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猪SLA-DQA一个新SNP的发现及其遗传效应的研究 被引量:22
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作者 彭勇波 李奎 +5 位作者 樊斌 余梅 朱猛进 熊统安 彭中镇 刘榜 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第12期2526-2530,共5页
采用PCR-RFLP方法对新发现的一引起氨基酸改变的SNP位点(读码框第722位碱基)进行了检测,初步探讨了DQA基因作为影响经济性状候选基因的可能性。经在6个中国地方猪种及大白猪中PCR-RFLP检测,发现除小梅山和大白猪外,其它几个猪种均存在... 采用PCR-RFLP方法对新发现的一引起氨基酸改变的SNP位点(读码框第722位碱基)进行了检测,初步探讨了DQA基因作为影响经济性状候选基因的可能性。经在6个中国地方猪种及大白猪中PCR-RFLP检测,发现除小梅山和大白猪外,其它几个猪种均存在多态性,同时对6个地方猪种间的基因型频率的差异进行了χ2检验。在通城猪、长白猪、大白猪及其三元杂种猪长大通和达长通猪中检测了该位点的基因型,并运用GLM进行基因型与生长、胴体性状间关联分析,发现该SNP位点与平均背膘厚、6-7肋间背膘厚存在显著相关(P<0.05),与胸腰椎间背膘厚也接近显著性水平(P=0.06),与内脂率、眼肌高、肌肉失水率亦存在显著相关(P<0.05),但未发现与生长性状间的相关。 展开更多
关键词 sladqa 第四外显 SNP PCR—RFLP 关联分析 多态性
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猪MHC-Ⅱ类区DQA新等位基因及新突变位点的发现 被引量:17
2
作者 刘榜 朱正茂 +6 位作者 余梅 曹建华 林丽 熊统安 朱猛进 彭中镇 李奎 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第10期955-960,共6页
根据猪SLA DQA基因cDNA序列和人HLA DQA基因组序列设计引物 ,在猪中成功扩增了一个 731bp的片段 ,该片段包括猪SLA DQA基因的大部分第 2外显子、完整第 2内含子和少部分第 3外显子 ,通过克隆和PCR直接测序获得该片段的核苷酸序列。在家... 根据猪SLA DQA基因cDNA序列和人HLA DQA基因组序列设计引物 ,在猪中成功扩增了一个 731bp的片段 ,该片段包括猪SLA DQA基因的大部分第 2外显子、完整第 2内含子和少部分第 3外显子 ,通过克隆和PCR直接测序获得该片段的核苷酸序列。在家系中对第 2外显子的核苷酸序列和其编码的α1 结构域的氨基酸序列进行了分析 ,并与GenBank中所有的SLA DQA第 2外显子序列进行比较分析 ,发现有 4个新突变位点和两个新等位基因存在。新等位基因分别是DQA SLT 2 6和DQA TC 2 1 1。DQA SLT 2 6与单倍型c、d相比有 8个核苷酸的差异和 4个氨基酸的改变 :单倍型c、d在 6 0、6 5、81、93位的氨基酸分别是Val、Lys、Asp、Lys;而DQA SLT 2 6相应的氨基酸是Ala、Glu、Gly、Ile。DQA TC 2 1 1与单倍型c、d相比存在 1个氨基酸的改变 ,由单倍型c和d中 94位氨基酸His变为Tyr。 展开更多
关键词 sla-dqa 第2外显子 第2内含子 DNA序列 新等位基因
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东北民猪SLA-DQA基因的PCR-RFLP多态性分析 被引量:7
3
作者 张冬杰 杨国伟 +2 位作者 汪晓鸿 刘琪 刘娣 《吉林农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期421-424,共4页
采用克隆测序和PCR-RFLP的方法对SLA-DQA基因的整个编码区进行了扫描和多态性分析。结果表明该基因的第2外显子是整个基因的高变区,突变率达到5.6%,其中80%为有效突变,但没有发现新的等位基因;PCR-RFLP结果表明外显子2用限制酶EcoR I酶... 采用克隆测序和PCR-RFLP的方法对SLA-DQA基因的整个编码区进行了扫描和多态性分析。结果表明该基因的第2外显子是整个基因的高变区,突变率达到5.6%,其中80%为有效突变,但没有发现新的等位基因;PCR-RFLP结果表明外显子2用限制酶EcoR I酶切可获得3种基因型:254 bp(AA)、254 bp/88 bp/ 166 bp(AB)、88 bp/166 bp(BB),用限制酶PvuⅡ酶切可获得3种基因型:254 bp(AA)、254 bp/129 bp/125 bp (AB)、129 bp/125 bp(BB),外显子3用限制酶FbaⅠ酶切可获得3种基因型:282 bp(AA)、282 bp/130 bp/152 bp (AB)、130 bp/152 bp(BB),外显子4用限制酶Hin1Ⅰ酶切可获得3种基因型:184 bp(AA)、184 bp/83 bp/101 bp (AB)、83 bp/101 bp(BB);Hardy-Weinberg平衡分析表明民猪在EcoRⅠ位点处于平衡状态(P<0.05),而在PvuⅡ位点处于不平衡状态(P>0.05),FbaⅠ和Hin 1Ⅰ位点处于极不平衡状态(P>0.01)。 展开更多
