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Functions and Application of the AP2/ERF Transcription Factor Family in Crop Improvement 被引量:91
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作者 Zhao-Shi Xu Ming Chen Lian-Cheng Li You-Zhi Ma 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2011年第7期570-585,共16页
Plants have acquired sophisticated stress response systems to adapt to changing environments. It is important to understand plants' stress response mechanisms in the effort to improve crop productivity under stressfu... Plants have acquired sophisticated stress response systems to adapt to changing environments. It is important to understand plants' stress response mechanisms in the effort to improve crop productivity under stressful conditions. The AP2/ERF transcription factors are known to regulate diverse processes of plant development and stress responses. In this study, the molecular characteristics and biological functions of AP2/ERFs in a variety of plant species were analyzed. AP2/ERFs, especially those in DREB and ERF subfamilies, are ideal candidates for crop improvement because their overexpression enhances tolerances to drought, salt, freezing, as well as resistances to multiple diseases in the transgenic plants. The comprehensive analysis of physiological functions is useful in elucidating the biological roles of AP2/ERF family genes in gene interaction, pathway regulation, and defense response under stress environments, which should provide new opportunities for the crop tolerance engineering. 展开更多
关键词 ap2/erf gene regulation signal pathway stress tolerance transgenic plant
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The Jasmonate-Responsive AP2/ERF Transcription Factors AaERF1 and AaERF2 Positively Regulate Artemisinin Biosynthesis in Artemisia annua L. 被引量:86
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作者 Zong-Xia Yu Jian-Xu Li +3 位作者 Chang-Qing Yang Wen-Li Hu Ling-Jian Wang Xiao-Ya Chen 《Molecular Plant》 SCIE CAS CSCD 2012年第2期353-365,共13页
Plants of Artemisia annua produce artemisinin, a sesquiterpene lactone widely used in malaria treatment. Amorpha-4,11-diene synthase (ADS), a sesquiterpene synthase, and CYP71AV1, a P450 monooxygenase, are two key e... Plants of Artemisia annua produce artemisinin, a sesquiterpene lactone widely used in malaria treatment. Amorpha-4,11-diene synthase (ADS), a sesquiterpene synthase, and CYP71AV1, a P450 monooxygenase, are two key enzymes of the artemisinin biosynthesis pathway. Accumulation of artemisinin can be induced by the phytohormone jasmonate (JA). Here, we report the characterization of two JA-responsive AP2 family transcription factors-AaERF1 and AaERF2-from A. annua L. Both genes were highly expressed in inflorescences and strongly induced by JA. Yeast one- hybrid and electrophoretic mobility shift assay (EMSA) showed that they were able to bind to the CRTDREHVCBF2 (CBF2) and RAVlAAT (RAA) motifs present in both ADS and CYP71AV1 promoters. Transient expression of either AaERF1 or AaERF2 in tobacco induced the promoter activities of ADS or CYP71AV1, and the transgenic A. annua plants overexpressing either transcription factor showed elevated transcript levels of both ADS and CYP71AV1, resulting in increased accumulation of artemisinin and artemisinic acid. By contrast, the contents of these two metabolites were reduced in the RNAi transgenic lines in which expression of AaERF1 or AaERF2 was suppressed. These results demonstrate that AaERF1 and AaERF2 are two positive regulators of artemisinin biosynthesis and are of great value in genetic engineering of arte- misinin production. 展开更多
关键词 ARTEMISININ Artemisiaannua SESQUITERPENE amorpha-4 11-dienesynthase CYP71Av1 JASMONATE ap2/erf transcription factor.
