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广东地区人禽流感H_5N_1血凝素基因特征与进化 被引量：11
1
作者 黄平 柯昌文 +2 位作者 邹丽容 李晖 陈秋霞 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期390-392,共3页
目的通过对广东地区人禽流感H5N1毒株（HA）基因序列的变异分析，揭示毒株HA基因变异与进化。方法对广东地区人禽流感H5N1毒株（A／GD／01／06）HA基因测序，同时检索全球各地人禽流感H5N1毒株HA基因，采用SPSS11．0和DNAStar5．0软件... 目的通过对广东地区人禽流感H5N1毒株（HA）基因序列的变异分析，揭示毒株HA基因变异与进化。方法对广东地区人禽流感H5N1毒株（A／GD／01／06）HA基因测序，同时检索全球各地人禽流感H5N1毒株HA基因，采用SPSS11．0和DNAStar5．0软件对检索的人禽流感H5N1毒株HA基因核苷酸序列进行聚类、比对和分析；并结合临床资料对变异毒株进行进化速度分析。结果1997～2006年，42毒株HA基因序列聚类分成3类；HA基因89氨基酸位点置换，占15．7％（89／568）；2003～2006年H5N1，毒株通过氨基酸第170～172位（NST／S）位点的置换，增加一个糖基化位点。同义变异中，HA基因Ks为1．99×10^-5～2．58×10^-5,生物进化线性回归方程为Y=4．8×10^-9X＋1．048×10^-5；同时各毒株Ks均大于Ka，进化检验Ks／Ka值显示HA基因进化压力主要来自自然变异。42株地N1毒株可以分3条进化途径，1997-1998年毒株为1条，2003～2005年东南亚毒株为第2条途径，2005～2006年中国毒株为第3条途径。毒株HK-213-03氨基酸变异显示其变异的进化过度性，而2004年毒株TL—L2004—04氨基酸位点变异值得注意。结论2003--2006年人禽流感H5N1毒株HA基因抗原性与1997年毒株有较大不同，人禽流感H5N1，毒株增加一个糖蛋白位点可能改变毒株致病性；少数毒株氨基酸位点变异较大，值得关注。人禽流感H5N1毒株在自然界变异频繁，但受到鸟禽和人体的免疫压力较小；但随着H5N1，毒株自然进化，H5N1，毒株具有人一人传播能力的概率较大。建议在研制人禽流感H5N1毒株疫苗时，要充分考虑不同毒株HA基因抗原性。 展开更多
关键词 人禽流感 h5n1 毒株 血凝素(hA)基因 进化
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广东地区人禽流感H5N1毒株的核蛋白基因变异和进化 被引量：8
2
作者 黄平 柯昌文 +3 位作者 李晖 邹丽容 方苓 陈秋霞 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第8期739-742,共4页
目的通过对人禽流感H5NI毒株核蛋白(NP)基因序列的变异分析,揭示毒株NP基因变异与进化。方法检测广东地区人禽流感H5N1毒株NP基因核苷酸序列,同时检索全球人禽流感HSN1毒株NP基因序列,采用DNAStar5.0软件对检索的人禽流感H5N1毒株NP基... 目的通过对人禽流感H5NI毒株核蛋白(NP)基因序列的变异分析,揭示毒株NP基因变异与进化。方法检测广东地区人禽流感H5N1毒株NP基因核苷酸序列,同时检索全球人禽流感HSN1毒株NP基因序列,采用DNAStar5.0软件对检索的人禽流感H5N1毒株NP基因核苷酸序列进行比对和分析;并结合流行病学资料对变异毒株进行进化速度分析。结果1997—2006年45株毒株NP基因核苷酸序列同源性分成3类,1997—1998年毒株为第1类,2004—2005年毒株为第2类,2003年毒株和2006年毒株为第3类;NP基因35个氨基酸位点全部置换,占7.03%(35/498);2003—2006年H5N1毒株通过氨基酸第430位(K_(430)T)位点的置换,增加一个糖基化位点(NGT_(430-432));GD-01-06毒株第370位发生N_(370)S变异;增加一个糖基化位点(NES_(368-370))。