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牛病毒性腹泻病毒基因组结构与蛋白功能研究进展 被引量:18
1
作者 范进江 薄新文 钟发刚 《动物医学进展》 CSCD 2008年第5期68-72,共5页
牛病毒性腹泻病毒为黄病毒科(Flaviviridae)瘟病毒属(Pestivirus)的代表种,这个属的成员中还包括羊边界病毒(BDV)和猪瘟病毒(CSFV)。病毒基因组为单股正链RNA。论文就牛病毒性腹泻病毒已定位的4种结构蛋白、8种非结构蛋白以及3′和5′... 牛病毒性腹泻病毒为黄病毒科(Flaviviridae)瘟病毒属(Pestivirus)的代表种,这个属的成员中还包括羊边界病毒(BDV)和猪瘟病毒(CSFV)。病毒基因组为单股正链RNA。论文就牛病毒性腹泻病毒已定位的4种结构蛋白、8种非结构蛋白以及3′和5′非翻译区的基因结构特征及其编码蛋白的合成与功能研究进行了综述,为牛病毒性腹泻的防控和疫苗研制提供参考。 展开更多
关键词 牛病毒性腹泻病毒 基因组结构 蛋白功能
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狂犬病病毒分子生物学研究进展 被引量:16
2
作者 袁慧君 王三虎 秦鄂德 《生物技术通讯》 CAS 2004年第6期596-599,共4页
狂犬病是由狂犬病病毒引起的一种重要的人兽共患传染病,一旦发病,100%死亡,目前尚无有效的治疗方法。本文主要综述了狂犬病病毒基因组结构特点及其形态、结构与功能,并详细阐述了狂犬病病毒与毒力、感染及免疫有关的分子生物学基础。
关键词 狂犬病病毒 分子生物学基础 发病 感染 分子生物学研究 人兽共患传染病 死亡 毒力 基因组结构 免疫
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鸡传染性支气管炎病毒研究进展 被引量:20
3
作者 贺会利 魏小兵 +5 位作者 欧长波 徐敏 闫艺婷 刘明成 勾肖晶 刘兴友 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2014年第7期73-77,共5页
鸡传染性支气管炎病毒(IBV)主要侵害鸡的呼吸系统和泌尿生殖系统,可以引起鸡的呼吸道症状、肾脏损害、产蛋量和蛋的品质下降。由于IBV基因组的RNA酶缺乏严密的校正功能,容易发生变异,使该病毒的基因型、血清型复杂,给该病的防控带来很... 鸡传染性支气管炎病毒(IBV)主要侵害鸡的呼吸系统和泌尿生殖系统,可以引起鸡的呼吸道症状、肾脏损害、产蛋量和蛋的品质下降。由于IBV基因组的RNA酶缺乏严密的校正功能,容易发生变异,使该病毒的基因型、血清型复杂,给该病的防控带来很大的困难,从而给养殖业造成了重大经济损失。从2003年起对IBV的分子生物学方面的研究也成了热点,寻找防控此病的有效措施。论文概述了近年来在IBV的基因组、结构蛋白、分子诊断及反向遗传学技术等方面的研究进展,为IBV的研究和防控提供参考。 展开更多
关键词 鸡传染性支气管炎病毒 基因组结构 结构蛋白 分子生物学诊断 反向遗传学技术
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戊型肝炎病原学及流行病学研究进展 被引量:18
4
作者 王金霞 李雯 张云智 《中国热带医学》 CAS 2018年第3期277-281,共5页
戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)属于戊肝病毒科(Hepeviridae),HEV引起的肝炎称戊型肝炎(Hepati-tis E,HE),是发展中国家引起急性病毒性肝炎的常见病因。现该科病毒分为2个属:正戊肝病毒属(Orthohepevirus)和鱼戊肝病毒属(Piscihep... 戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)属于戊肝病毒科(Hepeviridae),HEV引起的肝炎称戊型肝炎(Hepati-tis E,HE),是发展中国家引起急性病毒性肝炎的常见病因。现该科病毒分为2个属:正戊肝病毒属(Orthohepevirus)和鱼戊肝病毒属(Piscihepevirus)。正戊肝病毒属包含了A、B、C和D 4种:A主要感染人和猪、骆驼、兔、雪貂、鼠、鹿、猫鼬等哺乳动物;B主要感染禽类;C主要感染鼠和雪貂;D主要感染蝙蝠。鱼戊肝病毒属只包含了一个A种,主要感染鲑鱼。在疾病流行区,饮用被污染的水源可以导致急性HE的大暴发,粪口途径传播是引起HE暴发流行的主要原因。青少年和成人为好发人群,其中孕妇感染HEV导致的疾病更为严重。HEV是一种典型的人兽共患病,由其引起的人HE在亚洲、非洲、美洲、欧洲等地区均有暴发流行,全世界大约三分之一的人口受到HEV的威胁,它已成为我国乃至全球关注的公共卫生问题。本文就HEV的分类、基因组结构、宿主以及HE的流行病学研究进展进行了综述。 展开更多
