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微生物生态学研究方法进展 被引量：87
1
作者 张洪勋 王晓谊 齐鸿雁 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期988-995,共8页
微生物培养及显微技术作为鉴定微生物种群的手段有很大的局限性 ,因为环境中大多数微生物处于“存活但不能培养”的状态。因此 ,不依赖于微生物培养的生物化学以及分子生物学方法正被广泛地用于微生物生态学研究。主要介绍了荧光技术 ,... 微生物培养及显微技术作为鉴定微生物种群的手段有很大的局限性 ,因为环境中大多数微生物处于“存活但不能培养”的状态。因此 ,不依赖于微生物培养的生物化学以及分子生物学方法正被广泛地用于微生物生态学研究。主要介绍了荧光技术 ,基于 PCR的分析技术和 展开更多
关键词 微生物生态学 研究方法 显微技术 微生物培养 生物化学 分子生物学方法 pcr PLFA
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绵羊线粒体DNA控制区5’端序列PCR-SSCP与序列分析 被引量：31
2
作者 赵兴波 储明星 +2 位作者 李宁 龚国春 吴常信 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第3期225-228,共4页
通过绵羊线粒体ＤＮＡ控制区左功能域（５’端序列）ＰＣＲ－ＳＳＣＰ和序列分析，发现小尾寒 羊、乌珠穆沁羊、湖羊、萨福克羊和夏洛来羊以及多赛特公羊与小尾寒羊杂交家系共２０２只绵羊 可归纳为两种类型：突变型和野生型，提示现代... 通过绵羊线粒体ＤＮＡ控制区左功能域（５’端序列）ＰＣＲ－ＳＳＣＰ和序列分析，发现小尾寒 羊、乌珠穆沁羊、湖羊、萨福克羊和夏洛来羊以及多赛特公羊与小尾寒羊杂交家系共２０２只绵羊 可归纳为两种类型：突变型和野生型，提示现代绵羊品种在起源上存在两种主要的进化途径。 展开更多
关键词 绵羊 线粒体DNA pcr-sscp 序列分析
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优质细毛羊羊毛细度的候选基因分析 被引量：59
3
作者 刘桂芬 田可川 +2 位作者 张恩平 黄锡霞 张艳花 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期70-74,共5页
采用PCR-SSCP的分子标记技术,选择编码羊毛纤维组成蛋白基因中的KAP1.1、KAP1.3的部分序列、KAP6.1的外显子区作为候选基因,通过对其多态性的研究,探索将该基因作为候选基因来间接选择羊毛细度性状的可行性。得出其中在角蛋白辅助蛋白... 采用PCR-SSCP的分子标记技术,选择编码羊毛纤维组成蛋白基因中的KAP1.1、KAP1.3的部分序列、KAP6.1的外显子区作为候选基因,通过对其多态性的研究,探索将该基因作为候选基因来间接选择羊毛细度性状的可行性。得出其中在角蛋白辅助蛋白的多基因家族中的高硫蛋白辅助蛋白基因(KAP1.1、KAP1.3)中,位点W08667与羊毛细度有显著的相关性(P<0.05)。在甘氨酸酪氨酸角蛋白辅助蛋白中,外显子位点W06933的AA基因型和BB基因型与羊毛细度之间有显著的相关性(P<0.05)。 展开更多
关键词 优质细毛羊 羊毛细度 候选基因 pcr-sscp
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PCR-SSCP分支杆菌菌种初步鉴定方法的建立及其应用 被引量：46
4
作者 吴雪琼 张俊仙 +2 位作者 刘佳文 黄海南 王晋洪 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 2000年第7期25-26,共2页