同义变异中,NP基因Ks(同义变异速度)值为2.03×10~5～2.55×10^(-5)核苷酸/d,Ka(错义变异速度)值为1.58×10^(-6)～3.10×10^(-6)核苷酸/d,检验发现进化无明显选择性压力存在。结论1997—1998年毒株、2004—2005年毒株、2003年毒株和2006年毒株NP基因核苷酸有差异;2003—2006年人禽流感H5N1毒株NP基因增加一个糖蛋白位点、GD-01-06毒株再增加一个糖蛋白位点可能改变毒株抗原性。人禽流感H5N1毒株在自然界变异频繁,随着其自然进化,H5N1毒株具有人-人传播能力的概率较大。 展开更多
关键词 人禽流感 h5n1毒株 nP基因 进化
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人禽流感H_5N_1毒株NS基因特征和进化 被引量：4
3
作者 黄平 李晖 +3 位作者 柯昌文 邹丽容 陈秋霞 方苓 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期54-58,共5页
目的:通过对人禽流感H5N1毒株NS基因序列的变异分析,揭示毒株NS基因特征与进化。方法:检测广东地区人禽流感H5N1毒株NS基因核苷酸序列,同时检索全球人禽流感H5N1毒株NS基因序列,采用DNAStar5.0软件对检索的人禽流感H5N1毒株NS基因核苷... 目的:通过对人禽流感H5N1毒株NS基因序列的变异分析,揭示毒株NS基因特征与进化。方法:检测广东地区人禽流感H5N1毒株NS基因核苷酸序列,同时检索全球人禽流感H5N1毒株NS基因序列,采用DNAStar5.0软件对检索的人禽流感H5N1毒株NS基因核苷酸序列进行比对和分析;并结合流行病学资料对变异毒株进行进化速度分析。结果:根据对NS1基因和NS2基因核苷酸序列进行同源性比较,发现分成两个系列:1997～1998年人禽流感毒株为一个系列(G1),2003～2006年毒株为另一个系列(G2);其中,2003～2006年毒株NS1基因和NS2基因中,2004～2006年越南、泰国毒株为第1亚组(G2a),2005～2006年印尼毒株为第2亚组(G2b),2006年中国大陆毒株和2003年香港毒株为第3亚组(G2c)、2006年中西亚、北非毒株为第4亚组(G2d)。NS1基因74个氨基酸位点置换,占32.2%(74/230);其中,中国大陆2006年2株毒株(ZJ-16-06、GD-01-06)的NS1基因有3个位点有改变:A086T、F201Y和P215L。NS2基因共有31个氨基酸发生置换,置换率为25.6%(31/121);中国大陆2006年2株毒株(ZJ-16-06、GD-01-06)的NS1基因有3个位点有改变,包括E/K036G、S044T和L058F。NS1基因Ks值为10.1×10-6～33.4×10-6Nt/d,Ka值为11.6×10-6～17.6×10-6Nt/d;显示NS1基因受到机体免疫压力较大,检验发现基因进化存在明显选择性压力存在,而GD-01-06的NS1基因受到选择性压力较小;与NS1基因比较,NS2基因的同义突变和错义突变速度均降低,但尤以错义突变速度降低明显(Ks值为15.5×10-6～25.5×10-6Nt/d,Ka值为7.39×10-6～10.1×10-6Nt/d)。2003～2006年毒株NS1基因丢失第80～84位氨基酸序列(TIASV),引起氨基酸结构改变;而糖基化位点未改变。结论:目前NS1基因和NS2基因进化分成两组;NS1基因除自发置换进化较快外,受到明显机体免疫机制压力,第80～84位氨基酸TIASV丢失可能对致病性发生影响。2006年中国大陆毒株NS1基因和NS2基因均有3个氨基酸与其它毒 展开更多
关键词 人禽流感 h5n1毒株 nS基因 特征 进化
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广东人禽流感H5N1毒株M基因特性、进化和变异 被引量：3
4
