KRAB型锌指蛋白(KZNF)的研究进展 被引量：5

1

作者 田春艳 张令强 贺福初 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第11期1451-1456,共6页

KRAB型锌指蛋白是哺乳动物中最大的转录调控因子家族,它的多数成员在基因组上成簇分布。其结构特征是N端含有KRAB结构域,C端含有多个C2H2型锌指结构。KRAB结构域为一蛋白质-蛋白质相互作用区,可以与多种协同转录抑制因子和转录因子结合,... KRAB型锌指蛋白是哺乳动物中最大的转录调控因子家族,它的多数成员在基因组上成簇分布。其结构特征是N端含有KRAB结构域,C端含有多个C2H2型锌指结构。KRAB结构域为一蛋白质-蛋白质相互作用区,可以与多种协同转录抑制因子和转录因子结合,使KRAB型锌指蛋白作为转录因子和／或转录调控因子发挥依赖于DNA结合的转录抑制功能,在胚胎发育、细胞分化、细胞转化及细胞周期的调控中发挥重要功能。 展开更多

关键词 KRAB KZNF c2h2型锌指 KAP-1 转录抑制

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C2H2型锌指对生物大分子的识别 被引量：2

2

作者 卢多 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期834-841,共8页

C2H2锌指结构域在3%人类基因组编码蛋白中出现,可以特异性识别DNA、RNA和蛋白质。经过近30年的研究,锌指识别生物大分子的作用机制得到不同程度的解释。在识别DNA方面,锌指结合在DNA双螺旋的大沟中,并在氨基酸与碱基之间一一对应,根据DN... C2H2锌指结构域在3%人类基因组编码蛋白中出现,可以特异性识别DNA、RNA和蛋白质。经过近30年的研究,锌指识别生物大分子的作用机制得到不同程度的解释。在识别DNA方面,锌指结合在DNA双螺旋的大沟中,并在氨基酸与碱基之间一一对应,根据DNA序列的不同实现特异性识别。在识别RNA方面,针对RNA结构上的多样性,锌指综合识别特异碱基与特异的折叠骨架。在识别蛋白质方面,作用机制的研究尚处初始阶段,现有的研究结果显示为多元化的识别方式。分子作用机制的理论研究又催生了工程锌指蛋白,并且大量地进入实际应用。鉴于锌指在自然界的普遍存在、在功能上的多样性及在转化应用上的潜力,有必要对其进行系统的研究。 展开更多

关键词 c2h2锌指 DNA识别 RNA识别 蛋白质识别 工程锌指蛋白

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包含BTB锌指结构的新基因Bsg2结构特性及其在发育阶段的组织表达特异性 被引量：1

3

作者 姚艺桑 北京师范大学生命科学学院生物医学研究所 +3 位作者 邹星 慈宏亮 陈微 李亦平 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期725-731,共7页

通过消减差异筛选法寻找小鼠胚胎发育过程中在脑中特异表达的基因 .克隆得到的脑特异表达新基因 2 (brainspecificgene 2 ,简称Bsg2 )长 36 91bp ,通过生物信息学方法预测其编码一个含713个氨基酸的锌指蛋白 .此蛋白N端有一个BTB(BR C ,... 通过消减差异筛选法寻找小鼠胚胎发育过程中在脑中特异表达的基因 .克隆得到的脑特异表达新基因 2 (brainspecificgene 2 ,简称Bsg2 )长 36 91bp ,通过生物信息学方法预测其编码一个含713个氨基酸的锌指蛋白 .此蛋白N端有一个BTB(BR C ,ttkandbab)结构域 ,C端有 9个连续的C2H2锌指结构 .该基因定位在小鼠 12号染色体上 ,包含 1个内含子和 2个外显子 .应用生物信息学和RT PCR方法分别检验该基因在小鼠各组织中的表达 .结果表明 ,Bsg2基因在小鼠胚胎及成体的各组织中普遍表达 ,在脾、肾、睾丸、肠、子宫和脑的表达水平较强 .利用整体 (wholemount)原位杂交研究其时空表达模式 .结果显示 ,Bsg2在早期的小鼠胚胎和不同时期鸡胚的头部均特异表达 ,在11d鼠胚的肢芽里也有较强的表达 .Bsg2基因的结构和表达特征预示它编码 1个具有DNA结合功能的转录调控因子 。 展开更多