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药用植物转录因子AP2/ERF研究与展望 被引量:28
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作者 季爱加 罗红梅 +3 位作者 徐志超 张鑫 宋经元 陈士林 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第14期1272-1284,共13页
药用植物作为中药和世界传统药物的主要来源,面临着资源稀缺和活性成分含量低等问题.通过转录水平调控发育相关基因及活性成分合成途径酶基因表达是实现定向、高效调节药用植物生长及活性成分合成的有效手段之一.因此,近年来转录因子调... 药用植物作为中药和世界传统药物的主要来源,面临着资源稀缺和活性成分含量低等问题.通过转录水平调控发育相关基因及活性成分合成途径酶基因表达是实现定向、高效调节药用植物生长及活性成分合成的有效手段之一.因此,近年来转录因子调节药用植物发育及活性成分合成的研究备受关注.转录因子AP2/ERF家族是植物最大转录因子家族之一,家族成员均包含保守AP2结构域,根据结构域数量和识别序列不同,AP2/ERF家族被分为5个亚家族:AP2(APETALA2),ERF(ethylene-responsive factor),DREB(dehydration-responsive element binding proteins),RAV(related to ABI3/VP1)和Soloist.本文重点综述转录因子AP2/ERF调控药用植物活性成分生物合成、发育、胁迫响应的研究进展,阐述了转录因子AP2/ERF调控靶基因和自身受到调控的作用机制,同时总结转录因子AP2/ERF研究方法,提出组学和生物信息学方法成为分离、筛选转录因子,预测转录因子功能的强大工具,为分析、预测、验证药用植物AP2/ERF家族成员的功能和阐明AP2/ERF的调控机制提供理论基础和方法指导.转录因子AP2/ERF的功能研究及其作用机制的揭示将有助于利用代谢调控手段提高药用植物活性成分产量,有利于药用植物优良品种的培育,为满足人们对天然药物的需求奠定基础. 展开更多
关键词 转录因子 ap2/erf 药用植物 活性成分 生长发育
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Hairy Leaf 6, an AP2/ERF Transcription Factor, Interacts with OsWOX3B and Regulates Trichome Formation in Rice 被引量:23
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作者 Wenqiang Sun Dawei Gao +4 位作者 Yin Xiong Xinxin Tang Xiongfeng Xiao Chongrong Wang Sibin Yu 《Molecular Plant》 SCIE CAS CSCD 2017年第11期1417-1433,共17页
Trichome formation has been extensively studied as a mechanistic model for epidermal cell differentiation and cell morphogenesis in plants. However, the genetic and molecular mechanisms underlying trichome formation ... Trichome formation has been extensively studied as a mechanistic model for epidermal cell differentiation and cell morphogenesis in plants. However, the genetic and molecular mechanisms underlying trichome formation (i.e., initiation and elongation) in rice remain largely unclear. Here, we report an AP2/ERF transcription factor, Hairy Leaf 6 (HL6), which controls trichome formation in rice. Functional analyses revealed that HL6 transcriptionally regulates trichome elongation in rice, which is dependent on functional OsWOX3B, a homeodomain-containing protein that acts as a key regulator in trichome initiation. Biochemical and molecular genetic analyses