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玉米SSR遗传图谱的构建及产量性状基因定位 被引量：90
1
作者 向道权 曹海河 +4 位作者 曹永国 杨俊品 黄烈健 王守才 戴景瑞 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第8期778-784,共7页
利用中国农大培育的高产、多抗性玉米杂交组合农大３１３８的Ｆ２．３家系为材料，构建了具 有８０对ＳＳＲ标记的玉米遗传图谱，标记间平均距离２５．４２，覆盖玉米基因组的２０３３．４ｃｍ。采用 随机区组田间设计，考察了２３０个... 利用中国农大培育的高产、多抗性玉米杂交组合农大３１３８的Ｆ２．３家系为材料，构建了具 有８０对ＳＳＲ标记的玉米遗传图谱，标记间平均距离２５．４２，覆盖玉米基因组的２０３３．４ｃｍ。采用 随机区组田间设计，考察了２３０个家系的穗长、秃尖长、穗粗、穗行数、行籽数、千粒重、穗重、单 株粒重，利用区间作图法分析了影响各性状的数量性状基因座位（ＱＴＬ），共检测到３０个 ＱＴＬｓ。单个性状的ＱＴＬｓ为３～５个。ＱＴＬｓ解释变异量占总变异量的比例变化范围为９．５％～ ５５．３％． 展开更多
关键词 遗传图谱 ssr标记 产量性状 QTLS 玉米 基因定位
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开发SSR引物方法之研究动态 被引量：78
2
作者 李明芳 郑学勤 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期769-776,共8页
SSR标记是一种基于DNA长度多态性的分子标记技术,是进行群体遗传结构分析、构建遗传连锁图谱非常有效的工具。由于SSR标记是特异引物标记,必须在知道某个物种DNA序列的前提下,才能设计引物进行PCR扩增,故而存在一个引物开发的问题。从SS... SSR标记是一种基于DNA长度多态性的分子标记技术,是进行群体遗传结构分析、构建遗传连锁图谱非常有效的工具。由于SSR标记是特异引物标记,必须在知道某个物种DNA序列的前提下,才能设计引物进行PCR扩增,故而存在一个引物开发的问题。从SSR标记的发展历程来看,开发SSR引物的方法有经典的构建与筛选基因组文库的方法、微卫星富集法、省略筛库法和数据库搜索法等四种。综述了这4种方法的操作流程及其在实际应用中的优缺点,并对近年来SSR引物在相近的物种间转移使用的情况作了介绍。 展开更多
关键词 ssr标记 ssr引物 开发ssr引物 ssr引物的可转移性
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利用SSR和ISSR标记技术构建西瓜分子遗传图谱 被引量：61
3
作者 易克 徐向利 +4 位作者 卢向阳 许勇 肖浪涛 王永健 康国斌 《湖南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期333-337,共5页
为了促进西瓜饱和遗传图谱的构建、重要农艺性状的QTL分析以及以图谱为基础的克隆,利用可溶性固形物含量高、皮薄、感枯萎病的栽培西瓜自交系97103和可溶性固形物含量低、皮厚、抗病的野生西瓜种质PI296341为亲本,获得F8的重组自交系群... 为了促进西瓜饱和遗传图谱的构建、重要农艺性状的QTL分析以及以图谱为基础的克隆,利用可溶性固形物含量高、皮薄、感枯萎病的栽培西瓜自交系97103和可溶性固形物含量低、皮厚、抗病的野生西瓜种质PI296341为亲本,获得F8的重组自交系群体.通过16个SSR引物对和5个ISSR引物对该群体进行扩增,建立了一个包括38个SSR标记和10个ISSR标记组成的分子图谱,该图谱总长558.1cM,平均图距为11.9cM. 展开更多
关键词 ssr标记 Issr标记 分子遗传图谱 西瓜
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利用SSR标记进行优质冬小麦品种(系)的遗传多样性研究 被引量：65
4
作者 陈新民 何中虎 +4 位作者 史建荣 夏兰芹 Rick Ward 周阳 蒋国梁 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期13-19,共7页
