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中国玉米新品种DNA指纹库建立系列研究 Ⅱ.适于玉米自交系和杂交种指纹图谱绘制的SSR核心引物的确定 被引量：125
1
作者 赵久然 王凤格 +5 位作者 郭景伦 陈刚 廖琴 孙世贤 陈如明 刘龙洲 《玉米科学》 CAS CSCD 2003年第2期3-5,8,共4页
本项研究利用60个玉米自交系对初选出的158个SSR引物对进行进一步筛选,综合考虑PIC值大小、扩增带型统计的难易及引物的重复性高低,确定bnlg439、bnlg125、phi053、bnlg197、phi072、bnlg238、phi126、bnlg161、bnlg240、bnlg619共10个... 本项研究利用60个玉米自交系对初选出的158个SSR引物对进行进一步筛选,综合考虑PIC值大小、扩增带型统计的难易及引物的重复性高低,确定bnlg439、bnlg125、phi053、bnlg197、phi072、bnlg238、phi126、bnlg161、bnlg240、bnlg619共10个引物对作为构建玉米自交系和杂交种指纹库的核心引物;同时提出适用于计算玉米SSR指纹图谱概率的公式:P=1/N,对自交系N=n;对杂交种,N=Cn1+Cn2。n为所用引物的等位基因数。 展开更多
关键词 中国 玉米 品种 dna指纹库 自交系 杂交种 SSR 核心引物
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遗传标记及其在作物品种鉴定中的应用 被引量：67
2
作者 梁明山 曾宇 +2 位作者 周翔 侯留记 李霞 《植物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期257-265,共9页
本文评述了用于作物品种鉴定的形态标记 (morphologicalmarkers)、细胞标记 (cytologicalmarkers)、生化标记 (biochemicalmarkers)、分子标记 (molecularmarkers)的优缺点。重点评述了分子标记在作物品种鉴定中的应用。文中除对蛋白质... 本文评述了用于作物品种鉴定的形态标记 (morphologicalmarkers)、细胞标记 (cytologicalmarkers)、生化标记 (biochemicalmarkers)、分子标记 (molecularmarkers)的优缺点。重点评述了分子标记在作物品种鉴定中的应用。文中除对蛋白质电泳指纹图谱———同工酶和贮藏蛋白 (包括醇溶性蛋白、清蛋白、谷蛋白、球蛋白等 )电泳产生的指纹图谱的应用外 ,较详细地介绍了近年来DNA指纹图谱技术 ;包括限制片段长度多态性 (restrictionfragmentlengthpolymorphism ,简称RFLP)、随机扩增多态性DNA (randomamplifiedpolymorphicDNA ,简称RAPD)、小卫星DNA(minisatelliteDNA)、微卫星DNA(microsatelliteDNA) ,简单重复序列间扩增 (intersimplesequencerepeats,简称ISSR) ,扩增片段长度多态性 (amplifiedfragmentlengthpolymor phism ,简称AFLP)以及CAPS (cleavedamplifiedpolymorphicsequences)和SNPS (singlenucleotidepolymor phisms)对作物品种鉴定和新品种登记 ,品种纯度和真实性的检验以及品种间亲缘关系的探讨和在分类研究中的贡献等。 展开更多
关键词 品种鉴定 生物指纹 蛋白质电泳 dna指纹 作物
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利用SSR、ISSR和RAPD技术构建苜蓿基因组DNA指纹图谱 被引量：97