关键词 戊型肝炎病毒 戊型肝炎 流行病学 分类 基因组结构
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猪Ⅱ型圆环病毒浙江株的分离及全基因组结构分析 被引量:12
5
作者 陈庆新 周继勇 +2 位作者 叶菊秀 申会刚 陈婷飞 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期526-529,共4页
用PCR方法对从浙江省猪场收集的、以淋巴结肿大和生长迟缓为特征的患猪腹股沟淋巴结进行PCV2检测。将检测为阳性的病料研磨、离心、过滤除菌后 ,接种PCV freePK 1 5细胞进行病毒分离 ,分离获得 3株病毒 ,命名为HZ0 2 0 1、HZ0 2 0 2、NB... 用PCR方法对从浙江省猪场收集的、以淋巴结肿大和生长迟缓为特征的患猪腹股沟淋巴结进行PCV2检测。将检测为阳性的病料研磨、离心、过滤除菌后 ,接种PCV freePK 1 5细胞进行病毒分离 ,分离获得 3株病毒 ,命名为HZ0 2 0 1、HZ0 2 0 2、NB0 30 1。PK 1 5细胞增殖所得病毒离心纯化后 ,在电镜下可观察到直径约为 1 7~ 2 0nm ,呈二十面体对称的病毒粒子。以组织和病毒的细胞DNA为模板进行PCV2的全基因扩增 ,测序结果显示 ,3株病毒分离物全基因序列均由 1 76 7bp组成 ,直接来自病料与细胞分离毒株的核苷酸同源性为 1 0 0 %。基因组内含有 1 1个ORF。通过比较发现 ,分离毒株与PCV2参考株的同源性介于 94 2 %~ 99 7%之间 ;与PCV1参考株的同源性为77 2 %~ 77 9%。 展开更多
关键词 猪圆环病毒2型 形态 基因结构 分离 PCV2 浙江
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动物型溶菌酶研究新进展 被引量:17
6
作者 张士璀 许娜 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期46-51,共6页
溶菌酶可以分解连接N-乙酰胞壁酸(NAM)和N-乙酰氨基葡萄糖(NAG)残基之间的β-1,4糖苷键。g型、c型和i型溶菌酶是3种动物型溶菌酶。近年来,越来越多的报道表明这3种类型的溶菌酶在动物界广泛存在,g型和c型溶菌酶主要存在于脊椎动物中,i... 溶菌酶可以分解连接N-乙酰胞壁酸(NAM)和N-乙酰氨基葡萄糖(NAG)残基之间的β-1,4糖苷键。g型、c型和i型溶菌酶是3种动物型溶菌酶。近年来,越来越多的报道表明这3种类型的溶菌酶在动物界广泛存在,g型和c型溶菌酶主要存在于脊椎动物中,i型溶菌酶仅存在于无脊椎动物中,部分物种中同时存在2种动物型溶菌酶。本文简要概述了溶菌酶在动物各物种中的存在情况和组织分布情况、基因组结构与系统进化以及溶菌酶抑制剂的研究新进展。 展开更多
关键词 溶菌酶 组织分布 基因组结构 系统进化 溶菌酶抑制剂
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水稻细胞质铜锌超氧化物歧化酶基因的序列和表达分析 被引量:13
7
作者 王峰 王宏斌 王金发 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期101-106,共6页
以水稻(Oryza sativa)品种Cpslo17幼穗为材料,通过RT-PCR克隆了长度为698bp的编码水稻细胞质铜锌超氧化物歧化酶基因(OsCu/Zn-SOD)。序列分析表明其覆盖基因完整编码框,编码由152个氨基酸组成的蛋白,它与玉米(Zea maize)Cu/Zn-SOD基因... 以水稻(Oryza sativa)品种Cpslo17幼穗为材料,通过RT-PCR克隆了长度为698bp的编码水稻细胞质铜锌超氧化物歧化酶基因(OsCu/Zn-SOD)。序列分析表明其覆盖基因完整编码框,编码由152个氨基酸组成的蛋白,它与玉米(Zea maize)Cu/Zn-SOD基因序列的相似率为88%。TargetP和ChloroP预测编码蛋白N端无信号肽序列,且此编码区段有8个外显子和7个内含子。利用Swiss-Model站点预测OsCu/Zn-SOD三维结构,并分析其铜锌离子结合位点的结构。RT-PCR结果表明OsCu/Zn-SOD在水稻不同品种均有表达,但表达量存在差异,OsCu/Zn-SOD在Cpslo17的分裂旺盛的幼嫩组织如幼穗、开花期花序和未成熟种子中表达量较高,而在叶片中表达量相对较低,在愈伤组织中表达微弱。 展开更多