遗传多样性研究对于作物育种具有重要意义。选择分布于 2 1条小麦染色体上的 5 9对 SSR引物对 4 8个优质冬小麦新品种 (系 )进行了遗传多样性分析。共检测出 2 0 9个等位位点 ,每对引物等位位点数在 2～ 9之间 ,平均为 3.5个。位点多态... 遗传多样性研究对于作物育种具有重要意义。选择分布于 2 1条小麦染色体上的 5 9对 SSR引物对 4 8个优质冬小麦新品种 (系 )进行了遗传多样性分析。共检测出 2 0 9个等位位点 ,每对引物等位位点数在 2～ 9之间 ,平均为 3.5个。位点多态性信息含量 PIC变幅为 0 .16～ 0 .87,平均 0 .5 6。 8个引物组合在一起可将全部品种区分开来 ,4 8个品种可分为五类 ,分类结果与品种系谱比较吻合。结果表明 SSR分子标记在鉴别品种和品种遗传多样性研究方面具有重要作用。 展开更多
关键词 ssr标记 冬小麦 品种 遗传多样性 品种鉴别
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采用分子标记构建新疆野苹果核心种质的方法 被引量：49
5
作者 张春雨 陈学森 +4 位作者 张艳敏 苑兆和 刘遵春 王延龄 林群 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期597-604,共8页
【目的】探讨分子水平构建核心种质的方法,为新疆野苹果核心种质的构建提供方法。【方法】以109个新疆野苹果实生株系的128个SSR位点为材料,根据Nei&Li、SM和Jaccard遗传距离,采用UPGMA聚类法进行多次聚类,以随机取样策略为对照取... 【目的】探讨分子水平构建核心种质的方法,为新疆野苹果核心种质的构建提供方法。【方法】以109个新疆野苹果实生株系的128个SSR位点为材料,根据Nei&Li、SM和Jaccard遗传距离,采用UPGMA聚类法进行多次聚类,以随机取样策略为对照取样策略,应用位点优先取样策略,研究新疆野苹果核心种质构建的方法。采用丢失的等位基因数以及对Nei’s基因多样度和香农信息指数进行t检验来评价核心种质的代表性。【结果】与对照随机取样策略比较,位点优先取样策略能构建一个更有代表性的核心种质。SM、Jaccard和Nei&Li遗传距离构建的新疆野苹果核心种质无明显区别。采用SRAP数据和表型数据分析显示,位点优先取样策略是一种较好的构建新疆野苹果核心种质的方法。【结论】采用位点优先法,根据SM、Jaccard或Nei&Li遗传距离进行多次聚类,是较适宜的构建新疆野苹果核心种质的方法。 展开更多
关键词 新疆野苹果 核心种质 位点优先取样策略 遗传距离 ssr标记 SRAP标记
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长江春大豆核心种质构建及分析 被引量：37
6
作者 王丽侠 李英慧 +7 位作者 李伟 朱莉 关媛 宁学成 关荣霞 刘章雄 常汝镇 邱丽娟 《生物多样性》 CAS CSCD 2004年第6期578-585,共8页
利用长江春大豆初选核心种质SSR(simplesequencerepeat)标记和农艺性状表型等基础数据 ,对用不同个体取样方法以及不同数据类型建立的核心种质进行评价 ,目的是为确定中国大豆 (Glycinemax)核心种质的最佳取样策略提供依据。结果表明 ,... 利用长江春大豆初选核心种质SSR(simplesequencerepeat)标记和农艺性状表型等基础数据 ,对用不同个体取样方法以及不同数据类型建立的核心种质进行评价 ,目的是为确定中国大豆 (Glycinemax)核心种质的最佳取样策略提供依据。结果表明 ,根据SSR分子数据聚类 ,采用类内随机取样、类内以遗传相似性系数取样以及仅依据遗传相似性系数取样都可用于大豆核心种质构建。但是综合不同评价参数发现 ,以类内随机取样最佳 ,类内按遗传相似性系数取样次之 ,单独以遗传相似性系数取样较差。分析不同SSR等位变异保留比例的遗传多样性指数发现 ,当保留 90 %和 80 %的SSR等位变异时 ,核心种质具有更高的遗传多样性。由于与SSR分子数据对种质遗传关系评价的不一致性 ,农艺性状等基础数据虽然可用来构建核心种质 ,但其SSR分子水平代表性相对较低。本研究结果还表明 ,用不同方法或同一方法不同重复次数取样建立的核心种质具有异质性 ,且这种异质性随核心种质取样比例的降低而增大。因此 ,虽然可依据不同数据类型确定相应的方法建立核心种质 ,但综合表型和分子数据建立的核心种质更具有代表性。 展开更多
关键词 ssr分子标记 农艺性状 聚类分析 等位变异保留比例 取样策略