3
作者 魏臻武 《草业学报》 CSCD 2004年第3期62-67,共6页
在建立可靠的苜蓿基因组DNA提取分离和PCR扩增技术体系的基础上,筛选具有稳定多态性位点的RAPD、SSR和ISSR引物,建立苜蓿基因组DNA的SSR、ISSR和RAPD分子标记技术体系,并利用分子标记检测苜蓿品种(系)的DNA分子标记多态性,构建苜蓿品种... 在建立可靠的苜蓿基因组DNA提取分离和PCR扩增技术体系的基础上,筛选具有稳定多态性位点的RAPD、SSR和ISSR引物,建立苜蓿基因组DNA的SSR、ISSR和RAPD分子标记技术体系,并利用分子标记检测苜蓿品种(系)的DNA分子标记多态性,构建苜蓿品种的DNA指纹图谱。筛选出36个RAPD引物,8个SSR引物和12个ISSR随机引物,通过PCR扩增在55个国内外苜蓿品种(系)中获得了182个RAPD多态性位点和丰富的SSR和ISSR多态性位点,构建了55个苜蓿品种(系)的SSR、ISSR和RAPD指纹图谱。结果表明,不同苜蓿品种(系)的SSR多态性有较大差异;苜蓿品种ISSR指纹图谱多态性丰富,稳定性比RAPD强;可以通过2～3个引物鉴别我国主要苜蓿品种和引进品种,SSR和ISSR指纹图谱可以更好地用于苜蓿品种鉴定和遗传多样性分析。 展开更多
关键词 苜蓿 分子标记 dna指纹图谱 SSR ISSR RAPD
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建立小麦品种DNA指纹的方法研究 被引量：66
4
作者 王立新 李云伏 +6 位作者 常利芳 黄岚 李宏博 葛玲玲 刘丽华 姚骥 赵昌平 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第10期1738-1740,共3页
建立小麦DNA指纹对遗传资源评价、品种权益保护、种子质量鉴定具有重要的意义。本研究采用15个SSR标记和20个AFLP-SCAR标记,分析了来自我国不同麦区的455个小麦品种,证明用两种分子标记建立小麦DNA指纹可以更加全面地反应品种的遗传多... 建立小麦DNA指纹对遗传资源评价、品种权益保护、种子质量鉴定具有重要的意义。本研究采用15个SSR标记和20个AFLP-SCAR标记,分析了来自我国不同麦区的455个小麦品种,证明用两种分子标记建立小麦DNA指纹可以更加全面地反应品种的遗传多样性。从而,在提出采用SSR标记与AFLP-SCAR标记构建小麦品种DNA指纹的技术路线的基础上,建立了构建DNA指纹的方法模式。按此方法获得的品种指纹代码可以经条形码软件转换为条形码,使为每个品种建立身份证的设想成为可能。 展开更多
关键词 小麦 dna指纹 SSR标记 AFLP-SCAR标记
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ERIC-PCR:一种快速鉴别环境细菌菌株的方法 被引量：44
5
作者 赵立平 肖虹 +1 位作者 李艳琴 张峰 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 1999年第S1期30-33,共4页
以 Ｅ Ｒ Ｉ Ｃ（ 肠杆菌基因间共有重多序列） 序列设计的特异引物对３ 株大肠杆菌、３ 株软腐欧氏杆菌、２ 株草生欧氏杆菌、１ 株梨火疫欧氏杆菌、１ 株催娩克氏菌、１ 株阴沟肠杆菌和９ 株具有降酚能力的细菌等２０ 种细菌的基因组 ... 以 Ｅ Ｒ Ｉ Ｃ（ 肠杆菌基因间共有重多序列） 序列设计的特异引物对３ 株大肠杆菌、３ 株软腐欧氏杆菌、２ 株草生欧氏杆菌、１ 株梨火疫欧氏杆菌、１ 株催娩克氏菌、１ 株阴沟肠杆菌和９ 株具有降酚能力的细菌等２０ 种细菌的基因组 Ｄ Ｎ Ａ 进行 Ｐ Ｃ Ｒ 分析．每种菌株均存在数目不等的各自独特的带型，能够区分同一种类中极为相近的菌株．经多次重复，各特异性扩增的主要带型能重复稳定出现．聚类分析的结果表明，供试菌株多数按照分类地位归到相应的组中．９ 种具有降酚能力的细菌中，２ 种分离自处理焦化废水池活性污泥，７ 种来自土壤样品． Ｅ Ｒ Ｉ Ｃ Ｐ Ｃ Ｒ 指纹图显示，前２ 种属于一类，都有一条大小约１ ．１ ｋｂ 的主带，其它７ 种土壤中分离出来的细菌除其中１ 种有１ 条约１ ．２ ｋｂ 大小的主带外，其余６ 种都有１ 条大小约１ ．４ ｋｂ 的带．聚类分析将从土壤中分离出来的细菌归为３ 种不同的类型． Ｅ Ｒ Ｉ Ｃ Ｐ Ｃ Ｒ 可以从分子水平对细菌基因组进行快速指纹图分析。 展开更多