demonstrated that HL6 physically interacts with OsWOX3B, and both of them regulate the expression of some auxin-related genes during trichome formation, in which OsWOX3B likely enhances the binding ability of HL6 with one of its direct target gene, OsYUCCA5. Popu- lation genetic analysis indicated that HL6 was under negative selection during rice domestication. Taken together, our findings provide new insights into the molecular regulatory network of trichome formation in rice. 展开更多
关键词 RICE trichome development AUXIN ap2/erf transcription factor WOX transcription factor
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植物萜类物质生物合成的相关转录因子及其应用前景 被引量:18
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作者 赵恒伟 葛锋 +2 位作者 孙颖 刘迪秋 陈朝银 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2012年第12期2512-2519,共8页
植物萜类化合物具有很高的经济价值和药用价值。近年来,开始利用转录因子来提高萜类次生代谢物的产量。转录因子在萜类次生代谢生物合成中起着重要的作用,通过与结构基因的结合,转录因子可激活次生代谢合成途径中多个基因协同表达,从而... 植物萜类化合物具有很高的经济价值和药用价值。近年来,开始利用转录因子来提高萜类次生代谢物的产量。转录因子在萜类次生代谢生物合成中起着重要的作用,通过与结构基因的结合,转录因子可激活次生代谢合成途径中多个基因协同表达,从而有效启动次生代谢途径;转录因子还可激活不同植物中相似萜类次生代谢合成基因的表达,将从特定植物中分离出来的转录因子基因在不同植物中进行遗传转化,可以有效提高转基因植物中萜类物质的量。因此,转录因子的应用是萜类次生代谢基因工程中的一个新方向,已显示出广泛的应用前景。介绍了萜类次生代谢途径相关的重要转录因子:AP2/ERF、WRKY、bZCT、bHLH及其在萜类生物合成遗传改良中的研究进展。 展开更多
关键词 萜类 转录因子 ap2 erf WRKY 次生代谢
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AP2/ERF转录因子对植物非生物胁迫应答的研究进展 被引量:16
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作者 崔喜艳 陈众峰 陈展宇 《吉林农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期417-423,共7页
植物AP2/ERF(APETALA 2/ethylene-responsive element binding factor)是一个庞大的转录因子超家族,其蛋白质中均含有1或2段60~70个氨基酸残基组成的AP2/ERF结构域,存在于所有植物中。AP2/ERF转录因子参与多种生物学过程,包括干旱、... 植物AP2/ERF(APETALA 2/ethylene-responsive element binding factor)是一个庞大的转录因子超家族,其蛋白质中均含有1或2段60~70个氨基酸残基组成的AP2/ERF结构域,存在于所有植物中。AP2/ERF转录因子参与多种生物学过程,包括干旱、高盐、低温等逆境胁迫响应等。在植物受到逆境刺激后,脱落酸、乙烯等信号相应地被激活,并激活AP2/ERF转录因子的表达,从而调控功能基因的表达。文中对国内外近年来有关植物AP2/ERF类转录因子的分类、结构特点、分布、信号传导途径及基因调节等方面的研究进行了综述。 展开更多
关键词 ap2/erf 转录因子 非生物胁迫
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沪油15中两个AP2/ERF-B1亚族转录因子的克隆与分析 被引量:16
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作者 庄静 彭日荷 +6 位作者 高峰 付晓燕 朱波 金晓芬 Jian Zhang 熊爱生 姚泉洪 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期435-441,453,共8页
