期刊文献+
共找到13篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
APEX1和OGG1基因多态性与人结直肠癌的DNA损伤反应的相关性
1
作者 陈翼霖 曹辉彩 +3 位作者 贺世畅 高艳 王敏 ZHANG Qian 《标记免疫分析与临床》 CAS 2024年第6期1060-1067,共8页
目的探究APEX1和OGG1基因多态性与人结直肠癌的DNA损伤反应的相关性。方法招募2020年3月至2022年12月在保定市第一中心医院胃肠外科和肿瘤科住院治疗的240例结直肠癌患者为研究对象。所有结直肠癌症患者都进行了病理确认。招募同时期在... 目的探究APEX1和OGG1基因多态性与人结直肠癌的DNA损伤反应的相关性。方法招募2020年3月至2022年12月在保定市第一中心医院胃肠外科和肿瘤科住院治疗的240例结直肠癌患者为研究对象。所有结直肠癌症患者都进行了病理确认。招募同时期在本院体检的300例健康志愿者为对照人员。每位受试者均获得知情同意。从病理档案室和问卷调查中获得病例、志愿者的临床信息。通过Hardy-Weinberg平衡定律预测对照组人群的基因型和等位基因频率。分析所有结直肠癌病例和对照组参与者的基因型分布和优势比。通过在逻辑回归模型中分析多态性与吸烟混杂因素的相互作用。通过计算特定组合的调整后的OR值,对具有一个以上变异等位基因的个体进行结直肠癌风险分析。结果病例与对照组之间在年龄、性别分布、吸烟状况和癌症家族史等一般资料方面差异无统计学意义(P>0.05)。对照组人群中的所有基因型频率与Hardy-Weinberg下预测的一致(P>0.05)。XRCC1399Gln/Gln个体和Arg/Gln基因型患结直肠癌发病风险显著高于Arg/Arg基因型野生型患者。OGG1326Cys和APE1148Glu的变异等位基因显示出有害作用,OR分别为1.23和1.66。对于APE1-141G/G变异等位基因纯合的个体,获得了略微降低的OR(OR=0.58,95%CI 1.73~2.14,P=0.08),表明该等位基因可能会降低结直肠癌的风险,差异无统计学意义(P>0.05)。此外,在病例组和对照组之间OGG1 Ser326Cys和APE1 Asp148Glu的基因型或等位基因分布差异无统计学意义(P>0.05)。对于APE1-141T/G多态性,使用纯合子TT基因型作为参考组,观察到对GG基因型的当前吸烟者有明显的保护作用(OR=0.39,95%CI 0.16~0.88;P=0.04),但在非吸烟者中没有发现这种保护作用。XRCC1399Arg/Gln表现出有害效应,OR=1.66,差异无统计学意义(P>0.05)。结论本研究探讨了DNA碱基切除修复基因(XRCC1,OGG1和APE1)多态性与结直肠癌风险之间� 展开更多
关键词 apex1 OGG1 XRCC1 基因多态性 结直肠癌
下载PDF
hOGG1、APEX1和XRCC1基因单核苷酸多态性与噪声性听力损失的关联研究 被引量:5
2
作者 葛欣 盛荣建 +2 位作者 郭佳娣 朱宝立 程剑 《职业卫生与应急救援》 2019年第2期107-112,共6页
[目的]探讨人类8-羟基鸟嘌呤糖苷酶基因(hOGG1)、脱嘌呤脱嘧啶核酸内切酶1基因(APEX1)、X射线损伤修复交叉互补基因(XRCC1)多态性与中国汉族人群噪声性听力损失(noise-induced hearing loss,NIHL)的易感关联性。[方法]以江苏省某化纤公... [目的]探讨人类8-羟基鸟嘌呤糖苷酶基因(hOGG1)、脱嘌呤脱嘧啶核酸内切酶1基因(APEX1)、X射线损伤修复交叉互补基因(XRCC1)多态性与中国汉族人群噪声性听力损失(noise-induced hearing loss,NIHL)的易感关联性。[方法]以江苏省某化纤公司下属3个子公司接触噪声的作业工人为研究对象,结合工作场所噪声声级测量结果和工人纯音测听结果,筛选病例组585人和对照组619人。获取两组人群周围血基因组DNA,采用TaqMan探针法对所选基因的单核苷酸多态性位点进行基因分型。[结果]共筛选3个候选基因:hOGG1、XRCC1和APEX1。logistic回归分析结果显示:在显性模型中,相比GG基因型,rs2072668 CC+CG基因型可能是噪声性听力损失发病的危险因素,其调整的OR值及95%CI值为1.40(1.10~1.78);在90~95 dB(A)·年累积噪声暴露量下,相比GG基因型,rs2072668位点CC+CG基因型可能是噪声性听力损失发病的危险因素,其调整的OR值及95%CI值为2.11(1.16~3.82);在<90 dB(A)·年累积噪声暴露量下,相比TT基因型,rs 1130409 GG+GT基因型可能是噪声性听力损失发病的危险因素,其调整的OR值及95%CI值为2.76(1.13~6.73)。单体型分析结果显示,CTG(rs2072668-rs1799782-rs2230409)可能是噪声性听力损失发病的危险因素,相比对照组,其调整OR值及95%CI值为1.78(1.21~2.61)。[结论] rs2072668 CC+CG基因型增加了噪声作业工人患NIHL的风险,提示hOGG1基因单核苷酸多态性可能与NIHL易感性有关。 展开更多