关键词 ERIC-PCR 细菌 dna指纹图
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利用ISSR标记分析鱼腥草种质资源的遗传多样性 被引量：27
6
作者 吴卫 郑有良 +3 位作者 陈黎 杨瑞武 颜泽洪 魏育明 《世界科学技术-中医药现代化》 2003年第1期70-77,共8页
利用ISSR标记对70份鱼腥草种质资源遗传多样性进行检测。结果发现,所有引物扩增产物均具多态性,22个ISSR引物共得到352条扩增DNA片段,平均每个引物可获得16条DNA片段。其中,92.3%的片段具多态性。每个多态性引物能扩增出4～58条DNA片段... 利用ISSR标记对70份鱼腥草种质资源遗传多样性进行检测。结果发现,所有引物扩增产物均具多态性,22个ISSR引物共得到352条扩增DNA片段,平均每个引物可获得16条DNA片段。其中,92.3%的片段具多态性。每个多态性引物能扩增出4～58条DNA片段,平均可扩增出14.8条多态性片段,峨眉蕺菜与蕺菜中染色体数目为36的细胞型间相似程度最高,其平均遗传相似系数GS值达0.618。蕺菜中,除染色体数目为54的细胞型外,其余细胞型的类间GS值几乎均是与染色体数目为36的细胞型间最小。栽培蕺菜类群遗传多样性略高于野生类群。聚类分析表明,利用ISSR技术可将全部供试材料区分开,所有材料共划分为8类。根据ISSR遗传相似系数划分的类群主要同染色体数目有关,也与地理分布有一定关系。据此认为,鱼腥草种质资源在分子水平上确实存在较大遗传差异,ISSR标记可作为构建鱼腥草DNA指纹图谱的有效工具之一。鱼腥草药材道地性与环境因素有关,但更大程度上由其遗传因素所决定。本文中还讨论了蕺菜属植物的起源演化。 展开更多
关键词 鱼腥草 ISSR 遗传多样性 植物药 道地性 种质资源
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玉米品种DNA指纹数据库构建的标准化规范 被引量：42
7
作者 王凤格 赵久然 +6 位作者 戴景瑞 郭景伦 原亚萍 王璐 易红梅 孙世贤 吕波 《分子植物育种》 CAS CSCD 2007年第1期128-132,共5页
为了保证玉米品种DNA指纹库构建的标准化,从建库标记、检测平台、试剂、样品、评估程序、数据整合、模式库、扩展库、随机盲测等九个方面进行了全面的规范:(1)通过对不同分子标记的比较,确定SSR标记作为建库标记;(2)通过对不同DNA指纹... 为了保证玉米品种DNA指纹库构建的标准化,从建库标记、检测平台、试剂、样品、评估程序、数据整合、模式库、扩展库、随机盲测等九个方面进行了全面的规范:(1)通过对不同分子标记的比较,确定SSR标记作为建库标记;(2)通过对不同DNA指纹检测方法的比较,确定毛细管电泳结合多色荧光检测方法作为DNA指纹片段分析方法;(3)规范了DNA、引物、Taq酶等试剂质量,以保证数据的稳定性和可重复性;(4)规范了样品来源、样品类型及分析样品数量;(5)确定评估品种的数量及引物的取舍标准;(6)为解决不同来源DNA指纹数据的有效整合问题,提出了固定一套核心引物、提供标准品种、提供标准DNA、确定引物等位基因BIN、规定对异常带型数据处理方式、规定数据的编码方式等6个解决策略;(7)规范了构建模式库的材料名单、来源及构建方式;(8)规范了构建扩展库的材料来源及构建方式;(9)进行数据库数据随机盲测,以评估入库数据质量。以上规范将为不同单位合作开展大规模的DNA指纹库构建研究奠定基础。 展开更多
