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中药黄草石斛rDNA ITS序列分析 被引量：67
1
作者 徐红 李晓波 +3 位作者 丁小余 王峥涛 徐珞珊 周开亚 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第10期777-783,共7页
目的　研究黄草石斛ITS片段遗传多样性 ,分析该片段在黄草药材DNA分子鉴别和石斛属植物系统学研究中的意义。方法　用一对引物进行PCR扩增 ,扩增产物纯化后用双脱氧终止法 (Sangerdideoxy)测序。结果　获得核糖体DNA中ITS和 5 8SrDNA... 目的　研究黄草石斛ITS片段遗传多样性 ,分析该片段在黄草药材DNA分子鉴别和石斛属植物系统学研究中的意义。方法　用一对引物进行PCR扩增 ,扩增产物纯化后用双脱氧终止法 (Sangerdideoxy)测序。结果　获得核糖体DNA中ITS和 5 8SrDNA完整序列 ,14个石斛类群的ITS 1与ITS 2序列的长度分别为 2 2 8- 2 33bp和 2 42 -2 47bp。石斛种间ITS 1序列的差异百分率为 11 79% - 31 5 8% ,ITS 2序列的差异百分率为 10 2 9% - 2 5 30 % ,金钗石斛种内ITS 1序列的差异百分率为 0 87% ,ITS 2序列无差异。石斛各类群与外类群的差异百分率ITS 1序列为2 3 5 6 % - 36 89% ,ITS 2序列为 2 6 5 2 % - 33 31%。用NJ法根据ITS 1与ITS 2序列数据重建系统发生树。结论　两段序列在石斛种内保守 ,在种间有较大的差异 ,与外类群的差异最大 ,可作为中药黄草石斛分子鉴定的标记 。 展开更多
关键词 石斛属 黄草 its序列
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丹参及鼠尾草属植物的rDNA ITS序列分析 被引量：31
2
作者 汪红 王强 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2005年第9期1381-1385,共5页
目的研究丹参ITS片段遗传多样性,分析该片段在丹参药材DNA分子鉴别和鼠尾草属植物系统学研究中的意义。方法用一对引物进行PCR扩增,扩增产物纯化后用双脱氧终止法测序。结果获得核糖体DNA中ITS和5.8SrDNA完整序列,13个鼠尾草属植物ITS1... 目的研究丹参ITS片段遗传多样性,分析该片段在丹参药材DNA分子鉴别和鼠尾草属植物系统学研究中的意义。方法用一对引物进行PCR扩增,扩增产物纯化后用双脱氧终止法测序。结果获得核糖体DNA中ITS和5.8SrDNA完整序列,13个鼠尾草属植物ITS1与ITS2序列的长度分别为222～224bp、220～223bp。鼠尾草属植物种间ITS1序列差异百分率为0～12.16%,ITS2序列的差异百分率为0.5%～13.51%;丹参种内ITS1序列的差异百分率为0～0.9%,ITS2序列的差异百分率为0～0.5%;鼠尾草属各类群与外类群的差异百分率ITS1序列为16.07%～20.27%,ITS2序列为15.91%～20.27%。用邻接法(NJ)根据ITS1与ITS2序列数据建立系统发生树。结论两段序列在丹参种内保守,在属间有较大的差异,与外类群的差异最大,可作为中药丹参分子鉴定的标记,而鼠尾草属植物的系统发生关系尚须进一步研究。 展开更多
关键词 丹参 鼠尾草属 its序列
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云南羊肚菌rDNA的ITS序列与亲缘关系分析 被引量：28
3
作者 沈洪 陈明杰 +1 位作者 赵永昌 潘迎捷 《食用菌学报》 2007年第2期15-22,共8页