建立一种简便、快速、灵敏和特异的分支杆菌菌种鉴定方法。方法 :通过聚合酶链反应 (PolymeraseChainReaction ,PCR) -单链构象多态性 (Single -strndedConformationPolymorphism ,SSCP)方法分析分支杆菌 16SrRNA ,根据其电泳图谱与标... 建立一种简便、快速、灵敏和特异的分支杆菌菌种鉴定方法。方法 :通过聚合酶链反应 (PolymeraseChainReaction ,PCR) -单链构象多态性 (Single -strndedConformationPolymorphism ,SSCP)方法分析分支杆菌 16SrRNA ,根据其电泳图谱与标准株的相似性进行菌种初步鉴定。结果 :2 9种分支杆菌标准株中 ,除结核分支杆菌、牛结核分支杆菌和卡介苗之间及堪萨斯分支杆菌和胃分支杆菌之间SSCP电泳图谱相似外 ,其余各种分支杆之间电泳图谱均有显著差异。 70株BACTECTB4 60初步鉴定为结核分支杆菌复合群的临床分离株中 ,55株显示与结核分支杆菌SSCP电泳图谱相似 ,15例 (2 1.4 % )显示出与结核分支杆菌完全不同的电泳图谱 ;10株经传统方法鉴定为结核分支杆菌的分离株中 ,仅 1株显示出与结核分支杆菌不同的电泳图谱。结论 :PCR -SSCP有可能成为一种快速、有效的分支杆菌菌种初步鉴定方法。 展开更多
关键词 菌种鉴定 分支杆菌 pcr-sscp
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6个山羊品种高繁殖力候选基因BMP15多态性研究 被引量：39
5
作者 何远清 储明星 +2 位作者 王金玉 方丽 叶素成 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期61-64,共4页
骨形态发生蛋白15(bone morphogenetic prote in 15,BMP15)基因为控制Belc lare和Cambridge绵羊高繁殖力的主效基因。采用PCR-RFLP和PCR-SSCP技术检测BMP15基因中与绵羊高繁殖力相关的两个突变位点在高繁殖力山羊品种济宁青山羊(130只... 骨形态发生蛋白15(bone morphogenetic prote in 15,BMP15)基因为控制Belc lare和Cambridge绵羊高繁殖力的主效基因。采用PCR-RFLP和PCR-SSCP技术检测BMP15基因中与绵羊高繁殖力相关的两个突变位点在高繁殖力山羊品种济宁青山羊(130只母羊、20只公羊)以及低繁殖力山羊品种(波尔山羊30只母羊、文登奶山羊30只母羊、辽宁绒山羊30只母羊、内蒙古绒山羊50只母羊、北京本地山羊30只母羊)中的单核苷酸多态性,同时研究这两个突变位点对济宁青山羊高繁殖力的影响。结果表明,在6个山羊品种中都没有检测到BMP15的B2突变(C→T);检测到的BMP15的B4突变(G→T)在6个山羊品种中均呈现杂合子状态。这表明BMP15基因中影响Belc lare和Cambridge绵羊高繁殖力的突变位点对济宁青山羊的高繁殖力没有显著影响。 展开更多
关键词 山羊 繁殖力 骨形态发生蛋白15基因 pcr-RFLP pcr-sscp
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二花脸猪FSH β亚基位点PCR-SSCP标记与产仔数关系初探 被引量：29
6
作者 陈杰 姜志华 +3 位作者 刘红林 李齐贤 方美英 吴彦宁 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 1999年第2期55-58,共4页
采用ＰＣＲ－ＳＳＣＰ（ＰｏｌｙｍｅｒａｓｅＣｈａｉｎＲｅａｃｔｉｏｎ－ＳｉｎｇｌｅＳｔｒａｎｄＣｏｎｆｏｒｍａｔｉｏｎＰｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ）作为遗传标记，对二花脸猪ＦＳＨβ亚基位点与产仔数性状的关系进行了研究。二... 采用ＰＣＲ－ＳＳＣＰ（ＰｏｌｙｍｅｒａｓｅＣｈａｉｎＲｅａｃｔｉｏｎ－ＳｉｎｇｌｅＳｔｒａｎｄＣｏｎｆｏｒｍａｔｉｏｎＰｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ）作为遗传标记，对二花脸猪ＦＳＨβ亚基位点与产仔数性状的关系进行了研究。二花脸猪在被扩增位点有较大的变异，而在作为对照品种的大约克猪中则完全纯合。两品种在该位点基因频率差异显著。以标记基因型为因子，分别对二花脸猪群体的头胎产仔数、头三胎产仔数之和以及最高产仔数进行方差分析。结果表明，该标记位点与产仔数性状显著相关，其贡献率达到１０％以上。本文还就产仔数指标的选择作了讨论。 展开更多
