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鱼类线粒体DNA研究新进展 被引量:173
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作者 郭新红 刘少军 +1 位作者 刘巧 刘筠 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第9期983-1000,共18页
线粒体DNA是分子生物学研究中的一个热门领域 ,已成为鱼类进化生物学和群体遗传学研究的重要分子遗传标记。本文对鱼类线粒体DNA分子生物学的最新研究进展进行了较详细的阐述 ,重点介绍鱼类线粒体DNA全序列的研究进展、组成及特征 ,鱼... 线粒体DNA是分子生物学研究中的一个热门领域 ,已成为鱼类进化生物学和群体遗传学研究的重要分子遗传标记。本文对鱼类线粒体DNA分子生物学的最新研究进展进行了较详细的阐述 ,重点介绍鱼类线粒体DNA全序列的研究进展、组成及特征 ,鱼类线粒体DNA非编码区结构研究进展 ,鱼类线粒体DNA多态性及其主要的检测方法 ;综述了最近有关鱼类线粒体DNA在鱼类系统学、种间杂交渐渗、种群识别、起源和进化、地理分化等研究中的应用情况。 展开更多
关键词 鱼类 线粒体DNA 线粒体DNA控制区 多态性 分子进化
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SNP分子标记的研究及其应用进展 被引量:141
2
作者 唐立群 肖层林 王伟平 《中国农学通报》 CSCD 2012年第12期154-158,共5页
SNP标记作为第三代分子标记,在分子遗传学、药物遗传学、法医学以及疾病的诊断和治疗等方面发挥着重要作用。介绍了SNP标记的定义与特点,对近年来以SNP标记为基础构建的Bin图谱、高通量SNP芯片分型以及以SNP标记为基础进行群体进化研究... SNP标记作为第三代分子标记,在分子遗传学、药物遗传学、法医学以及疾病的诊断和治疗等方面发挥着重要作用。介绍了SNP标记的定义与特点,对近年来以SNP标记为基础构建的Bin图谱、高通量SNP芯片分型以及以SNP标记为基础进行群体进化研究等三方面的应用概况进行了简述。提出了SNP标记现阶段发展存在的问题,并对其发展前景予以展望。 展开更多
关键词 SNP 分子标记 Bin图谱 芯片分型 群体进化
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分子进化研究中系统发生树的重建 被引量:54
3
作者 常青 周开亚 《生物多样性》 CAS CSCD 1998年第1期55-62,共8页
在现代分子进化研究中,根据现有生物基因或物种多样性来重建生物的进化史是一个非常重要的问题。一个可靠的系统发生的推断,将揭示出有关生物进化过程的顺序,有助于我们了解生物进化的历史和进化机制。本文简要介绍了系统发生树推断... 在现代分子进化研究中,根据现有生物基因或物种多样性来重建生物的进化史是一个非常重要的问题。一个可靠的系统发生的推断,将揭示出有关生物进化过程的顺序,有助于我们了解生物进化的历史和进化机制。本文简要介绍了系统发生树推断的几个重要问题:建树方法、数据转换、树的可靠性及目前使用较多的几种分析软件。 展开更多
关键词 分子进化 系统发生树 DNA标记 序列
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从超氧化物歧化酶的分布和结构看其分子进化 被引量:70
4
作者 陈淮杨 刘望夷 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1996年第5期408-413,共6页
超氧化物歧化酶(SOD)是一种催化超氧化物阴离子自由基发生歧化反应,生成氧和过氧化氢的金属酶.按其结合的金属离子,区分为Fe-SOD,Mn-SOD和CuZn-SOD三种.Fe-SOD主要存在于原核细胞中;Mn-SOD... 超氧化物歧化酶(SOD)是一种催化超氧化物阴离子自由基发生歧化反应,生成氧和过氧化氢的金属酶.按其结合的金属离子,区分为Fe-SOD,Mn-SOD和CuZn-SOD三种.Fe-SOD主要存在于原核细胞中;Mn-SOD在原核和真核细胞中都存在;CuZn-SOD主要存在于真核细胞中.Fe,Mn-SOD的一级结构,空间结构及其性质很相似,来自一个共同的祖先;CuZn-SOD的结构与前两者相差较大,是在以后的发展中单独进化的. 展开更多
关键词 超氧化物歧化酶 分布 结构 分子进化
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低等鲤科鱼类RAPD分析及系统发育研究 被引量:34