采用ITS（Internal Transcribed Spacers）序列比对技术分析了根据形态挑选的14个羊肚菌子实体（其中11个来自云南，3个来自浙江）。结果表明，云南的11个羊肚菌子实体（M1～M11）可分为4个种；高羊肚菌（Morchella elata），尖顶羊肚菌... 采用ITS（Internal Transcribed Spacers）序列比对技术分析了根据形态挑选的14个羊肚菌子实体（其中11个来自云南，3个来自浙江）。结果表明，云南的11个羊肚菌子实体（M1～M11）可分为4个种；高羊肚菌（Morchella elata），尖顶羊肚菌（Morchella conica），粗柄羊肚菌（Morchella crassipes）和大孔（宽肋）羊肚菌（Morchella　costata）。浙江的3个羊肚菌子实体（M12～M14）经鉴定为未知羊肚菌种。14个羊肚菌子实体样品和GenBank中黑脉（小顶）羊肚菌[Morchella　angusticeps（AJ698476）]、美味羊肚菌[Morchella　esculenta（AJ698475）]以及羊肚菌科常见属钟菌属Verpa　conica（AJ544206）的ITS序列聚类，以钟菌（AJ544206）作为外类群，可分为三大聚类群：高羊肚菌、大孔（宽肋）羊肚菌和黑脉（小顶）羊肚菌为第1类群（Group1）；美味羊肚菌和尖顶羊肚菌为第2类群（Group2）；粗柄羊肚菌和浙江的3个羊肚菌为第3类群（Group3）。 展开更多
关键词 羊肚菌 INTERNAL Transcribed Spacers序列 相似性
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白肉灵芝--中国西南地区一个重要灵芝种类 被引量：28
4
作者 沈亚恒 李挺 +3 位作者 胡惠萍 熊卫平 闫文娟 李泰辉 《食用菌学报》 CSCD 北大核心 2015年第4期49-52,F0003,共5页
通过形态、显微结构观察和ITS测序,介绍了白肉灵芝(Ganoderma leucocontextum)的正确学名、宏观形态、显微形态和分子生物学特征。
关键词 灵芝 形态学特征 its
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江苏省小麦禾谷孢囊线虫群体核糖体DNA-ITS区序列分析 被引量：24
5
作者 王暄 梁中伟 +3 位作者 裴世安 乐秀虎 李红梅 彭德良 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期55-62,共8页
对采集自江苏省徐州、宿迁、连云港和盐城4个地区的15个小麦禾谷孢囊线虫群体进行核糖体DNA-ITS区的RFLP分析。结果表明:测定的所有群体均具有相同的酶切图谱,既具有与国外"B"型群体(印度群体)相同的AluⅠ和RsaⅠ酶切图谱,同... 对采集自江苏省徐州、宿迁、连云港和盐城4个地区的15个小麦禾谷孢囊线虫群体进行核糖体DNA-ITS区的RFLP分析。结果表明:测定的所有群体均具有相同的酶切图谱,既具有与国外"B"型群体(印度群体)相同的AluⅠ和RsaⅠ酶切图谱,同时也具有中国群体独特的HinfⅠ和Tru9Ⅰ酶切图谱("C"型)。采用Neighbor-Joining法(MEGA4.0)构建的ITS序列系统进化树显示:所有15个江苏群体均聚在小麦禾谷孢囊线虫组(Heterodera avenae group)下的小麦禾谷孢囊线虫复合种群(H.avenae complex)分支内,且多数江苏群体与草地孢囊线虫(H.pratensis)德国和俄罗斯群体的遗传距离相对较近。通过江苏群体与其他近源群体的ITS序列分析比较,河南郑州群体与澳州孢囊线虫(H.australis)的遗传距离较近,青海群体和河南郑州群体在分子遗传水平上具有明显的地域性,而江苏省和我国其他省份的小麦孢囊线虫群体具有丰富的遗传多样性。 展开更多
关键词 禾谷孢囊线虫 核糖体DNA its区序列 系统发育
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不同树叶凋落物对人参土壤理化性质及微生物群落结构的影响 被引量：24
6