关键词 生物信息学 BTB结构域 c2h2锌指 原位杂交

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植物C2H2型锌指蛋白的结构与功能 被引量：70

4

作者 黄骥 王建飞 张红生 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期414-418,共5页

锌指蛋白是一类具有指状结构域的转录因子。根据半胱氨酸(C)和组氨酸(H)残基的数目和位置可将锌指蛋白分为C2H2、C2HC、C2C2、C2HCC2C2、C2C2C2C2等亚类。C2H2型锌指蛋白是最多也是研究最为清楚的一类锌指蛋白,在植物中已经克隆了50多个... 锌指蛋白是一类具有指状结构域的转录因子。根据半胱氨酸(C)和组氨酸(H)残基的数目和位置可将锌指蛋白分为C2H2、C2HC、C2C2、C2HCC2C2、C2C2C2C2等亚类。C2H2型锌指蛋白是最多也是研究最为清楚的一类锌指蛋白,在植物中已经克隆了50多个,主要涉及植物的生长发育和对环境胁迫的应答反应。该类锌指蛋白大部分在锌指区具有植物中特有的QALGGH保守结构,可能涉及调控植物特有的生物学功能。文章主要讨论了植物C2H2型锌指转录因子的结构、对靶DNA的识别及在生长发育和环境胁迫反应中可能的调控功能。 展开更多

关键词 转录因子 c2h2锌指蛋白 结构 功能

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低密度脂蛋白诱导下调的新基因cDNA的克隆及组织表达 被引量：22

5

作者 张文成 陈保生 +2 位作者 曾武威 吴刚 薛红 《基础医学与临床》 CSCD 北大核心 2003年第3期279-282,共4页

用改进的mRNA差异显示 PCR技术分析ECV30 4在低密度脂蛋白的诱导下表达水平明显差异的cDNA。获得一差异表达的 2 6 5bp新EST ;以该EST为探针 ,从人主动脉cDNA文库中筛选到一个 172 6bp的cDNA克隆 ,其 74 8 12 6 6bp之间的 5 19个碱基... 用改进的mRNA差异显示 PCR技术分析ECV30 4在低密度脂蛋白的诱导下表达水平明显差异的cDNA。获得一差异表达的 2 6 5bp新EST ;以该EST为探针 ,从人主动脉cDNA文库中筛选到一个 172 6bp的cDNA克隆 ,其 74 8 12 6 6bp之间的 5 19个碱基构成一个完整的开放阅读框架 ,编码 172个氨基酸组成的蛋白质。其羧基端 94 172区间氨基酸序列中含有三个重复的C2H2型锌指蛋白基序CX2CX3FX5LX2HX3H ,NorthenBlot证实两组ECV30 4中均出现一条 1 7kb的区带 ,LDL诱导后其表达降低了 2 2倍。与差异显示 PCR的结果一致 ,该基因被定名为LRZFG。LRZFG是多组织表达的基因 。 展开更多

关键词 低密度脂蛋白 MRNA差异显示 基因克隆 cDNA 动脉粥样硬化

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植物C_2H_2型锌指蛋白研究进展 被引量：20

6

作者 张佳 刘俊芳 +2 位作者 赵婷婷 任婧 许向阳 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期427-433,共7页

C_2H_2型锌指蛋白是锌指家族中最经典也是目前研究最为深入的一类锌指蛋白。植物中该类锌指蛋白大多具有高度保守的基序QALGGH,并且该序列除了Q其他任何一个氨基酸的突变都会导致该蛋白完全失去结合DNA的功能,而Q突变则会大大降低结合DN... C_2H_2型锌指蛋白是锌指家族中最经典也是目前研究最为深入的一类锌指蛋白。植物中该类锌指蛋白大多具有高度保守的基序QALGGH,并且该序列除了Q其他任何一个氨基酸的突变都会导致该蛋白完全失去结合DNA的功能,而Q突变则会大大降低结合DNA的能力。本综述综述了C_2H_2型锌指蛋白的结构特征、分类方法以及近年来的功能研究成果,系统介绍了植物中该类蛋白在生长发育、非生物胁迫如干旱胁迫、盐胁迫以及冷胁迫等方面的作用,为今后C_2H_2型锌指蛋白功能研究的深入奠定基础。 展开更多