5
作者 何舜平 王伟 陈宜瑜 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第2期101-106,共6页
通过对鲤科鱼类30个个体所代表的18个种的随机扩增,作者得到了大量有系统发育信息的DNA多态片段。通过Rapdplot程序将DNA的多态片段转换成遗传距离(d=1-S,S=2NxNy/Nx+Ny)。该遗传距离的矩阵经PHYLIP软件包中的Neighbor(option... 通过对鲤科鱼类30个个体所代表的18个种的随机扩增,作者得到了大量有系统发育信息的DNA多态片段。通过Rapdplot程序将DNA的多态片段转换成遗传距离(d=1-S,S=2NxNy/Nx+Ny)。该遗传距离的矩阵经PHYLIP软件包中的Neighbor(option=NJ)程序处理后,生成了低等鲤科鱼类代表属种的分支系统图。从该系统图可以看出:RAPD分析方法在鲤科鱼类的系统发育研究中有一定的局限性,它比较适合于亚科内属间系统发育的研究。结果显示亚科并不是一个单元类群,其中的马口鱼类和细鲫类各自形成单元群,但这两个类群间的关系并不直接联系。在分析结果中,分布于东亚的雅罗鱼亚科鱼类比亚科鱼类更原始。 展开更多
关键词 鲤科 系统发育 分子进化 RAPD分析
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鹰科四种鸟类线粒体DNA的差异和分子进化关系的研究 被引量:18
6
作者 李庆伟 田春宇 李爽 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2001年第6期529-534,共6页
采用聚合酶链反应 ,从雀鹰、大、秃鹰、灰脸鹰 4种鸟类中分别扩增出线粒体DNA细胞色素b基因 ,并测定出 10 86bp的碱基序列 ,它们之间的序列差异在 10 .31%~ 16 .5 7%之间。DNA一级序列数据显示 ,这 4种鸟类DNA序列变异丰富 ,MEGA1.... 采用聚合酶链反应 ,从雀鹰、大、秃鹰、灰脸鹰 4种鸟类中分别扩增出线粒体DNA细胞色素b基因 ,并测定出 10 86bp的碱基序列 ,它们之间的序列差异在 10 .31%~ 16 .5 7%之间。DNA一级序列数据显示 ,这 4种鸟类DNA序列变异丰富 ,MEGA1.0 1数据软件构建了 4种鸟类的分子系统树 ,与化石资料和形态学研究结果相吻合。 展开更多
关键词 鹰科 线粒体DNA 细胞色素B 分子进化 鸟类
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分子标记技术在杨树遗传变异及系统分类中的应用 被引量:22
7
作者 张德强 张志毅 杨凯 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期76-80,共5页
该文介绍了在杨树分子基因组研究中常用的 3种分子标记RFLP ,RAPD和AFLP ,并综述了这 3种分子标记技术在杨树遗传变异。
关键词 杨树 分子标记 遗传变异 系统分类 应用
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赤潮叉角藻18SrDNA和ITS区序列测定与分析 被引量:33
8
作者 庄丽 陈月琴 +1 位作者 李钦亮 屈良鹄 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2001年第2期148-154,共7页
采用PCR及克隆测序的方法 ,对 1 998年引发渤海赤潮的叉角藻 1 8SrRNA基因及rDNAITS区 (InternalTranscribedSpacerRegions)进行了序列测定与分析。并通过因特网从国际分子生物学数据库中获取甲藻另外 1 5个种的 1 8SrDNA序列 ,以Tetrah... 采用PCR及克隆测序的方法 ,对 1 998年引发渤海赤潮的叉角藻 1 8SrRNA基因及rDNAITS区 (InternalTranscribedSpacerRegions)进行了序列测定与分析。并通过因特网从国际分子生物学数据库中获取甲藻另外 1 5个种的 1 8SrDNA序列 ,以Tetrahymenacorlissi作为外类群 ,分别采用Neighbor Joining和Fitch方法构建了甲藻较为一致和可靠的进化树图 ,探讨具有高度多样性和在分类上争议较多的甲藻各类群之间的形态与分子进化关系。结果表明 ,Prorocentrum(有 2个简单的壳板 )出现得较早 ,而大多数多甲藻目 (覆盖着多个壳板 )、裸甲藻目 (大多数不具壳板 )和膝沟藻目的成员较晚出现。另外 ,对叉角藻ITS区的分析表明 ,ITS区为高变区 ,是良好的分子标记 。 展开更多