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利用SSR分子标记快速鉴定杂交水稻种子纯度技术体系的优化 被引量：42
7
作者 刘之熙 陈祖武 +2 位作者 朱克永 李召华 詹庆才 《杂交水稻》 CSCD 北大核心 2008年第1期60-63,共4页
针对目前SSR分子标记技术快速鉴定杂交水稻种子纯度方法商业化应用的限制因素,从DNA提取、PCR反应体系和程序及凝胶电泳等方面进行了技术体系的优化。原方法经优化后,DNA提取时间从每次5h以上减少到2.5min,PCR反应过程从200min缩短至65m... 针对目前SSR分子标记技术快速鉴定杂交水稻种子纯度方法商业化应用的限制因素,从DNA提取、PCR反应体系和程序及凝胶电泳等方面进行了技术体系的优化。原方法经优化后,DNA提取时间从每次5h以上减少到2.5min,PCR反应过程从200min缩短至65min,改聚丙烯酰胺凝胶电泳为琼脂糖凝胶电泳,电泳时间由3.0-3.5h缩短为1h,且通过减少dNTP、Taq酶的用量,对琼脂糖凝胶反复利用,大大降低了成本,减少了废弃物的污染,从而建立了准确、简单、快速、成本低廉的快速鉴定杂交稻种子纯度的技术体系。 展开更多
关键词 杂交水稻 ssr分子标记 纯度鉴定 技术体系优化
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利用SSR标记鉴定鲁棉研15号杂交种纯度的研究 被引量：37
8
作者 刘勤红 王芙蓉 +3 位作者 张军 杨静 李汝忠 王宗文 《山东农业科学》 2003年第2期7-9,16,共4页
杂交棉制种中的主要问题是由于去雄不彻底导致的制种亲本尤其是母本的混杂。传统的纯度鉴定方法要到下个生长季节才能进行 ,陆地棉品种间杂交种纯度的早期准确鉴定是一个比较难以解决的问题。本研究筛选了 2 17对异源四倍体棉花的SSR引... 杂交棉制种中的主要问题是由于去雄不彻底导致的制种亲本尤其是母本的混杂。传统的纯度鉴定方法要到下个生长季节才能进行 ,陆地棉品种间杂交种纯度的早期准确鉴定是一个比较难以解决的问题。本研究筛选了 2 17对异源四倍体棉花的SSR引物 ,获得了十几个足以区分鲁棉研 15号父母本及其F1的标记位点 ,为鲁棉研 15号杂交种的纯度鉴定提供了一个准确、稳定和快捷、实用的方法。 展开更多
关键词 棉花 鲁棉研15号杂交种 纯度鉴定 ssr标记
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水稻SSR标记在RI群体的偏分离分析 被引量：31
9
作者 彭勇 梁永书 +4 位作者 王世全 吴发强 李双成 邓其明 李平 《分子植物育种》 CAS CSCD 2006年第6期786-790,共5页
以完成了部分测序的培矮64s和全基因组测序已经完成了的粳稻日本晴(Nipponbare)为亲本杂交得到的F6群体作为构图群体,共330个单株,构建了一张含92个微卫星标记的水稻分子遗传图谱。结果发现该F6群体有较高的偏分离现象,有63个分子标记... 以完成了部分测序的培矮64s和全基因组测序已经完成了的粳稻日本晴(Nipponbare)为亲本杂交得到的F6群体作为构图群体,共330个单株,构建了一张含92个微卫星标记的水稻分子遗传图谱。结果发现该F6群体有较高的偏分离现象,有63个分子标记表现偏分离(P<0.05),占总标记数的68.47%,在这些偏分离标记中,有60个标记偏向母本培矮64s,我们对这种偏分离现象和原因进行了分析讨论。 展开更多
关键词 ssr标记 偏分离 重组自交系 水稻
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大豆遗传图谱的构建和若干农艺性状的QTL定位分析 被引量：29
10
作者 杨喆 关荣霞 +4 位作者 王跃强 刘章雄 常汝镇 王曙明 邱丽娟 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 2004年第4期309-314,323,共7页