关键词 单核苷酸多态性 噪声性听力损失 易感性 HOGG1 apex1 XRCC1 基因 危险因素
原文传递
APEX1介导Jagged1上调驱动结肠癌进展的机制
3
作者 贺世畅 曹辉彩 +2 位作者 陈翼霖 高艳 王敏 《标记免疫分析与临床》 CAS 2023年第10期1726-1733,共8页
目的探讨APEX1介导Jagged1上调驱动结肠癌进展的机制。方法APEX1 siRNA转染NCI-H548和DLD1,构建APEX1低表达细胞;SW480和HT29转染APEX1 shRNA,构建APEX1超表达细胞。NCI-H548细胞用于构建APEX1超表达、Jagged1低表达、Jagged1超表达。... 目的探讨APEX1介导Jagged1上调驱动结肠癌进展的机制。方法APEX1 siRNA转染NCI-H548和DLD1,构建APEX1低表达细胞;SW480和HT29转染APEX1 shRNA,构建APEX1超表达细胞。NCI-H548细胞用于构建APEX1超表达、Jagged1低表达、Jagged1超表达。将构建的NCI-H548-APEX1、NCI-H548-APEX1+Jagged1siRNA,NCI-H548-APEX1+Jagged1细胞注射小鼠体内用于肿瘤生长检测。通过Western blot分析人结肠癌细胞系中APEX1、Jagged1、Notch1和Notch3的蛋白表达。通过MTT试验检测细胞增殖。通过Transwell小室试验检测细胞迁移侵袭。用指定细胞的上清液培养HUVECs成管进行血管生成试验。通过卡尺测量异种移植小鼠肿瘤大小。结果NCI-H548和DLD1中APEX1、Jagged1、Notch1和Notch3蛋白表达较SW480、HT29升高(P<0.05),在APEX1高表达的NCI-H548和DLD1中,Jagged1和Notch蛋白表达较高。相反,在APEX1低表达的SW480、HT29中,Jagged1和Notch蛋白表达较低。在NCI-H548、DLD1等结肠癌细胞中转染APEX1 siRNA敲低APEX1后,Jagged1蛋白和/Notch蛋白水平显著降低(P<0.05),而在SW480-APEX1和HT29-APEX1细胞中,Jagged1蛋白/Notch蛋白平显著升高(P<0.05)。NCI-H548-APEX1+Jagged1 siRNA细胞增殖较NCI-H548-APEX1降低(P<0.05),NCI-H548-APEX1+Jagged1细胞增殖较NCI-H548-APEX1+Jagged1 siRNA升高(P<0.05)。NCI-H548-APEX1+Jagged1 siRNA细胞迁移、侵袭能力较NCI-H548-APEX1降低(P<0.05),NCI-H548-APEX1+Jagged1细胞迁移侵袭能力较NCI-H548-APEX1+Jagged1siRNA升高(P<0.05)。NCI-H548-APEX1+Jagged1 siRNA细胞血管生成量较NCI-H548-APEX1减少(P<0.05),NCI-H548-APEX1+Jagged1细胞血管生成量较NCI-H548-APEX1+Jagged1 siRNA增多(P<0.05)。注射NCI-H548-APEX1+Jagged1 siRNA细胞的小鼠肿瘤体积较注射NCI-H548-APEX1细胞减小(P<0.05),注射NCI-H548-APEX1+Jagged1细胞的小鼠肿瘤体积较注射NCI-H548-APEX1+Jagged1 siRNA细胞增大(P<0.05)。结论APEX1通过上调Jagged1的表达,正向调节Notch信号通路,从而促进结肠癌在体内和体外的肿瘤发生。由于AP 展开更多
关键词 apex1 Jagged1/Notch 结肠癌 异种移植
下载PDF
APEX1基因多态性影响结肠癌细胞的细胞代谢的机制 被引量:1
4
作者 高艳 曹辉彩 +3 位作者 陈翼霖 贺世畅 王敏 李鲜爱 《现代消化及介入诊疗》 2023年第4期437-441,共5页