作者 孙海 王秋霞 +7 位作者 张春阁 李乐 刘政波 刘宁 邵财 张亚玉 严珺 李跃雄 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第10期3603-3615,共13页
树种选择是林下山参护育成败的关键,研究树叶凋落物对人参土壤养分、微生物群落结构组成的影响,旨在为林下山参护育选择适宜林地及农田栽参土壤改良提供科学依据和理论指导。通过盆栽试验,研究添加5.0 g色木槭Acer mono.Maxim.var.mono... 树种选择是林下山参护育成败的关键,研究树叶凋落物对人参土壤养分、微生物群落结构组成的影响,旨在为林下山参护育选择适宜林地及农田栽参土壤改良提供科学依据和理论指导。通过盆栽试验,研究添加5.0 g色木槭Acer mono.Maxim.var.mono(A)、赤松Pinus densiflora Sieb.et Zucc.(B)、胡桃楸Juglans mandshurica Maxim.(C)、紫椴Tilia amurensis Rupr.(D)、蒙古栎Quercus mongolica Fisch.ex Ledeb.(E)树叶凋落物到土壤中,种植人参(Panax ginseng C.A.meyer)后研究土壤理化性质以及微生物群落结构的变化。结果表明:添加不同树叶处理后人参土壤性质发生改变,土壤p H值显著高于对照土壤5.91(P<0.05),土壤全氮、速效氮磷、微生物碳氮在所有树叶处理中显著增加(P<0.05),而土壤容重、速效钾和C/N在添加树叶处理中降低。18个土壤样品基因组,经16S和ITS1测序分别得到6064和1900个OUTs。其中细菌涵盖了42门、117纲、170目、213科、225属,真菌涵盖了24门、98纲、196目、330科、435属。不同树叶处理人参土壤细菌和真菌地位发生改变,细菌Proteobacteria是树叶分解的关键微生物,添加树叶后其多样性显著高于对照(P<0.05)。而细菌Bacteroidetes和真菌Basidiomycota可能是区别阔叶林和针叶林树种的关键微生物,针叶林中含量显著低于阔叶林(P<0.05),而真菌Ascomycota是针叶林分解的关键微生物。进一步从不同分类水平上得到特定树叶凋落物的特异细菌和真菌。典型相关分析(CDA)表明细菌Bacteroidetes、Chloroflexi、Actinobacteria及真菌Basidiomycota、Zygomycota、Chytridiomycota及Ascomycota的位置及多样性的改变均与土壤因子SMBN、TN、AP、SOC、AK、C/N、p H有关。综上所述,添加不同树叶后不仅提高土壤微生物量碳氮、改善土壤理化性质,同时改变微生物群落结构组成,不同树叶处理土壤理化性质不同导致人参土壤微生物组成的差异,本结果对于林下参选地� 展开更多
关键词 人参 凋落物 群落结构 土壤养分 土壤微生物量碳 土壤微生物量氮 16S its
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基于ITS序列分析鉴定灵芝属菌种 被引量：23
7
作者 黄龙花 杨小兵 +3 位作者 张智 胡惠萍 张一帆 吴清平 《中国食用菌》 北大核心 2010年第1期55-57,共3页
针对11个本所保藏灵芝属菌株及9个灵芝属野生菌株的ITS序列,应用特异引物进行PCR扩增,对其产物进行测序,并从GenBank上下载2条赤芝(Ganoderma luncidum)、1条黑紫灵芝(Ganoderma japonicum)和1条无柄紫灵芝(Ganoderma mastoporum)的ITS... 针对11个本所保藏灵芝属菌株及9个灵芝属野生菌株的ITS序列,应用特异引物进行PCR扩增,对其产物进行测序,并从GenBank上下载2条赤芝(Ganoderma luncidum)、1条黑紫灵芝(Ganoderma japonicum)和1条无柄紫灵芝(Ganoderma mastoporum)的ITS序列,以猴头菇(Hericium erinaceum)为外类群,用NJ(Neighbor-Joining)法构建系统发育树,结果表明,20个灵芝属菌株聚为4个簇,其中赤芝组和树舌亚属的菌株各自聚为1组,其组内同源性均达99.7%以上,紫灵芝组的菌株分成2组:无柄紫灵芝和黑紫灵芝。系统发育分析也表明仅根据形态学特征难以将灵芝属菌株进行有效的分类,利用分子生物学的技术手段对灵芝菌株进行分类是一种更有效的方法,ITS序列分析在近缘种的分类鉴定上很有价值。 展开更多