关键词 二花脸猪 FSHΒ亚基 pcr-sscp 产仔数 猪 遗传
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小尾寒羊高繁殖力候选基因ESR的研究 被引量：35
7
作者 毕晓丹 储明星 +2 位作者 金海国 方丽 叶素成 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第10期1060-1065,共6页
利用PCR-SSCP技术对高繁殖力绵羊品种(小尾寒羊、湖羊、德国肉用美利奴羊)和低繁殖力绵羊品种(多赛特羊、萨福克羊)的雌激素受体(estrogenreceptor,ESR)基因第一外显子部分序列进行单核苷酸多态性研究。结果表明:小尾寒羊、湖羊和德国... 利用PCR-SSCP技术对高繁殖力绵羊品种(小尾寒羊、湖羊、德国肉用美利奴羊)和低繁殖力绵羊品种(多赛特羊、萨福克羊)的雌激素受体(estrogenreceptor,ESR)基因第一外显子部分序列进行单核苷酸多态性研究。结果表明:小尾寒羊、湖羊和德国肉用美利奴羊中存在3种基因型(AA、BB、AB),而在多赛特羊和萨福克羊中只存在两种基因型(AA、AB)。统计结果表明:湖羊、德国肉用美利奴羊、小尾寒羊、萨福克羊和多赛特羊A等位基因频率分别为0.672、0.786、0.846、0.857和0.867,B等位基因频率分别为0.328、0.214、0.154、0.143和0.133。测序结果表明:BB型和AA型相比在外显子1第363位发生1处碱基突变(C→G)。独立性检验表明:小尾寒羊和湖羊之间基因型分布差异极显著(P<0.01),湖羊和多赛特羊之间基因型分布差异显著(P<0.05),其他各个绵羊品种之间基因型分布差异均不显著。AB基因型和BB基因型小尾寒羊产羔数比AA基因型分别多0.51只(P<0.05)和0.7只(P<0.05)。研究结果表明:ESR基因可能是控制小尾寒羊多胎性能的一个主效基因或与之存在紧密的遗传连锁。 展开更多
关键词 绵羊 高繁殖力 候选基因法 雌激素受体基因 pcr-sscp
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FSHβ基因PCR-SSCP多态性及其与济宁青山羊高繁殖力关系的研究 被引量：33
8
作者 梁琛 储明星 +3 位作者 张建海 刘文忠 方丽 叶素成 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第9期1071-1077,共7页
采用PCR-SSCP技术检测促卵泡素β亚基(follicle-stimulatinghormoneβ,FSHβ)基因5′调控区、外显子1和外显子2在高繁殖力山羊品种(济宁青山羊)和低繁殖力山羊品种(辽宁绒山羊、波尔山羊、安哥拉山羊)中的单核苷酸多态性,同时研究该基... 采用PCR-SSCP技术检测促卵泡素β亚基(follicle-stimulatinghormoneβ,FSHβ)基因5′调控区、外显子1和外显子2在高繁殖力山羊品种(济宁青山羊)和低繁殖力山羊品种(辽宁绒山羊、波尔山羊、安哥拉山羊)中的单核苷酸多态性,同时研究该基因对济宁青山羊高繁殖力的影响。结果表明:山羊与绵羊的FSH基因该段核苷酸序列同源性为98%。9对引物中,只有P9的扩增片段存在多态性。P9的扩增片段在济宁青山羊和辽宁绒山羊中检测到AA、AB和AC3种基因型;在波尔山羊中检测到AA、CC和AC3种基因型;在安哥拉山羊中检测到AA、BB、CC、AB、AC和BC共6种基因型。测序分析发现BB型与AA型相比在外显子2的第94bp处有G→A突变,并引起氨基酸改变(丙氨酸→苏氨酸);CC型与AA型相比在外显子2的第174bp有一处C→T沉默突变。济宁青山羊AA、AB和AC基因型频率分别为0.686、0.137和0.177。AA基因型济宁青山羊产羔数最小二乘均值比AB基因型的多0.78只(P<0.05),比AC基因型的多0.64只(P<0.05)。 展开更多
关键词 山羊 高繁殖力 促卵泡素β亚基基因 pcr-sscp
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浓香型大曲原核微生物群落的PCR-SSCP解析 被引量：46