关键词 植物c2h2型锌指蛋白 分类 功能

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C_2H_2型锌指蛋白的研究进展 被引量：13

7

作者 周畅 李麓芸 《生命科学研究》 CAS CSCD 2004年第3期215-220,共6页

锌指基因家族是人体中最大的基因家族,它参与细胞分化、胚胎发育,并与许多疾病的发生相关.根据半胱氨酸(C)和组氨酸(H)的数目和位置可将锌指蛋白分为C2H2、C2HC、C2C2、C2HCC2C2、C2C2C2C2等亚类.C2H2型锌指是最普遍的类型,它们作为重... 锌指基因家族是人体中最大的基因家族,它参与细胞分化、胚胎发育,并与许多疾病的发生相关.根据半胱氨酸(C)和组氨酸(H)的数目和位置可将锌指蛋白分为C2H2、C2HC、C2C2、C2HCC2C2、C2C2C2C2等亚类.C2H2型锌指是最普遍的类型,它们作为重要的转录调控因子参与许多的生理过程.C2H2型锌指蛋白包含的锌指数目从1个到30多个不等.依据锌指的数量以及在蛋白中的分布情况,大多数C2H2型锌指蛋白属于下列3类之一:1)含3个C2H2锌指的蛋白(tC2H2);2)含多个锌指的C2H2型锌指结构蛋白(maC2H2);3)锌指成对间隔排列的C2H2型锌指蛋白(spC2H2).一些C2H2型锌指蛋白能识别并结合特异性RNA或DNA片段,另一些则只能与RNA结合.通常锌指蛋白含锌指数目越多,它选择结合的能力就越强. 展开更多

关键词 转录因子 c2h2锌指蛋白 DNA结合蛋白结构域

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烟草C2H2锌指蛋白转录因子家族成员的鉴定与表达分析 被引量：16

8

作者 杨明磊 晁江涛 +4 位作者 王大伟 胡军华 吴华 龚达平 刘贯山 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期337-349,共13页

C2H2锌指蛋白转录因子家族在真核生物中具有重要的生物学功能,广泛参与植物叶的发生、花器官的调控、侧枝的形成及逆境胁迫等生命过程。植物C2H2锌指蛋白不仅结合DNA和RNA,而且与蛋白质之间相互作用。本研究利用普通烟草(Nicotiana taba... C2H2锌指蛋白转录因子家族在真核生物中具有重要的生物学功能,广泛参与植物叶的发生、花器官的调控、侧枝的形成及逆境胁迫等生命过程。植物C2H2锌指蛋白不仅结合DNA和RNA,而且与蛋白质之间相互作用。本研究利用普通烟草(Nicotiana tabacum)基因组数据库,运用Blastp比对,结合Pfam和SMART分析,鉴定了118条普通烟草C2H2锌指蛋白家族成员;对烟草C2H2锌指蛋白家族进行了进化树分析、结构域分析、物理化学性质分析、染色体定位、基因结构分析、三维结构分析及组织表达分析等。结果表明:不同成员的氨基酸长度差异较大;系统进化及结构域分析显示,所有C2H2家族成员可以被分为5个亚家族,同一亚家族成员之间在结构域和理化性质上呈现较高一致性;每个成员都含有C2H2结构域,在数量上存在较大差异;将所有基因家族成员定位在22条染色体上;组织表达分析表明,每个C2H2亚家族都有成员在不同组织中表达,在叶及根中有些基因的表达量较高。 展开更多

关键词 c2h2锌指蛋白转录因子 烟草 基因家族

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植物逆境响应相关的C2H2型锌指蛋白研究进展 被引量：14

9

作者 钟婵娟 彭伟业 +3 位作者 王冰 刘世名 戴良英 李魏 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期2356-2366,共11页

植物锌指蛋白是一类具有核酸结合作用的关键性调控蛋白。其中, C2H2型锌指蛋白在植物体内分布最为广泛,并且可以调控植物体内多种生理生化反应,例如通过识别靶标DNA,与RNA相互作用,进而调控植物的抗病性和抗逆性等。本文重点综述了近年... 植物锌指蛋白是一类具有核酸结合作用的关键性调控蛋白。其中, C2H2型锌指蛋白在植物体内分布最为广泛,并且可以调控植物体内多种生理生化反应,例如通过识别靶标DNA,与RNA相互作用,进而调控植物的抗病性和抗逆性等。本文重点综述了近年来植物C2H2型锌指蛋白在调控植物抗逆境胁迫、抗病和生长发育方面的生物学功能及分子机制。 展开更多