关键词 民猪 sla-dqa 克隆 PCR-RFLP
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海南五指山猪SLA-DQA基因cDNA全长的克隆分析 被引量:7
4
作者 郑心力 王峰 +2 位作者 魏立民 孙瑞萍 张燕 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第10期4433-4435,4438,共4页
[目的]为猪异种器官移植的免疫识别机理的研究奠定基础。[方法]采用RT-PCR方法扩增五指山猪DQA基因cDNA,然后进行测序和序列分析。[结果]海南五指山猪SLA-DQA基因序列长度为768个核苷酸,其中1~765为完全阅读框编码255个氨基酸残基。五... [目的]为猪异种器官移植的免疫识别机理的研究奠定基础。[方法]采用RT-PCR方法扩增五指山猪DQA基因cDNA,然后进行测序和序列分析。[结果]海南五指山猪SLA-DQA基因序列长度为768个核苷酸,其中1~765为完全阅读框编码255个氨基酸残基。五指山猪SLA-DQA基因cDNA序列及其推导的氨基酸序列与我国小型猪同源性最高,与人相应基因的同源性明显高于与小鼠的同源性。[结论]将五指山猪作为适合于进行异种器官移植的中国猪种,对免疫遗传学特性系列研究具有重要意义。 展开更多
关键词 sla-dqa 主要组织相容性复合体 异种移植 五指山猪
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三品种外种猪SLA-DQA基因的PCR-RFLP分析 被引量:5
5
作者 于辉 李建东 +2 位作者 赵海全 左启祯 李华 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2010年第9期14-17,共4页
对杜洛克、长白猪和大白猪的SLA-DQA第1和第2内含子部分序列以及完整的第2外显子进行群体分析,PCR-RFLP分型。结果表明:三品种猪在EcoRⅠ酶切位点上,基因型频率BB(0.5604)高于AB(0.3626)和AA(0.0769),B等位基因频率较高;在AluⅠ酶切位点... 对杜洛克、长白猪和大白猪的SLA-DQA第1和第2内含子部分序列以及完整的第2外显子进行群体分析,PCR-RFLP分型。结果表明:三品种猪在EcoRⅠ酶切位点上,基因型频率BB(0.5604)高于AB(0.3626)和AA(0.0769),B等位基因频率较高;在AluⅠ酶切位点上,基因型频率NN(0.6154)高于MN(0.3407)和MM(0.0440),N等位基因频率较高。三品种猪仅在EcoRⅠ酶切位点上达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),各组合基因型频率差异均不显著(P>0.05)。在2个酶切位点上,杜洛克的杂合度最高为0.4966,依次为大白猪0.2774和长白猪0.1467。 展开更多
关键词 sla-dqa PCR-RFLP 遗传指标
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SLA-DQA基因的多态性与仔猪初生重和30日龄体重的相关性分析 被引量:6
6
作者 张冬杰 《黑龙江农业科学》 2010年第1期1-2,共2页
采用PCR-RFLP方法,对250头黑龙江野猪与北京黑猪杂交的F1个体进行了SLA-DQA基因的多态性检测,并对不同基因型影响新生仔猪的初生重和30日龄体重的效应进行了分析。结果表明:SLA-DQA基因的第2、34、外显子处均存在多态性,但只有第2外显... 采用PCR-RFLP方法,对250头黑龙江野猪与北京黑猪杂交的F1个体进行了SLA-DQA基因的多态性检测,并对不同基因型影响新生仔猪的初生重和30日龄体重的效应进行了分析。结果表明:SLA-DQA基因的第2、34、外显子处均存在多态性,但只有第2外显子处的PvuⅡ酶切所产生的BB型个体可显著增加仔猪的30日龄体重,其余的多态位点对这两个性状的效应差异均不显著。 展开更多
关键词 SIAD(M PCR-RFLP 初生重 30日龄体重
