目的分析牡蛎过敏原Cra g 1的二级结构及其B、T细胞表位,为探索基于抗原表位的免疫治疗奠定基础。方法从Uniprot数据库中获得牡蛎过敏原Cra g 1的氨基酸序列,通过DNA Star Protean软件,采用Garnier-Robson方法和Chou-Fasman方法分析其...目的分析牡蛎过敏原Cra g 1的二级结构及其B、T细胞表位,为探索基于抗原表位的免疫治疗奠定基础。方法从Uniprot数据库中获得牡蛎过敏原Cra g 1的氨基酸序列,通过DNA Star Protean软件,采用Garnier-Robson方法和Chou-Fasman方法分析其二级结构;采用Kyte-Doolittle法、Karplus-Schulz法、Emini法、Jameson-Wolf法综合分析Cra g 1主要的B细胞抗原表位。使用SYFPEITHI和NetMHC-Ⅱ在线网站分析T细胞抗原表位。结果牡蛎过敏原Cra g 1的二级结构主要为α-螺旋,其B细胞表位接近覆盖Cra g 1氨基酸全序列;而T细胞优势表位位于第89～103、108～122、129～143位肽段。结论本研究分析牡蛎过敏原Cra g 1的B、T细胞优势表位,为日后Cra g 1的基础免疫学研究,如疫苗的研制、诊断试剂的制备和其抗原性改造等提供了理论依据。展开更多
目的:分析粉尘螨过敏原Der f 38的理化性质及结构特征,并综合生物信息学工具预测其免疫优势B、T细胞表位。方法:从世界卫生组织/国际免疫学联合会的过敏原数据库中获取Der f 38的氨基酸序列信息,利用ProtParam对Der f 38的理化性质特征...目的:分析粉尘螨过敏原Der f 38的理化性质及结构特征,并综合生物信息学工具预测其免疫优势B、T细胞表位。方法:从世界卫生组织/国际免疫学联合会的过敏原数据库中获取Der f 38的氨基酸序列信息,利用ProtParam对Der f 38的理化性质特征进行分析。通过SWISS-MODEL、AlphaFold2及GalaxyRefine对Der f 38的三维结构模型进行综合构建、优化得到最佳的蛋白模型。利用DNAStar Protean、Bepipred 2.0、ElliPro、DiscoTop、TepiTool进行Der f 38蛋白的B细胞线性、构象型表位以及T细胞表位的综合预测。结果:Der f 38为分子量13.99kDa且等电点为9.08,总平均亲水性为-0.337,不稳定指数为31.79。通过多种生物信息学工具综合分析,共得到4个优势B细胞线性表位、8个B细胞构象表位和8个T细胞表位。结论:Der f 38属于碱性蛋白,具有一定的亲水性和稳定性,含有多个免疫优势的B细胞和T细胞抗原表位,为进一步针对该蛋白的疫苗和过敏原特异性免疫疗法的设计与开发提供理论参考。展开更多
文摘目的分析牡蛎过敏原Cra g 1的二级结构及其B、T细胞表位,为探索基于抗原表位的免疫治疗奠定基础。方法从Uniprot数据库中获得牡蛎过敏原Cra g 1的氨基酸序列,通过DNA Star Protean软件,采用Garnier-Robson方法和Chou-Fasman方法分析其二级结构;采用Kyte-Doolittle法、Karplus-Schulz法、Emini法、Jameson-Wolf法综合分析Cra g 1主要的B细胞抗原表位。使用SYFPEITHI和NetMHC-Ⅱ在线网站分析T细胞抗原表位。结果牡蛎过敏原Cra g 1的二级结构主要为α-螺旋,其B细胞表位接近覆盖Cra g 1氨基酸全序列;而T细胞优势表位位于第89～103、108～122、129～143位肽段。结论本研究分析牡蛎过敏原Cra g 1的B、T细胞优势表位,为日后Cra g 1的基础免疫学研究,如疫苗的研制、诊断试剂的制备和其抗原性改造等提供了理论依据。
文摘目的:分析粉尘螨过敏原Der f 38的理化性质及结构特征,并综合生物信息学工具预测其免疫优势B、T细胞表位。方法:从世界卫生组织/国际免疫学联合会的过敏原数据库中获取Der f 38的氨基酸序列信息,利用ProtParam对Der f 38的理化性质特征进行分析。通过SWISS-MODEL、AlphaFold2及GalaxyRefine对Der f 38的三维结构模型进行综合构建、优化得到最佳的蛋白模型。利用DNAStar Protean、Bepipred 2.0、ElliPro、DiscoTop、TepiTool进行Der f 38蛋白的B细胞线性、构象型表位以及T细胞表位的综合预测。结果:Der f 38为分子量13.99kDa且等电点为9.08,总平均亲水性为-0.337,不稳定指数为31.79。通过多种生物信息学工具综合分析,共得到4个优势B细胞线性表位、8个B细胞构象表位和8个T细胞表位。结论:Der f 38属于碱性蛋白,具有一定的亲水性和稳定性,含有多个免疫优势的B细胞和T细胞抗原表位,为进一步针对该蛋白的疫苗和过敏原特异性免疫疗法的设计与开发提供理论参考。