关键词 灵芝属 its序列 系统发育树 鉴定
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金荞麦内转录间隔区(ITS)的扩增及序列分析 被引量：20
8
作者 吴琦 曾子贤 +2 位作者 邵继荣 陈惠 唐宇 《草业学报》 CSCD 2007年第5期127-132,共6页
以2份金荞麦为材料，对其内转录间隔区ITS区序列进行PCR扩增，均获得长约700bp的特异性产物。测序结果表明，金荞麦1号样品包含ITS序列660bp，金荞麦2号样品包含ITS序列646bp，在Genebank中的登录号分别为DQ780602和DQ780600。对现有金... 以2份金荞麦为材料，对其内转录间隔区ITS区序列进行PCR扩增，均获得长约700bp的特异性产物。测序结果表明，金荞麦1号样品包含ITS序列660bp，金荞麦2号样品包含ITS序列646bp，在Genebank中的登录号分别为DQ780602和DQ780600。对现有金荞麦ITS的序列比对表明，其同源率为80．2％～93．1％，变异位点主要在ITS1，表现出较丰富的遗传多样性。采用邻接法构建了金荞麦的系统进化树。 展开更多
关键词 金荞麦 内转录间隔区(its)序列 PCR 序列分析
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牛蒡子及其伪品的ITS序列分子鉴定研究 被引量：21
9
作者 许亮 窦德强 +3 位作者 王冰 杨燕云 康廷国 刘阳楠 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期338-341,共4页
目的:研究牛蒡子与伪品之间的DNA分子鉴别方法。方法:采集全国26个不同产地的牛蒡子药材26份和4种伪品毛头牛蒡、大翅蓟、紫穗槐、水飞蓟10份样品进行总DNA的提取,PCR扩增,对扩增产物克隆并测序,计算机软件统计分析。结果:测得了36份样... 目的:研究牛蒡子与伪品之间的DNA分子鉴别方法。方法:采集全国26个不同产地的牛蒡子药材26份和4种伪品毛头牛蒡、大翅蓟、紫穗槐、水飞蓟10份样品进行总DNA的提取,PCR扩增,对扩增产物克隆并测序,计算机软件统计分析。结果:测得了36份样品的ITS序列全长,分别为牛蒡子641 bp,毛头牛蒡为641 bp;大翅蓟为639 bp;水飞蓟为630～631bp;紫穗槐为625～626 bp,在GenBank中注册,获得登记号。牛蒡子样品间的相似度大于99%,牛蒡子与大翅蓟、水飞蓟、紫穗槐间的相似度低于95%,毛头牛蒡与牛蒡子的相似度为98.29%～99.22%。通过以ITS序列重建系统树进行的聚类分析可以将牛蒡子与伪品有效的区分开。结论:根据ITS序列,能够有效的区分牛蒡子与伪品。 展开更多
关键词 牛蒡子 its序列 分子鉴定
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中国灵芝属真菌的多样性与资源 被引量：14
10
作者 崔宝凯 潘新华 +3 位作者 潘峰 孙一翡 邢佳慧 戴玉成 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期170-178,共9页
灵芝属是大型真菌的一个重要类群,具有重要的经济价值、生态价值和文化价值。尽管国内外对灵芝属真菌的研究较多,但灵芝属真菌的分类一直存在诸多问题,我国过去报道的灵芝属真菌有114个分类单元,但其中很多的分类地位存在争议。本文基... 灵芝属是大型真菌的一个重要类群,具有重要的经济价值、生态价值和文化价值。尽管国内外对灵芝属真菌的研究较多,但灵芝属真菌的分类一直存在诸多问题,我国过去报道的灵芝属真菌有114个分类单元,但其中很多的分类地位存在争议。本文基于凭证标本,确认我国目前发现的灵芝种类有40种,其中具有ITS分子序列的种类有39种,其他74个分类单元或为同物异名或为待定种。本文提供的中国39种灵芝的ITS序列可为今后准确鉴定灵芝的野生和栽培种类提供依据。 展开更多
