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海洋新放线菌及其次级代谢产物研究进展 被引量:21
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作者 王淑霞 朱天骄 +2 位作者 卢圳域 顾谦群 朱伟明 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第9期513-519,共7页
由于自身特殊的生存环境,海洋放线菌具有复杂独特的代谢途径,产生了诸多结构新颖、生物活性显著的次级代谢产物,这些活性代谢产物为新抗生素的发现提供了丰富的先导化合物,有些已经进入临床前研究。本文简要介绍近十几年从海洋样品中分... 由于自身特殊的生存环境,海洋放线菌具有复杂独特的代谢途径,产生了诸多结构新颖、生物活性显著的次级代谢产物,这些活性代谢产物为新抗生素的发现提供了丰富的先导化合物,有些已经进入临床前研究。本文简要介绍近十几年从海洋样品中分离到的放线菌新种属及其次级代谢产物研究概况。 展开更多
关键词 海洋放线菌 代谢产物 salinispora Verrucosispora Marinispora
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稀有海洋放线菌Salinispora arenicola非核糖体肽合成酶和卤代酶生物合成基因簇核心区的克隆及序列分析 被引量:10
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作者 马艳玲 邓海 +8 位作者 魏菁菁 郭秀红 刘中来 邓灵福 刘艳丽 郭建军 姚汉超 熊国梅 祁超 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期157-162,共6页
克隆稀有海洋放线菌Salinispora arenicola的非核糖体肽合成酶(NRPS)和卤代酶生物合成基因簇核心区基因片段。根据已发表的放线菌NRPS和卤代酶生物合成基因簇核心区的核苷酸序列保守区设计两对简并性引物,采用PCR的方法扩增NRPS和卤代... 克隆稀有海洋放线菌Salinispora arenicola的非核糖体肽合成酶(NRPS)和卤代酶生物合成基因簇核心区基因片段。根据已发表的放线菌NRPS和卤代酶生物合成基因簇核心区的核苷酸序列保守区设计两对简并性引物,采用PCR的方法扩增NRPS和卤代酶生物合成基因簇核心区基因片段,使用分子生物学软件进行序列分析。获得两段大小分别为662bp和557bp的基因片段,编码220个和185个氨基酸。这两段序列与海洋放线菌Salinispora arenicola CNS-205的NRPS和卤代酶生物合成基因簇核心区基因核苷酸序列的同源性分别为99%和98%。成功地获得了稀有海洋放线菌Salinispora arenicola的NRPS和卤代酶生物合成基因簇核心区基因片段,该基因片段的获取将为分离全长基因簇以及研究该基因簇在生物合成中的功能奠定基础。 展开更多
关键词 salinispora arenicola 腺苷酰化结构域 色氨酸卤代酶 系统进化
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西沙海藻共附生放线菌的分离鉴定及其抗菌活性评价 被引量:2
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作者 于伟伟 唐贤明 +4 位作者 熊子君 张世清 王蓉 曾晓起 郭志凯 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期1472-1489,共18页
【目的】为了探究南海海藻共附生放线菌资源的多样性及潜在的应用价值,对中国西沙群岛来源的海藻进行共附生放线菌的分离鉴定与抗菌活性筛选。【方法】利用稀释涂布平板法,采用2种不同分离培养基对不同采样位点的6种海藻进行放线菌分离... 【目的】为了探究南海海藻共附生放线菌资源的多样性及潜在的应用价值,对中国西沙群岛来源的海藻进行共附生放线菌的分离鉴定与抗菌活性筛选。【方法】利用稀释涂布平板法,采用2种不同分离培养基对不同采样位点的6种海藻进行放线菌分离;通过16S rRNA基因序列分析、构建系统发育树对分离的放线菌进行鉴定;用打孔法对无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)等10种敏感细菌进行抗菌活性筛选;对筛选得到的目标活性菌株HZ014进行全基因组测序,通过AntiSMASH在线工具分析其次级代谢产物生物合成基因簇,预测其产生新型活性物质的潜力。