9
作者 罗惠波 黄治国 +2 位作者 李浩 张强 卫春会 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第9期1363-1367,共5页
采用PCR-SSCP(单链构象多态性)技术对浓香型大曲发酵过程中原核微生物群落结构的变化情况进行了研究,结果表明:(1)发酵各时期曲样的群落结构相似,同时也具有多态性;(2)不同微生物群落具有协同和制约的复杂生态学效应;(3)各时期曲样微生... 采用PCR-SSCP(单链构象多态性)技术对浓香型大曲发酵过程中原核微生物群落结构的变化情况进行了研究,结果表明:(1)发酵各时期曲样的群落结构相似,同时也具有多态性;(2)不同微生物群落具有协同和制约的复杂生态学效应;(3)各时期曲样微生物多样性指数均在1.69～2.01之间,群落结构相对较稳定;(4)各曲样微生物群落相似性位于0.67～1.00之间,邻近时期样品间的相似性程度较高。 展开更多
关键词 大曲 pcr-sscp 16S RDNA 微生物群落
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connexin 26基因突变与国人遗传性无综合征耳聋相关性分析 被引量：36
10
作者 柯肖枚 路远 +4 位作者 刘玉和 卜定方 朱平 戚豫 刘学忠 《中华耳鼻咽喉科杂志》 CSCD 北大核心 2001年第3期163-165,I001,共4页
目的　分析国人遗传性无综合征耳聋与缝隙连接蛋白 2 6 (connexin 2 6 ,Cx 2 6 )基因突变相关性 ,从分子水平探讨该病的发病机理。方法　收集国人 35个无综合征耳聋家系中 138名成员 ,99例散发的无综合征耳聋患者以及 10 0份健康对照个... 目的　分析国人遗传性无综合征耳聋与缝隙连接蛋白 2 6 (connexin 2 6 ,Cx 2 6 )基因突变相关性 ,从分子水平探讨该病的发病机理。方法　收集国人 35个无综合征耳聋家系中 138名成员 ,99例散发的无综合征耳聋患者以及 10 0份健康对照个体的外周血DNA样本共 337份 ;采用聚合酶链反应 单链构像多态性 (polymerasechainreaction singlestandconformationalpolymorphism ,PCR SSCP)分析方法 ,初筛受试者Cx 2 6基因部分编码区的突变 ,发现异常电泳带的PCR产物直接序列分析。结果　PCR SSCP检出 2个家系 5例耳聋成员异常泳带的样本。 2个常染色体遗传性耳聋家系发现所有 5例患者Cx 2 6基因的编码区 2 33 2 35位碱基C纯合性缺失 ,导致移码突变 ,这 2个家系听力正常者为杂合性突变或无此突变。结论　国人遗传性无综合征耳聋患者的Cx 2 6基因突变热点可能与其他人种不同。Cx 2 6基因编码区 2 33 2 35位碱基C纯合性缺失可致常染色体隐性遗传性聋 。 展开更多
关键词 聋 连接蛋白 基因突变 遗传病 CX26 pcr-sscp
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MyoG基因多态性与优质肉鸡屠宰性状和肉质性状的相关性分析 被引量：37
11
作者 王琼 刘益平 +4 位作者 蒋小松 杨朝武 杜华瑞 邱莫寒 朱庆 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2007年第9期1089-1096,共8页
采用PCR-SSCP分析方法,对8个品系240只个体的大恒优质肉鸡进行了MyoG基因5′调控区的研究。结果表明,MyoG基因5′调控区存在A、B2个多态位点,结合测定的生产资料,分析了该基因5′调控区两个变异位点产生的基因型之间在屠宰性状和肉质性... 采用PCR-SSCP分析方法,对8个品系240只个体的大恒优质肉鸡进行了MyoG基因5′调控区的研究。结果表明,MyoG基因5′调控区存在A、B2个多态位点,结合测定的生产资料,分析了该基因5′调控区两个变异位点产生的基因型之间在屠宰性状和肉质性状的差异并进行了最小二乘分析和显著性检验。表明MyoG基因对鸡的肌纤维生长发育有显著的正相关。 展开更多