关键词 灵芝 its序列 药用真菌 分类
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远志属7种药用植物ITS1和ITS2序列分析 被引量：16
11
作者 樊杰 白妍 束明月 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期562-565,共4页
目的采用ITS序列进行远志属7种药用植物的分子鉴定。方法通过测定远志Polygala tenuifolia、卵叶远志P.sibirica、瓜子金P.japonica、华南远志P.glomerata、蓼叶远志P.persicariifolia、肾果小扁豆P.furcata和小花远志P.arvensis的ITS1... 目的采用ITS序列进行远志属7种药用植物的分子鉴定。方法通过测定远志Polygala tenuifolia、卵叶远志P.sibirica、瓜子金P.japonica、华南远志P.glomerata、蓼叶远志P.persicariifolia、肾果小扁豆P.furcata和小花远志P.arvensis的ITS1、ITS2序列,借助Clustal X、MEGA 3.1软件比较和分析ITS1、ITS2的序列特征。结果远志属7种药用植物ITS1长度为279~291 bp,ITS2的长度为211~219 bp,变异位点232个,信息位点53个;远志与卵叶远志的遗传距离最小,华南远志与肾果小扁豆遗传距离最大,亲缘关系最远。结论远志属7种药用植物的ITS1、ITS2序列可作为分子鉴定的依据。 展开更多
关键词 远志属 its序列 DNA条形码 物种鉴别 its1 its2
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黄芪与其混伪品的ITS序列分子鉴定研究 被引量：17
12
作者 崔占虎 李越 +2 位作者 袁庆军 周立社 李旻辉 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第24期3773-3776,共4页
目的:研究黄芪与其混伪品之间的DNA分子鉴别方法。方法:采集不同产地的黄芪药材13份,替代品红芪2份,混伪品紫花苜蓿3份和蜀葵1份,所有样品进行总DNA的提取,PCR扩增,并对扩增产物进行测序得到相应的序列,同时从GenBank下载蓝花棘豆、锦鸡... 目的:研究黄芪与其混伪品之间的DNA分子鉴别方法。方法:采集不同产地的黄芪药材13份,替代品红芪2份,混伪品紫花苜蓿3份和蜀葵1份,所有样品进行总DNA的提取,PCR扩增,并对扩增产物进行测序得到相应的序列,同时从GenBank下载蓝花棘豆、锦鸡儿2种伪品的ITS序列。用MEGA 4计算其种间的K-2-P距离,最后利用ITS序列构建其系统发育树。结果:测得了19份样品的ITS序列全长,分别为蒙古黄芪646～650 bp,膜荚黄芪为646～650 bp;红芪为664 bp;紫花苜蓿为659 bp;蜀葵为728 bp,在GenBank中注册,获得登记号。通过以ITS序列重建系统进化树进行的聚类分析可以将黄芪与其混伪品有效的区分开。结论:ITS序列能够成功鉴定黄芪及其易混伪品,可以作为黄芪与其混伪品的分子鉴定方法。 展开更多
关键词 黄芪 its序列 分子鉴定
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不同产地山药rDNA ITS区序列的比较 被引量：15
13
作者 王东 白雁 陈志红 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期54-55,共2页