关键词 c2h2型锌指蛋白 转录因子 核酸结合 逆境胁迫

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金荞麦C2H2-ZFP家族基因分析及FdC2H2-2在芦丁合成积累中的功能表征 被引量：3

10

作者 龙欧 卢翔 +4 位作者 石亚亮 李光胜 张凯旋 王俊珍 周美亮 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期1161-1173,共13页

C2H2锌指蛋白转录因子在植物生长发育、胁迫响应和次生代谢合成调控等方面发挥重要作用。前期研究发现金荞麦根部类黄酮含量高于苦荞麦可能是由于FdCHI,FdF3H,FdDFR等与类黄酮生物合成相关的基因家族被扩增。然而,参与类黄酮生物合成的C... C2H2锌指蛋白转录因子在植物生长发育、胁迫响应和次生代谢合成调控等方面发挥重要作用。前期研究发现金荞麦根部类黄酮含量高于苦荞麦可能是由于FdCHI,FdF3H,FdDFR等与类黄酮生物合成相关的基因家族被扩增。然而,参与类黄酮生物合成的C2H2锌指蛋白转录因子家族基因在金荞麦中如何调控芦丁合成尚未见报道。本研究对金荞麦FdC2H2-ZFP转录因子进行了全基因组鉴定和表达谱分析。共鉴定出114个FdC2H2-ZFPs。在对RNA-Seq数据分析基础上,筛选并克隆C2H2锌指蛋白基因FdC2H2-2。该基因具有3个典型的C2H2锌指结构,与拟南芥AtTREE1、AtDAZ3同源性较高。qRT-PCR显示FdC2H2-2基因的表达显著受茉莉酸诱导。此外,过表达FdC2H2-2毛状根中芦丁含量显著高于对照,且其芦丁合成途径中关键酶基因黄酮醇合成酶(FLS)、苯丙氨酸解氨酶(PAL)与类黄酮3’,5’-羟化酶(F3’5’H)表达量显著提高。以上结果表明,金荞麦FdC2H2-2基因可能通过激活芦丁生物合成关键酶基因FLS、PAL以及F3’5’H的表达,从而正向调控芦丁的积累。本研究为今后解析金荞麦C2H2锌指蛋白基因的功能提供参考。 展开更多

关键词 金荞麦 c2h2锌指蛋白 全基因组鉴定 系统进化 基因克隆 芦丁合成

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十字花科植物C2H2型锌指蛋白新基因BcMF20同源序列克隆与进化分析 被引量：6

11

作者 韩莹琰 张爱红 +1 位作者 范双喜 曹家树 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期916-921,共6页

为获取C2H2型锌指蛋白基因在物种间的分类和进化关系,分析其在基因结构上的保守性,更好地研究该基因在植物花粉发育中的功能,根据白菜花粉发育相关基因BcMF20 DNA序列设计引物,运用PCR技术分别从十字花科芸薹属和萝卜属18种材料中克隆了... 为获取C2H2型锌指蛋白基因在物种间的分类和进化关系,分析其在基因结构上的保守性,更好地研究该基因在植物花粉发育中的功能,根据白菜花粉发育相关基因BcMF20 DNA序列设计引物,运用PCR技术分别从十字花科芸薹属和萝卜属18种材料中克隆了C2H2型锌指蛋白基因BcMF20的同源序列。经序列比对分析,BcMF20同源基因在DNA序列上的相似性为86.9%～100%,所推导的氨基酸序列相似性为77.6%～100%,在锌指的保守区域,氨基酸序列完全相同。这些结果表明该基因具有较好的保守性,可能在十字花科植物的花粉发育中行使重要的功能。 展开更多

关键词 十字花科 c2h2锌指蛋白 BcMF20 克隆 系统发育

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过表达C2H2型锌指蛋白基因PdbZFP26提高山新杨耐盐性 被引量：2

12

作者 马姗姗 杨静静 +5 位作者 曲德辉 李梦婕 张进 吴凡林 宿红艳 王磊 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第1期110-118,共9页