关键词 鸡 MYOG基因 pcr-sscp 屠体性状 肉质性状 相关分析
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应用PCR-SSCP快速鉴定结核分枝杆菌复合群 被引量：25
12
作者 李洪敏 吴雪琼 +2 位作者 张俊仙 王巍 程红群 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第3期202-204,共3页
通过聚合酶链反应（ＰＣＲ）－单链构象多态性（ＳＳＣＰ）技术分析结核分枝杆菌和非结核分枝杆菌临床株的１６ＳｒＤＮＡ基因。６０例临床标本中，２０例为阳性，与传统方法比较无差异。其中分型：１８例为结核分枝杆菌，２例为结核分... 通过聚合酶链反应（ＰＣＲ）－单链构象多态性（ＳＳＣＰ）技术分析结核分枝杆菌和非结核分枝杆菌临床株的１６ＳｒＤＮＡ基因。６０例临床标本中，２０例为阳性，与传统方法比较无差异。其中分型：１８例为结核分枝杆菌，２例为结核分枝杆菌和非结核分枝杆菌双重感染。２０例阴性标本中，ＰＣＲ－ＳＳＣＰ又检查出５例阳性。２０例对照标本中，３种传统方法与ＰＣＲ－ＳＳＣＰ法均检测为阴性。全部试验３ｄ报告结果。结核分枝杆菌复合群和卡介苗的图形相同以外，其它分枝杆菌的ＰＣＲ－ＳＳＣＰ电泳图谱均有差异。所以，应用ＰＣＲ－ＳＳＣＰ技术快速鉴定结核分枝杆菌是可行的。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌复合群 pcr-sscp 鉴定 16SrDNA
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活性污泥微生物菌群研究方法进展 被引量：33
13
作者 朱海霞 陈林海 +7 位作者 张大伟 赵现方 杨天佑 陈洪卫 闫亚娟 汪杏莉 秦广雍 李宗义 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期314-322,共9页
活性污泥是活性污泥法处理污水系统的功能主体。人类对活性污泥微生物菌群的认识随着其研究方法的发展而逐步深入。传统培养方法只能检测到活性污泥中1％～15％的微生物。随着一系列基于免培养的分子生物学技术的出现，活性污泥中菌群... 活性污泥是活性污泥法处理污水系统的功能主体。人类对活性污泥微生物菌群的认识随着其研究方法的发展而逐步深入。传统培养方法只能检测到活性污泥中1％～15％的微生物。随着一系列基于免培养的分子生物学技术的出现，活性污泥中菌群的复杂性和多样性以惊人的速度被人们认识，大量依靠传统检测方法未能发现却在活性污泥中起关键作用的微生物逐渐被发现。许多模拟活性污泥菌群生存环境条件的现代培养技术开始发展，且已成功培养了一部分传统培养方法不能培养的细菌类群，这为研究基于免培养方法发现的大量新的微生物菌群的生理特性和作用机制提供了可能，也无疑将把人们对活性污泥菌群的认识推向一个新的层次．主要介绍活性污泥微生物菌群研究的一系列方法，从传统培养方法到基于免培养的现代分子生物学技术，再到现代培养技术，着重论述了现代分子生物学技术及其在活性污泥微生物菌群研究中的进展。 展开更多
关键词 活性污泥 菌群 16S RRNA pcr-DGGE pcr-sscp FISH FCM
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山羊生长分化因子9基因外显子2的PCR-SSCP分析 被引量：27
14
作者 吴泽辉 储明星 +4 位作者 李学伟 方丽 叶素成 刘忠慧 陈国宏 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期802-808,共7页