利用油菜EST数据库,以拟南芥ERF-B1亚族转录因子序列为探针,电子克隆拼接得到2个cDNA序列(BnaERFB1-1和BnaERFB1-2),通过PCR和RT-PCR方法分别从甘蓝型油菜沪油15的DNA和cDNA中克隆了上述基因。克隆转录因子BnaERFB1-1-Hy15和BnaERFB1-2-... 利用油菜EST数据库,以拟南芥ERF-B1亚族转录因子序列为探针,电子克隆拼接得到2个cDNA序列(BnaERFB1-1和BnaERFB1-2),通过PCR和RT-PCR方法分别从甘蓝型油菜沪油15的DNA和cDNA中克隆了上述基因。克隆转录因子BnaERFB1-1-Hy15和BnaERFB1-2-Hy15与电子克隆的序列差异很小,分别只有2个和6个氨基酸位点不同,且都没有内含子。从cDNA序列、氨基酸序列的相似性、组成成分、理化性质、疏水性/亲水性、进化树、序列比对、功能域、二级和三级结构等方面进行了分析,结果显示,BnaERFB1-1-Hy15和BnaERFB1-2-Hy15转录因子属于AP2/ERF家族中的ERF-B1亚族,是亲水性蛋白,在蛋白质的三级结构上与拟南芥atERF7相似。EST丰度分析显示,BnaERFB1-1的表达主要集中在种子中,而BnaERFB1-2的表达则主要集中在分生组织中。 展开更多
关键词 ap2/erf B1亚族 转录因子 克隆 沪油15
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茶树AP2/ERF-B3类转录因子基因的克隆与表达特性分析 被引量:15
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作者 吴致君 卢莉 +4 位作者 黎星辉 房婉萍 周琳 谭国飞 庄静 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期67-75,共9页
植物在受到高温、低温、干旱和盐害等逆境胁迫时,ERF作为信号转导因子被诱导并调控其他抗逆基因的表达。研究茶树AP2/ERF-B3类转录因子在不同茶树品种间的分子特性、组织表达和逆境响应情况,将有助于了解AP2/ERF转录因子在茶树逆境调控... 植物在受到高温、低温、干旱和盐害等逆境胁迫时,ERF作为信号转导因子被诱导并调控其他抗逆基因的表达。研究茶树AP2/ERF-B3类转录因子在不同茶树品种间的分子特性、组织表达和逆境响应情况,将有助于了解AP2/ERF转录因子在茶树逆境调控中的作用。以2个茶树品种‘安吉白茶’和‘迎霜’为试验材料,通过RT-PCR方法分别从2种茶树的cDNA中克隆得到CsERF-B3基因。利用实时定量PCR技术检测该基因在茶树根、茎、叶、花各组织和4种非生物逆境胁迫处理(4℃低温、38℃高温、200 g·L-1PEG干旱处理、200 mmol·L-1NaCl)中的表达情况。结果表明:2种茶树中CsERF-B3基因全长均为639 bp,编码212个氨基酸,含有保守的AP2结合域,是植物典型的AP2/ERF家族转录因子;该转录因子属于AP2/ERF转录因子家族中的ERF亚族B3组;该转录因子是亲水性蛋白,无序化特征明显,并与拟南芥AtERF1具有相似的三级结构;该基因在茶树根中表达量最高,并且均能快速响应高温(38℃)、低温(4℃)和高盐(200 mmol·L-1NaCl)等非生物逆境胁迫。结论:环境中常见非生物胁迫可诱导茶树中CsERF-B3基因的表达,表明该AP2/ERF-B3类转录因子在茶树非生物胁迫中起着重要调节作用。 展开更多
关键词 茶树 转录因子 ap2/erf 进化分析 三级结构 表达分析
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植物转录因子AP2/ERF家族蛋白结构和功能的研究进展 被引量:14
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作者 悦曼芳 张春 吴忠义 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期11-26,共16页
AP2/ERF(APETALA2/ethylene responsive factor)转录因子家族均含有1-2个由60个左右的氨基酸所构成的AP2/ERF结构域。按照AP2/ERF结构域的个数以及是否含有其他结构域,将其分为AP2(APETALA2)、乙烯响应因子(ERF)、脱水响应元件结合蛋白(... AP2/ERF(APETALA2/ethylene responsive factor)转录因子家族均含有1-2个由60个左右的氨基酸所构成的AP2/ERF结构域。按照AP2/ERF结构域的个数以及是否含有其他结构域,将其分为AP2(APETALA2)、乙烯响应因子(ERF)、脱水响应元件结合蛋白(DREB)、RAV和Soloist五个亚家族。该家族在植物生长发育以及响应生物胁迫和非生物胁迫等方面起重要作用。概括了AP2/ERF转录因子的结构功能特点,以及近年来AP2/ERF家族蛋白参与植物生长发育以及对逆境响应等方面的进展,为该类转录因子今后的研究提供帮助。 展开更多
关键词 ap2/erf 转录因子 激素 生长发育 逆境胁迫
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AP2/ERF转录因子对植物非生物胁迫的应答机制研究进展 被引量:14