关键词 玉米 dna指纹 数据库
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利用DNA指纹鉴定玉米杂交种纯度及其真伪技术的研究 被引量：37
8
作者 赵久然 郭景伦 +3 位作者 孔艳芳 池书敏 尉德铭 滕海涛 《玉米科学》 CAS CSCD 1999年第1期9-13,共5页
从５００个随机引物中筛选出３０个在玉米上具有较好多态性的ＲＡＰＤ随机引物，并进一步筛选确定了适合我国主要玉米杂交种及其双亲的特异引物，建立了相应的ＤＮＡ指纹图谱。杂交种的ＤＮＡ指纹图谱表现为父、母本双亲带型的互补，均... 从５００个随机引物中筛选出３０个在玉米上具有较好多态性的ＲＡＰＤ随机引物，并进一步筛选确定了适合我国主要玉米杂交种及其双亲的特异引物，建立了相应的ＤＮＡ指纹图谱。杂交种的ＤＮＡ指纹图谱表现为父、母本双亲带型的互补，均未出现互补带型之外的新带型。应用ＲＡＰＤ技术获得ＤＮＡ指纹图谱的方法可以简便、快捷、经济、准确地鉴别玉米杂交种子纯度及真伪。目前已进行了上百份的检测实践。 展开更多
关键词 玉米 dna指纹图谱 纯度鉴定 RAPD 鉴定
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镉胁迫对大麦幼苗基因组DNA多态性影响 被引量：33
9
作者 刘宛 郑乐 +3 位作者 李培军 齐雪梅 周启星 孙铁珩 《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期19-24,共6页
采用随机扩增DNA多态性(RAPD)技术,在实验室条件下研究了镉胁迫对大麦幼苗根尖基因组DNA的多态性影响,比较了RAPD图谱与幼苗根系生长、可溶性蛋白含量变化的关系。结果表明,20￣80mg·L-1Cd溶液处理8d后,大麦幼苗根的生长及根系中... 采用随机扩增DNA多态性(RAPD)技术,在实验室条件下研究了镉胁迫对大麦幼苗根尖基因组DNA的多态性影响,比较了RAPD图谱与幼苗根系生长、可溶性蛋白含量变化的关系。结果表明,20￣80mg·L-1Cd溶液处理8d后,大麦幼苗根的生长及根系中可溶性蛋白质含量均受到不同程度的抑制,在所用的12条寡核苷酸序列10碱基(bp)引物中,仅有5条引物可以扩增出特异、稳定的PCR产物。对照大麦根尖基因组DNA的RAPD图谱中可分辨出51条谱带,其分子量在240～2344bp之间。Cd胁迫影响使大麦基因组的RAPD图谱产生明显的改变,包括RAPD谱带的增加、缺失及其荧光强度的改变,而且这些变化与Cd剂量有关。这些结果表明Cd明显影响基因组模板的稳定性(RAPD图谱变化的定性描述指标),利用RAPD分析获得的DNA多态性变化可作为检测Cd污染对植物遗传毒性效应的生物标记物。 展开更多
关键词 RAPD CD胁迫 大麦幼苗 遗传毒性 dna印迹
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苹果RAPD分析体系的建立 被引量：20
10
作者 祝军 周爱琴 +2 位作者 王涛 李光晨 李绍华 《果树科学》 CSCD 北大核心 2000年第4期239-243,共5页
对富士苹果（Ｍａｌｕｓ　ｐｕｍｉｌａ　Ｍｉｌｌ．ｃｖ．Ｆｕｊｉ）ＲＡＰＤ（Ｒａｎｄｏｍ　Ａｍｐｌｉｆｉｅｄ　Ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃ　ＤＮＡ）分析体系的优化研究表明，ＲＡＰＤ反应体系中，ＤＮＡ、Ｔａｑ酶、引物和Ｍｇ２＋... 对富士苹果（Ｍａｌｕｓ　ｐｕｍｉｌａ　Ｍｉｌｌ．ｃｖ．Ｆｕｊｉ）ＲＡＰＤ（Ｒａｎｄｏｍ　Ａｍｐｌｉｆｉｅｄ　Ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃ　ＤＮＡ）分析体系的优化研究表明，ＲＡＰＤ反应体系中，ＤＮＡ、Ｔａｑ酶、引物和Ｍｇ２＋４种主要成分的最适用量分别为：２０ｎｇ、１．０ Ｕ、０．２ｕｍｏｌ·Ｌ－１和３．０ｕｍｏｌ·Ｌ－１。采用该优化体系，以 ＯＰＪ０３为引物，构建了我国及世界范围内苹果生产中重要的２８个品种的ＲＡＰＤ指纹图谱，分析了其遗传多样性，区分了供试的２８个苹果品种中的１５个，区分率达５３．６％。讨论了ＲＡＰＤ鉴定苹果品种的应用及其主要影响因素。 展开更多