关键词 水稻 铜锌超氧化物歧化酶 序列分析 基因组结构 RT-PCR
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鳜脂蛋白脂酶和肝脂酶基因结构与组织表达 被引量:10
8
作者 姚煜 梁旭方 +2 位作者 李光照 王琳 刘秀霞 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期506-517,共12页
为了研究鳜(Siniperca chuatsi)脂蛋白脂酶(LPL)、肝脂酶(HL)基因结构与功能关系,首先采用RT-PCR及RACE法,克隆得到鳜肝脏LPL与HL基因cDNA全序列。鳜肝脏LPL基因cDNA全长为2089bp,其中开放阅读框(ORF)为1548bp,编码515个氨基酸。鳜HL基... 为了研究鳜(Siniperca chuatsi)脂蛋白脂酶(LPL)、肝脂酶(HL)基因结构与功能关系,首先采用RT-PCR及RACE法,克隆得到鳜肝脏LPL与HL基因cDNA全序列。鳜肝脏LPL基因cDNA全长为2089bp,其中开放阅读框(ORF)为1548bp,编码515个氨基酸。鳜HL基因cDNA全长为1964bp,其中ORF为1494bp,编码497个氨基酸。进化树分析显示,鳜LPL与HL基因与其他脊椎动物的LPL、HL基因各自聚集成簇。对鳜基因组进行PCR获得鳜LPL与HL全基因组DNA序列,与其他脊椎动物基因结构相似,鳜LPL基因由10个外显子和9个内含子组成,全长7392bp;鳜HL基因由9个外显子和8个内含子组成,全长8837bp。应用Genome Walker方法在鳜克隆得到一段长为1071bp的LPL和一段长为2173bp的HL基因5′侧翼区序列,并利用相关软件预测其中具有多个保守的顺式调控元件。组织表达研究显示与易患动脉粥样硬化的人类LPL不同,鳜LPL基因在所有被检测组织中均有表达:在脂肪组织中大量表达,其次是肝脏、脑、肠道、肌肉,在脾中表达量最低;而鳜HL基因的表达则与人类相似,只在肝脏中表达。本研究将为深入探讨机体脂质代谢调节机制以及LPL、HL在防治动脉粥样硬化中的作用奠定良好基础。 展开更多
关键词 脂蛋白脂酶 肝脂酶 CDNA序列 基因结构 5'调控区 组织表达
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冠状病毒的研究进展 被引量:10
9
作者 李向茸 李倩 冯若飞 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期22-38,共17页
冠状病毒是一类在自然界广泛存在的,可引起跨种间传播并对人兽健康构成严重威胁的传染病病原体。由于宿主谱广泛和选择压力大,冠状病毒会发生变异以逃避宿主免疫反应,从而变得更具致病性。在不到20年的时间里,冠状病毒已经导致了3次令... 冠状病毒是一类在自然界广泛存在的,可引起跨种间传播并对人兽健康构成严重威胁的传染病病原体。由于宿主谱广泛和选择压力大,冠状病毒会发生变异以逃避宿主免疫反应,从而变得更具致病性。在不到20年的时间里,冠状病毒已经导致了3次令全球恐慌的重大疫情,包括目前的新冠疫情。基于此,有必要对冠状病毒进行重新审视。因此,本文从冠状病毒的分类、基因与蛋白结构、编码蛋白功能、复制周期与致病机制、免疫应答、检测与防治等方面对冠状病毒进行了全面系统的概括和分析,以期深入了解冠状病毒的特性,为预防和控制新发冠状病毒的发生和传播提供参考。 展开更多
关键词 冠状病毒 基因组结构 致病机制 细胞因子风暴
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流行性腹泻病毒分子生物学研究进展 被引量:10
10
作者 崔小荣 陈志林 +3 位作者 陈斌灿 陈兴荣 梁振华 严广宽 《中国猪业》 2020年第1期62-67,共6页