作者 黄平 邹丽容 +4 位作者 方苓 李晖 陈秋霞 俞守义 柯昌文 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期371-376,共6页
通过对人禽流感H5N1毒株M基因序列的变异分析，揭示毒株M基因特征与进化。检测广东地区人禽流感H5N1毒株M基因核苷酸序列，同时检索全球人禽流感H5N1毒株M基因序列，采用DNAStar5．0软件对检索的人禽流感H5N1毒株M基因核苷酸序列进行比... 通过对人禽流感H5N1毒株M基因序列的变异分析，揭示毒株M基因特征与进化。检测广东地区人禽流感H5N1毒株M基因核苷酸序列，同时检索全球人禽流感H5N1毒株M基因序列，采用DNAStar5．0软件对检索的人禽流感H5N1毒株M基因核苷酸序列进行比对和分析；并结合流行病学资料对变异毒株进行进化速度分析。结果发现，1997-2006年53株毒株M1基因和51株毒株M2核苷酸序列同源性均分成两组，1997年毒株为第一组（GⅠ），2003-2006年香港、越南、泰国、印尼、中国大陆、土耳其、伊拉克、阿塞拜疆、埃及毒株为第二组（GⅡ）。M1基因20个氨基酸位点置换，占7．94％（20／252），其中2003-2006年毒株M1基因有9个氨基酸位点不同于1997年毒株；M2基因22个氨基酸置换，占22．7％，其中2003-2006年毒株M2基因有4个氨基酸不同于1997年毒株。M2基因Ks值为26．8×10^-6～42．6×10^-6Nt／d，Ka值为4．39×10^-6～6．98×10^-6Nt／d；而M1基因的同义突变速度均远高于错义突变速度，显示M1基因受到机体免疫压力较小；检验发现M1基因进化存在负选择性压力。2003-2006年毒株M1基因通过氨基酸S224N置换，增加一个糖基化位点NSS224-226；而来自印尼的8株毒株M2基因发生C50F置换，引起蛋白二级结构改变。1997年中国香港人禽流感毒株自当时出现后，便未在以后人禽流感疫情中出现。2003-2006年毒株M1基因增加糖基化位点NSS224-226，可能与毒株致病性有关。人禽流感H5N1毒株M基因在自然界变异频繁，可能影响H5N1毒株的人-人传播能力。 展开更多
关键词 人禽流感 h5nI毒株 M基因 特性 进化 变异
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人禽流感H_5N_1毒株PB1基因突变分析 被引量：3
5
作者 黄平 俞守义 +4 位作者 柯昌文 邹丽容 方苓 李晖 陈秋霞 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第22期2168-2170,共3页
目的通过对人禽流感H5N1毒株PB1基因序列的变异分析，揭示毒株PB1基因的特征与进化。方法检测广东地区人禽流感H5N1毒株PB1基因核苷酸序列，同时检索全球人禽流感H5N1毒株PB1基因序列，采用DNAStarLa-sergene软件对检索的人禽流感H5N1毒... 目的通过对人禽流感H5N1毒株PB1基因序列的变异分析，揭示毒株PB1基因的特征与进化。方法检测广东地区人禽流感H5N1毒株PB1基因核苷酸序列，同时检索全球人禽流感H5N1毒株PB1基因序列，采用DNAStarLa-sergene软件对检索的人禽流感H5N1毒株PB1基因核苷酸序列进行比对和分析，并结合流行病学资料对变异毒株进行进化速度分析。结果将50株毒株PB1基因核苷酸序列按同源性分成两组：1997-1998年毒株为第1组（G1），2003-2006年毒株为第2组（G2）。PB1基因74个氨基酸发生位点置换，占9．78％（74/757）。PB1基因Ks值为26．1×10^-6～39．8×10～Nt/d，Ka值为3．91×10^-6～5．59×10^-6～Nt/d，检验结果显示，基因进化受到负选择性压力。2003-2006年毒株（G2）丢失G757，引起氨基酸结构改变；同时糖基化位点也较1997-1998年毒株减少了1个糖基化位点NES382-384。结论目前PB1基因进化分成两组，自发突变作用影响PB1基因进化；PB1基因与PB2基因的进化途径在时间特征和区域特征方面类似。2003-2006年毒株PB1基因氨基酸结构和糖基化位点均有改变。 展开更多