关键词 叉角藻 18SrDNA ITS区 形态演化 分子进化 赤潮 浮游植物
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National Epidemiology and Evolutionary History of Four Hand, Foot and Mouth Disease-Related Enteroviruses in China from 2008 to 2016 被引量:39
9
作者 Xuemin Fu Zhenzhou Wan +3 位作者 Yanpeng Li Yihong Hu Xia Jin Chiyu Zhang 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2020年第1期21-33,共13页
Hand, foot and mouth disease(HFMD) is a major public health concern in China. The most predominant enteroviruses that cause HFMD have traditionally been attributed to enterovirus A71(EVA71) and coxsackievirus A16(CVA1... Hand, foot and mouth disease(HFMD) is a major public health concern in China. The most predominant enteroviruses that cause HFMD have traditionally been attributed to enterovirus A71(EVA71) and coxsackievirus A16(CVA16). Since its first large outbreak in 2008, the dominant HFMD pathogens are constantly changing. In 2013 and 2015, CVA6 exceeded both EVA71 and CVA16 to become the leading cause of HFMD in some provinces. However, there still lacks a comprehensive overview on the molecular epidemiology and evolution of HFMD-related enteroviruses at the national level. In this study, we performed systematic epidemiological analyses of HFMD-related enteroviruses using the data of 64 published papers that met the inclusion criteria, and conducted phylogenetic analyses based on 12,080 partial VP1 sequences identified in China before 31 st June 2018. We found that EVA71 prevalence has decreased sharply but other enteroviruses have increased rapidly from 2008 to 2016 and that one subtype of each enterovirus is represented during the epidemic. In addition, four genotypes EVA71_C4, CVA16_B1, CVA6_D and CVA10_C are the most predominant enterovirus strains and collectively they cause over 90% of all HFMD cases in China according to the phylogenetic trees using representative partial VP1 sequences. These four major enterovirus genotypes have different geographical