关键词 RAPD dna 指纹图谱 品种 鉴定 苹果
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中药材指纹体系 被引量：29
11
作者 李晓波 屠鹏飞 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期385-388,共4页
建立反映中药材整体信息的指纹体系是现阶段全面、有效控制中药材质量的手段。中药材指纹体系是采用化学指纹图谱和基因指纹图谱来分别表述、控制中药材的多元化学组份和源于生物体的特性 ,从有效成分和遗传物质两方面实现对中药材质量... 建立反映中药材整体信息的指纹体系是现阶段全面、有效控制中药材质量的手段。中药材指纹体系是采用化学指纹图谱和基因指纹图谱来分别表述、控制中药材的多元化学组份和源于生物体的特性 ,从有效成分和遗传物质两方面实现对中药材质量的控制。基因指纹图谱可从遗传物质上进一步佐证中药区别于化学药品的特性。基因指纹与化学指纹相结合 ,对于中药的品种鉴定、质量评价、药用优良品种的选育都具有重要的意义。实施中药材指纹体系 ,首先要建立药典品种的含多种检测方法的化学指纹和基因指纹图谱库 ,其次要建立指纹图谱的计算机模式识别系统。 展开更多
关键词 中药材 指纹体系 质量标准 指纹图谱 中药现代化 多元化学组份
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利用SRAP标记构建18个木薯品种的DNA指纹图谱 被引量：42
12
作者 齐兰 王文泉 +2 位作者 张振文 叶剑秋 李开绵 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第10期1642-1648,共7页
利用SRAP标记,选用36对多态性较好的引物组合,对18个木薯品种进行分析鉴定,扩增出320个位点,其中多态性位点235个,多态性比率达73.4%,平均每对引物组合可产生8.9个位点和6.5个多态性位点;235个多态性位点采用非加权组平均法(UPGMA)进行... 利用SRAP标记,选用36对多态性较好的引物组合,对18个木薯品种进行分析鉴定,扩增出320个位点,其中多态性位点235个,多态性比率达73.4%,平均每对引物组合可产生8.9个位点和6.5个多态性位点;235个多态性位点采用非加权组平均法(UPGMA)进行聚类分析,以遗传相似系数0.734为阈值,可将18份供试材料分为4组;选用2对多态性引物Me1-Em5和Me24-Em10,初步构建了18份木薯品种的指纹图谱,根据条带的有无转换为0、1二进制编码形成数字指纹,每个品种拥有唯一的数字指纹区别于其他品种,置信概率达到99.999%。结果表明,采用SRAP标记建立的指纹图谱适用于木薯品种的分类和鉴定。 展开更多
关键词 木薯 SRAP dna指纹图谱
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羊蹄甲属3种园艺树种分子鉴定及亲缘关系的ISSR分析 被引量：30
13
作者 罗瑜萍 龚维 +1 位作者 邱英雄 Yuk Sing Gibert Chan 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期433-436,共4页