【目的】土壤盐渍化是制约农林资源生产力的主要因素之一。为适应环境,植物会通过启动基因表达及生理和形态结构的变化来减缓盐害。越来越多的研究表明,C2H2型锌指蛋白在植物应答盐胁迫调控网络中扮演重要角色。迄今,关于植物C2H2锌指... 【目的】土壤盐渍化是制约农林资源生产力的主要因素之一。为适应环境,植物会通过启动基因表达及生理和形态结构的变化来减缓盐害。越来越多的研究表明,C2H2型锌指蛋白在植物应答盐胁迫调控网络中扮演重要角色。迄今,关于植物C2H2锌指蛋白生物学功能的研究集中于植物特有的Q型,而对于非Q型C2H2锌指蛋白的认识非常有限。前人从毛果杨中鉴定到109个C2H2锌指蛋白的编码基因PtrZFPs,其中62个编码的蛋白为非Q型锌指蛋白。鉴定、解析耐盐相关C2H2锌指蛋白基因的功能将为深入理解植物应对非生物胁迫的分子机制提供重要资料。通过分析过表达PdbZFP26转基因山新杨的表型以鉴定其功能,本文以期为山新杨抗盐遗传改良提供优良资源及理论基础。【方法】本研究利用实时定量PCR方法分析PdbZFP26的组织器官表达模式及对非生物胁迫和植物激素的响应模式;利用叶盘转化法获得过表达PdbZFP26转基因山新杨,观察转基因和对照株系在盐胁迫处理前后的长势,测定其抗逆生理指标,比较不同株系对盐胁迫的耐受能力。【结果】基于前期表达谱数据分析,从山新杨茎中筛选到一个受盐胁迫诱导表达的C2H2锌指蛋白基因PdbZFP26,该基因编码区为2 061 bp,共编码686个氨基酸。PdbZFP26仅含有一个C2H2锌指结构域,且该结构域中不具备Q型特征基序“QALGGH”。进化树分析显示,PdbZFP26为C型C2H2型锌指蛋白。表达模式分析结果显示,PdbZFP26在茎中特异表达,主要集中在木质部(包含维管形成层);除盐胁迫之外,ABA和BRs会引起PdbZFP26不同程度的上调,其中ABA胁迫诱导的上调幅度最为显著。转基因山新杨表型分析结果显示,盐胁迫条件下,过表达PdbZFP26转基因山新杨的生长明显优于对照,转基因株系的叶绿素含量显著高于对照,MDA和H2O2含量明显低于对照,而SOD、POD、CAT等抗氧化酶活性高于对照。【结� 展开更多

关键词 山新杨 c2h2锌指蛋白 盐胁迫

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矮牵牛冷响应转录因子PhZPT2-12的特性及表达分析 被引量：5

13

作者 张慧琳 朱婉 +1 位作者 田丽 张蔚 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期1543-1552,共10页

从矮牵牛‘H’自交系中分离获得1个响应低温胁迫的C2H2型锌指蛋白基因PhZPT2-12,其开放阅读框为525 bp,编码1条含有两个典型的C2H2型保守结构域,长度为174 aa的氨基酸多肽链。系统进化树分析表明,PhZPT2-12与已报道的SlZF3亲缘关系较近... 从矮牵牛‘H’自交系中分离获得1个响应低温胁迫的C2H2型锌指蛋白基因PhZPT2-12,其开放阅读框为525 bp,编码1条含有两个典型的C2H2型保守结构域,长度为174 aa的氨基酸多肽链。系统进化树分析表明,PhZPT2-12与已报道的SlZF3亲缘关系较近。亚细胞定位和转录激活活性分析显示,PhZPT2-12定位于细胞核,是一种核蛋白,并且其全长在酵母细胞中不具有转录激活活性。半定量RT-PCR表达分析结果表明,正常生长条件下PhZPT2-12在矮牵牛根、茎、叶中表达量较高,而在成熟的花中仅有微弱表达;在低温、高盐和干旱胁迫处理下PhZPT2-12表现出不同程度的上调,其中对低温胁迫最为敏感,上调倍数最高,初步推测该基因与矮牵牛应答低温、高盐等非生物逆境相关。 展开更多

关键词 矮牵牛 低温胁迫 c2h2锌指蛋白 转录因子 表达分析

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水稻C_2H_2型锌指蛋白OsZAT12转化拟南芥功能的初步研究 被引量：5

14

作者 陈宗新 陈俊飞 王亚琴 《华南师范大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2019年第1期63-68,共6页