目的寻找与产羔数相关的遗传标记,为山羊高繁殖力的标记辅助选择提供科学依据。方法以控制Belclare绵羊和Cambridge绵羊高繁殖力的生长分化因子9(growthdifferentiationfactor9,GDF9)基因为候选基因,根据绵羊GDF9基因序列设计4对引物,采... 目的寻找与产羔数相关的遗传标记,为山羊高繁殖力的标记辅助选择提供科学依据。方法以控制Belclare绵羊和Cambridge绵羊高繁殖力的生长分化因子9(growthdifferentiationfactor9,GDF9)基因为候选基因,根据绵羊GDF9基因序列设计4对引物,采用PCR-SSCP技术检测GDF9基因外显子2在高繁殖力山羊品种(济宁青山羊)以及低繁殖力山羊品种(波尔山羊、文登奶山羊、辽宁绒山羊、北京本地山羊)中的单核苷酸多态性,同时研究该基因对济宁青山羊高繁殖力的影响。结果山羊与绵羊的GDF9基因外显子2核苷酸序列同源性为99%(955/965)。引物1和引物4存在多态性。对于引物1扩增片段,5个山羊品种均检测到AA、AB和BB3种基因型,测序分析发现外显子2第26bp处有1个G→A的单碱基突变,但没有引起氨基酸改变;济宁青山羊A等位基因频率为0.9128,B等位基因频率为0.0872;AA基因型济宁青山羊产羔数最小二乘均值比AB基因型的多0.54只(P<0.01),比BB基因型的多0.63只(P<0.01)。对于引物4扩增片段,5个山羊品种均检测到CC、CD和DD3种基因型,测序分析发现外显子2第792bp处有1个G→A的单碱基突变并且导致缬氨酸改变为异亮氨酸;济宁青山羊C等位基因频率为0.9266,D等位基因频率为0.0734;CC基因型济宁青山羊产羔数最小二乘均值比CD基因型的多0.57只(P<0.01),比DD基因型的多0.62只(P<0.01)。结论初步表明GDF9基因可能是控制济宁青山羊多胎性能的一个主效基因或是与之存在紧密遗传连锁的分子标记。 展开更多
关键词 山羊 高繁殖力 生长分化因子9基因 pcr-sscp
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秦川牛GHR基因SNPs及其与生长性状关系的研究 被引量：29
15
作者 赵高锋 陈宏 +5 位作者 雷初朝 张春雷 张丽 蓝贤勇 房兴堂 康湘涛 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期319-323,共5页
利用PCR-SSCP技术研究了136头秦川牛GHR基因第10外显子多态性,所研究的秦川牛群体GHR基因该座位存在多态性,发现了A、B、C3个等位基因,其基因频率依次为0.5956、0.2905、0.1140,并且群体处于Hardy-Weinberg平衡状态。对纯合基因型个体... 利用PCR-SSCP技术研究了136头秦川牛GHR基因第10外显子多态性,所研究的秦川牛群体GHR基因该座位存在多态性,发现了A、B、C3个等位基因,其基因频率依次为0.5956、0.2905、0.1140,并且群体处于Hardy-Weinberg平衡状态。对纯合基因型个体进行测序,测序结果,该座位存在两个突变位点。通过构建最小二乘线性模型,分析了生长激素受体基因与生长性状的关系,表明生长激素受体基因的AB基因型效应在部分生长性状上高于其他基因型,差异达到显著水平,提示GHR基因有可能作为秦川牛生长性状的侯选基因。 展开更多
关键词 秦川牛 pcr-sscp 生长激素受体基因 多态性
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猪UCP3基因部分编码区序列分析及其单核苷酸多态与胴体、肉质性状的遗传效应 被引量：29
16
作者 涂荣剑 邓昌彦 熊远著 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第8期807-812,共6页
以猪解耦联蛋白基因 3(UCP3)作为控制猪胴体与肉质性状主基因的候选基因。利用直接测序法对 4个品种猪骨骼肌中UCP3基因的部分编码区序列 (第 4外显子部分及第 5、6、7外显子全部片段 )进行比较分析 ,发现3个cSNP位点 ,其中ORF中第 84 ... 以猪解耦联蛋白基因 3(UCP3)作为控制猪胴体与肉质性状主基因的候选基因。利用直接测序法对 4个品种猪骨骼肌中UCP3基因的部分编码区序列 (第 4外显子部分及第 5、6、7外显子全部片段 )进行比较分析 ,发现3个cSNP位点 ,其中ORF中第 84 2碱基的突变可导致相应编码氨基酸序列的改变 :甲硫氨酸→苏氨酸 ,选取此位点作为猪UCP3基因的多态位点。用PCR SSCP检测方法在 3个品种猪中进行该cSNP位点多态性片段的基因型分型 ,结果显示在 3个猪群中表现出 3种基因型 (AA、AB、BB) ,χ2 独立性检验结果表明 3种基因型在各品种间分布不一致 ,梅山猪同大白、长白猪分别比较差异极显著 (P <0 0 1) ;对大白×梅山资源家系F2 代 139头个体进行了该多态片段的基因型鉴定 ,并对其基因型与所检测个体相应的胴体、肉质性状采用GLM分析进行遗传效应研究 ,结果表明 :该基因对一些胴体、肉质性状有显著性影响 ,并且该基因以加性效应为主 (如 ,眼肌高度、背最长肌色值、系水力的加性效应都达显著水平 )。因此 ,推测UCP3基因可能是影响猪胴体及肉质性状的主效基因或与主效基因紧密连锁的标记基因 ,并且能够在分子标记辅助选择中用于对猪胴体。 展开更多