10
作者 邵文靖 敖特根白音 郎明林 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第15期4981-4988,共8页
AP2/ERF (APETALA2/ethylene responsive factor)家族转录因子是植物中的一大类转录因子,最早从拟南芥(Arabidopsis thaliana)中分离出。该家族转录因子一般包含两个AP2/ERF结构域,该结构域大约由60~70个氨基酸组成与DNA结合有关。AP2/... AP2/ERF (APETALA2/ethylene responsive factor)家族转录因子是植物中的一大类转录因子,最早从拟南芥(Arabidopsis thaliana)中分离出。该家族转录因子一般包含两个AP2/ERF结构域,该结构域大约由60~70个氨基酸组成与DNA结合有关。AP2/ERF家族参与非生物胁迫的反应,比如干旱胁迫、高盐胁迫和低温胁迫等。这些胁迫会激活植物激素ABA、茉莉酸(jasmonate, JA)、乙烯(ethylene, ET)、水杨酸(salicylic acid, SA)等信号途径,同时激活AP2/ERF转录因子家族基因的表达,进而调控其下游功能基因的表达。本研究综述了近年来有关植物AP2/ERF转录因子响应非生物胁迫应答机制的新进展,探讨了该家族转录因子的结构特点、分布,及其对植物发育和次级代谢的影响以及对非生物胁迫的应答。 展开更多
关键词 ap2/erf 转录因子 植物 非生物胁迫
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水稻AP2/ERF转录因子参与逆境胁迫应答的分子机制研究进展 被引量:12
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作者 陈悦 孙明哲 +2 位作者 贾博为 冷月 孙晓丽 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期781-790,共10页
AP2/ERF(APETALA2/ethylene responsive factor)是植物特有的转录因子家族,广泛参与生长发育和胁迫应答等多种生物学进程。水稻是我国重要的粮食作物,但在其生长过程中受到多种逆境的影响。目前研究发现AP2/ERF转录因子在水稻逆境应答... AP2/ERF(APETALA2/ethylene responsive factor)是植物特有的转录因子家族,广泛参与生长发育和胁迫应答等多种生物学进程。水稻是我国重要的粮食作物,但在其生长过程中受到多种逆境的影响。目前研究发现AP2/ERF转录因子在水稻逆境应答中扮演十分重要的角色。本文结合国内外研究进展,综述了水稻AP2/ERF转录因子的分类和结构,并梳理了不同亚家族的AP2/ERF转录因子响应病害、干旱、高盐和低温胁迫的功能和机制研究进展,为深入阐释水稻AP2/ERF转录因子调控逆境应答的分子网络及品种改良提供参考。 展开更多
关键词 水稻 转录因子 ap2/erf 逆境应答
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A seed-specific AP2-domain transcription factor from soybean plays a certain role in regulation of seed ger-mination 被引量:11
12
作者 WANG ChunMei, WANG HuiWen, ZHANG JinSong & CHEN ShouYi National Key Laboratory of Plant Genomics, Institute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences, Bei-jing 100101, China 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 2008年第4期336-345,共10页
Plant seed development and germination are under strict temporal and spatial regulation, and tran-scription factors play important roles in this regulation. In the present study we identified an EST ex-pressed specifi... Plant seed development and germination are under strict temporal and spatial regulation, and tran-scription factors play important roles in this regulation. In the present study we identified an EST