源的四路糯,获得了27个多态性基因位点。[结论]试验所用四路糯有统一的起源,在形成后基因组内依然保留了大量多等位基因位点,由于四路糯在传播过程中发生不同等位基因的丢失,形成不同类型的四路糯。
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关键词
四路糯
WAXY基因
tb1基因
遗传分化
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Keywords
Four-row waxy maizes
Waxy gene
tb1 gene
genetic differentiation
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分类号
S513
[农业科学—作物学]
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