distributions, and they may cocirculate with other genotypes and serotypes. These results suggest that more molecular epidemiological studies should be performed on several enteroviruses simultaneously, and such information should have implications for virological surveillance, disease management, vaccine development and policy-making on the prevention and control of HFMD. 展开更多
关键词 ENTEROVIRUS Hand foot and MOUTH disease(HFMD) molecular EPIDEMIOLOGY evolution Genotype
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海洋生物DNA条形码研究现状与展望 被引量:37
10
作者 林森杰 王路 +6 位作者 郑连明 董云伟 柳淑芳 丁少雄 叶乃好 曹文清 庄志猛 《海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期1-17,共17页
海洋生物种类多样,分布广泛,具有复杂性、多样性和趋同性等特点,为了对物种进行更快速、准确地鉴定,急需在传统形态分类学基础上,建立并结合便捷准确的分子鉴定手段。DNA条形码提供了可信息化的分类标准和有效的分类学手段,已成为近年... 海洋生物种类多样,分布广泛,具有复杂性、多样性和趋同性等特点,为了对物种进行更快速、准确地鉴定,急需在传统形态分类学基础上,建立并结合便捷准确的分子鉴定手段。DNA条形码提供了可信息化的分类标准和有效的分类学手段,已成为近年来分类学与生物多样性研究中重要的技术依托。本文概述了DNA条形码当前的发展现状与趋势,并介绍了DNA条形码技术在主要海洋浮游植物(红藻、褐藻、绿藻、硅藻、甲藻)、无脊椎动物(海绵动物、刺胞动物、甲壳动物和软体动物等)和鱼类中的研究进展,以及不同条形码基因针对于不同生物类群的有效性和适用性,指出了目前条形码技术在各海洋类群中存在的主要问题,并对未来的相关工作做了展望,希望为今后我国的海洋生物DNA条形码研究提供理论基础。 展开更多
关键词 DNA条形码 海洋生物 形态分类 分子分类进化 条形码基因
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暗纹东方鲀线粒体COI及其侧翼tRNA基因的克隆与序列分析 被引量:29
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作者 邵爱华 朱江 +2 位作者 陈葵 史全良 姚炜雯 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第8期963-971,共9页
以暗纹东方鲀(Takifugu fasciatus)肝脏的线粒体DNA为模板,按照红鳍东方鲀线粒体DNA序列设计合成特异引物进行PCR扩增,克隆并测定了线粒体细胞色素氧化酶I亚基(COI)及其侧翼tRNA基因的全序列,结果显示,克隆了暗纹东方鲀COI基因1 546 bp... 以暗纹东方鲀(Takifugu fasciatus)肝脏的线粒体DNA为模板,按照红鳍东方鲀线粒体DNA序列设计合成特异引物进行PCR扩增,克隆并测定了线粒体细胞色素氧化酶I亚基(COI)及其侧翼tRNA基因的全序列,结果显示,克隆了暗纹东方鲀COI基因1 546 bp及其5′端上游的tRNATyr基因和3′端下游的tRNASer基因序列共1 766 bp。用DNA分析软件对暗纹东方鲀与GenBank中10个目14种鱼类的COI序列进行比较分析,显示暗纹东方鲀与这些鱼类的COI基因具有较高的同源性,与同属红鳍东方鲀的同源性最高为97.6%,与同目不同科的矛尾翻车鲀和翻车鲀的同源性为76.5%和75.4%。根据暗纹东方鲀与其他1 314种鱼的COI基因序列同源性所建立的进化树,与传统的分类地位基本吻合。推定的这两种tRNA的二级结构都具有典型的三叶草型结构。 展开更多
关键词 暗纹东方鲀 线粒体DNA COI 系统学
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蓖麻蚕线粒体基因组细胞色素氧化酶亚基Ⅲ的序列及其分子进化分析 被引量:29