ex-pressed specifically in the developing soybean seeds. The full length of the gene was obtained through further RACE analysis and the gene was named GmSGR. Sequence analysis revealed that this gene belonged to the AP2/ERF transcription factor family. Its AP2 domain had the highest similarity with that of the A-3 member AtABI4 of DREB subgroup in the AP2/ERF family in Arabidopsis. GmSGR did not exhibit transcriptional activation activity in the yeast assay system. GmSGR was overexpressed in Arabidopsis and the germination rates of the transgenic seeds were significantly higher than that of the wild type seeds under higher concentrations of ABA and glucose respectively. However, the germina-tion rates of the transgenic seeds were lower than that of control under salt stress. The expression of AtEm6 and AtRD29B was higher in the seedlings of the transgenic plants than that in the wild-type seedlings. These results suggest that GmSGR may confer reduced ABA sensitivity and enhanced salt sensitivity to the transgenic seeds through regulating the expression of AtEm6 and AtRD29B genes. 展开更多
关键词 ABA ap2/erf transcription factor salt stress SEED GERMINATION SOYBEAN
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基于乙烯受体下游转录因子的果实品质调控机制研究进展 被引量:11
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作者 徐倩 殷学仁 陈昆松 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第9期1913-1923,共11页
近年来乙烯作用机制的研究已陆续从乙烯受体等上游级别延伸至下游转录因子(EIN3/EIL和AP2/ERF),其中转录调控机制是研究热点之一。本文综述了基于乙烯受体下游转录因子的果实品质调控研究进展,讨论了果实品质转录调控存在的问题和研究... 近年来乙烯作用机制的研究已陆续从乙烯受体等上游级别延伸至下游转录因子(EIN3/EIL和AP2/ERF),其中转录调控机制是研究热点之一。本文综述了基于乙烯受体下游转录因子的果实品质调控研究进展,讨论了果实品质转录调控存在的问题和研究趋势。 展开更多
关键词 EIN3/EIL ap2/erf 果实 品质 转录调控
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AP2/ERF转录因子参与植物次生代谢和逆境胁迫响应的研究进展 被引量:6
14
作者 兰孟焦 后猛 +8 位作者 肖满秋 李臣 潘皓 张允刚 卢凌志 侯隆英 葛瑞华 吴问胜 李强 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期1223-1235,共13页
AP2/ERF(APETALA2/ethylene-responsive factor)是植物中最大的转录因子家族之一,至少含有1个由60~70个高度保守的氨基酸组成的特有的AP2结构域,根据AP2结构域数量和相似性可划分为5个亚家族:AP2(APETALA2)、DREB(Dehydration-responsiv... AP2/ERF(APETALA2/ethylene-responsive factor)是植物中最大的转录因子家族之一,至少含有1个由60~70个高度保守的氨基酸组成的特有的AP2结构域,根据AP2结构域数量和相似性可划分为5个亚家族:AP2(APETALA2)、DREB(Dehydration-responsive element binding proteins)、ERF(Ethylene-responsive factor)、RAV(Related to AB13/VP)和Soloist。AP2/ERF转录因子通过AP2结构域中的YRG和RAYD保守元件与靶基因结合,实现对相关基因的转录调控功能。目前,AP2/ERF已成为研究植物抗逆机制和活性成分生物合成的热点候选基因,越来越多植物AP2/ERF家族及其成员被报道。本研究对近年来有关AP2/ERF家族的最新研究成果进行了总结,综述了AP2/ERF家族转录因子的结构特征与分类,重点介绍了该类转录因子调控植物次生代谢产物的合成以及参与生物、非生物胁迫应答等方面的研究进展,并展望了AP2/ERF转录因子可能的研究热点和领域,以期为今后进一步挖掘和利用该类转录因子基因进行植物遗传改良以及种质创新提供参考。 展开更多