猪流行性腹泻(Porcine epidemic diarrhea,PED)是由猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)引起猪的高度接触性肠道传染病,感染PEDV的猪群主要表现为腹泻、呕吐、厌食、脱水等临床症状。PEDV可感染各个阶段的猪群,临床... 猪流行性腹泻(Porcine epidemic diarrhea,PED)是由猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)引起猪的高度接触性肠道传染病,感染PEDV的猪群主要表现为腹泻、呕吐、厌食、脱水等临床症状。PEDV可感染各个阶段的猪群,临床上PEDV主要造成7日龄以内的仔猪高发病率及高死亡率(可达100%)。PEDV的迅速传播给养猪行业造成了巨大的经济损失。本文针对PEDV的病原学、病毒编码蛋白及其生物学功能、感染细胞机制进行综述,以期为深入研究PEDV的致病机制提供参考。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻 猪流行性腹泻病毒 基因组结构 分子生物学 感染机制
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水稻胞质核糖体蛋白基因OsRPS7的克隆与序列分析 被引量:7
11
作者 顾志敏 王建飞 +1 位作者 黄骥 张红生 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期181-185,共5页
以已公布的黑麦胞质核糖体蛋白基因ScRPS7的cDNA序列为信息探针,在中国华大水稻基因组数据库中搜索与之高度同源的基因组重叠群。采用计算机拼接和RT PCR方法克隆了水稻胞质核糖体蛋白基因的全长cD NA序列,命名为OsRPS7。该cDNA序列全长... 以已公布的黑麦胞质核糖体蛋白基因ScRPS7的cDNA序列为信息探针,在中国华大水稻基因组数据库中搜索与之高度同源的基因组重叠群。采用计算机拼接和RT PCR方法克隆了水稻胞质核糖体蛋白基因的全长cD NA序列,命名为OsRPS7。该cDNA序列全长919bp,编码192个氨基酸;其与黑麦、拟南芥和芸薹的S7核糖体蛋白的氨基酸一致率分别为88%、72%和72%。对OsRPS7的基因组结构和基因的功能进行了分析和预测。 展开更多
关键词 水稻 胞质 核糖体蛋白 基因 OsRPS7 克隆 序列 结构
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牛病毒性腹泻病毒的分子生物学研究进展 被引量:5
12
作者 王镇 丁明孝 《中国病毒学》 CSCD 1997年第2期112-118,共7页
关键词 牛病 病毒性腹泻病毒 分子生物学
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人转铁蛋白基因的克隆及序列分析 被引量:7
13
作者 王峰 黄璐圆 《暨南大学学报(自然科学与医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期111-114,119,共5页
目的:克隆人转铁蛋白基因并对其编码序列进行分析。方法:以人胎肝cDNA为模板,利用PCR方法克隆人转铁蛋白基因;通过与基因组序列对比分析基因组结构;通过TargetP 1.1和S ignalP 3.0预测信号肽;通过C lustal X(1.81)进行蛋白序列联配。结... 目的:克隆人转铁蛋白基因并对其编码序列进行分析。方法:以人胎肝cDNA为模板,利用PCR方法克隆人转铁蛋白基因;通过与基因组序列对比分析基因组结构;通过TargetP 1.1和S ignalP 3.0预测信号肽;通过C lustal X(1.81)进行蛋白序列联配。结果:PCR扩增了一个长2 160 bp的基因片断,序列分析表明其覆盖了完整编码框,编码由698个氨基酸组成的人转铁蛋白。进一步分析发现人转铁蛋白基因有19个外显子和18个内含子,编码人转铁蛋白N端具有19个氨基酸组成的信号肽序列。人转铁蛋白与猩猩、猴子、兔子和老鼠的转铁蛋白氨基酸相似率分别为94%、91%、78%、73%。生物信息分析表明,人转铁蛋白含有高度保守的参与蛋白二硫键形成的半胱氨酸以及铁离子结合位点,有两个序列较同源的结构域。结论:成功克隆人转铁蛋白基因,人转铁蛋白与其它物种转铁蛋白同源。 展开更多
关键词 转铁蛋白 序列分析 基因组结构
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金鱼Vsx1基因结构及其内含子多态性分析 被引量:7