植物C_2H_2型锌指蛋白是植物转录调节因子中的大家族,通过转录调控、翻译后调节和蛋白质间的相互作用在植物发育和环境胁迫中发挥关键作用.该研究在水稻基因组中克隆到一个C_2H_2型锌指蛋白,命名为OsZAT12.生物信息学分析显示OsZAT12基... 植物C_2H_2型锌指蛋白是植物转录调节因子中的大家族,通过转录调控、翻译后调节和蛋白质间的相互作用在植物发育和环境胁迫中发挥关键作用.该研究在水稻基因组中克隆到一个C_2H_2型锌指蛋白,命名为OsZAT12.生物信息学分析显示OsZAT12基因全长597 bp,其中不包含内含子,其蛋白质序列含有199个氨基酸,具有2个典型的C_2H_2锌指结构. OsZAT12蛋白定位于细胞核,在根中特异性表达.过表达拟南芥植株与野生型比较,其根变短,子叶的变绿率明显降低,植株矮小.初步推断OsZAT12基因可能影响植物生长发育,尤其是根的伸长. 展开更多

关键词 拟南芥 OsZAT12 c2h2型锌指蛋白 生长发育

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C2H2型锌指蛋白结合的DNA序列预测方法的研究进展 被引量：4

15

作者 沈磐 杨冬 贺福初 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2017年第7期573-579,共7页

C2H2型锌指蛋白是哺乳动物中数量最多的一类转录调控因子.C2H2型锌指蛋白中含有的C2H2型锌指基序多是不相同的,表明它们很可能结合不同的DNA序列,从而调控不同的基因,行使多样化的调控功能.然而,目前大多数C2H2型锌指蛋白结合的DNA序列... C2H2型锌指蛋白是哺乳动物中数量最多的一类转录调控因子.C2H2型锌指蛋白中含有的C2H2型锌指基序多是不相同的,表明它们很可能结合不同的DNA序列,从而调控不同的基因,行使多样化的调控功能.然而,目前大多数C2H2型锌指蛋白结合的DNA序列仍不明确,这阻碍了C2H2型锌指蛋白的功能研究.目前,针对C2H2型锌指蛋白的靶序列预测已有一些初步的研究.本文介绍了C2H2型锌指基序与DNA结合的经典模式,并对C2H2型锌指蛋白靶序列预测方法中所用到的算法、训练集、金标准数据集及相应工具进行了全面系统的总结归纳,旨在丰富对C2H2型锌指蛋白靶序列预测原理和工具的认识,为C2H2型锌指蛋白靶序列的精确预测和更深入的功能研究打下基础. 展开更多

关键词 转录因子 c2h2型锌指蛋白 靶序列预测

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油棕C2H2基因家族鉴定及低温胁迫下的表达分析

16

作者 程秋如 刘子凡 曾宪海 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2023年第3期453-467,共15页

C2H2型锌指蛋白是最常见的锌指蛋白之一,广泛存在于真核生物中,在植物的生长发育、盐、低温、干旱胁迫等非生物胁迫响应中扮演重要作用。本研究以拟南芥C2H2氨基酸序列作为探针,在油棕基因组数据库中进行本地BLASTP比对和保守结构域预... C2H2型锌指蛋白是最常见的锌指蛋白之一,广泛存在于真核生物中,在植物的生长发育、盐、低温、干旱胁迫等非生物胁迫响应中扮演重要作用。本研究以拟南芥C2H2氨基酸序列作为探针,在油棕基因组数据库中进行本地BLASTP比对和保守结构域预测分析,筛选出油棕C2H2型锌指蛋白家族成员,利用生物信息学手段对基因家族成员的理化性质、进化关系、染色体位置、基因结构、保守基序和启动子顺式元件进行分析,并利用转录组数据和荧光定量PCR方法分析EgC2H2基因家族成员在低温胁迫下的表达情况。结果显示:从油棕基因组中共鉴定出73个C2H2型锌指蛋白家族成员,EgC2H2家族成员氨基酸的数目为128~556个,分子量为14176.73~58983.30 Da,等电点为4.99~9.62,不稳定系数为38.84~86.01,亲水性为–1.154~-0.226,亚细胞定位显示C2H2基因家族所有成员均定位于细胞核;系统进化树分析显示EgC2H2家族成员可以分为4个亚家族,EgC2H2家族成员多数归类于第Ⅰ亚家族和第Ⅱ亚家族,且同一亚家族成员的结构域具有较高的一致性;染色体定位结果显示,EgC2H2家族成员不均匀地分布于油棕的16条染色体上;启动子顺式元件分析显示,EgC2H2家族包含许多光响应元件、植物激素响应元件和逆境胁迫响应元件;转录组数据分析显示,大部分EgC2H2基因响应低温胁迫,且大多数EgC2H2基因在耐寒材料中高表达,在冷敏感材料中低表达;荧光定量PCR分析显示,EgC2H2-23、EgC2H2-11、EgC2H2-19、EgC2H2-17和EgC2H2-21显著上调表达,且在耐寒材料中的表达量显著高于冷敏感材料,推测这些基因可能在油棕低温响应中发挥关键作用,可以作为候选基因进一步深入研究。本研究为深入研究油棕C2H2基因家族功能提供理论参考。 展开更多