目的探究APEX1基因多态性影响结肠癌细胞的细胞代谢的机制。方法筛选保定市第一中心医院2019年2月至2021年12月诊断为结肠癌的160例患者的标本作为结肠癌组,招募同时期在本院进行肠镜活检的200例健康志愿者为对照组。标本培养的结肠癌-... 目的探究APEX1基因多态性影响结肠癌细胞的细胞代谢的机制。方法筛选保定市第一中心医院2019年2月至2021年12月诊断为结肠癌的160例患者的标本作为结肠癌组,招募同时期在本院进行肠镜活检的200例健康志愿者为对照组。标本培养的结肠癌-细胞和SW480细胞用于体外细胞研究。采用单链构象多态性(SSCP)对样本PCR产物进行突变分析。通过CCK8检测培养细胞增值。通过TUNEL染色分析细胞凋亡。通过伤口愈合试验比较细胞迁移能力。使用Seahorse XFp细胞外通量分析仪测量线粒体应激试验。通过蛋白印迹分析培养细胞中pAkt、FOXO3和MMP9蛋白表达。结果CRC和所选基因APEX1突变之间有显著的相互作用。13T<G-GG基因型的患者发生CRC的风险高于GT和TT基因型(P<0.05),ser129argg-GG和GT基因型的患者发生CRC的风险高于TT基因型(P<0.05),Val131Gly-GG和GT基因型患者发生CRC的风险更高(P<0.05)。培养48 h和72 h后,结肠癌-细胞组细胞增殖能力较对照-细胞组升高(P<0.05)。结肠癌-细胞组细胞凋亡率较对照-细胞组降低(P<0.05)。划痕完成的第1 d,两组细胞伤口愈合率比较无差异(P>0.05)。第3 d、5 d,结肠癌-细胞组伤口愈合率较对照-细胞组增大(P<0.05)。结肠癌-细胞组呼吸耗氧率、胞外酸化率和耦合效率较对照-细胞组降低(P<0.05)。结肠癌-细胞组pAkt、FOXO3和MMP9蛋白表达较对照-细胞组升高(P<0.05)。结论APEX1多态性与CRC之间的存在显著相关性和致癌特性。此外,APEX1多态性通过降低结肠癌的偶联效率来影响线粒体呼吸,并通过Akt/FOXO3/MMP9信号通路的正反馈调控来推动癌症的进展。 展开更多
关键词 apex1 基因多态性 结肠癌细胞 细胞代谢
下载PDF
APEX1和Jagged1基因在肝细胞癌中的表达及相关性 被引量:3
5
作者 方雪婷 马小杰 +1 位作者 张钰 黄爱民 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期1294-1299,共6页
目的探讨APEX1和Jagged1基因在原发性肝细胞癌中的表达,并分析两者表达的相关性,探讨其在肝细胞癌发生、发展中的作用及相关机制。方法采用qRT-PCR技术检测46例肝细胞癌及癌旁肝组织中APEX1及Jagged1 mRNA的表达水平;采用Western blot... 目的探讨APEX1和Jagged1基因在原发性肝细胞癌中的表达,并分析两者表达的相关性,探讨其在肝细胞癌发生、发展中的作用及相关机制。方法采用qRT-PCR技术检测46例肝细胞癌及癌旁肝组织中APEX1及Jagged1 mRNA的表达水平;采用Western blot法检测18对新鲜冷冻肝细胞癌组织及癌旁肝组织中APEX1及Jagged1蛋白的表达水平;采用组织芯片结合免疫组化法检测118例肝细胞癌中APEX1及Jagged1蛋白的表达,分析两者表达与临床病理特征的关系及相关性,并复习相关文献。结果肝细胞癌中APEX1 mRNA及蛋白的表达量明显高于癌旁肝组织(P<0.05)。免疫组化染色示,APEX1定位于细胞质和(或)细胞核内,在肝细胞癌中APEX1蛋白在细胞质中的表达高于癌旁肝组织,差异有统计学意义(P<0.001)。APEX1 mRNA表达与肿瘤包膜侵犯、分化程度、转移及复发有关(P<0.05)。qRT-PCR和Western blot结果示,肝细胞癌中Jagged1 mRNA和蛋白的表达明显高于癌旁肝组织(P<0.05)。免疫组化染色示,Jagged1定位于细胞质,在肝细胞癌组织中的阳性率高于癌旁肝组织,两者差异有显著性(P<0.001)。Jagged1蛋白表达与肝细胞癌的AFP水平、分化程度、转移及复发有关(P<0.05)。在肝细胞癌中,APEX1表达与Jagged1的表达呈显著正相关(P<0.05)。结论APEX1和Jagged1基因在肝细胞癌中的过表达与肝细胞癌侵袭、转移明显相关,APEX1可能通过调控Jagged1表达来参与肝细胞癌的发生、发展。APEX1和Jagged1蛋白过表达可以预测肝细胞癌的恶性转化和转移。 展开更多
关键词 肝肿瘤 肝细胞癌 apex1 JAGGED1 QRT-PCR WESTERN BLOT 免疫组织化学
下载PDF
肝细胞癌骨转移中APEX1和JAG1的表达及意义 被引量:1