大豆许多重要农艺性状都是由微效多基因控制的数量性状 ,对这些数量性状进行QTL定位是大豆数量性状遗传研究领域的一个重要内容。本研究利用栽培大豆科新 3号为父本、中黄 2 0为母本杂交得到含 192个单株的F2 分离群体 ,构建了含 12 2个... 大豆许多重要农艺性状都是由微效多基因控制的数量性状 ,对这些数量性状进行QTL定位是大豆数量性状遗传研究领域的一个重要内容。本研究利用栽培大豆科新 3号为父本、中黄 2 0为母本杂交得到含 192个单株的F2 分离群体 ,构建了含 12 2个SSR标记、覆盖 1719 6cM、由 33个连锁群组成的连锁遗传图谱。利用复合区间作图法 ,对该群体的株高、主茎节数、单株粒重和蛋白质含量等农艺性状的调查数据进行QTL分析 ,共找到两个株高QTL ,贡献率分别为 9 15 %和 6 0 8% ;两个主茎节数QTL ,贡献率分别为 10 1%和 8 6 % ;一个蛋白质含量QTL ,贡献率为 9 8% ;一个单株粒重QTL ,贡献率为11 4 %。通过遗传作图共找到与所定位的 4个农艺性状QTL连锁的 6个SSR标记 ,这些标记可以应用于大豆种质资源的分子标记辅助选择 ,从而为大豆分子标记辅助育种提供理论依据。 展开更多
关键词 QTL定位 大豆 农艺性状 单株 遗传图谱 株粒重 主茎 连锁群 研究利用 豆科
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利用SSR标记分析藜麦品种的遗传多样性 被引量：40
11
作者 陆敏佳 蒋玉蓉 +2 位作者 陆国权 陈国林 毛前 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期260-269,共10页
为了解藜麦种质资源的多样性,本研究利用SSR引物对所搜集的41个藜麦种质的多态性及其亲缘关系进行了分析。结果表明,从54对SSR引物中筛选出了16对能明显扩增出稳定的多态性条带的引物,共检测出139个等位基因条带,每一对引物的等位基因... 为了解藜麦种质资源的多样性,本研究利用SSR引物对所搜集的41个藜麦种质的多态性及其亲缘关系进行了分析。结果表明,从54对SSR引物中筛选出了16对能明显扩增出稳定的多态性条带的引物,共检测出139个等位基因条带,每一对引物的等位基因个数为3~13,平均为8.7;16对引物的多态信息含量（PIC）变幅为0.208~0.432,平均为0.366。UPGMA聚类分析显示,41份材料的遗传相似系数（GS）在0.374~0.906之间,平均相似系数为0.626。在阀值（GS）约为0.665时,41份材料可分为4大类。其中614929与B.B.Quinoa浙Ⅰ间的遗传相似系数最小,为0.374,表明来源于不同地区的遗传距离较远,遗传基础较广泛。藜麦品种资源间的亲缘关系的揭示为藜麦资源保存和新品种选育提供了理论依据。 展开更多
关键词 藜麦 种质资源 ssr分子标记 遗传多样性
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用SSR标记划分云南糯玉米地方品种资源遗传类群的研究 被引量：33
12
作者 张金渝 张建华 +6 位作者 杨晓洪 金航 王波 肖植文 孔令明 米艳华 华秋瑾 《玉米科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期53-58,共6页
利用SSR标记对37个云南糯玉米地方品种遗传多样性和遗传关系进行研究,和5个国内主要自交系进行优势群的划分。结果表明:从国内外所用的63对核心引物中筛选出PIC值高、稳定的20对玉米核心SSR引物扩增出225个等位基因,平均多态信息量PIC值... 利用SSR标记对37个云南糯玉米地方品种遗传多样性和遗传关系进行研究,和5个国内主要自交系进行优势群的划分。结果表明:从国内外所用的63对核心引物中筛选出PIC值高、稳定的20对玉米核心SSR引物扩增出225个等位基因,平均多态信息量PIC值为0.87、标记索引系数MI值9.91、Shannon多样性指数I为0.54;37个云南糯玉米地方品种可划分为5大类群13个小类群;少数的云南糯玉米种质资源与常见的5大杂种优势群的遗传距离较近,而大多数资源则较远,可形成多个单独的类群,云南糯玉米地方种质资源具有广泛的遗传基础;来自不同地区或来自同一地区不同云南糯玉米资源与5大优势群之间的遗传相似度均有很大差异。 展开更多
关键词 糯玉米 遗传多样性 遗传类群划分 ssr标记
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中国西部芥菜型油菜遗传多样性研究 被引量：34
13
作者 徐爱遐 马朝芝 +6 位作者 肖恩时 权景春 马长珍 田广文 涂金星 傅廷栋 张改生 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期754-763,共10页