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甘孜藏猪与合作猪SLA-DQA基因的群体遗传研究 被引量:3
7
作者 李华 蒋岸岸 +3 位作者 于辉 吕学斌 李学伟 赵海全 《高技术通讯》 CAS CSCD 北大核心 2006年第12期1294-1299,共6页
对甘孜藏猪和合作猪SLA-DQA基因的第1和第2内含子部分序列以及完整的第2外显子进行了PCR-RFLP分析,结果表明:经EcoRⅠ酶切后,BB基因型频率(0.5537)分别高于AB型(0.3719)和从型(0.0744);B为优势等位基因(0.7397)。经Alu... 对甘孜藏猪和合作猪SLA-DQA基因的第1和第2内含子部分序列以及完整的第2外显子进行了PCR-RFLP分析,结果表明:经EcoRⅠ酶切后,BB基因型频率(0.5537)分别高于AB型(0.3719)和从型(0.0744);B为优势等位基因(0.7397)。经AluⅠ酶切后,MM基因型频率(0.4380)分别高于MN型(0.3637)和NN型(0.1983);M为优势等位基因(0.6198)。2品种中AluⅠ酶切基因型在合作猪中未达到Hardy-Weinberg平衡,且群体间M、N的基因频率和NN基因型频率差异分别达极显著(P〈0.01)和显著水平(P〈0.05)。共鉴别了9种组合基因型,甘孜藏猪和合作猪分别为6和8种组合基因型,BB-MM、BBNN组合基因型频率在两群体间差异显著(P〈0.05)。两酶切位点均表现为中度多态,AluⅠ位点多态信息含量均高于EcoRⅠ位点,合作猪杂合性高于甘孜藏猪,两群体间的遗传距离为0.0389。 展开更多
关键词 藏猪 sla-dqa PCR-RFLP 遗传参数
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撒坝猪及长撒二元杂交猪SLA-DQA基因PCR-RFLP多态性分析 被引量:4
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作者 钱锦花 连林生 《猪业科学》 2008年第6期66-68,共3页
根据SLA-DQA基因cDNA序列和已报道的引物序列,在猪中成功扩增了一个731 bp的片段,该片段包括猪SLA-DQA基因的大部分第2外显子、完整第2内含子和少部分第3外显子。采用限制性内切酶EcoRⅠ对撒坝猪和长撒二元杂猪SLA-DQA基因的扩增产物进... 根据SLA-DQA基因cDNA序列和已报道的引物序列,在猪中成功扩增了一个731 bp的片段,该片段包括猪SLA-DQA基因的大部分第2外显子、完整第2内含子和少部分第3外显子。采用限制性内切酶EcoRⅠ对撒坝猪和长撒二元杂猪SLA-DQA基因的扩增产物进行多态性分析,结果2个猪种在酶切后出现2个等位基因,3种基因型:654bp/77bp(AA)、731bp(BB)和731bp/654bp/77bp(AB)。分析发现,A等位基因在群体中占优势,经χ2适合性检验,撒坝猪和长撒二元杂交猪SLA-DQA基因在EcoRⅠ酶切位点处于Hardy-Weinberg遗传平衡状态。 展开更多
关键词 撒坝猪 长撒二元杂交猪 sla-dqa PCR-RFLP
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撒坝猪SLA-DQA基因多态性与生长性状的相关性分析 被引量:5
9
作者 钱锦花 连林生 《畜牧与兽医》 北大核心 2014年第5期59-61,共3页
应用PCR-RFLPs方法检测撒坝猪SLA-DQA基因突变位点多态性,通过最小二乘分析进行基因型与生长性状表型值的相关分析,结果表明SLA-DQA基因3种基因型在所分析的几个阶段体重和6月龄体尺性状上差异均未达到显著水平,且而在0~45日龄日增重和7... 应用PCR-RFLPs方法检测撒坝猪SLA-DQA基因突变位点多态性,通过最小二乘分析进行基因型与生长性状表型值的相关分析,结果表明SLA-DQA基因3种基因型在所分析的几个阶段体重和6月龄体尺性状上差异均未达到显著水平,且而在0~45日龄日增重和70日龄~4月龄日增重上AA基因型与AB基因型间的差异达到显著水平,大多数生长性状都以BB型的较高。 展开更多
关键词 撒坝猪 sla-dqa 生长性状 PCR-RFLP 基因多态性
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Effects of SLA-DQA Gene on Birth Weight and 30-Day-Old Weight in Piglets 被引量:1
10
作者 ZHANG Dong-jie 《Animal Husbandry and Feed Science》 CAS 2010年第2期8-9,共2页