关键词 人禽流感 h5n1毒株 PB1基因 突变 进化
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广东人H_5N_1毒株PB2基因进化和特性 被引量：3
6
作者 黄平 李晖 +4 位作者 俞守义 邹丽容 方苓 陈秋霞 柯昌文 《第四军医大学学报》 北大核心 2007年第17期1547-1550,共4页
目的:通过对人禽流感H5N1毒株PB2基因序列的因H变异分析,揭示毒株PB2基因特征与进化.方法:检测广东地区人禽流感H5N1毒株PB2基因核苷酸序列,同时检索全球人禽流感H5N1毒株PB2基因序列,采用DNAStar5.0软件对检索的人禽流感H5N1毒株PB2基... 目的:通过对人禽流感H5N1毒株PB2基因序列的因H变异分析,揭示毒株PB2基因特征与进化.方法:检测广东地区人禽流感H5N1毒株PB2基因核苷酸序列,同时检索全球人禽流感H5N1毒株PB2基因序列,采用DNAStar5.0软件对检索的人禽流感H5N1毒株PB2基因核苷酸序列进行比对和分析;并结合流行病学资料对变异毒株进行进化速度分析.结果:1997/200648株毒株PB2基因核苷酸序列同源性分成两组,1997/1998毒株为第一组(G1),2003/2006毒株为第二组(G2).PB2基因错义置换导致101个氨基酸位点变异,占比例13.3%(101/759).PB2基因Ks值为39.4×10-6～63.4×10-6Nt/d,Ka值为3.36×10-6～5.11×10-6Nt/d;提示PB2基因进化主要受到自发突变影响.2003/2006毒株(包括毒株GD-01-06)仅保留一个糖基化位点(NPT301-303),丢失3个糖基化位点,可能影响蛋白致病性和抗原性.结论:目前PB2基因进化分成两组,主要受到除自发突变影响;PB2基因丢失3个糖基化位点可能影响蛋白致病性.人禽流感H5N1毒株PB2基因在自然界变异非常频繁,不断变异将影响H5N1毒株在人-人传播能力和引发大流行. 展开更多
关键词 人禽流感 h5n1毒株 PB2基因 进化 特性
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H_5亚型禽流感灭活疫苗的研制 被引量：1
7
作者 王贺民 何诚 +1 位作者 张建平 李浩鹏 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期41-44,共4页
以H5N1亚型禽流感病毒接种鸡胚 ,收取鸡胚液为抗原研制了禽流感灭活疫苗 ,并对制苗抗原以及疫苗的物理性状、安全性、免疫效力、免疫剂量和保护期等进行了试验。结果表明 ,获得了较高效价的制苗抗原 ,灭活前后HA分别为 2 10 0～ 11 0 ... 以H5N1亚型禽流感病毒接种鸡胚 ,收取鸡胚液为抗原研制了禽流感灭活疫苗 ,并对制苗抗原以及疫苗的物理性状、安全性、免疫效力、免疫剂量和保护期等进行了试验。结果表明 ,获得了较高效价的制苗抗原 ,灭活前后HA分别为 2 10 0～ 11 0 和 2 9 0～ 10 0 。试制疫苗物理性状符合要求 ,安全性良好。试验鸡在免疫 14d后血清抗体达到2 7 5,2 10d血清HI抗体仍维持在 2 5 0 左右 ;免疫后 18d使用高致病性H5亚型禽流感病毒攻毒 ,获得 10 0 %的保护。分别使用 0 1,0 3和 0 5mL免疫鸡 ,发现 0 3～ 0 5mL剂量组免疫后血清抗体达到 2 7 4～ 8 0 。疫苗在 2～ 8℃保存5 4 0d ,疫苗物理性状没有改变 ,免疫后血清HI抗体可以达到 2 7 5。 展开更多
关键词 h5亚型 禽流感 灭活疫苗 研制 制苗抗原 免疫效果
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2006年人禽流感H5N1毒株PA基因特性、变异和进化 被引量：1
8
作者 黄平 方苓 +6 位作者 莫艳玲 舒跃龙 李晖 邹丽容 柯昌文 陈秋霞 俞守义 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第12期1103-1106,共4页