利用23对SRAP引物、11对AFLP引物和10对SSR引物对我国西部地区的芥菜型油菜及其近缘种108份材料进行了遗传多样性分析,共检测到313个等位变异,3种标记的每对引物平均分别可检测到6.8、12.5和1.9个等位变异。包括白菜型和芸芥在内的108... 利用23对SRAP引物、11对AFLP引物和10对SSR引物对我国西部地区的芥菜型油菜及其近缘种108份材料进行了遗传多样性分析,共检测到313个等位变异,3种标记的每对引物平均分别可检测到6.8、12.5和1.9个等位变异。包括白菜型和芸芥在内的108份品种间遗传相似系数在0.378-0.936之间,103份芥菜型油菜品种间遗传相似系数在0.545-0.936之间。聚类分析结果表明,在相似系数0.558处,5个参照品种白菜型油菜、小白菜以及芸芥首先被聚出芥菜型油菜之外;在相似系数0.70处,103份芥菜型油菜可分为云贵陕南冬播（A）、关中冬播（B）、新疆I（C）、新疆II（D）和西部春播（E）五个类群,其中A、B基本为冬播品种,C、D、E为春播品种。A类群品种间遗传差异最大,B类群其次。陕西和新疆的品种均分别被聚到3个类群,表现出更广泛的遗传多样性。春播类型绝大部分被聚到E类群,E类群可分为3个亚类,其中陕北及其邻近一带春播黄芥为一类,形成一个独立的遗传群体,群内遗传多样性较高;西藏的10个品种为一类,相似系数高达0.83以上,表现出西藏品种遗传系统的独立和遗传基础的单一;澳大利亚2个品种单独为一类,与我国的春播品种关系较近。由此说明,地理和生态条件是影响芥菜型油菜类群的主要因素,我国的冬播品种间的遗传多样性高于春播品种,陕西和新疆的芥菜型油菜遗传多样性较高。 展开更多
关键词 芥菜型油菜 遗传多样性 SRAP标记 AFLP标记 ssr标记
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SSR标记及其在作物遗传育种中的应用 被引量：16
14
作者 席章营 张桂权 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 2002年第3期293-297,共5页
概述了SSR标记在农作物基因组中的分布、功能、方法及其在农作物遗传育种中的应用 ,探讨了该技术存在的问题及发展趋势 .
关键词 ssr标记 作物 遗传育种 应用 PCR 遗传图谱 标记辅助选择
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30个粳稻品种SSR标记遗传多样性分析 被引量：36
15
作者 赵庆勇 张亚东 +3 位作者 朱镇 赵凌 陈涛 王才林 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期218-223,共6页
选用分布于水稻12条染色体上的64对SSR引物,对江苏省育成以及日本引进的粳稻品种共30份材料进行遗传多样性分析。结果表明,有50对SSR引物在30个品种间表现为多态性。共检测到140个等位基因,每对引物的等位基因数变幅为2～5个,平均为2.8... 选用分布于水稻12条染色体上的64对SSR引物,对江苏省育成以及日本引进的粳稻品种共30份材料进行遗传多样性分析。结果表明,有50对SSR引物在30个品种间表现为多态性。共检测到140个等位基因,每对引物的等位基因数变幅为2～5个,平均为2.8个。有效等位基因为94.336个,平均为1.887。每个SSR位点的多态性信息量(PIC)变化范围为0.064～0.752,平均为0.410。30个品种间的遗传相似系数变幅为0.386～0.956之间,平均值为0.719,且81.4%的供试品种其遗传相似系数在0.600～0.800之间,亲缘关系较近;以遗传相似系数为原始数据,按UPGMA方法将30个品种划分为3大类群,结合系谱分析结果表明,江苏省育成的水稻品种遗传多样性不够丰富,多数品种间的亲缘关系较近,欲进一步提高江苏省水稻产量还需拓宽亲本选择范围,扩大遗传背景。 展开更多
关键词 粳稻 ssr标记 遗传多样性 聚类分析
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我国部分优质小麦品种遗传差异的SSR标记分析 被引量：28
16
作者 郭小丽 刘冬成 +1 位作者 罗铮 张爱民 《麦类作物学报》 CAS CSCD 2004年第1期1-5,共5页