关键词 ap2/erf 转录调控 次生代谢 生物及非生物胁迫
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基因调控植物花器官发育的研究进展 被引量:3
15
作者 杜朝金 张汉尧 +4 位作者 罗心平 宋云连 毕珏 王跃全 张惠云 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期151-161,共11页
花作为被子植物的繁殖器官,是植物的重要组成部分,也是研究植物进化、分类的重要依据。花器官的发育受到外部环境和内部生理等多种因素的影响,不同物种或同一物种间出现不同的性状,基因作为其中的关键因子,在整个过程中发挥着重要作用,... 花作为被子植物的繁殖器官,是植物的重要组成部分,也是研究植物进化、分类的重要依据。花器官的发育受到外部环境和内部生理等多种因素的影响,不同物种或同一物种间出现不同的性状,基因作为其中的关键因子,在整个过程中发挥着重要作用,其在花发育调控中的作用一直都是大家研究的热点。花器官的花萼、花冠、雄蕊、雌蕊、胚珠五轮结构分别受到AE花发育模型中A、B、C、D、E五类基因的调控,这些基因在花器官发育过程中形成了一个复杂的基因调控网络。各类基因的表达或沉默均会导致花器官的结构发生改变,但不同的物种之间又存在差异。本研究综述了MADS-box、AP2/ERF基因家族相关成员AP1、AP2、AP3、PI、AG、SEP、AGL6、SHP、STK及其他基因NAP、SPL、TGA、PAN、WOX等在花器官建成中的调控作用,从分子水平解析了基因在花器官发育中的影响,为进一步深入了解基因在各植物花器官发育调控中的作用提供参考。 展开更多
关键词 花器官 基因调控 MADS-BOX ap2/erf Nap
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胡萝卜AP2/ERF-B1亚族两个转录因子基因的克隆及其非生物胁迫响应分析 被引量:7
16
作者 黄蔚 王枫 +3 位作者 谭国飞 徐志胜 李梦瑶 熊爱生 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第8期1184-1194,共11页
AP2/ERF是植物中普遍存在的一类重要转录因子,参与植物整个生命周期的生长发育和逆境信号转导。本研究以胡萝卜(Daucus carota)‘黑田五寸’为试验材料,基于其转录组和基因组数据,检索和拼接获得胡萝卜AP2/ERF家族2个转录因子基因序列g3... AP2/ERF是植物中普遍存在的一类重要转录因子,参与植物整个生命周期的生长发育和逆境信号转导。本研究以胡萝卜(Daucus carota)‘黑田五寸’为试验材料,基于其转录组和基因组数据,检索和拼接获得胡萝卜AP2/ERF家族2个转录因子基因序列g39811和g47170。采用RT-PCR方法,分别从‘黑田五寸’中克隆DcERF-B1-1(g39811)和DcERF-B1-2(g47170)转录因子基因。序列分析显示,胡萝卜DcERF-B1-1和DcERF-B1-2转录因子基因分别含有630个和594个开放阅读框,分别编码209和197个氨基酸;均含有相对保守的AP2结合域,具有典型的植物AP2/ERF类转录因子特征。从氨基酸组成成分、理化性质、亲水性/疏水性和三级结构上分析显示,胡萝卜DcERF-B1-1和DcERF-B1-2转录因子亲水性大于疏水性,其氨基酸序列可能属于亲水性蛋白。空间结构分析显示,它们都具有1个α螺旋和3个β折叠。进化树分析显示,二者均属于AP2/ERF家族转录因子中ERF亚族的B1组。实时定量荧光PCR显示,在低温、干旱、盐胁迫的条件下,DcERF-B1-2转录因子比DcERF-B1-1转录因子对逆境的响应更大;在高温的条件下,DcERF-B1-1转录因子比DcERF-B1-2转录因子对逆境的响应更大。 展开更多
关键词 ap2 erf 胡萝卜 转录因子 erf亚族 表达调控
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AP2/ERF转录因子调控果实品质研究进展 被引量:8
17
作者 宋康华 黎宇婷 张鲁斌 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2019年第5期1032-1040,共9页