目的通过对人禽流感H5N1毒株PA基因序列的变异分析,揭示毒株PA基因特征、变异与进化。方法检测广东地区人禽流感H5N1毒株PA基因核苷酸序列,同时检索全球人禽流感H5N1毒株PA基因序列,采用MEGA4.0软件对检索的人禽流感H5N1毒株PA基因核苷... 目的通过对人禽流感H5N1毒株PA基因序列的变异分析,揭示毒株PA基因特征、变异与进化。方法检测广东地区人禽流感H5N1毒株PA基因核苷酸序列,同时检索全球人禽流感H5N1毒株PA基因序列,采用MEGA4.0软件对检索的人禽流感H5N1毒株PA基因核苷酸序列进行比对和分析;并结合流行病学资料对变异毒株进行进化速度分析。结果PA蛋白呈酸性,等电点pH5.4。1997-2006年52株毒株PA基因核苷酸序列同源性分成两组,1997年毒株为第一组(G1),2003-2006年香港、越南、泰国、印尼、中国大陆毒株、土耳其、伊拉克、阿塞拜疆、埃及毒株为第二组(G2)。PA基因114个氨基酸位点置换,占15.9(114/716),其中2003-2006年毒株PA基因有17个氨基酸位点不同于1997年毒株。PA基因Ks值为30.9×10-6～46.1×10-6Nt/d,Ka值为4.50×10-6～8.13×10-6Nt/d;而PA基因的同义突变速度是错义突变速度的5.7～6.9倍,显示PA基因受到机体免疫压力较小;检验发现PA基因进化存在负选择性压力。PA基因中潜在的7个糖基化位点基本稳定,毒株IDNS-569H-06的PA基因半胱氨酸发生置换(S224C)。结论PA基因进化分成两系列,PA基因进化特点是自发突变较快,而受到机体免疫机制压力较小;A基因与其它多聚酶基因(PB2和PB1)比较,核苷酸序列同源性和进化在时间特征和地区特征方面具有一致性;来自中国大陆的毒株进化值得关注。人禽流感H5N1毒株PA基因在自然界变异频繁,可能影响HN毒株致病性和在人-人传播能力。 展开更多
关键词 人禽流感 h5n1毒株 PA基因 交异 进化
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1株对小鼠呈高致病性H5N1亚型禽流感病毒的遴选 被引量：1
9
作者 董梅 顾敏 +3 位作者 曹军平 彭大新 王希良 刘秀梵 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期132-135,143,共5页
目的观察从死禽体内分离的禽流感H5N1病毒株对小鼠的致病情况,筛选一株可用于小鼠攻毒实验的H5N1毒株。方法将17株禽源H5N1病毒分别滴鼻感染6～8周龄Balb/c小鼠,观察其对小鼠的致病和致死情况。通过测定其中毒力较强一株的EID_(50)、TCI... 目的观察从死禽体内分离的禽流感H5N1病毒株对小鼠的致病情况,筛选一株可用于小鼠攻毒实验的H5N1毒株。方法将17株禽源H5N1病毒分别滴鼻感染6～8周龄Balb/c小鼠,观察其对小鼠的致病和致死情况。通过测定其中毒力较强一株的EID_(50)、TCID_(50)、小鼠LD_(50)及濒死小鼠不同组织中病毒载量,判定其致病力;采用遗传进化分析绘制HA基因进化树,了解其进化特征。结果动物实验表明,17株高致病性禽源H5N1毒株中,仅有一株对小鼠为高致病性。该毒株TCID_(50)/100μl=7.2,EID_(50)/100μl=8.325,小鼠1 LD_(50)/100μl=6.318≈10~2EID_(50)。鼻粘膜感染4～6 d小鼠发病,表现为精神萎靡、食欲减退、竖毛、弓背等临床症状,体重明显减轻。小鼠死亡集中在发病后的2～5 d,耐过死亡者12 d完全恢复正常。从濒死感染小鼠脾、肺、鼻及脑组织中皆可检出流感病毒NS片段,病毒数载量以脑组织中最多,达3.56×10^(10)拷贝/5μl。结论筛选到一株对小鼠呈强致病性H5N1亚型禽流感毒株,可以用于禽流感疫苗交叉保护效果评价的小鼠攻击实验,也可以作为感染模型用于H5N1禽流感病毒致病机制的研究。 展开更多
关键词 禽 h5n1病毒株 致病性 小鼠
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