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作者 魏兆军 赵巧玲 +3 位作者 张志芳 肖庆利 王章娥 何家禄 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期193-197,共5页
测定了蓖麻蚕Samiacynthiaricini线粒体基因组 (mtDNA)含完整的细胞色素氧化酶亚基Ⅲ (COX3)、tRNA Gly和部分的NADH亚基Ⅲ (ND3)基因的DNA片段序列。COX3基因编码框包含 789个核苷酸 ,编码 2 6 2个氨基酸的蛋白质。通过同源性比较 ,发... 测定了蓖麻蚕Samiacynthiaricini线粒体基因组 (mtDNA)含完整的细胞色素氧化酶亚基Ⅲ (COX3)、tRNA Gly和部分的NADH亚基Ⅲ (ND3)基因的DNA片段序列。COX3基因编码框包含 789个核苷酸 ,编码 2 6 2个氨基酸的蛋白质。通过同源性比较 ,发现COX3基因的 3′端比 5′端要保守 ,其编码的蛋白在C端有两个保守序列存在。COX3的下游为 6 6bp的tRNA Gly基因。蓖麻蚕的COX3与家蚕COX3同源性最高 ,核苷酸和氨基酸序列同源性分别是 80 2 %和 85 6 %。根据COX3氨基酸序列进行了 12种无脊椎动物的分子进化树分析 ,认为在采用线粒体基因序列进行分子进化分析时 ,应该综合考虑物种的繁殖模式及生态特点。 展开更多
关键词 蓖麻蚕 线粒体基因组 细胞色素氧化酶亚基Ⅲ 序列 COX3基因 分子进化
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葡萄基因组密码子使用偏好模式研究 被引量:32
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作者 续晨 蔡小宁 +1 位作者 钱保俐 贲爱玲 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期409-415,共7页
根据完整基因组序列,运用多元统计分析和对应分析的方法,探讨了葡萄全基因组序列密码子的使用模式和影响密码子使用的各种可能因素。结果显示:葡萄密码子偏好性主要受到碱基差异(r=0.925)和自然选择(r=0.193)共同作用的影响,突变压力占... 根据完整基因组序列,运用多元统计分析和对应分析的方法,探讨了葡萄全基因组序列密码子的使用模式和影响密码子使用的各种可能因素。结果显示:葡萄密码子偏好性主要受到碱基差异(r=0.925)和自然选择(r=0.193)共同作用的影响,突变压力占了主导因素,自然选择的作用较小。同时基因长度和蛋白质疏水性也对密码子的偏好性有所影响。确定了葡萄的20个最优密码子。 展开更多
关键词 分子进化 密码子用法 密码子偏好性
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植物热激蛋白70基因家族及其生物学功能研究进展 被引量:32
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作者 王明强 张道远 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期421-428,共8页
植物热激蛋白70(heat shock protein 70,Hsp70)是热激蛋白家族中保守、普遍表达的家族,有两个主要功能区:N端核酸结合区和C端底物结合区。通常Hsp70具有分子伴侣功能,参与新生蛋白的折叠、转运、重折叠变性蛋白、协助降解变性蛋白;Hsp7... 植物热激蛋白70(heat shock protein 70,Hsp70)是热激蛋白家族中保守、普遍表达的家族,有两个主要功能区:N端核酸结合区和C端底物结合区。通常Hsp70具有分子伴侣功能,参与新生蛋白的折叠、转运、重折叠变性蛋白、协助降解变性蛋白;Hsp70不仅受高温胁迫诱导,且受其它多种胁迫诱导;同时,Hsp70参与植物正常发育过程。Hsp70基因分布广泛,序列高度保守,在植物基因组中以基因家族形式存在,最近广泛用于遗传多样性和系统发育研究。文章对植物中Hsp70的基因家族、结构、表达调控机制和生物学功能进行了综述。 展开更多
关键词 热激蛋白70 基因家族 分子伴侣 调控机制 进化分析
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从12SrRNA基因序列探讨8种鳄类的系统学关系 被引量:17