乙烯是影响果实品质形成的重要植物激素,乙烯信号转导途径研究已经在不同果实中广泛开展,但其转录调控机制研究基本处于起步阶段。本文重点综述了AP2/ERF的果实品质转录调控研究进展,讨论了果实品质转录调控存在问题和研究趋势。
关键词 乙烯 ap2/erf 转录调控 果实品质
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新疆紫草AP2/ERF转录因子的电子克隆和生物信息学分析 被引量:7
18
作者 谢腾 王升 +2 位作者 周良云 唐金富 郭兰萍 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期2251-2257,共7页
应用电子克隆技术,以紫草AP2/ERF序列为探针,获得了新疆紫草的1条876 bp AP2/ERF的序列,包含1个1 077 bp的开放阅读框编码205个氨基酸,命名为AeAP2/ERF。采用生物信息学方法,对该基因所编码的蛋白从氨基酸组成、理化性质、亚细胞定位、... 应用电子克隆技术,以紫草AP2/ERF序列为探针,获得了新疆紫草的1条876 bp AP2/ERF的序列,包含1个1 077 bp的开放阅读框编码205个氨基酸,命名为AeAP2/ERF。采用生物信息学方法,对该基因所编码的蛋白从氨基酸组成、理化性质、亚细胞定位、跨膜结构域、疏水性/亲水性、高级结构及功能域等方面进行预测和分析,结果显示该基因编码蛋白定位于细胞核,为水溶性蛋白,可以调控代谢、转导信号。 展开更多
关键词 电子克隆 新疆紫草 ap2 erf基因 生物信息学
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巴西蕉2个ERF转录因子基因的克隆及功能研究 被引量:7
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作者 侯晓婉 胡伟 +2 位作者 徐碧玉 张鲁斌 金志强 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期806-816,共11页
【目的】筛选、克隆响应非生物胁迫的关键ERF转录因子基因,并研究其功能。【方法】综合运用转录组学、生物信息学、生物化学等技术手段,分析不同非生物逆境胁迫下AP2/ERF转录因子超家族基因的表达谱聚类变化,并从中筛选、克隆关键ERF转... 【目的】筛选、克隆响应非生物胁迫的关键ERF转录因子基因,并研究其功能。【方法】综合运用转录组学、生物信息学、生物化学等技术手段,分析不同非生物逆境胁迫下AP2/ERF转录因子超家族基因的表达谱聚类变化,并从中筛选、克隆关键ERF转录因子,对其功能进行研究。【结果】不同非生物胁迫下,AP2/ERF超家族基因的表达模式不同,对低温胁迫的响应较其他胁迫敏感;筛选克隆的Ma ERF25和Ma ERF27基因是ERF家族基因,具备ERF家族基本特征,编码蛋白为核定位蛋白,C端具有转录激活活力,并参与了香蕉对非生物胁迫和激素的应答,在其中发挥着一定的作用。【结论】获得了2个巴西蕉ERF基因Ma ERF25和Ma ERF27,被定位在细胞核,具有转录激活活性,参与非生物逆境胁迫应答。 展开更多
关键词 香蕉 ap2/erf 基因克隆 亚细胞定位 转录激活 实时荧光定量PCR
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大叶杨干旱和水淹胁迫的转录组分析 被引量:2
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作者 张佳琪 张新新 +3 位作者 冯佳珺 施婷婷 张钰麟 王婧 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期1653-1662,共10页
大叶杨(Populus lasiocarpa)是中国特有的杨属物种,干旱和水淹是影响大叶杨生长和分布范围的2个关键因子。AP2/ERF转录因子家族在植物响应非生物胁迫中发挥重要作用。研究采用转录组测序、生物信息学分析手段并结合分子实验验证初步鉴... 大叶杨(Populus lasiocarpa)是中国特有的杨属物种,干旱和水淹是影响大叶杨生长和分布范围的2个关键因子。AP2/ERF转录因子家族在植物响应非生物胁迫中发挥重要作用。研究采用转录组测序、生物信息学分析手段并结合分子实验验证初步鉴定了参与大叶杨干旱和水淹胁迫响应的关键基因。研究结果显示,(1)在大叶杨中分别鉴定到3986/385个响应干旱/水淹胁迫的差异表达基因,其中包括237个同时响应干旱和水淹胁迫的差异表达基因。(2)在大叶杨中共鉴定到205个AP2/ERF家族成员,系统发育分析表明其在大叶杨中主要分为5个亚家族,并显著富集于差异表达基因中。(3)筛选部分胁迫前后差异表达的PlAP2/ERF基因进行qRT-PCR实验,经证实这些基因在大叶杨受到干旱/水淹胁迫时均可被诱导表达。综上,大叶杨在水淹胁迫下的差异表达基因数量明显少于干旱胁迫,AP2/ERF基因家族的部分基因参与到大叶杨干旱/水淹胁迫的应激表达过程。 展开更多
关键词 大叶杨 ap2/erf 水淹胁迫 干旱胁迫 差异表达
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