为了解我国优质小麦的遗传多样性,利用108对SSR引物对36个优质小麦品种和12个来自不同生态区的普通品种进行了遗传差异分析和比较研究。结果表明,108对引物共扩增出705个等位位点,平均每个位点有6.53个等位变异,其中B染色体组位点的等... 为了解我国优质小麦的遗传多样性,利用108对SSR引物对36个优质小麦品种和12个来自不同生态区的普通品种进行了遗传差异分析和比较研究。结果表明,108对引物共扩增出705个等位位点,平均每个位点有6.53个等位变异,其中B染色体组位点的等位变异最多。全部48个品种的聚类结果、36个优质小麦品种的聚类结果及根据 和 部分同源群聚类的结果均相似,聚类结果和品种的系谱来源及地域相吻合。比较了4种有代表性的双核苷酸重复基序(CT)n、(GA)n、(GT)n、(CA)n的等位位点数目,发现小麦中这4种双核苷酸重复基序的顺序为:(CT)n>(GA)n>(GT)n>(CA)n。 展开更多
关键词 优质小麦 品种 遗传差异 ssr标记 遗传多样性
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甜瓜SSR标记遗传多样性的研究 被引量：31
17
作者 盛云燕 栾非时 陈克农 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 2006年第2期165-170,共6页
采用50对SSR特异引物对甜瓜栽培品种(系)进行分析,其中48对扩增出谱带,46对引物具有多样性。扩增带分子量在250￣1750bp之间,187条谱带中有130条谱带具有多态性(占69.52%),平均每个引物可扩增出3.729条带。46份材料经过NTSYS软件分析后... 采用50对SSR特异引物对甜瓜栽培品种(系)进行分析,其中48对扩增出谱带,46对引物具有多样性。扩增带分子量在250￣1750bp之间,187条谱带中有130条谱带具有多态性(占69.52%),平均每个引物可扩增出3.729条带。46份材料经过NTSYS软件分析后分为9组,从9组中再选取21个具有代表性材料重新进行聚类,应用NTSYS软件的立体旋转模拟分析和聚类分析两种方法。结果表明,21份材料分为8组,15份材料具有相同的分析结果,6份材料具有不同的分析结果。聚类结果显示21份材料可分为绿麻瓜类、黄白皮瓜类、白皮瓜类、面瓜类、菜瓜类等几个类型,基本与形态学分类相似,但也有特殊性,如花皮面瓜聚到绿麻瓜一类中。分析结果说明这两种方法具有各自的特点,要根据研究目的来选择和确定分析方法。此外,运用分子标记的方法可以提高甜瓜栽培品种多样性分析的准确性。 展开更多
关键词 甜瓜 遗传多样性 ssr标记
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香稻品种的遗传多样性研究 被引量：32
18
作者 张涛 郑家奎 +3 位作者 徐建第 蒋开锋 吴先军 汪旭东 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期625-635,共11页
【目的】研究香稻品种的遗传多样性。【方法】利用分布于12条水稻染色体上的60个SSR引物和22个水稻功能基因标记检测了32个香稻品种的遗传多样性。【结果】60对SSR引物共检测出188个等位基因,其中有效等位基因数126个。每对引物等位基... 【目的】研究香稻品种的遗传多样性。【方法】利用分布于12条水稻染色体上的60个SSR引物和22个水稻功能基因标记检测了32个香稻品种的遗传多样性。【结果】60对SSR引物共检测出188个等位基因,其中有效等位基因数126个。每对引物等位基因数在2～6之间,平均为3.13个。多态性信息含量(PIC)变幅为0.116～0.744,平均为0.467±0.175。32个品种间的遗传相似系数在0.51～0.96之间,平均为0.697。聚类分析将32个香稻品种在遗传相似系数0.58处分为籼、粳两类,分类结果与品种系谱分析比较吻合。【结论】SSR分子标记在香稻品种遗传多样性分析和育种应用方面具有重要价值。功能基因标记检测表明,部分功能基因在所研究材料中不存在等位变异。而存在等位变异的功能基因标记则表明不同产地来源、不同生态类型的香稻品种具有不同的等位基因。抗稻瘟病基因标记检测出宜香B、香恢1号和丝苗香3个品种同时含有两个抗稻瘟病等位基因,为香稻抗性育种提供了材料基础。 展开更多
关键词 香稻 ssr标记 遗传多样性 聚类分析 功能基因
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基于SSR标记的黍稷种质资源遗传多样性及亲缘关系研究 被引量：33