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作者 吴孝兵 王义权 +4 位作者 周开亚 童宗中 聂继山 王朝林 谢万树 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第5期522-527,共6页
测得扬子鳄 (Alligatorsinensis)和暹罗鳄 (Crocodylussiamensis)的mtDNA 12SrRNA基因片段的部分序列 ,与GenBank中的 2种鳄及文献中 4种鳄的 12SrRNA基因相应片段 ,经比对后构建系统树。其结果显示 ,现存鳄类为单系起源 ,可划分为 3个... 测得扬子鳄 (Alligatorsinensis)和暹罗鳄 (Crocodylussiamensis)的mtDNA 12SrRNA基因片段的部分序列 ,与GenBank中的 2种鳄及文献中 4种鳄的 12SrRNA基因相应片段 ,经比对后构建系统树。其结果显示 ,现存鳄类为单系起源 ,可划分为 3个科 ,即 :鳄科、食鱼鳄科和假食鱼鳄科。食鱼鳄与假食鱼鳄亲缘关系较近 ,支持将假食鱼鳄作为食鱼鳄科的一个属 ,与以形态学为基础的研究结果不同。在钝吻鳄科中 ,扬子鳄与凯门鳄亲缘关系较远 ,而与密西西比鳄的亲缘关系虽较近 ,但它们的确存在很多差异 ,两者 12SrRNA基因序列差异达12 12 % ,碱基的颠换数为 9。在基于碱基转换和颠换的NJ系统树及仅基于碱基颠换的NJ系统树中 ,前者支持扬子鳄与密河鳄间的亲缘关系较近 ,而后者支持扬子鳄与凯门鳄间的亲缘关系较近 ,说明扬子鳄与密河鳄间亲缘关系是值得研究的问题。因本文仅根据 12SrRNA基因部分序列来进行分析的 。 展开更多
关键词 鳄类 12SRRNA基因 DNA序列 分子进化 系统学
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核果类果树ITS序列分子进化及系统发育关系研究 被引量:27
16
作者 王化坤 陶建敏 +4 位作者 渠慎春 房经贵 马瑞娟 章镇 娄晓鸣 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期363-374,共12页
为研究核果类果树的进化和系统发育,选择桃、李、梅、杏、樱桃各2~4个主要种或变种共16个基因型测定其ITS序列,与从GenBank下载的6个核果类果树ITS序列形成了较为全面的数据矩阵。采用二次置根法用樱桃置根,用PAUP软件计算数据集在56... 为研究核果类果树的进化和系统发育,选择桃、李、梅、杏、樱桃各2~4个主要种或变种共16个基因型测定其ITS序列,与从GenBank下载的6个核果类果树ITS序列形成了较为全面的数据矩阵。采用二次置根法用樱桃置根,用PAUP软件计算数据集在56个进化模型的得分,Modeltest筛选最佳模型和参数,计算遗传距离、变异,用最大简约法构建了桃、李、梅、杏、樱桃的系统发育树。结果表明:1.核果类果树各组ITS1和ITS2的分子进化速率不同,信息量也不同;2.核果类果树演化顺序为:共同的原始材料分化成樱桃、李、杏,再由李进化产生桃,杏进化产生梅;3.辽杏较普通杏和西伯利亚杏原始,桃演化顺序是:巴旦杏—山桃—普通桃、新疆桃;4.本结果支持将核果类果树分成4个亚属。 展开更多
关键词 核果类 系统发育 ITS 分子进化
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雀形目10种鸟类线粒体的DNA变异及分子进化 被引量:17
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作者 李庆伟 李爽 +2 位作者 田春宇 王勇军 郭玉梅 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第5期625-632,共8页
采用 14种限制性内切酶 (ApaⅠ、BamHⅠ、BglⅡ、EcoRI、EcoRⅤ、HindⅢ、HpaⅠ、KpnⅠ、PstⅠ、PvuⅡ、SalⅠ、ScaⅠ、XbaⅠ和XhoⅠ )对雀形目 3科 10种鸟类 (蒙古百灵、喜鹊、小嘴乌鸦、白腰朱顶雀、锡嘴雀、朱雀、红腹灰雀、灰腹灰... 采用 14种限制性内切酶 (ApaⅠ、BamHⅠ、BglⅡ、EcoRI、EcoRⅤ、HindⅢ、HpaⅠ、KpnⅠ、PstⅠ、PvuⅡ、SalⅠ、ScaⅠ、XbaⅠ和XhoⅠ )对雀形目 3科 10种鸟类 (蒙古百灵、喜鹊、小嘴乌鸦、白腰朱顶雀、锡嘴雀、朱雀、红腹灰雀、灰腹灰雀、红交嘴雀和黄喉 )进行限制性片段长度多态分析 (RFLP分析 )。结果表明 :雀形目鸟类基因组大小存在遗传多态性 ,不同类群在酶切类型上表现出各自的特点 ,雀形目鸟类与非雀形目鸟类在线粒体DNA的进化速率有着相同的特点 ,化石记录的地质年代与线粒体DNA分子时钟记录的年代有着惊人的吻合 ,这两个互为独立事件的统一 ,提示线粒体DNA作为分子进化的良好工具。 展开更多