6
作者 方雪婷 张丽 +2 位作者 蔡素琴 王声耀 吴春林 《中国卫生标准管理》 2022年第6期100-103,共4页
目的分析肝细胞癌骨转移(hepatocellular carcinoma bone metastasis,HCC-BM)的临床及病理学特征,检测脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶1(apurinic/apyrimidinic endonuclease-1,APEX1)和JAG1基因在HCC-BM和肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,H... 目的分析肝细胞癌骨转移(hepatocellular carcinoma bone metastasis,HCC-BM)的临床及病理学特征,检测脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶1(apurinic/apyrimidinic endonuclease-1,APEX1)和JAG1基因在HCC-BM和肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的表达;探讨两者的表达与临床病理特征的关系。方法回顾性分析2012年1月—2019年12月在福建医科大学附属第一医院和福建医科大学附属第二医院HCC-BM患者的资料。采用免疫组化检测79例HCC及HCC-BM中APEX1、JAG1的表达,分析两者与临床病理特征的关系。结果福建医科大学附属第一医院和第二医院2012—2019年间肝细胞癌骨转移的发生率为17.02%(79/464)。患者男女比例8.9︰1;中位年龄53岁。脊柱(72.0%)为最常见的骨转移部位,其次为下肢骨11.0%。免疫组化结果显示79例HCC-BM中APEX1胞质、JAG1的阳性率分别为63.3%、62.0%;HCC中的阳性率分别为46.8%、41.8%。APEX1、JAG1在HCC-BM中的表达高于HCC;APEX1的表达与肿瘤的分化程度、原发灶的数目有关(P<0.05);JAG1的表达与肿瘤分化程度、是否合并骨外转移有关(P<0.05)。在HCC-BM中APEX1和JAG1蛋白之间的表达呈正相关(P=0.035)。结论HCC-BM的发生率为17.02%,好发于中老年男性,脊柱为最常见的骨转移部位。APEX1及JAG1在HCCBM中的表达高于HCC,提示两者可能参与肝细胞癌的骨转移,而其具体作用机制尚有待进一步研究。 展开更多
关键词 肝细胞癌 骨转移 apex1 JAG1 临床病理学 免疫组化
下载PDF
SHG-44与U251胶质瘤细胞株放射抵抗性差异及其与APEX1 mRNA表达和细胞周期分布的关系 被引量:1
7
作者 张兴逵 杨智勇 +2 位作者 邓兴力 刘永贵 杨德标 《肿瘤防治研究》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期425-429,共5页
目的对不同级别的SHG-44与U251胶质瘤细胞株放射抵抗性差异进行比较,探索放射抵抗性与APEX1 mRNA表达及细胞周期分布的关系。方法采用平板克隆形成实验法检测SHG-44细胞株与U251细胞株之间放射抵抗性的差别;采用RT-PCR技术检测已知的胶... 目的对不同级别的SHG-44与U251胶质瘤细胞株放射抵抗性差异进行比较,探索放射抵抗性与APEX1 mRNA表达及细胞周期分布的关系。方法采用平板克隆形成实验法检测SHG-44细胞株与U251细胞株之间放射抵抗性的差别;采用RT-PCR技术检测已知的胶质瘤放射抵抗因子APEX1mRNA的表达情况;流式细胞术检测两种细胞细胞周期的分布情况;直线相关分析分析细胞放射抵抗性与APEX1 mRNA的表达情况及细胞周期分布的关系。结果与WHOⅣ级的U251相比,WHOⅡ~Ⅲ级的SHG-44的放射抵抗性较高(SF2_(U251)=0.58±0.02,SF2_(SHG-44)=0.70±0.15,t=3.19,P<0.05),但其APEX1 mRNA表达要低(1.17±0.04 vs.0.70±0.18,t=19.92,P<0.05),G_1期SHG-44比例高于U251(60.13±3.26 vs.51.72±5.14,t=2.51,P<0.05),S期SHG-44低于U251(18.57±0.64 vs.28.80±2.96,t=5.09,P<0.05),G_2期两者差异无统计学意义(17.63±3.91 vs.21.78±4.81,t=1.25,P>0.05),G_1期比例与SF2存在相关性(r=0.735,P<0.05)。结论胶质瘤的放射抵抗性与病理级别可能呈负相关,不同类型胶质瘤的放射抵抗机制可能存在差异,APEX1并不是SHG-44细胞放射抵抗性增高的决定因素,G_1期阻滞可能是SHG-44细胞放射抵抗性增高的原因之一。 展开更多