The genetic polymorphism of SLA-DQA gene was investigated by PCR-RFLP. The effects of SLA.DQA gene on birth weight and 30-day-old weight were analyzed in 250 individuals of FI hybrid pig ( Heilongjiang wild boar x Be... The genetic polymorphism of SLA-DQA gene was investigated by PCR-RFLP. The effects of SLA.DQA gene on birth weight and 30-day-old weight were analyzed in 250 individuals of FI hybrid pig ( Heilongjiang wild boar x Beijing Black sow). The analysis revealed four poly- morphic loci in the SLA-DQA gene, but only the Pvu II locus in exon 2 of SLA-DQA gene ( BB genotype) greatly increased the 30-day-old weight of piglets. 展开更多
关键词 sla-dqa gene PIG Birth weight 30-day-old weight PCR-RFLP
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滇南小耳猪与云南野猪SLA-DQA基因的多态性比较 被引量:1
11
作者 刘荣辉 卢丽仪 +2 位作者 陶璇 于辉 李华 《实验动物与比较医学》 CAS 2011年第5期360-364,共5页
目的 分析滇南小耳猪与云南野猪(S.s.silvianus) SLA-DQA基因不同酶切位点的基因型多态性以及等位基因的多态性,检验这些酶切位点上的基因频率是否达到Hardy-Weinberg平衡.方法 采用EcoRⅠ和AluⅠ两种限制性内切酶对滇南小耳猪和云南... 目的 分析滇南小耳猪与云南野猪(S.s.silvianus) SLA-DQA基因不同酶切位点的基因型多态性以及等位基因的多态性,检验这些酶切位点上的基因频率是否达到Hardy-Weinberg平衡.方法 采用EcoRⅠ和AluⅠ两种限制性内切酶对滇南小耳猪和云南野猪SLA-DQA第1和第2内含子部分序列以及完整的外显子2进行PCR-RFLP分析.结果 在EcoRⅠ与AluⅠ酶切位点上均得到3种基因型,在这两个酶切位点上版纳系有9种组合基因型,明光系有8种组合基因型,而野猪仅发现4种组合基因型.经x2适合性检验表明:滇南小耳猪SLA-DQA外显子2在EcoRⅠ与Alu Ⅰ酶切位点上均未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05),但明光系和云南野猪在两酶切位点均达到了平衡状态(P>0.05).结论 滇南小耳猪SLA-DQA在EcoRⅠ与AluⅠ酶切位点均表现为中度多态,云南野猪在EcoRⅠ为中度多态,在Alu Ⅰ酶切位点则为低度多态;滇南小耳猪的HardyWeinberg不平衡主要来自版纳系小耳猪. 展开更多
关键词 滇南小耳猪 云南野猪 sla-dqa RFLP 遗传特性
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八眉猪SLA-DQA基因外显子2多态性分析 被引量:3
12
作者 寸海霞 谢德琼 +4 位作者 王龙 魏涛 张稳 郭鹏辉 刘丽霞 《中兽医学杂志》 2016年第3期10-13,共4页
本研究以八眉猪为研究对象,采用PCR-SSCP和克隆测序的方法研究了SLA-DQA基因外显子2功能区的分子遗传特征。结果显示,八眉猪SLA-DQA基因外显子2共有7种等位基因(A、B、C、D、E、F、G)和7种基因型(分别是AA、AB、AC、AE、AF、BB、DG),其... 本研究以八眉猪为研究对象,采用PCR-SSCP和克隆测序的方法研究了SLA-DQA基因外显子2功能区的分子遗传特征。结果显示,八眉猪SLA-DQA基因外显子2共有7种等位基因(A、B、C、D、E、F、G)和7种基因型(分别是AA、AB、AC、AE、AF、BB、DG),其中A等位基因和AA基因型占优势,DG基因型为劣势基因型。对不同等位基因进行克隆测序,结果共发现15个氨基酸发生了改变,19个抗原结合位点上共有5个氨基酸发生改变。x2检验结果表明,该基因偏离了Hardy-Weinberg平衡(P<0.01)。遗传多态性分析结果表明,八眉猪SLA-DQA基因外显子2,属于中度多态(0.25<PIC<0.5)。研究结果表明,八眉猪SLA-DQA基因第2外显子属于多态基因。 展开更多