目的 分析怀山药与其它产地山药的rDNA ITs区序列的差异，为山药的基源鉴定和品质评价提供分子依据。方法采用PCR扩增纯化后直接测序的方法测定不同产地山药的rDNA基因ITS核苷酸序列并作序列同源性分析。结果8种产地山药的ITS1片段长度... 目的 分析怀山药与其它产地山药的rDNA ITs区序列的差异，为山药的基源鉴定和品质评价提供分子依据。方法采用PCR扩增纯化后直接测序的方法测定不同产地山药的rDNA基因ITS核苷酸序列并作序列同源性分析。结果8种产地山药的ITS1片段长度均为165bp，ITS2片段长度均为158-160bp，5．8S片段长度为均为159bp。8种不同产地的山药ITS1和ITS2区分别有6个和9个碱基变异。结论利用ITS区序列的差异鉴别不同产区的山药提供了依据。 展开更多
关键词 山药 its区序列 聚合酶链反应
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商丘地区番茄白粉菌的鉴定 被引量：15
14
作者 王文静 裴冬丽 +2 位作者 马原松 王芳 李成伟 《河南大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2009年第5期505-508,共4页
对中国商丘地区首次检出的番茄白粉菌进行了形态特征的观察、致病性检测及分子鉴定.结果显示,该病原菌经人工接种可导致番茄栽培品种致病,发病症状与自然状态一致,而对野生品种无作用;在显微镜下分生孢子单生呈椭圆状,孢子梗直立无分支... 对中国商丘地区首次检出的番茄白粉菌进行了形态特征的观察、致病性检测及分子鉴定.结果显示,该病原菌经人工接种可导致番茄栽培品种致病,发病症状与自然状态一致,而对野生品种无作用;在显微镜下分生孢子单生呈椭圆状,孢子梗直立无分支;核糖体DNA转录间隔区(ITS)序列与来自Oidium neolycopersici的5条序列聚为1支,亲缘关系最近,而与来自Oidium lycopersici的3条ITS序列亲缘关系较远.以上结果表明,来自商丘的番茄白粉菌为O. neolycopersici. 展开更多
关键词 番茄白粉菌 its序列 分子鉴定
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滇藏地区8种鹅膏菌的ITS序列分析 被引量：15
15
作者 曹杰 张志国 +6 位作者 刘弟 李飞 程霞 张蕴 王辉 常亚军 李宗菊 《云南大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期90-96,共7页
对滇藏地区8种鹅膏菌的核糖体DNA（rDNA）内转录间隔区（ITS）进行PCR扩增和测序，用Clustal X（version1．81）软件对所测的ITS序列进行比对分析．结果表明，除5．8SrDNA（其长度为160bp）比较保守外，8个不同种的ITS序列在长度和碱基... 对滇藏地区8种鹅膏菌的核糖体DNA（rDNA）内转录间隔区（ITS）进行PCR扩增和测序，用Clustal X（version1．81）软件对所测的ITS序列进行比对分析．结果表明，除5．8SrDNA（其长度为160bp）比较保守外，8个不同种的ITS序列在长度和碱基位点上都存在较大差异，其中ITSI区间的片段长度为206～297bp，ITS2区间的片段长度为191—238bp．这说明鹅膏属的种间具有较高的遗传多样性．利用MEGA（version3．1）软件进行聚类，8个鹅膏菌在D=0．14处分成3组，与传统分类有出入．这为鹅膏菌的进一步分类及研究提供了分子依据． 展开更多
关键词 its序列 鹅膏菌 系统进化树
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灰树花的系统发育分析和主要木质素降解酶的测定 被引量：15
16
作者 尹立伟 池玉杰 王雪童 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2010年第4期574-580,共7页