关键词 雀形目 鸟类 线粒体 DNA变异 分子进化
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黄精属植物甾体皂苷的分子进化及其化学分类学意义 被引量:26
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作者 杨崇仁 张影 +1 位作者 王东 张颖君 《云南植物研究》 CSCD 北大核心 2007年第5期591-600,共10页
在植物化学研究的基础上,按分子的氧化水平将黄精属植物的甾体皂苷元分为5个等级,通过对不同氧化水平之间分子进化规律的分析,讨论黄精属植物甾体皂苷元分子进化与形态特征的相关性。结果表明,较原始的类群通常含有氧化水平较低的甾体皂... 在植物化学研究的基础上,按分子的氧化水平将黄精属植物的甾体皂苷元分为5个等级,通过对不同氧化水平之间分子进化规律的分析,讨论黄精属植物甾体皂苷元分子进化与形态特征的相关性。结果表明,较原始的类群通常含有氧化水平较低的甾体皂苷,如:互叶系(Ser. Alternifolia);而氧化水平较高的甾体皂苷类型则大多存在于较进化的类群中,如:轮叶系(Ser. Verticillata)。这一植物化学分类学的观点有助于黄精属植物的系统分类。 展开更多
关键词 甾体皂苷 黄精属 化学分类 分子进化
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木质素合成酶C3H基因的生物信息学分析 被引量:24
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作者 薛永常 聂会忠 刘长斌 《生物信息学》 2009年第1期13-17,共5页
应用生物信息学的方法对GenBank中拟南芥、火炬松、胡麻、紫花罗兰等植物香豆酸-3-羟基化酶(c3h)基因以及本实验室克隆的欧美杨107的c3h基因(AM920690)核苷酸序列以及翻译的氨基酸序列的组成成分、导肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、蛋... 应用生物信息学的方法对GenBank中拟南芥、火炬松、胡麻、紫花罗兰等植物香豆酸-3-羟基化酶(c3h)基因以及本实验室克隆的欧美杨107的c3h基因(AM920690)核苷酸序列以及翻译的氨基酸序列的组成成分、导肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、蛋白质二级结构及功能域等进行了初步分析预测。分析表明欧美杨107的C3H氨基酸序列不存在导肽,无跨膜结构域,肽链表现为亲水性;二级结构域与P450高度匹配,其高级结构中含有由含铁血红素和半胱氨酸组成的活性中心,并构建了c3h进化树,对其分子进化进行了探讨。 展开更多
关键词 香豆酸-3-羟基化酶 生物信息学 分子进化
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昆虫乙酰胆碱酯酶基因研究进展 被引量:19
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作者 王敦 唐振华 +1 位作者 尚金燕 张传溪 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期497-503,共7页
对昆虫乙酰胆碱酯酶(acetylcholinesterase,AChE,EC3·1·1·7)的基因结构和表达等方面的研究进展进行了综述。分析了昆虫乙酰胆碱酯酶基因的结构,包括10个外显子的特征。对已经报道的昆虫AChE基因进行了系统归纳,并基于已... 对昆虫乙酰胆碱酯酶(acetylcholinesterase,AChE,EC3·1·1·7)的基因结构和表达等方面的研究进展进行了综述。分析了昆虫乙酰胆碱酯酶基因的结构,包括10个外显子的特征。对已经报道的昆虫AChE基因进行了系统归纳,并基于已知全序列的昆虫AChE基因,进行了昆虫AChE基因的分子进化分析。对昆虫AChE基因的结构特点及其功能,以及昆虫AChE基因的活性位点、AChE的变构与昆虫抗药性的关系进行了探讨。最后对昆虫AChE基因研究中存在的问题和前景进行了分析和展望。 展开更多
关键词 乙酰胆碱酯酶 乙酰胆碱酯酶基因 分子进化 基因突变 抗药性
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