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作者 薛延桃 陆平 +2 位作者 乔治军 刘敏轩 王瑞云 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第15期2846-2859,3036,3037,3038,3039,3040,3041,3042,共21页
【目的】利用SSR标记,分析黍稷种质资源(野生材料和地方品种)的遗传多样性水平,揭示不同来源黍稷种质资源的亲缘关系和遗传群体结构差异,为黍稷起源进化研究奠定基础。【方法】用6份地理差异显著的黍稷种质资源对137对小宗作物课题组开... 【目的】利用SSR标记,分析黍稷种质资源(野生材料和地方品种)的遗传多样性水平,揭示不同来源黍稷种质资源的亲缘关系和遗传群体结构差异,为黍稷起源进化研究奠定基础。【方法】用6份地理差异显著的黍稷种质资源对137对小宗作物课题组开发的具有多态性的SSR引物进行初步筛选,最终筛选103对条带清晰、扩增良好且多态性稳定的SSR引物,利用这103对多态性SSR标记对146份黍稷材料进行PCR扩增,通过遗传参数、聚类、遗传结构等分析,评估不同个体间及不同群体间的遗传多样性,探讨遗传结构差异。【结果】103对SSR标记共检测出308个等位基因(Na),平均值为2.99,平均Shannon-Weaver指数(I)为0.8478,平均期望杂合度为0.3642,平均多态性信息含量指数(PIC)为0.5544。103对SSR标记的分布区间为0—1、1—2、2—3、3—4和4—5,分辨率范围为0.334—4.002,77.67%的标记分布于区间1—4,具有适度分辨力。国内资源的观测等位基因数(2.9126)、多样性指数(0.8302)、期望杂合度(0.5023)、多态性信息含量指数(0.5278)均高于国外资源,遗传多样性更丰富。12个群体的遗传距离的变化范围为0.0783—0.5762,均值为0.2938;遗传一致度变化范围为0.5620—0.9247,均值为0.75,遗传相似性与地理分布具有一定相关性,地理分布越近,遗传距离越小,遗传一致度越高。聚类分析在遗传距离为0.15处可以把12个群体分为4个组群,其中南美洲和山西资源各自独立分为一支,与其他资源亲缘关系较远。个体间聚类中,国内外资源划分非常显著,在遗传距离为0.63处,146份黍稷资源可分为3大组群,组群Ⅰ和组群Ⅱ为国外资源,组群Ⅲ为国内资源。组群Ⅱ在遗传距离为0.39处又分为3个亚群,组群Ⅲ在遗传距离为0.45处分为5个亚群,其中亚洲与欧洲资源、中国河北与中国山西、中国内蒙古资源的遗传关系较近。遗传结构分析结果显示国内外群� 展开更多
关键词 黍稷 野生糜子 国外品种 ssr标记 遗传多样性 群体结构
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利用重组近交系群体检测花生青枯病抗性SSR标记 被引量：30
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作者 姜慧芳 陈本银 +6 位作者 任小平 廖伯寿 雷永 傅廷栋 马朝芝 E Mace J H Crouch 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期26-30,共5页
用抗青枯病花生品种远杂9102与感病品种Chico杂交,从F2起用单粒传法构建了花生重组近交系群体(RIL)F6和F7。采用354对SSR引物对重组近交系F6群体的基因组DNA鉴定,获得多态性标记45个。结合重组近交系群体F6和F7青枯病抗性鉴定结果,应用... 用抗青枯病花生品种远杂9102与感病品种Chico杂交,从F2起用单粒传法构建了花生重组近交系群体(RIL)F6和F7。采用354对SSR引物对重组近交系F6群体的基因组DNA鉴定,获得多态性标记45个。结合重组近交系群体F6和F7青枯病抗性鉴定结果,应用相关软件统计分析,构建了栽培种花生部分遗传连锁图。图谱总长度为603.9cM,含29个标记(28个SSR标记和1个表型标记)的8个连锁群,还有17个独立的SSR标记;获得了与青枯病抗性相关的SSR标记2个(7G02和PM137),位于该图谱的第1连锁群上,与青枯病抗性基因间的遗传距离为10.9cM和13.8cM,并且位于抗性基因的两侧,两标记间的距离为23.7cM。 展开更多
关键词 花生 青枯病抗性 ssr标记 作图
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