对灰树花菌株迁西二号进行了ITS序列扩增与测序(GenBank登录号为GU584099),并对灰树花及相关白腐菌进行了基于ITS序列的系统发育分析,结果表明灰树花与Grifola sordulenta (Mont.) Singer等白腐菌的亲缘关系较近。采用LNAS(低氮天冬酰胺... 对灰树花菌株迁西二号进行了ITS序列扩增与测序(GenBank登录号为GU584099),并对灰树花及相关白腐菌进行了基于ITS序列的系统发育分析,结果表明灰树花与Grifola sordulenta (Mont.) Singer等白腐菌的亲缘关系较近。采用LNAS(低氮天冬酰胺-琥珀酸)培养基添加4种不同底物,对菌株迁西二号在25℃恒温下静置培养,得到了不同时间内的培养液,用紫外可见分光光度计分别检测了在470、420、310 nm处对于2,6-二甲氧基苯酚(2,6-DMP)、2,2’-连氮-双(3-乙基苯并噻唑-6-磺酸)(ABTS)、3,4-二甲氧基苯甲醇/藜芦醇(VA)的氧化作用后光密度值的变化情况,作为锰过氧化物酶(MnP)、漆酶(Laccase)和木质素过氧化物酶(LiP)产生和活性大小的依据,从而获得了灰树花木质素降解酶系统的主要酶系及其与培养基的成分和酶作用底物的基本关系。结果表明,灰树花可产生MnP和漆酶,但不产生LiP;对比4种成分不同的培养液酶活力测定结果,未添加底物的培养液MnP最大酶活仅为2.96 U.L-1,漆酶最大酶活仅为4.49 U.L-1。添加底物木屑和2,6-DMP后MnP最大酶活为8.06 U.L-1,漆酶最大酶活为9.85 U.L-1,表明在培养液内添加酶的底物木屑后能轻微地提高两种酶的分泌量。 展开更多
关键词 灰树花 its序列 木质素降解酶系统 锰过氧化物酶 漆酶
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中药秦艽基原植物的DNA分子鉴定 被引量：14
17
作者 张得钧 高庆波 +1 位作者 李福安 李永平 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2011年第24期14609-14612,14615,共5页
[目的]分析秦艽基原植物间不同DNA序列的差异,为秦艽药材DNA条形码的筛选和基原鉴定提供分子证据。[方法]采用PCR扩增纯化后直接测序的方法,测定大叶秦艽（G.macrophylla Pall.）、麻花艽（G.straminea Maxim.）、粗茎秦艽（G.crassicau... [目的]分析秦艽基原植物间不同DNA序列的差异,为秦艽药材DNA条形码的筛选和基原鉴定提供分子证据。[方法]采用PCR扩增纯化后直接测序的方法,测定大叶秦艽（G.macrophylla Pall.）、麻花艽（G.straminea Maxim.）、粗茎秦艽（G.crassicaulis Duthie exBurk.）、小秦艽（G.dahurica Fisch）、黄管秦艽（G.officinalis H.Smith）5种植物的核糖体DNA ITS、叶绿体DNApsbA-trnH核苷酸序列,并作序列同源性分析。[结果]cpDNApsbA-trnH序列长度变异范围为316~318 bp,有7种不同的单倍型,单倍型间有7个变异位点,序列的GC含量为21.2%;最大简约树的聚类结果与单倍型反映的结果一致。nrDNAITS序列长度变异范围为624~625 bp,有5种不同的单倍型,单倍型间有12个变异位点,序列的GC含量为59.3%;最大简约树的聚类结果表明,小秦艽与麻花艽聚为一支,大叶秦艽与黄管秦艽聚为一支,粗茎秦艽位于聚类图的最基部。[结论]nrDNAITS序列较适合作秦艽基原植物的DNA分子鉴定。 展开更多
关键词 中药秦艽 psbA-trnH序列 its序列 PCR DNA分子鉴定
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普洱茶样中“金花”微生物的分离鉴定 被引量：14
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作者 马燕 赵明 +4 位作者 周玲 袁文侠 刘议聪 董燕梅 周红杰 《茶叶通讯》 2011年第2期17-20,共4页
