密码对的使用与基因组进化 被引量：8

1

作者 王芳平 李宏 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期176-184,共9页

以5种真核、20种细菌、10种古菌生物的基因组为样本,分析了编码序列中密码对和基因间序列中三联体对的相对模式数随频数的分布,验证了这种分布符合Γ(α,β)分布。发现分布形状参数!值与生物基因组进化存在明显的相关性;编码序列与基因... 以5种真核、20种细菌、10种古菌生物的基因组为样本,分析了编码序列中密码对和基因间序列中三联体对的相对模式数随频数的分布,验证了这种分布符合Γ(α,β)分布。发现分布形状参数!值与生物基因组进化存在明显的相关性;编码序列与基因间序列的进化方式截然不同。随着进化,编码序列的分布形状逐渐向随机分布靠近(α值逐渐增大)。而对基因间序列,古菌与真核生物的分布形状接近,与细菌的分布相差明显。 展开更多

关键词 基因组进化 密码对 三联体对 r(邶)分布

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基因组中开阅读框架长度的分布模型与基因组进化 被引量：5

2

作者 冯立芹 李宏 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期375-381,共7页

分析了5种真核、15种细菌和10种古菌基因组中开阅读框架(openreadingframe,ORF)的数目随长度的分布,发现不同生物的分布相似且有明显的规律性。用各种分布模型进行拟合比较,结果显示每种生物的这类分布均符合Г(α,β)分布,由此提出生... 分析了5种真核、15种细菌和10种古菌基因组中开阅读框架(openreadingframe,ORF)的数目随长度的分布,发现不同生物的分布相似且有明显的规律性。用各种分布模型进行拟合比较,结果显示每种生物的这类分布均符合Г(α,β)分布,由此提出生物基因组中ORF的数目随长度的分布是Г(α,β)分布的假设。分析各生物基因组的拟合参数,发现α和β值与基因组进化存在明显的相关性;讨论了α和β值的生物进化意义,并给出了真核生物偏好使用长基因的结论;依照Г(α, β)分布估计了酵母基因组中ORF数目的上限为5870个。该方法对于研究生物基因组进化以及评估理论预测基因的可靠性具有建设性意义。 展开更多

关键词 基因组 ORF г(α β)分布 基因组进化

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几种模式生物密码对的使用和基因组进化 被引量：4

3

作者 王芳平 李宏 《内蒙古大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期166-172,共7页

以闪烁古生球菌、枯草杆菌、大肠杆菌、酿酒酵母、拟南芥和线虫基因组为样本,分别分析了编码序列中密码对、基因间序列中三联体对的相对模式数目随频数的分布,验证这种分布是Γ(α,β)分布.发现分布参数与基因组进化相关;另外,比较了密... 以闪烁古生球菌、枯草杆菌、大肠杆菌、酿酒酵母、拟南芥和线虫基因组为样本,分别分析了编码序列中密码对、基因间序列中三联体对的相对模式数目随频数的分布,验证这种分布是Γ(α,β)分布.发现分布参数与基因组进化相关;另外,比较了密码对的观测值与期望值之差的分布,发现密码对的使用普遍具有偏好性,且不同的物种所偏好的密码对是不同的. 展开更多

关键词 基因组进化 密码对 三联体对 г(α β)分布

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酵母基因组中ORF数目与长度的关系

4

作者 冯立芹 《生物信息学》 2011年第1期32-34,共3页

根据NCBI数据库中基因注释序列及相关注释文件,统计了酿酒酵母基因组中不同长度的开阅读框架(Open ReadingFrame,ORF)的数目,分析了开阅读框架的数目随长度的分布关系,结果发现有明显的规律性。根据分布的特点用各种分布模型进行拟合比... 根据NCBI数据库中基因注释序列及相关注释文件,统计了酿酒酵母基因组中不同长度的开阅读框架(Open ReadingFrame,ORF)的数目,分析了开阅读框架的数目随长度的分布关系,结果发现有明显的规律性。根据分布的特点用各种分布模型进行拟合比较,提出这类分布是Г(α,β)分布的假设。进一步根据Г(α,β)分布估算了酵母基因组蛋白质编码序列的数目为5870个。该结果对于基因注释具有一定的参考价值。 展开更多

关键词 基因组 开阅读框架(ORF) г(α β)分布

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几种模式生物基因数目与长度的关系研究

5

作者 冯立芹 《内蒙古民族大学学报（自然科学版）》 2011年第1期55-57,共3页

分析了大肠杆菌、枯草杆菌、酵母、拟南芥基因组中基因数目随长度的分布,发现有明显的规律性,根据分布的特点用各种分布模型进行拟合比较,提出这类分布是Г(α,β)分布的假设.

