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水稻种质资源的分子鉴定和育种利用 被引量:10
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作者 叶卫军 胡时开 +2 位作者 李媛媛 马伯军 郭龙彪 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期625-633,共9页
水稻种质资源包括栽培稻、野生稻及育种材料等各种类型,是水稻新品种选育、生物技术研究以及农业生产的物质基础。中国具有丰富的水稻种质资源,但其利用率却不高,原因之一就在于传统方法不能够对其进行准确的研究评价。理想的分子标记... 水稻种质资源包括栽培稻、野生稻及育种材料等各种类型,是水稻新品种选育、生物技术研究以及农业生产的物质基础。中国具有丰富的水稻种质资源,但其利用率却不高,原因之一就在于传统方法不能够对其进行准确的研究评价。理想的分子标记具有稳定性高、重复性好、检测简单快速和共显性遗传等优点。本文综述了分子标记技术在水稻种质资源遗传多样性分析、重要功能基因的挖掘、品种DNA指纹库的构建及分子育种材料遗传基础的拓展等方面的作用,旨在为更充分的将分子标记技术应用于水稻种质资源的鉴定和分子育种提供参考。 展开更多
关键词 水稻种质资源 分子鉴定 遗传多样性 基因挖掘 育种应用
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小粒野生稻优异基因的挖掘与利用研究进展 被引量:7
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作者 郭嗣斌 韦宇 +2 位作者 李孝琼 高国庆 邓国富 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期371-376,共6页
小粒野生稻拥有丰富的遗传多样性,含有大量的优异基因,是进行栽培稻遗传改良和基因组研究的宝贵资源。本文总结了国内外研究利用小粒野生稻种质取得的系列进展,主要包括:小粒野生稻优异性状的鉴定和遗传群体的构建,小粒野生稻有利基因... 小粒野生稻拥有丰富的遗传多样性,含有大量的优异基因,是进行栽培稻遗传改良和基因组研究的宝贵资源。本文总结了国内外研究利用小粒野生稻种质取得的系列进展,主要包括:小粒野生稻优异性状的鉴定和遗传群体的构建,小粒野生稻有利基因的定位、克隆与育种利用,还对小粒野生稻优异基因利用的困难和应对策略进行了讨论。这些结果必将有利于进一步挖掘和利用小粒野生稻的有利基因。 展开更多
关键词 小粒野生稻 基因挖掘 育种利用 进展
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基因组水平的基因挖掘与功能分析方法的探讨 被引量:2
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作者 孙文 顾文杰 +2 位作者 吴永英 肖维伟 王立群 《生物信息学》 2007年第2期94-96,共3页
为了实现基因组中特定基因功能的注释,研究者提出一种新的思路,即利用对目的基因启动子上游的顺式元件的功能的分析,进一步来推断目的基因的功能。在此主要对基因组水平的基因挖掘与功能分析方法及其研究进展进行了探讨。
关键词 基因组 基因挖掘 启动子 顺式元件
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生防菌株HG18基因组信息分析与抗菌功能基因挖掘 被引量:1
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作者 姜威 张淑梅 +6 位作者 闫更轩 田缘 胡基华 潘钰 夏海华 吴皓琼 于冲 《微生物学杂志》 CAS CSCD 2021年第5期14-23,共10页
贝莱斯芽胞杆菌(Bacillus velezensis)HG18是一株低温生防菌株,能够分泌抗菌物质。为挖掘和利用其抗菌功能基因,服务农业生产,采用二、三代相结合测序技术,对其进行全基因组测序,获得菌株完整基因组序列。基因组全长4461844 bp,包含一... 贝莱斯芽胞杆菌(Bacillus velezensis)HG18是一株低温生防菌株,能够分泌抗菌物质。为挖掘和利用其抗菌功能基因,服务农业生产,采用二、三代相结合测序技术,对其进行全基因组测序,获得菌株完整基因组序列。基因组全长4461844 bp,包含一个染色体和一个质粒,GC含量44.06%,编码4643个基因,编码基因总长度3893994 bp,占基因组87.27%。发现6个几丁质降解相关基因,2个葡聚糖酶基因和1个壳聚糖酶基因,2个脂肽类抗菌物质芬芥素与表面活性素合成基因簇,2个细菌素subtilin和bacillolysin合成基因。研究为提高抗菌物质产量的菌株定向遗传改造以及植物抗病育种提供基因资源。 展开更多
关键词 贝莱斯芽胞杆菌 HG18 全基因组 基因挖掘 抗菌物质
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野生稻优良基因的发掘利用研究进展