14
作者 童英 李冰霞 +3 位作者 陈金辉 刘正华 郑康 罗琛 《激光生物学报》 CAS CSCD 2007年第4期418-423,共6页
Vsx1是第一个在金鱼中发现的编码含有同源异型框(homeodomain)和CVC结构域蛋白的基因。该基因在胚胎发育的不同阶段在胚胎的不同区域和不同组织中表达,并已经证明它在视网膜视锥双极细胞的分化和正常功能的维持中具有重要作用。为了进... Vsx1是第一个在金鱼中发现的编码含有同源异型框(homeodomain)和CVC结构域蛋白的基因。该基因在胚胎发育的不同阶段在胚胎的不同区域和不同组织中表达,并已经证明它在视网膜视锥双极细胞的分化和正常功能的维持中具有重要作用。为了进一步研究该基因在不同发育阶段组织特异性表达的调节机制,实验用PCR方法分析了金鱼Vsx1的基因组结构和内含子多态性。结果表明:金鱼Vsx1基因由5个外显子和4个内含子组成,与斑马鱼、人、小鼠的Vsx1基因结构相同。4个内含子中,第一内含子有两种序列差异明显的类型,但第二、三、四内含子无明显差异。第一内含子的一种类型比另外一种类型多39个碱基,这39个碱基中包括了真核生物增强子的核心序列。这一观测结果提示金鱼Vsx1第一内含子可能与该基因的发育阶段特异性和组织特异性表达调节有关。同时,第一内含子序列的明显差异也为分析Vsx1不同等位基因或基因拷贝的表达活性,以及组织特异性表达调节方式提供了合适的探针序列。 展开更多
关键词 金鱼 VSX1 基因结构 内含子 多态性
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传染性法氏囊病病毒分子生物学研究的一些进展 被引量:4
15
作者 龙进学 韦平 +1 位作者 磨美兰 阳秀英 《广西大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 2003年第1期26-31,共6页
对IBDV近年来的分子生物学方面的研究进展进行概况,主要包括IBDV的基因组结构及理化特性、病毒蛋白、不同型IBDV变异的分子基础和分子生物学诊断技术等,以探讨利用病毒重要基因核酸序列的差异进行IBDV分子流行病学研究及病毒各致病型快... 对IBDV近年来的分子生物学方面的研究进展进行概况,主要包括IBDV的基因组结构及理化特性、病毒蛋白、不同型IBDV变异的分子基础和分子生物学诊断技术等,以探讨利用病毒重要基因核酸序列的差异进行IBDV分子流行病学研究及病毒各致病型快速鉴别诊断的可能性. 展开更多
关键词 鸡传染性法氏囊病病毒 基因组结构 病毒蛋白 毒力 抗原变异 RT—PCR 分子生物学
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牛病毒性腹泻病毒分子机制的研究进展 被引量:7
16
作者 刘泽余 刘占悝 +3 位作者 李智杰 孙飞雁 张加力 郭利 《当代畜牧》 2019年第11期17-21,共5页
牛病毒性腹泻是阻碍养牛业发展的一种重大疾病。患病动物以发热、腹泻、流产、产乳量下降、产出死胎或畸形胎为主要症状。其病原体(BVDV)除感染牛外,也能感染猪、骆驼、羊驼及其他反刍动物。该病呈世界性流行分布,国际病毒分类委员会(In... 牛病毒性腹泻是阻碍养牛业发展的一种重大疾病。患病动物以发热、腹泻、流产、产乳量下降、产出死胎或畸形胎为主要症状。其病原体(BVDV)除感染牛外,也能感染猪、骆驼、羊驼及其他反刍动物。该病呈世界性流行分布,国际病毒分类委员会(International Committee on Taxonomy of Viruses,ICTV)已将BVDV分为BVDV-1与BVDV-22个型。2种基因型的BVDV均能造成牛群的大范围发病,但临床症状稍有不同。本文从流行特点与致病机制、最新检测方法及病毒基因组结构几个方面介绍了当下牛病毒性腹泻分子机制的研究进展。 展开更多
关键词 牛病毒性腹泻 流行特点 分型 基因组结构
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金钱鱼MHC Ⅱ β基因结构、多态性与组织表达分析 被引量:5
17
作者 王晓冰 刘至治 +2 位作者 李强 张璐菲 张俊彬 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期21-33,共13页