关键词 胶质瘤 放射抵抗性 病理级别 apex1 细胞周期
下载PDF
APEX1和Vimentin在肝细胞癌中的表达及临床意义 被引量:1
8
作者 郑智华 吴春林 +3 位作者 李振喜 吴晓岚 魏攀凤 杨维群 《广东职业技术教育与研究》 2018年第4期88-92,共5页
目的:通过检测APEX1和Vimentin在原发性肝细胞癌(Hepatocellular Carcino-ma,HCC)中的表达,探讨二者与HCC侵袭转移的相关性及其意义。方法:采用免疫组化Eli Vision二步法检测APEX1和Vimentin在HCC及其癌旁肝组织、正常肝组织中的表达,... 目的:通过检测APEX1和Vimentin在原发性肝细胞癌(Hepatocellular Carcino-ma,HCC)中的表达,探讨二者与HCC侵袭转移的相关性及其意义。方法:采用免疫组化Eli Vision二步法检测APEX1和Vimentin在HCC及其癌旁肝组织、正常肝组织中的表达,分析二者与HCC临床病理资料的相关性。结果:APEX1和Vimentin在HCC中表达明显增强,在HCC中表达率分别为69.52%及75.2%,而在癌旁肝组织及正常肝组织表达明显减弱,差异均具有统计学意义(P<0.05)。APEX1高表达与HCC组织分化程度、门静脉癌栓及肝被膜侵犯相关(P<0.05)。Vimentin高表达与HCC门静脉癌栓和肝被膜侵犯相关(P<0.05)。APEX1和Vimentin二者在HCC表达呈正相关(P<0.05)。结论:APEX1和Vimentin的过表达与肝癌的恶性生物学行为有关。二者在HCC进展及侵袭转移中,可能起协同作用。 展开更多
关键词 原发性肝细胞癌 apex1 VIMENTIN 转移 免疫组化
下载PDF
五指山小型猪APEX1基因cDNA的克隆及生物信息学分析 被引量:1
9
作者 李治深 杜丽 +7 位作者 刘涛 申明霞 王凤阳 成鹰 陈品林 林杰材 满初日嘎 祁超 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第30期14621-14624,共4页
[目的]对五指山小型猪脱嘌呤嘧啶核酸内切酶cDNA进行克隆和生物信息学分析。[方法]以构建的五指山小型猪外周血白细胞cDNA文库为材料,采用菌落PCR方法,克隆得到APEX1基因全长cDNA,并运用生物信息学软件对该基因核苷酸序列及其编码蛋白... [目的]对五指山小型猪脱嘌呤嘧啶核酸内切酶cDNA进行克隆和生物信息学分析。[方法]以构建的五指山小型猪外周血白细胞cDNA文库为材料,采用菌落PCR方法,克隆得到APEX1基因全长cDNA,并运用生物信息学软件对该基因核苷酸序列及其编码蛋白的理化性质及二级结构等进行分析和预测。[结果]生物信息学分析表明,该cDNA全长1392bp,5′非翻译区长132bp,3′非翻译区长303bp,含有一个957bp的完整开放阅读框,编码318个氨基酸。该蛋白的分子量为35kD,等电点为8.05。比对分析表明,五指山小型猪APEX1基因的核酸序列及其氨基酸序列与人、小鼠、黑猩猩等哺乳动物具有较高的相似性。[结论]成功克隆了五指山小型猪A-PEX1基因cDNA,为进一步研究APEX1在动物体内的作用机制奠定了基础。 展开更多
关键词 五指山小型猪 脱嘌呤嘧啶核酸内切酶 CDNA文库 克隆 序列分析
下载PDF
人APEX1基因的生物信息学分析 被引量:6
10
作者 郭润民 黄金智 +1 位作者 卫月 马天仲 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期1852-1857,共6页
APEXl是影响基因表达和氧化还原活性相关碱基修复和多功能蛋白的关键基因,对APEXl基因及编码蛋白进行生物信息学方面的深入分析,更有利于对APEXl基因相关癌症及其他遗传流行病学的阐述。本研究利用生物信息学分析方法以11个物种APEXl... APEXl是影响基因表达和氧化还原活性相关碱基修复和多功能蛋白的关键基因,对APEXl基因及编码蛋白进行生物信息学方面的深入分析,更有利于对APEXl基因相关癌症及其他遗传流行病学的阐述。本研究利用生物信息学分析方法以11个物种APEXl基因序列及编码蛋白序列为研究对象,对人APEXl基因进行了系统进化分析及预测启动子及CpG岛,并对其蛋白质理化性质及结构功能等进行了预测分析。核酸分析结果表明,人APEXl基因包含5个外显子,预测核心启动子区域为158~208bp。进化分析结果显示,人与黑猩猩的遗传距离为0.003,亲缘关系最近。蛋白预测软件结果显示,人APEXl蛋白主要由自由卷曲及仪一螺旋结构组成,无合适信号肽及明显跨膜区,表明该基因不参与跨膜物质运输及信号转导。 展开更多