关键词 UCP3 cSNP pcr-sscp 遗传效应分析
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ESR与PRLR基因对民猪产仔数的影响 被引量：25
17
作者 李婧 孟和 +2 位作者 李长龙 孙立彬 潘玉春 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2003年第4期11-17,共7页
采用PCR -SSCP ,检测ESR与PRLR基因的多态性 ,并采用混合模型统计了基因型与表型值 (产仔数 )的相关性 ,分析了民猪ESR与PRLR基因各基因型及其合并基因型对民猪产仔数性状的影响。结果表明 :就民猪总产仔数、活产仔数的最小二乘均值而言... 采用PCR -SSCP ,检测ESR与PRLR基因的多态性 ,并采用混合模型统计了基因型与表型值 (产仔数 )的相关性 ,分析了民猪ESR与PRLR基因各基因型及其合并基因型对民猪产仔数性状的影响。结果表明 :就民猪总产仔数、活产仔数的最小二乘均值而言 :ESR基因基因型间 ,AB型较AA和BB高 ,差异不显著 (P >0 .0 5 ) ;PRLR基因基因型间 ,AA >BB >AB ,差异也不显著 (P >0 .0 5 ) ;两基因的互作效应显著 (P <0 .0 5 ) ,其中ESR与PRLR基因的合并基因型AAAA为最佳的合并基因型 (P <0 .0 5 )。 展开更多
关键词 民猪 ESR PRLR pcr-sscp 合并基因型 产仔数
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山羊生长激素基因5′调控区的多态性分析 被引量：23
18
作者 李美玉 闵令江 +3 位作者 孙国强 潘庆杰 沈伟 王广莲 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期831-835,共5页
以鲁北白山羊、引进波尔山羊、纯繁波尔山羊以及鲁北白山羊与波尔山羊的杂交一代、回交一代共计 2 74个个体为研究材料 ,用两对引物分别扩增山羊生长激素 (GH)基因 5′区的 2 6～ 2 39bp以及 2 2 5～ 4 2 9bp片段 ,扩增产物经SSCP分析... 以鲁北白山羊、引进波尔山羊、纯繁波尔山羊以及鲁北白山羊与波尔山羊的杂交一代、回交一代共计 2 74个个体为研究材料 ,用两对引物分别扩增山羊生长激素 (GH)基因 5′区的 2 6～ 2 39bp以及 2 2 5～ 4 2 9bp片段 ,扩增产物经SSCP分析发现均存在多态性。在 2 6～ 2 39bp片段上 ,波尔山羊及杂交后代以AA型个体占多数 ,而鲁北白山羊则BB型个体较多 ;在 2 2 5～ 4 2 9bp片段上 ,所有种群均以CC型个体较多。对两个片段的纯合型 (AA ,BB ;CC ,DD)分别克隆测序发现 :(1) 2 6～ 2 39bp片段上AA型在第 6 0位发生了C→T的突变 ,第 2 11位发生碱基C的丢失 ,(2 ) 2 2 5～ 4 2 9bp片段上 ,DD型存在 3处突变 ,分别为 2 6 4位由T→C ,2 92位由T→A ,372位由C→T。上述结果为首次实验证实山羊生长激素 展开更多
关键词 山羊 生长激素基因 pcr—sscp 遗传多态性
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鸡H-FABP基因多态性及其与屠宰性能的关联分析 被引量：27
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作者 游小燕 刘益平 +1 位作者 朱庆 杨志勤 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期230-234,共5页