关键词 模式生物 基因组 基因 г(α β)分布

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人类基因组中蛋白质编码序列数目随其长度的分布研究 被引量：1

6

作者 冯立芹 李宏 《内蒙古民族大学学报（自然科学版）》 2009年第1期58-64,共7页

分析了人类24条染色体基因组中蛋白质编码序列的数目随长度的分布,发现分布规律有明显的相似性;用Г(α,β)分布对实际分布进行拟合,其特征参数α均小于1,即蛋白质编码序列是呈随长度减少而其数目一直增加的分布.而研究的其它生物(15种... 分析了人类24条染色体基因组中蛋白质编码序列的数目随长度的分布,发现分布规律有明显的相似性;用Г(α,β)分布对实际分布进行拟合,其特征参数α均小于1,即蛋白质编码序列是呈随长度减少而其数目一直增加的分布.而研究的其它生物(15种真细菌,10种古核菌和5种真核生物)均是α>1的Г(α,β)分布.经过分析比较,推测人类蛋白质编码序列的分布也应该是α>1的Г(α,β)分布.在对短序列补充了推测数据后,重新对数据拟合,效果很好,α值在1.19～1.85之间.生物基因所遵从的Г(α,β)分布规律对研究基因组进化及评估理论预测的基因准确性具有积极意义. 展开更多

关键词 人类基因组 蛋白质编码序列 г(α β)分布 染色体进化速率

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Γ（）－的计算

7

作者 王晓江 《宝鸡文理学院学报（自然科学版）》 CAS 1996年第1期80-82,共3页

Γ（）－的计算王晓江（宝鸡教育学院数学系宝鸡７２１００７）实分析中把广义含参变量积分定义为函数，即当时，有对上式作变量替换：令ｔ＝Ｘ２．于是有以下讨论积分的值。根据重积分化为累次积分公式有：注意到非负且点集，故由... Γ（）－的计算王晓江（宝鸡教育学院数学系宝鸡７２１００７）实分析中把广义含参变量积分定义为函数，即当时，有对上式作变量替换：令ｔ＝Ｘ２．于是有以下讨论积分的值。根据重积分化为累次积分公式有：注意到非负且点集，故由重积分的极坐标系变量替换，有作者：... 展开更多

关键词 г(α)函数 实分析 Π 开方

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长方矩阵的Γ_(α,β)-Moore-Penrose群逆

8

作者 崔雪芳 《浙江大学学报（理学版）》 CAS CSCD 2014年第1期6-11,17,共7页

PATRICIO等讨论了环中元素的Drazin-Moore-Penrose(DMP)可逆性,在矩阵环中得到了一些结果.讨论了长方矩阵的Γα,β-Moore-Penrose群逆,给出了长方矩阵的Γα,β-Moore-Penrose群逆存在的几个充要条件以及Γα,β-Moore-Penrose群逆的... PATRICIO等讨论了环中元素的Drazin-Moore-Penrose(DMP)可逆性,在矩阵环中得到了一些结果.讨论了长方矩阵的Γα,β-Moore-Penrose群逆,给出了长方矩阵的Γα,β-Moore-Penrose群逆存在的几个充要条件以及Γα,β-Moore-Penrose群逆的几个计算公式,把已有的平方矩阵的结果推广到了长方矩阵中. 展开更多

关键词 长方矩阵 гα β-Moore-Penrose逆 гα β-群逆 гα β-Moore—Penrose群逆

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关于环上矩阵的Г_(αβ)-广义逆 被引量：1

9

作者 陈建国 岑建苗 《科技通报》 北大核心 2009年第6期732-736,742,共6页

研究环上矩阵的Гαβ-广义逆和Гαβ-Moore-Penrose逆,得到带有对合反自同构的有单位元的结合环R上的一类可分解矩阵的Гαβ-广义逆和Гαβ-Moore-Penrose逆存在的充要条件及表达式,推广了以往的相应结果。

关键词 广义逆 гαβ-广义逆 гαβ-Moore-Penrose逆 左高矩阵 右高矩阵

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On Matrix Гα-group Inverse and Гα-sharp Ordering

10

作者 ZHANG Jin-ou CEN Jian-miao 《Chinese Quarterly Journal of Mathematics》 CSCD 北大核心 2008年第2期215-221,共7页

The Γα-group inverse and the Γα-sharp ordering in matrix set are introduced. Some characterizations and properties of the Γα-sharp ordering are given. The relations between the Γα-sharp ordering and the Γα-m... The Γα-group inverse and the Γα-sharp ordering in matrix set are introduced. Some characterizations and properties of the Γα-sharp ordering are given. The relations between the Γα-sharp ordering and the Γα-minus ordering are discussed. 展开更多

关键词 MATRIX гα-group inverse гα-sharp ordering

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矩阵Γ_α-Moore-Penrose逆与星序

11

作者 岑建苗 《工程数学学报》 CSCD 北大核心 2006年第1期127-132,共6页

本文讨论矩阵的Γα-逆与星序。给出了Γα-Moore-Penrose逆存在的一些条件、Γα-Moore- Penrose逆与星序的联系以及星序的一些Γα-逆刻画。

关键词 矩阵 гα-逆 星序

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关于矩阵Γ_α^-减序

12

作者 岑建苗 《宁波大学学报（理工版）》 CAS 2004年第1期1-4,共4页

引进并讨论矩阵Γα- 减序 .给出了Γα- 减序的一些刻划和性质 .

关键词 矩阵 гα-减逆 гα-减序

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关于矩阵的Г_α-Moore-Penrose逆

13

作者 岑建苗 《科技通报》 2007年第6期771-773,811,共4页

讨论矩阵的Г_α-Moore-Penrose逆。给出了矩阵的Г_α-Moore-Penrose逆存在的几个充要条件以及Г_α-Moore-Penrose逆的几个计算公式。

关键词 矩阵 гα-Moore—Penrose逆 矩阵方程

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