关键词 apex1基因 生物信息学分析
原文传递
Investigation of osteosarcoma genomics and its impact on targeted therapy: an international collaboration to conquer human osteosarcoma 被引量:7
11
作者 Ji-Long Yang 《Chinese Journal of Cancer》 SCIE CAS CSCD 2014年第12期575-580,共6页
Osteosarcoma is a genetically unstable malignancy that most frequently occurs in children and young adults.The lack of progress in managing this devastating disease in the clinic has prompted international researchers... Osteosarcoma is a genetically unstable malignancy that most frequently occurs in children and young adults.The lack of progress in managing this devastating disease in the clinic has prompted international researchers to collaborate to profile key genomic alterations that define osteosarcoma.A team of researchers and clinicians from China,Finland,and the United States investigated human osteosarcoma by integrating transcriptome sequencing(RNA-seq),high-density genome-wide array comparative genomic hybridization(a CGH),fluorescence in situ hybridization(FISH),reverse transcription-polymerase chain reaction(RT-PCR),Sanger sequencing,cell culture,and molecular biological approaches.Systematic analysis of genetic/genomic alterations and further functional studies have led to several important findings,including novel rearrangement hotspots,osteosarcoma-specific LRP1-SNRNP25 and KCNMB4-CCND3 fusion genes,VEGF and Wnt signaling pathway alterations,deletion of the WWOX gene,and amplification of the APEX1 and RUNX2 genes.Importantly,these genetic events associate significantly with pathogenesis,prognosis,progression,and therapeutic activity in osteosarcoma,suggesting their potential impact on improved managements of human osteosarcoma.This international initiative provides opportunities for developing new treatment modalities to conquer osteosarcoma. 展开更多