关键词 油棕 c2h2型锌指蛋白 基因家族 低温胁迫

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C2H2锌指转录因子FpCzf7参与假禾谷镰孢的生长和致病性 被引量：1

17

作者 赵静雅 彭梦雅 +7 位作者 张时雨 单艺轩 邢小萍 施艳 李海洋 杨雪 李洪连 陈琳琳 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期216-224,共9页

假禾谷镰孢引起的小麦茎基腐病已成为威胁我国小麦安全生产的重要病害,但是对假禾谷镰孢致病的机理还了解的比较少。C2H2锌指转录因子在人、植物和真菌中广泛分布,调控生长、发育和逆境胁迫等多种生理过程。本研究在假禾谷镰孢中鉴定到... 假禾谷镰孢引起的小麦茎基腐病已成为威胁我国小麦安全生产的重要病害,但是对假禾谷镰孢致病的机理还了解的比较少。C2H2锌指转录因子在人、植物和真菌中广泛分布,调控生长、发育和逆境胁迫等多种生理过程。本研究在假禾谷镰孢中鉴定到一个编码C2H2锌指转录因子的基因FpCzf7,利用PEG介导的原生质体转化,获得FpCzf7基因缺失的突变体(Δfpczf7)。生物学表型分析发现,与野生型(WT)和回补菌株(Δfpczf7-cp)相比,Δfpczf7在PDA培养基上的菌丝生长速率明显减慢、气生菌丝减少;在CMC液体中的分生孢子产量减少,但是分生孢子形态和萌发无差异。致病性测定结果显示,与WT和Δfpczf7-cp相比,Δfpczf7在大麦叶片、小麦胚芽鞘和小麦穂部的致病性均显著降低,DON毒素合成明显减少。综上所述,FpCzf7参与假禾谷镰孢的生长、产孢、致病性和毒素的产生。 展开更多

关键词 小麦茎基腐病 假禾谷镰孢 c2h2型锌指蛋白 致病性

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C2H2型锌指蛋白对成体干细胞分化的调控作用 被引量：1

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作者 向敏荣 许菁菁 陈继华 《生命的化学》 CAS 2022年第1期12-19,共8页

识别和监测干细胞更新和分化的影响要素对制定和实施相关疾病再生疗法至关重要。成体干细胞分化过程中存在许多调控因子,其中锌指蛋白家族的调控作用近年来受到了较多的关注,特别是C2H2型锌指蛋白。C2H2型锌指蛋白是锌指蛋白家族中成员... 识别和监测干细胞更新和分化的影响要素对制定和实施相关疾病再生疗法至关重要。成体干细胞分化过程中存在许多调控因子,其中锌指蛋白家族的调控作用近年来受到了较多的关注,特别是C2H2型锌指蛋白。C2H2型锌指蛋白是锌指蛋白家族中成员最多的一类转录因子,在转录和翻译水平上调控基因的表达参与多种生物学活动。本文重点概述了各类结构域的C2H2型锌指蛋白通过不同信号通路及调控机制对成体干细胞分化的作用,以期为该家族新成员的功能探索及干细胞治疗技术提供新思路和见解。 展开更多

关键词 c2h2型锌指蛋白 成体干细胞 转录因子 细胞分化

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水稻OsZAT12基因响应非生物胁迫和植物激素的研究

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作者 陈言博 陈宗新 +2 位作者 夏快飞 张明永 王亚琴 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期1797-1810,共14页