关键词 八眉猪 sla-dqa 基因PCR-SSCP 多态性
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Cloning and cDNA Sequence Analysis of SLA-DQA Gene from Hainan Wuzhishan Miniature Pig
13
作者 郑心力 王峰 +2 位作者 魏立民 孙瑞萍 张燕 《Animal Husbandry and Feed Science》 CAS 2009年第1期17-21,共5页
[ Objective] The study aimed to lay a foundation for studying immune recognition mechanism in xenotransplantation. [ Method] SLA- DQA gene of Hainan Wuzhishan miniature pig was cloned by RT-PCR and sequenced. J-Result... [ Objective] The study aimed to lay a foundation for studying immune recognition mechanism in xenotransplantation. [ Method] SLA- DQA gene of Hainan Wuzhishan miniature pig was cloned by RT-PCR and sequenced. J-Result] The SLA-DQA gene sequence of Wuzhishan minia- ture pig contained 768 nucleotides, among which 1 -765 were the complete open reading frame, encoding 255 amino acids. SLA-DQA cDNA se- quence and its deduced amino acid sequence of Wuzhishan miniature pig were most similar to those of the other miniature pigs in China. When compared with corresponding cDNA sequences and the amino acid sequences in other species, the homology with human was obviously higher than that with mouse. [ Conclusion] As the Chinese pig breed suitable for xenotransplantation, Wuzhishan miniature pig has significant importance to ser- ial studies on immunogenetics characteristics. 展开更多
关键词 sla-dqa gene Major histocompatibility complex XENOTRANSPLANTATION Wuzhishan miniature pig
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滇南小耳猪与巴马小型猪SLA-DQA基因多态分析 被引量:15
14
作者 李华 于辉 +4 位作者 蒋岸岸 李学伟 田允波 赵海全 陈云 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期430-435,共6页
对滇南小耳猪和巴马小型猪的SLA-DQA基因的部分内含子1、完整的外显子2和部分内含子2共341bp片段进行了PCR-RFLP酶切分型,结果表明:2品种经EcoRⅠ酶切后BB基因型频率(0.468 8)高于AB型(0.375 0),AA型最低(0.156 3),B为优势基因(0.656 3... 对滇南小耳猪和巴马小型猪的SLA-DQA基因的部分内含子1、完整的外显子2和部分内含子2共341bp片段进行了PCR-RFLP酶切分型,结果表明:2品种经EcoRⅠ酶切后BB基因型频率(0.468 8)高于AB型(0.375 0),AA型最低(0.156 3),B为优势基因(0.656 3),A为劣势基因(0.343 7)。经AluⅠ酶切后,滇南小耳猪MM基因型频率(0.500 0)高于MN型(0.321 4)和NN型(0.178 6);而巴马猪则以MN基因型频率(0.485 3)高于MM型(0.338 2)和NN型(0.176 5);2个品种中M等位基因(0.604 2)频率高于N等位基因(0.395 8)。经分析表明,2猪种在两酶切位点上各分型已达Hardy-Weinberg平衡。巴马小型猪和滇南小耳猪中分别存在9种和7种PCR-RFLP组合基因型,其中BBMN为优势组合基因型,AAMN为劣势组合基因型;AAMM组合基因型在2品种间差异显著(P<0.05)。遗传多态参数分析表明:SLA-DQA基因外显子2的两酶切位点在2猪种间均表现为中度多态,AluⅠ的基因多样性略高于EcoRⅠ,巴马小型猪杂合性略高于滇南小耳猪,2品种间遗传距离为0.000 4。 展开更多