【结果】从6种海藻中分离得到36株共附生放线菌,基于16S rRNA基因序列比对和系统发育分析,鉴定结果为链霉菌属(Streptomyces)2株、红球菌属(Rhodococcus)2株、诺卡氏菌属(Nocardia)3株、小单孢菌属(Micromonospora)5株和盐孢菌属(Salinispora)24株;抗菌活性筛选结果表明,36株共附生放线菌发酵粗提物对至少1种敏感细菌表现出一定的抑制作用,不同菌株发酵粗提物的抗菌活性存在明显差异,盐孢菌发酵粗提物抑菌谱较另外4个属更广;AntiSMASH分析结果显示,菌株HZ014基因组中超过22.28%的基因序列与次级代谢产物合成相关,表明盐孢菌属存在巨大的生物合成潜能,值得深入发掘。【结论】西沙海藻中蕴藏着丰富的可培养稀有放线菌资源,首次从西沙海藻共附生环境中分离得到专性海洋稀有放线菌盐孢菌属,且分离得到的36株海藻共附生放线菌发酵粗提物对部分敏感细菌具有较好的抗菌活性,在渔业病害防治中具有潜在的开发应用价值,有望为海洋药物或生物菌剂的研发提供新资源。 展开更多
关键词 海藻 共附生放线菌 盐孢菌属 抗菌活性
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海洋放线菌盐孢菌属研究进展 被引量:1
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作者 房耀维 刘姝 +2 位作者 王淑军 吕明生 焦豫良 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期1203-1210,共8页
1991年,Jensen等从热带及亚热带海洋样品中分离获得了放线菌目专性海洋放线菌类群MAR1。根据形态学特征、生理生化特征及16S rRNA基因分析,提议该类群为新属——盐孢菌属(Salinospora)。2005年,盐孢菌属被正式报道,并将Salinospora更正... 1991年,Jensen等从热带及亚热带海洋样品中分离获得了放线菌目专性海洋放线菌类群MAR1。根据形态学特征、生理生化特征及16S rRNA基因分析,提议该类群为新属——盐孢菌属(Salinospora)。2005年,盐孢菌属被正式报道,并将Salinospora更正为Salinispora。盐孢菌属是放线菌目第一个被报道的专性海洋微生物属,可以产生丰富的活性次级代谢产物,使盐孢菌属成为海洋微生物研究的热点。短短几年内,相继报道了许多研究成果。本文从盐孢菌属的建立过程、属及所含种的分类特征、生理生态学研究、次级代谢产物和分子生物学研究等方面对盐孢菌属的研究进展进行综述。 展开更多
关键词 海洋放线菌 salinispora 分类 次级代谢产物
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专性海洋放线菌盐孢菌的研究进展 被引量:3
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作者 王可欣 陈柔雯 田新朋 《生物资源》 CAS 2018年第5期430-442,共13页
盐孢菌属(Salinispora)作为首个被报道的专性海洋放线菌,主要分布于热带和亚热带海洋沉积环境中,在海绵、海鞘中也有发现。与其他大多数放线菌一样,盐孢菌属的菌株可以产生大量具有抗细菌、抗病毒、抗肿瘤细胞活性、结构新颖的次级代... 盐孢菌属(Salinispora)作为首个被报道的专性海洋放线菌,主要分布于热带和亚热带海洋沉积环境中,在海绵、海鞘中也有发现。与其他大多数放线菌一样,盐孢菌属的菌株可以产生大量具有抗细菌、抗病毒、抗肿瘤细胞活性、结构新颖的次级代谢产物且表现出物种特异性。全基因组序列分析显示,盐孢菌属菌株基因组中超过10%的基因序列与次级代谢产物合成相关,但绝大多数生物合成基因簇编码的产物未被发现,表明盐孢菌属还存在巨大的生物合成潜能,有待深入发掘。目前新的培养方法、测序技术及生物信息学、基因组发掘技术、合成生物学技术的发展对提升盐孢菌属菌株新型药物的生产潜力发挥重要作用。本文对盐孢菌属的物种多样性、系统分类与化合物发现等方面的研究进行了系统综述。 展开更多
关键词 盐孢菌属 专性海洋放线菌 次级代谢产物 生物合成 基因组发掘
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Production and purification of a bioactive substance against multi-drug resistant human pathogens from the marine-sponge-derived Salinispora sp.