以90日龄草科鸡为实验材料,对H-FABP基因进行PCR扩增,采用PCR-SSCP技术结合测序分析了H-FABP基因在草科鸡中的多态性。结果表明:草科鸡中存在332G→A、534G→A、835C→T、1131→A、1294C→A、2329C→T、2372C→T、2636C→T等8处突变。... 以90日龄草科鸡为实验材料,对H-FABP基因进行PCR扩增,采用PCR-SSCP技术结合测序分析了H-FABP基因在草科鸡中的多态性。结果表明:草科鸡中存在332G→A、534G→A、835C→T、1131→A、1294C→A、2329C→T、2372C→T、2636C→T等8处突变。经过基因型与屠宰性能的关联分析得知:在7对产生多态的引物中,只有第1对引物的各基因型与活重、屠体重、胸肌重、腿肌重和半净膛重差异显著(P<0.05);全净膛重在不同基因型间差异极显著(P<0.01)。由此推测,H-FABP可能对于鸡屠宰性能具有很大的影响或与控制屠宰性能的主基因连锁。 展开更多
关键词 H-FABP pcr-sscp 草科鸡 屠宰性能
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催乳素受体基因外显子10多态性及其与济宁青山羊高繁殖力关系的研究 被引量：28
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作者 张跟喜 储明星 +2 位作者 王金玉 方丽 叶素成 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期329-336,共8页
设计5对引物,采用PCR-SSCP技术检测催乳素受体(prolactin receptor,PRLR)基因外显子10及部分3′非翻译区在高繁殖力山羊品种(济宁青山羊)和低繁殖力山羊品种(辽宁绒山羊、波尔山羊和安哥拉山羊)中的单核苷酸多态性,同时研究该基因对济... 设计5对引物,采用PCR-SSCP技术检测催乳素受体(prolactin receptor,PRLR)基因外显子10及部分3′非翻译区在高繁殖力山羊品种(济宁青山羊)和低繁殖力山羊品种(辽宁绒山羊、波尔山羊和安哥拉山羊)中的单核苷酸多态性,同时研究该基因对济宁青山羊高繁殖力的影响。结果表明:首次拼接出的山羊PRLR基因外显子10及部分3′非翻译区的核苷酸序列长度为1,118bp,与已公布的绵羊、牛、人PRLR基因mRNA相应序列的同源性分别为98.33%、93.92%、74.52%,与已公布的羊驼PRLR基因部分序列的同源性为78.29%。引物P1、P2与P4扩增片段具有多态性,其余2对引物的扩增片段不存在多态性。对于P1扩增片段,在济宁青山羊和辽宁绒山羊中检测到AA型和AB型,在安哥拉山羊中检测到AA型和AC型,在波尔山羊中只检测到AA型;克隆测序表明AB型与AA型相比有两处突变(186G→A和220T→C),分别导致氨基酸由天冬氨酸变为天冬酰胺、亮氨酸变为脯氨酸;AC型与AA型相比有1处突变(140A→G),该突变没有导致氨基酸变化;济宁青山羊AA和AB基因型之间产羔数的最小二乘均值差异不显著(P>0.05)。对于P2扩增片段,在济宁青山羊、辽宁绒山羊和波尔山羊中都检测到DD型和DE型,而在安哥拉山羊中只检测到DD型;克隆测序表明DE型和DD型相比有两处突变(52G→A和122G→A),其中122bp处的突变导致氨基酸由精氨酸变为甘氨酸;济宁青山羊DD和DE基因型之间产羔数的最小二乘均值差异不显著(P>0.05)。对于P4扩增片段,在济宁青山羊中检测到FF型和FG型,在辽宁绒山羊中检测到FF型和GG型,在波尔山羊中只检测到FF型,在安哥拉山羊中检测到FF型、FG型和GG型;克隆测序表明GG型和FF型相比在扩增片段的143bp处发生1处碱基突变(A→G),并导致氨基酸由蛋氨酸变为缬氨酸;FG基因型济宁青山羊产羔数最小二乘均值比FF基因型的多0.76只(P<0.05)。研究结果初步表明:PRLR 展开更多
关键词 山羊 高繁殖力 催乳素受体基因 pcr-sscp
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