关键词 小型猪 sla-dqa基因 PCR-RFLP 基因多态
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中国猪种DQA新等位基因的克隆和分析 被引量:11
15
作者 陈福祥 谢晋 +2 位作者 张勇 沈佰华 周光炎 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期111-116,共6页
目的 :克隆和序列分析中国猪种DQA基因cDNA ,为猪异种器官移植的免疫识别机理的研究提供基础。方法 :采用RT PCR方法扩增广西巴马猪 (GXP)、贵州香猪 (GZP)及云南小耳猪 (YNP)DQA基因cDNA ,克隆入测序载体 ,然后进行测序及其序列分析。... 目的 :克隆和序列分析中国猪种DQA基因cDNA ,为猪异种器官移植的免疫识别机理的研究提供基础。方法 :采用RT PCR方法扩增广西巴马猪 (GXP)、贵州香猪 (GZP)及云南小耳猪 (YNP)DQA基因cDNA ,克隆入测序载体 ,然后进行测序及其序列分析。结果 :获得具有阅读框架的 3个结构和已有序列不同的DQA新等位基因 (GXPDQA、GZPDQA和YNPDQA) ,基因序列号分别为AY10 2 4 73,AY10 2 4 74和AY10 2 4 75 ,其长度分别为 76 5、76 8和 76 8个核苷酸 ,除末端终止密码外 ,分别编码2 5 4、2 5 5和 2 5 5个氨基酸残基。结论 :发现了 3个猪DQA新等位基因 ,同时发现中国猪种DQA基因及其推导的氨基酸与人相应基因的同源性明显高于小鼠。 展开更多
关键词 猪白细胞抗原dqa 主要组织相容性复合体 异种移植
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苏太猪SLA-DQA基因多态性及其与生产性能的关联分析 被引量:9
16
作者 吴圣龙 鞠慧萍 +5 位作者 包文斌 李碧春 陈国宏 杨建生 黄雪根 华金弟 《中国畜牧兽医》 CAS 2007年第7期38-40,共3页
本研究采用PCR-RFLP方法对苏太猪SLA-DQA基因多态性进行分析,结果表明,苏太猪SLA-DQA基因开放阅读框第722个碱基存在1个A→G突变,从而导致了氨基酸Gly到Arg的转变,并产生了TaqⅠ酶切位点。当扩增产物被限制性内切酶TaqⅠ消化后,检测到AA... 本研究采用PCR-RFLP方法对苏太猪SLA-DQA基因多态性进行分析,结果表明,苏太猪SLA-DQA基因开放阅读框第722个碱基存在1个A→G突变,从而导致了氨基酸Gly到Arg的转变,并产生了TaqⅠ酶切位点。当扩增产物被限制性内切酶TaqⅠ消化后,检测到AA和AG基因型。分析这2种基因型与苏太猪生产性能间的相关性,结果表明:SLA-DQA基因与生产性能不存在相关性。 展开更多
关键词 sla-dqa基因 生产性能
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近交五指山小型猪SLA-DQA基因的克隆及在大肠杆菌的原核表达 被引量:7
17
作者 王晓东 牟玉莲 +3 位作者 张莉 杨树林 罗玉柱 冯书堂 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 2006年第4期23-26,共4页
采用RT-PCR方法扩增五指山猪SLA-DQA基因cDNA,克隆入测序载体,测序结果与Gene Bank(登陆号:AY243104)的序列相同,大小为768 bp,该基因编码255个氨基酸残基和一个终止密码,预计蛋白分子量为28 kD.将这个基因克隆到原核表达载体PET-28a(+)... 采用RT-PCR方法扩增五指山猪SLA-DQA基因cDNA,克隆入测序载体,测序结果与Gene Bank(登陆号:AY243104)的序列相同,大小为768 bp,该基因编码255个氨基酸残基和一个终止密码,预计蛋白分子量为28 kD.将这个基因克隆到原核表达载体PET-28a(+)中,经酶切、PCR扩增和测序分析确证其正确,插入到表达载体中,阅读框是正确的,从而构建成重组表达载体PET-28a(+)-DQA.重组质粒转化至宿主菌BL21(DE3)中,用IPTG进行诱导表达,对表达的蛋白用SDS-PAGE电泳分析,结果表明得到了与预计分子量相同的蛋白. 展开更多