为探究金钱鱼(Scatophagusargus)MHCⅡβ基因的结构和特性,采用同源克隆和RACE等技术,在获得cDNA全序列的基础上,分析其内含子序列、基因多态性和组织表达情况。结果表明,金钱鱼MHCⅡβ基因cDNA序列全长1172bp,其中5'UTR长34bp... 为探究金钱鱼(Scatophagusargus)MHCⅡβ基因的结构和特性,采用同源克隆和RACE等技术,在获得cDNA全序列的基础上,分析其内含子序列、基因多态性和组织表达情况。结果表明,金钱鱼MHCⅡβ基因cDNA序列全长1172bp,其中5'UTR长34bp,3'UTR长388bp,开放阅读框(ORF)长750bp,编码249个氨基酸,包含信号肽、B1结构域、p2结构域、连接肽(CP)、跨膜区(TM)和胞质区(cYT);MHCⅡβ基因由6个外显子和5个内含子组成,其中内含子3将p2结构域分开。从43尾金钱鱼的209个有效克隆中,获得209条不同的核苷酸序列,可归为48个等位基因主型,分别命名为Scar-DXB*0101~Scar-DXB*4801,揭示金钱鱼MHCⅡβ基因的多态性很丰富。RT-PCR检测发现,金钱鱼MHCIIB基因在所检测的11种组织中均有表达,其中在脾、鳃、肠和皮肤中表达量较高,在肾、胃、心脏表达量中等,而在眼、脑、肝、肌肉中表达量较低。对健康金钱鱼人工感染嗜水气单胞菌后,发现其MHCIID基因在肝、脾、鳃、肾等组织中的表达量均发生了不同程度的变化,证明该基因在金钱鱼免疫反应中有重要作用。在NJ法构建的系统树中,金钱鱼与舌齿鲈、大西洋鲑等硬骨鱼类的亲缘关系相对较近,而与铰口鲨、原鸡、小鼠、人等的亲缘关系则依次渐远。 展开更多
关键词 金钱鱼 MHC Ⅱβ基因 基因结构 多态性 组织表达
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A global alfalfa diversity panel reveals genomic selection signatures in Chinese varieties and genomic associations with root development 被引量:5
18
作者 Lin Chen Fei He +5 位作者 Ruicai Long Fan Zhang Mingna Li Zhen Wang Junmei Kang Qingchuan Yang 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2021年第11期1937-1951,共15页
Alfalfa(Medicago sativa L.) is an important forage crop worldwide. However, little is known about the effects of breeding status and different geographical populations on alfalfa improvement. Here, we sequenced 220 al... Alfalfa(Medicago sativa L.) is an important forage crop worldwide. However, little is known about the effects of breeding status and different geographical populations on alfalfa improvement. Here, we sequenced 220 alfalfa core germplasms and determined that Chinese alfalfa cultivars form an independent group, as evidenced by comparisons of FSTvalues between different subgroups, suggesting that geographical origin plays an important role in group differentiation. By tracing the influence of geographical regions on the genetic diversity of alfalfa varieties in China, we identified 350 common candidate genetic regions and 548 genes under selection. We