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作者 Satyendra Singh Pritesh Prasad +1 位作者 Ramesh Subramani William Aalbersberg 《Asian Pacific Journal of Tropical Biomedicine》 SCIE CAS 2014年第10期825-831,共7页
Objective:To isolate,purify,characterize,elucidate structure and evaluate bioactive compounds from the sponge-derived Salinispora sp.FS-0034.Methods:The symbiotic actinomycete strain FS-0034 with an interesting bioact... Objective:To isolate,purify,characterize,elucidate structure and evaluate bioactive compounds from the sponge-derived Salinispora sp.FS-0034.Methods:The symbiotic actinomycete strain FS-0034 with an interesting bioactivity profile was isolated from the Fijian marine sponge Theonella sp.Based on colony morphology and obligatory requirement of seawater for growth,and mycelia morphological characteristics the isolate FS-0034 was identified as a Salinispora sp.The bioactive compound was identified by using various spectral analysis of ultraviolet,high resolution electrospray ionization mass spectroscopy,H nuclear magnetic resonance,correlated spectroscopy and heteronuclear multiple bond coherence spectral data.A minimum inhibitory concentration assay were performed to evaluate the biological properties of the pure compound against multi-drug resistant pathogens.Results:Bioassay guided fractionation of the ethyl acetate extract of the culture of Salinispora sp.FS-0034 by different chromatographic methods yielded the isolation of an antibacterial compound,which was identified as rifamycin W(compound 1).Rifamycin W was reported for its potent antibacterial activity against methicillin-resistant Staphylococcus aureus,wild type Staphylococcus aureus and vancomycin-resistant Enterococcus faecium and displayed minimum inhibitory concentrations of 15.62,7.80 and 250.00 μg/mL,respectively.Conclusions:The present study reported the rifamycin W from sponge-associated Salinispora sp.and it exhibited appreciable antibacterial activity against multi-drug resistant human pathogens which indicated that sponge-associated Actinobacteria are significant sources of bioactive metabolites. 展开更多
关键词 MARINE ACTINOMYCETES Sponge-derived salinispora Multi-drug resistant ANTIBACTERIAL RIFAMYCIN
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海洋放线菌(Salinispora arenicola)基因转移系统的建立
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作者 马艳玲 李海贤 +3 位作者 翁萍 刘泽璇 许小庆 曾荣 《中国酿造》 CAS 北大核心 2018年第3期131-134,共4页
该实验旨在建立海洋放线菌Salinispora arenicola基因转移系统,以便基因敲除和外源基因表达等遗传操作。以整合型质粒pSET152和p IB139为出发质粒,通过接合转移构建了海洋放线菌Salinispora arenicola的基因转移系统。结果表明,25μg/m ... 该实验旨在建立海洋放线菌Salinispora arenicola基因转移系统,以便基因敲除和外源基因表达等遗传操作。以整合型质粒pSET152和p IB139为出发质粒,通过接合转移构建了海洋放线菌Salinispora arenicola的基因转移系统。结果表明,25μg/m L阿泊拉霉素可有效筛选接合子,大肠杆菌与孢子的比例为8:1时可获得较多的转化子。经聚合酶链式反应(PCR)验证,质粒成功整合到菌株海洋放线菌S.arenicola基因组中,接合子经多次传代后,导入的质粒pSET152和pIB139仍稳定整合于接合子基因组上。成功构建了海洋放线菌S.arenicola接合转移系统。 展开更多
关键词 海洋放线菌 salinispora arenicola 接合转移 遗传稳定性
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一株海洋专性放线菌的分类鉴定及其抑菌活性 被引量:7
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作者 房耀维 王淑军 +4 位作者 刘姝 吕明生 焦豫良 陈国强 潘建梅 《农药》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期136-139,152,共5页