关键词 sladqa基因 CDNA 克隆 原核表达
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苏太猪SLA-DQA基因SNP检测及其对部分经济性状的遗传效应分析 被引量:7
18
作者 朱璟 叶兰 +3 位作者 潘章源 黄雪根 包文斌 吴圣龙 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2010年第23期5-8,共4页
实验对苏太猪SLA-DQA基因的第4外显子进行多态性分析,并初步探讨DQA基因作为影响苏太猪经济性状候选基因的可能性。PCR-SSCP分析共检测到CC、CD和DD 3种基因型;在第4外显子检测到G5233A突变,导致了氨基酸Thr到Ala的改变。结果表明:苏太... 实验对苏太猪SLA-DQA基因的第4外显子进行多态性分析,并初步探讨DQA基因作为影响苏太猪经济性状候选基因的可能性。PCR-SSCP分析共检测到CC、CD和DD 3种基因型;在第4外显子检测到G5233A突变,导致了氨基酸Thr到Ala的改变。结果表明:苏太猪3种基因型个体的初生重、35日龄断奶体重、4月龄体重、6月龄体重以及60 kg体尺和背膘厚等生长发育指标差异不显著(P>0.05);DD基因型第3胎次总产仔数、产活仔数、初生窝重均高于CC和CD基因型的个体,尤其是断奶仔猪数和断奶窝重显著高于CC和CD基因型的个体(P<0.05),但CC和CD基因型个体间繁殖性能差异不显著(P>0.05)。 展开更多
关键词 sla-dqa基因 PCR-SSCP 生长发育 繁殖性能 苏太猪
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大白猪SLA-DQ基因表达规律的研究 被引量:7
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作者 杨军 张冬杰 刘娣 《江苏农业科学》 CSCD 北大核心 2007年第2期118-121,共4页
采用半定量RT-PCR方法对SLA-DQA和SLA-DQB基因在1、90、180、270和360日龄大白猪不同组织与器官中表达情况进行了研究。结果表明,SLA-DQA和SLA-DQB基因在大白猪的整个生长发育期的心、肝、胃、脾、肾、肺、大肠、小肠、肌肉、子宫、卵巢... 采用半定量RT-PCR方法对SLA-DQA和SLA-DQB基因在1、90、180、270和360日龄大白猪不同组织与器官中表达情况进行了研究。结果表明,SLA-DQA和SLA-DQB基因在大白猪的整个生长发育期的心、肝、胃、脾、肾、肺、大肠、小肠、肌肉、子宫、卵巢共11个组织与器官中均有表达,但表达量存在明显差异与变化。DQA基因在90日龄时表达量最高,在1日龄时最低;DQB基因除了在1日龄的心、肝和肾中表达量高于DQA基因外,其余各时间点的不同组织与器官内的表达量均低于DQA基因。 展开更多
关键词 大白猪 组织 器官 sla-dqa基因 sla-DQB基因 表达
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合作猪SLA-DQA基因第4外显子多态性分析 被引量:5
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作者 张国华 马小军 吕伟丽 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期97-101,共5页
合作猪的MHC-DQA基因的适应性变异,其抗原识别区域(即外显子4)通过PCR扩增和随后的单链构象多态性(SSCP)和序列分析,结果显示在439个合作猪个体,SLA-DQA第4外显子检出4个等位基因和6个基因型(AA、BB、DD、AB、AC和AD),其中A等位基因和A... 合作猪的MHC-DQA基因的适应性变异,其抗原识别区域(即外显子4)通过PCR扩增和随后的单链构象多态性(SSCP)和序列分析,结果显示在439个合作猪个体,SLA-DQA第4外显子检出4个等位基因和6个基因型(AA、BB、DD、AB、AC和AD),其中A等位基因和AA基因型的频率最高,为优势基因和优势基因型。对不同型的PCR-SSCP条带测序分析,发现7个突变位点(5 068 bp T→C,5 109 bp和5 149 bp处缺失C,5 131 bp A→G导致丝氨酸变为甘氨酸,5 135 bp C→T,5 234 bp G→A,5 136 bp处插入A)。遗传学分析发现,合作猪多态信息含量(PIC)为0.240 1,属于低度多态,各种基因型的分布不显著。研究结果证实,合作猪SLA—DQA基因第4外显子为低度多态。 展开更多
关键词 合作猪 sla-dqa基因 多态性 遗传特性
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