"金花"是茯砖的品质特征,部分普洱茶样品也有"金花",但是对普洱茶中"金花"微生物研究较少。本文从1个类似"金花"的普洱茶样品中,分离出4株真菌,经形态观察和ITS序列同源性搜索比对鉴定为塔宾曲... "金花"是茯砖的品质特征,部分普洱茶样品也有"金花",但是对普洱茶中"金花"微生物研究较少。本文从1个类似"金花"的普洱茶样品中,分离出4株真菌,经形态观察和ITS序列同源性搜索比对鉴定为塔宾曲霉(Aspergillus tubingensis)、伞枝犁头霉(Lichtheimia corymbifera)、阿姆斯特丹散囊菌(Eurotium amstelodami)和黑附球菌(Epicoccum nigrum)。在自制的普洱茶砖上接种阿姆斯特丹散囊菌,茶砖表面也长出类似的"金花",表明该普洱茶样品的"金花"是阿姆斯特丹散囊菌的闭囊壳。 展开更多
关键词 普洱茶 金花 阿姆斯特丹散囊菌 its序列
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基于ITS序列的鸢尾属植物部分种的系统分类 被引量：11
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作者 王玲 卓丽环 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期54-56,75,共4页
通过引物设计、PCR、基因克隆、测序，获得了10种鸢尾属植物和1个外类群种的ITS序列。鸢尾属植物ITS1区长度219～243bp，5．8S序列长度均为165bp，ITS2区长度变异范围为196～239bp。5．8S序列过于保守，保守位点占81．9％。ITS序列对于... 通过引物设计、PCR、基因克隆、测序，获得了10种鸢尾属植物和1个外类群种的ITS序列。鸢尾属植物ITS1区长度219～243bp，5．8S序列长度均为165bp，ITS2区长度变异范围为196～239bp。5．8S序列过于保守，保守位点占81．9％。ITS序列对于区分鸢尾属植物组级的较大分类等级较好。用近缘属射干属的Belamcanda chinensiss作为外类群，用邻位相接法（NJ）和最大简约法（MP）进行聚类分析，得到了较一致的系统树，且分析表明，ITS序列对于建立属间的分类等级更加有效。结合Genebank中的中国鸢尾属植物的序列，比较支持赵毓棠建立的中国鸢尾属植物组以上的分类系统。 展开更多
关键词 鸢尾属 its序列 系统分类
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促进滇重楼皂苷类活性成分积累的内生真菌筛选 被引量：11
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作者 李艳冰 林亮 +2 位作者 廖秋红 杨生超 刘涛 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2019年第1期132-137,共6页
【目的】植物内生菌(Endophyte)是近年来深受重视的一种新型的微生物能源,具有固氮、促进植物生长、增强宿主植物抗逆性等作用,目前研究表明:内生菌可增强宿主植物合成活性物质的能力,甚至它们本身也能产生与宿主植物相同或相近的生物... 【目的】植物内生菌(Endophyte)是近年来深受重视的一种新型的微生物能源,具有固氮、促进植物生长、增强宿主植物抗逆性等作用,目前研究表明:内生菌可增强宿主植物合成活性物质的能力,甚至它们本身也能产生与宿主植物相同或相近的生物活性物质。【方法】以传统药用植物滇重楼(Pairs polyphylla var.yunnanensis)为研究对象,从滇重楼地下块茎中分离得到23株内生菌,对其进行分子鉴定,之后与滇重楼组培苗进行共生培养,一段时间后利用高效液相色谱法检测组培苗的皂苷含量。【结果】最终筛选出2株对滇重楼组培苗皂苷含量有促进作用的菌株。【结论】人参生柱隔孢和木霉菌能促进滇重楼皂苷类活性成分的积累。 展开更多
关键词 滇重楼 内生真菌 its序列
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