[目的]对一株海洋专性放线菌进行菌种鉴定,并考察其抑菌物质的性质。[方法]通过形态特征、生理生化特性以及16S rRNA基因序列分析,对专性海洋放线菌CMZ023进行鉴定;采用管碟法测定抑菌谱;测定菌株CMZ023抑菌物质的性质。[结果]鉴定菌株C... [目的]对一株海洋专性放线菌进行菌种鉴定,并考察其抑菌物质的性质。[方法]通过形态特征、生理生化特性以及16S rRNA基因序列分析,对专性海洋放线菌CMZ023进行鉴定;采用管碟法测定抑菌谱;测定菌株CMZ023抑菌物质的性质。[结果]鉴定菌株CMZ023为Salinispora arenicola,该菌对革兰氏阴性细菌、革兰氏阳性细菌、啤酒酵母以及多种植物病原真菌均有拮抗作用。其抑菌物质粗提液耐酸碱、耐高温,紫外照射不影响抑菌活性。[结论]该菌株具有开发成新型广谱生物农药的潜力。 展开更多
关键词 专性海洋放线菌 盐孢菌 鉴定 抑菌物质
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西沙石珊瑚共附生放线菌的分离培养及抗菌活性评价 被引量:1
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作者 李依霖 熊子君 +2 位作者 张世清 王蓉 郭志凯 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期1756-1771,共16页
【背景】珊瑚礁生态系统是海洋中一类极其重要的生态系统,健康珊瑚礁中丰富的共附生放线菌群体是珊瑚抵御各种致病菌的重要防线,因此,这类放线菌是寻找抗菌活性分子的重要资源,其药用潜力巨大。【目的】从西沙石珊瑚样品中分离共附生放... 【背景】珊瑚礁生态系统是海洋中一类极其重要的生态系统,健康珊瑚礁中丰富的共附生放线菌群体是珊瑚抵御各种致病菌的重要防线,因此,这类放线菌是寻找抗菌活性分子的重要资源,其药用潜力巨大。【目的】从西沙石珊瑚样品中分离共附生放线菌,并从中筛选具有良好抗菌活性的菌株。【方法】通过稀释涂布法分离珊瑚共附生放线菌,并根据16S rRNA基因序列构建系统发育树进行菌种鉴定;通过平板对峙法对放线菌进行抗菌活性筛选并确定目标菌株;将目标菌株涂布于不同氯化钠浓度的ISP2固体培养基上培养,测试其盐度耐受能力;通过平板对峙法对该菌株发酵产物的热稳定性和光稳定性进行测试;采用NanoPore和Illumina方法完成目标活性放线菌全基因组测序,并通过antiSMASH在线分析预测其次级代谢产物生物合成基因簇及其结构类型。【结果】从6份西沙石珊瑚样品中分离得到104株可培养放线菌,根据菌落形态和分离来源去重后对其中27株放线菌进行16S rRNA基因序列测序,通过序列比对和系统发育树分析将菌株初步鉴定为盐孢菌属(Salinispora)(25株)、链霉菌属(Streptomyces)(1株)和戈登菌属(Gordonia)(1株)。活性筛选结果表明,盐孢菌株SH098抑菌活性最好,该菌株在无盐的培养基中不生长,盐耐受范围为2%−5%,其发酵产物的抗菌活性具有良好的热稳定性和光稳定性。全基因组序列分析显示,盐孢菌株SH098基因组中21.93%的基因序列与次级代谢产物合成相关,预测的次级代谢产物结构类型多样,有待深入发掘。【结论】首次从我国西沙石珊瑚中分离得到具有嗜盐特性和抗农业病原细菌活性的盐孢菌,丰富了我国西沙海域来源的专性海洋放线菌资源,为海水养殖业的新型微生态制剂的研发提供新菌种资源,也为后期挖掘新型抗菌活性物质奠定了研究基础。 展开更多
关键词 石珊瑚 共附生放线菌 分离培养 沙栖盐孢菌 抗菌活性
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Salinispora Arenicola CNP193新颖NRPS基因簇在Streptomycetes Coelicolor M512中的异源表达
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作者 刘姝 房耀维 +3 位作者 王淑军 焦豫良 胡晟源 潘建梅 《科学技术与工程》 北大核心 2017年第2期161-164,共4页
异源表达海洋专性放线菌salinispora arenicola CNP193新颖NRPS基因簇。PCR扩增基因簇两端各约1 000 bp的片段,融合PCR将两片段融合,同质粒pC AP01双酶切后连接,构建基因簇捕获载体pC AP01-preP KS/NRPS,通过TAR(transformation-associa... 异源表达海洋专性放线菌salinispora arenicola CNP193新颖NRPS基因簇。PCR扩增基因簇两端各约1 000 bp的片段,融合PCR将两片段融合,同质粒pC AP01双酶切后连接,构建基因簇捕获载体pC AP01-preP KS/NRPS,通过TAR(transformation-associated recombination)克隆技术构建基因簇捕获质粒pC AP01-PKS/NRPS,运用三亲接合转移法将pC AP01-PKS/NRPS转化streptomycetes coelicolor M512。HPLC检测对照菌株和重组菌发酵液乙酸乙酯提取物初步表明基因簇有表达产物产生。为新颖salinispora arenicola CNP193新颖NRPS基因簇的鉴定奠定基础。 展开更多
关键词 海洋专性放线菌 基因簇 异源表达
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稀有海洋放线菌Salinispora arenicola CNH643 DSM 44819的sare4854基因异源表达对链霉菌抗生素产量的影响
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作者 舒晓 余金龙 +8 位作者 吴绍文 张巍 马艳玲 朱珉喆 夏思思 夏诗超 张浩 李爱英 祁超 《华中师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2014年第1期75-79,85,共6页
稀有海洋放线菌Salinispora arenicola CNH643DSM 44819的sare4854基因编码1个典型的SARP,但其确切功能没有得到认证.为了研究sare4854基因的功能,我们在链霉菌Streptomyces sp.AM-7161中异源表达了sare4854基因.实验结果表明,对比野生... 稀有海洋放线菌Salinispora arenicola CNH643DSM 44819的sare4854基因编码1个典型的SARP,但其确切功能没有得到认证.为了研究sare4854基因的功能,我们在链霉菌Streptomyces sp.AM-7161中异源表达了sare4854基因.实验结果表明,对比野生菌,转化子中抗生素的产量被明显抑制.生物信息学分析表明,sare4854除了与编码SARPs蛋白家族中的其他1样在N-端编码1个SARP样结构域外,在其C-端还编码有1个核苷三磷酸水解酶(nucleoside triphosphate hydrolases,NTPase)结构域.这可能是sare4854基因对Streptomyces sp.AM-7161抗生素产量负调控的主要作用机制. 展开更多
关键词 sare4854 SARP 放线菌 抗生素产量
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