also defined 165 loci associated with 24 important traits from genome-wide association studies. Of those, 17 genomic regions closely associated with a given phenotype were under selection, with the underlying haplotypes showing significant differences between subgroups of distinct geographical origins. Based on results from expression analysis and association mapping,we propose that 6-phosphogluconolactonase(MsPGL) and a gene encoding a protein with NHL domains(MsNHL) are critical candidate genes for root growth. In conclusion, our results provide valuable information for alfalfa improvement via molecular breeding. 展开更多
关键词 ALFALFA genome-wide association studies genomic selection geographical origin population structure root development
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植物交配系统与分子进化理论及其应用研究 被引量:1
19
作者 李玲玲 王茜 +3 位作者 肖钰 程祥 陈晓阳 胡新生 《中国科学:生命科学》 CSCD 北大核心 2023年第1期50-63,共14页
伴随着植物交配系统从异交向自交演化过程,植物花性状和基因组结构呈现自交综合征.本文系统探讨了形成有关综合征的理论基础与分子机制,分析了交配系统与不同进化过程互作基本理论.自交导致有效群体大小、突变率、重组率以及选择功效降... 伴随着植物交配系统从异交向自交演化过程,植物花性状和基因组结构呈现自交综合征.本文系统探讨了形成有关综合征的理论基础与分子机制,分析了交配系统与不同进化过程互作基本理论.自交导致有效群体大小、突变率、重组率以及选择功效降低,但漂变效应、连锁不平衡等增强.这些理论较好地解释了同义和非同义突变相对比值变化、转座子数量变化、基因家族成员遗传相关性以及基因组结构特征.虽然分子标记被应用于交配系统参数估计,但交配系统研究与分子进化研究属于不同的研究领域,两者结合可形成一些重要生物学问题,如交配系统驱动与强化种间分子进化的作用模式、自交与异交植物分子进化模式差异、同种异质交配系统的群体间基因组结构差异等,澄清这些问题有助于深入理解交配系统在种内和种间分子进化过程中的作用. 展开更多
关键词 交配系统 分子进化 适应分化选择 基因组结构 物种形成
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羊口疮病毒主要基因组编码蛋白及其功能 被引量:4
20
作者 张孟然 丛潇 +4 位作者 顾月月 刘少冰 刘欣超 李文超 顾有方 《动物医学进展》 北大核心 2022年第4期96-101,共6页
羊口疮(Orf)是由羊口疮病毒(Orf virus, ORFV)引起的一种接触性传染病,绵羊与山羊是主要宿主。该病属于自限性疾病,当不发生继发性感染时,机体调节就可以控制疾病发展,逐渐恢复痊愈。该特性可能与病毒的基因组结构有关,因此,重点阐述了... 羊口疮(Orf)是由羊口疮病毒(Orf virus, ORFV)引起的一种接触性传染病,绵羊与山羊是主要宿主。该病属于自限性疾病,当不发生继发性感染时,机体调节就可以控制疾病发展,逐渐恢复痊愈。该特性可能与病毒的基因组结构有关,因此,重点阐述了羊口疮病毒基因组编码的蛋白及其功能。此外,还对羊口疮病毒的流行病学、病原学、临床诊断与防控进行了概述,为羊口疮病毒的进一步研究提供了信息与参考。 展开更多
关键词 羊口疮病毒 基因组结构 编码蛋白 蛋白功能
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