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作者 张凡 刘小烛 +6 位作者 李定琴 余腾琼 周英 殷富有 张敦宇 黄兴奇 程在全 《现代农业科技》 2012年第7期85-88,共4页
野生稻中蕴含着大量抗生物胁迫和耐非生物胁迫的基因,是栽培稻品种进一步改良的天然遗传种质资源库。对野生稻中抗虫、抗病、抗逆、高产等优良基因的发掘及定位作了概述,并对野生稻优异基因的利用前景进行了展望。
关键词 野生稻 优良基因 基因定位 发掘利用
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利用加权基因共表达网络分析牛口蹄疫病毒感染通路变化 被引量:3
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作者 杨生海 刘西兰 张勇 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2021年第9期1617-1624,共8页
从基因表达综合数据库下载GSE83514数据集,利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选与牛口蹄疫病毒感染的相关模块及枢纽基因,并对整个模块内的基因进行GO功能注释和KEGG通路分析。结果显示,通过构建WGCNA共表达网络,确定与牛口蹄疫病毒... 从基因表达综合数据库下载GSE83514数据集,利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选与牛口蹄疫病毒感染的相关模块及枢纽基因,并对整个模块内的基因进行GO功能注释和KEGG通路分析。结果显示,通过构建WGCNA共表达网络,确定与牛口蹄疫病毒感染显著负相关的Darkred模块和显著正相关的Green模块为枢纽模块,它们的枢纽基因分别为MFSD4和RHOH。这两个模块基因共富集到20个生物学过程及14条KEGG信号通路,并且两个模块同时富集到DNA复制通路。本研究为探究牛口蹄疫病毒感染通路变化提供了生物信息学依据,筛选的枢纽基因MFSD4和RHOH有望成为抑制牛口蹄疫病毒感染的治疗靶标。 展开更多
关键词 牛口蹄疫病毒 转录组测序 加权基因共表达 数据挖掘 枢纽基因
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转录组测序及其在甜菜功能基因挖掘中的应用 被引量:2
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作者 张自强 白晨 +7 位作者 张惠忠 李晓东 付增娟 赵尚敏 鄂圆圆 张辉 王良 张必周 《北方农业学报》 2018年第5期39-43,共5页
由于转录组测序技术具有检测费用低、检测通量高、不受遗传背景影响等优势,使其成为当前挖掘基因的主要手段之一。文章首先介绍了转录组测序技术的基本情况,接着阐述了该技术在甜菜功能基因研究方面的进展,文章最后展望转录组测序技术... 由于转录组测序技术具有检测费用低、检测通量高、不受遗传背景影响等优势,使其成为当前挖掘基因的主要手段之一。文章首先介绍了转录组测序技术的基本情况,接着阐述了该技术在甜菜功能基因研究方面的进展,文章最后展望转录组测序技术在甜菜基因挖掘中的应用前景。通过转录组测序可以构建甜菜丰富的基因表达数据库,尤其是挖掘与甜菜产量、含糖量调控、抗逆性相关的基因资源,为后续基因克隆、分子标记辅助育种以及转基因育种等提供理论支持与基因资源。 展开更多
关键词 转录组测序 甜菜 功能基因挖掘
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克隆植物苯丙氨酸解氨酶基因通用引物的发掘与应用 被引量:2
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作者 杜何为 蔡荣 +1 位作者 徐树德 肖琴 《河北农业科学》 2010年第7期45-47,76,共4页
根据松树、咖啡、山茶、鳄梨和白杨PAL基因第2外显子的保守区段,设计了1对简并引物。以该引物对88种植物的基因组DNA进行了PCR扩增。结果发现,每种植物中都能扩增出介于750~1 000 bp的特异片段。随机选取银杏、夹竹桃、核桃、海桐和盘... 根据松树、咖啡、山茶、鳄梨和白杨PAL基因第2外显子的保守区段,设计了1对简并引物。以该引物对88种植物的基因组DNA进行了PCR扩增。结果发现,每种植物中都能扩增出介于750~1 000 bp的特异片段。随机选取银杏、夹竹桃、核桃、海桐和盘槐的PCR扩增产物进行测序分析,发现其大小分别为862 bp、866 bp、866 bp、866 bp和865 bp。使用生物信息学进行进化树分析,所克隆的5种植物的特异片段与其亲缘关系密切的物种PAL高度同源,初步证实了这些片段是银杏、夹竹桃、核桃、海桐和盘槐的PAL基因。因此,本研究开发的PAL基因简并引物,可以克隆任意植物的PAL基因。 展开更多
关键词 苯丙氨酸解氨酶基因 通用引物 发掘
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