关键词 基因组学 国际合作 靶向治疗 骨肉瘤 遗传不稳定 比较基因组杂交 分子生物学方法 WNT信号通路
下载PDF
APEX1和OGG1基因多态性与结肠癌发病风险、肿瘤分期和预后转归的相关性 被引量:2
12
作者 曹辉彩 陈翼霖 +3 位作者 高艳 贺世畅 王敏 李鲜爱 《现代消化及介入诊疗》 2023年第3期372-376,共5页
目的调查APEX1和OGG1基因多态性与结肠癌发病风险、肿瘤分期和预后转归的相关性。方法筛选保定市第一中心医院2019年2月至2021年12月诊断为结肠癌的160例患者的标本作为结肠癌组,同期收集我院160名健康个体的标本作为对照组。流行病学... 目的调查APEX1和OGG1基因多态性与结肠癌发病风险、肿瘤分期和预后转归的相关性。方法筛选保定市第一中心医院2019年2月至2021年12月诊断为结肠癌的160例患者的标本作为结肠癌组,同期收集我院160名健康个体的标本作为对照组。流行病学调查表收集个人数据;通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)对APEX1基因中的多态性(ASP/Glu)和OGG1基因中的多态性进行基因分型(Ser/Cys);按性别,年龄,饮酒和吸烟情况对APEX1基因多态性SNP分析。结果ASP/Glu基因型与结肠癌正相关(OR=3.45;95%CI=1.32~5.87,P=0.003)。Glu/Glu基因型也与结肠癌相关(OR=3.87;95%CI=1.48~6.43,P=0.004)。结肠癌组患者和对照组中等位基因频率不同,Glu等位基因的携带者增加了结肠癌的风险(OR=1.85;95%CI=1.24~4.22,P=0.014)。Ser/Cys基因型与结肠癌正相关(OR=2.85;95%CI=1.64~4.27,P=0.001)。Cys/Cys基因型也与结肠癌相关(OR=3.22;95%CI=1.87~5.34,P=0.001)。结肠癌组患者和对照组中等位基因频率不同,Cys等位基因的携带者增加了结肠癌的风险(OR=1.97;95%CI=1.15~4.78,P=0.001)。年龄大于50岁的结肠癌组患者存在ASP/Glu+Glu/Glu基因型的风险增加。吸烟和酗酒的结肠癌组患者,与ASP/Glu+Glu/Glu基因型的风险增加相关。ASP/Glu和Ser/Cys基因型与早期TNM阶段(Ⅰ+Ⅱ期)和晚期TNM阶段(Ⅲ+Ⅳ)有关,具有Cys/Cys基因型与晚期TNM阶段(Ⅲ+Ⅳ)有关。APEX1 Glu/Glu基因型和OGG1 Cys/Cys基因型病情恶化升高。结论APE1 Asp148Glu和OGG1 Ser326Cys多态性与结肠癌风险增加、肿瘤分期和预后转归有关。 展开更多
关键词 结肠癌 apex1基因 OGG1基因 基因多态性 发病风险 肿瘤分期 预后转归
下载PDF
天祝白牦牛APEX-1基因的克隆及生物信息学分析 被引量:1
13
作者 李亚兰 张全伟 +3 位作者 王雪莹 马友记 张勇 赵兴绪 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2014年第2期51-55,共5页
克隆天祝白牦牛脱嘌呤嘧啶核酸内切酶基因(APEX-1)全长cDNA序列,为研究天祝牦牛高原抗逆性机制提供理论基础。根据已知哺乳动物APEX-1基因cDNA序列同源性,设计引物以及5'和3'特异性引物,运用cDNA末端快速扩增(RACE)技术获得天... 克隆天祝白牦牛脱嘌呤嘧啶核酸内切酶基因(APEX-1)全长cDNA序列,为研究天祝牦牛高原抗逆性机制提供理论基础。根据已知哺乳动物APEX-1基因cDNA序列同源性,设计引物以及5'和3'特异性引物,运用cDNA末端快速扩增(RACE)技术获得天祝白牦牛APEX-1基因全长cDNA序列。扩增获得天祝白牦牛APEX-1基因全长cDNA序列为1 391 bp(GenBank登录号:KF611690),ORF长957 bp,编码318个氨基酸。氨基酸序列分析显示天祝白牦牛APEX-1基因编码氨基酸序列与大多数哺乳动物相似,但有7个氨基酸突变。同源建模预测,显示天祝白牦牛APEX-1蛋白由8个α-螺旋和11个β-折叠片形成一个呈三明治的α/β球蛋白。天祝白牦牛APEX-1基因的成功克隆为进一步研究该基因的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 天祝白牦牛 脱嘌呤嘧啶核酸内切酶 CDNA末端快速扩增 序列分析
下载PDF
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部