C2H2锌指蛋白是真核生物体内一类重要的转录因子,在植物生长发育和应对非生物胁迫方面具有重要作用。实验室前期克隆了水稻C2H2锌指蛋白OsZAT12,该基因在水稻根中特异表达,定位于细胞核,异源过表达OsZAT12的拟南芥植株矮小。为进一步研... C2H2锌指蛋白是真核生物体内一类重要的转录因子,在植物生长发育和应对非生物胁迫方面具有重要作用。实验室前期克隆了水稻C2H2锌指蛋白OsZAT12,该基因在水稻根中特异表达,定位于细胞核,异源过表达OsZAT12的拟南芥植株矮小。为进一步研究OsZAT12在水稻中的功能,该文分析了OsZAT12的启动子元件和转录活性,并采用qRT-PCR技术分析OsZAT12在非生物胁迫和植物激素处理下的响应模式。结果表明:(1)OsZAT12含有2个典型的C2H2锌指结构域和1个EAR motif,具有转录抑制活性,该基因的启动子中含有与非生物胁迫和植物激素相关的元件。(2)对野生型水稻进行非生物胁迫和激素处理发现,低温胁迫(4℃)和激素脱落酸(ABA)处理显著下调OsZAT12的表达;而渗透胁迫(20%PEG 6000)、激素油菜素甾醇(BR)或吲哚-3-乙酸(IAA)处理则显著上调OsZAT12的表达,这说明OsZAT12介导了水稻应对多种非生物胁迫和激素的变化。(3)利用含35S启动子的过表达载体和CRISPR/Cas9基因编辑技术分别得到纯合的OsZAT12过表达植株和OsZAT12敲除植株。(4)对过表达OsZAT12的水稻表型观察发现,相比于野生型,OsZAT12过表达植株在分蘖期、抽穗期和成熟期这3个时期的株高均显著降低;OsZAT12敲除植株的株高与野生型虽无明显差异,但每株穗数和结实率均显著低于野生型,这说明OsZAT12影响了水稻株型、穗型及结实率等农艺性状的建成。(5)实验进一步表明,过表达OsZAT12降低了水稻对外源ABA的敏感性,而OsZAT12敲除植株则相反。因此推测,OsZAT12对植株生长发育的影响可能与该基因响应多种非生物胁迫和激素信号的调控有关,该研究结果为将来利用OsZAT12进行水稻耐逆稳产分子设计育种提供了依据。 展开更多

关键词 水稻 c2h2锌指蛋白 OsZAT12 非生物胁迫 脱落酸

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冬虫夏草菌C2H2基因家族鉴定及其在砷胁迫下表达分析 被引量：1

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作者 吴端 李文佳 +3 位作者 姚辉 钱正明 赵德刚 向丽 《菌物研究》 CAS 2020年第2期110-120,共11页

C2H2型锌指蛋白转录因子家族是真核生物中广泛存在且具有重要生物学功能的锌指蛋白转录因子之一,在真菌生长发育、分生孢子形成、致病性以及胁迫应答等过程中起着重要作用。砷超标是影响冬虫夏草品质的重要因素之一,本研究基于冬虫夏草... C2H2型锌指蛋白转录因子家族是真核生物中广泛存在且具有重要生物学功能的锌指蛋白转录因子之一,在真菌生长发育、分生孢子形成、致病性以及胁迫应答等过程中起着重要作用。砷超标是影响冬虫夏草品质的重要因素之一,本研究基于冬虫夏草菌基因组数据库,利用Hmmsearch程序及PFAM、SMART等在线软件,对冬虫夏草菌C2H2型锌指蛋白(OsC2H2)家族成员进行鉴定,并对OsC2H2基因结构、保守结构域、系统进化分析及砷胁迫下基因表达等进行分析。结果显示,全基因组水平共鉴定出的23条含有C2H2保守结构域的Os C2H2基因,其定位在14条scaffold上且不存在串联重复,不同OsC2H2保守结构域数目及排列方式存在差异;系统进化及基因表达分析显示,18条OsC2H2基因在进化上相对保守,5条OsC2H2基因进化上存在差异,且多数OsC2H2基因响应砷胁迫。通过对全基因组水平OsC2H2进行鉴定及相关生物信息学分析,为进一步研究其结构和功能提供相应理论基础,同时为揭示冬虫夏草砷富集提供参考。 展开更多

关键词 冬虫夏草菌 c2h2型锌指蛋白 基因家族 胁迫表达分析

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