利用ISSRPCR方法对香港羊蹄甲属(Bauhinia)中最常见3种园艺树种:红花羊蹄甲(B.purpurea)、宫粉羊蹄甲(B.variegate)和洋紫荆(B.blakeana)的遗传变异进行了研究,从74个ISSR引物中筛选出9个多态性引物用于正式扩增,共扩增出80条DNA带,平... 利用ISSRPCR方法对香港羊蹄甲属(Bauhinia)中最常见3种园艺树种:红花羊蹄甲(B.purpurea)、宫粉羊蹄甲(B.variegate)和洋紫荆(B.blakeana)的遗传变异进行了研究,从74个ISSR引物中筛选出9个多态性引物用于正式扩增,共扩增出80条DNA带,平均每个引物扩增的DNA带的数目为8.88条,多态性条带数目为55条,占总条带数的68.8%。其中,有8个引物扩增出差异条带和特异条带,并分别能准确地鉴定羊蹄甲属3个园艺树种。本研究的结果表明,ISSR-PCR的DNA电泳谱带在检测香港羊蹄甲(B.blakeana)品种的真实性方面非常有用。同时,通过对3个种扩增条带的叠加性进行分析,证实了洋紫荆杂交起源的父母本为红花羊蹄甲和宫粉羊蹄甲。 展开更多
关键词 羊蹄甲属 洋紫荆 红花羊蹄甲 宫粉羊蹄甲 ISSR 指纹图谱
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杂交稻部分不育系与恢复系的SSR分类 被引量：31
14
作者 贺浩华 罗小金 +5 位作者 朱昌兰 贺晓鹏 傅军如 孙俊立 张洪亮 李自超 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期169-175,共7页
选用分布于水稻(Oryza sativaL.)12条染色体上的36对SSR(simple sequence repeats)引物,分析了5个光温敏核不育系、7个细胞质雄性不育系及54份来自不同生态类型的恢复系或品种的遗传差异。在供试材料中共检测出300条多态性片段,平均每对... 选用分布于水稻(Oryza sativaL.)12条染色体上的36对SSR(simple sequence repeats)引物,分析了5个光温敏核不育系、7个细胞质雄性不育系及54份来自不同生态类型的恢复系或品种的遗传差异。在供试材料中共检测出300条多态性片段,平均每对SSR引物检测到8.33条。分析结果表明:(1)SSR标记明确地把供试的66份水稻材料中的65份区分开来,和已知系谱的亲缘关系多数吻合,与表型性状聚类结果也有一定的相似性。(2)以GD=0.73为标准,可准确地将籼稻、粳稻、野生稻三大类区分开;以GD=0.63为标准,又可区分出籼稻大类中带有粳稻或野生稻血缘的品种。表明SSR标记对籼稻、粳稻、野生稻品种的分类灵敏度高、结果可靠;并筛选出可用于鉴别水稻籼粳类型的10对特异性引物。(3)以GD=0.56为标准,将供试材料划分在8个生态类型中,为生产上杂优组合亲本的选配提供了一些有益的参考。同时,生产上常用的一些杂交稻亲本划分在不同的生态类型中,表明强优势组合亲本间的遗传差异一般较大。 展开更多
关键词 杂交水稻 分类 SSR标记 杂种优势生态型 dna指纹图谱
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AFLP用于构建罗汉果DNA指纹图谱及其幼苗雌雄鉴别 被引量：21
15
作者 陶莉 王跃进 +1 位作者 尤敏 王有为 《武汉植物学研究》 CSCD 北大核心 2005年第1期77-80,共4页
对罗汉果(Siraitiagrosvenorii(Swingle)C.JeffreyexLuetZ.Y.Zhang)的几个品种进行AFLP标记分析,从中筛选出2个引物组合,其中一个能够用于构建不同品种的指纹图谱,另一个可以结合数量性状分析成功地鉴别罗汉果幼苗的雌雄。建立了一种可... 对罗汉果(Siraitiagrosvenorii(Swingle)C.JeffreyexLuetZ.Y.Zhang)的几个品种进行AFLP标记分析,从中筛选出2个引物组合,其中一个能够用于构建不同品种的指纹图谱,另一个可以结合数量性状分析成功地鉴别罗汉果幼苗的雌雄。建立了一种可用于罗汉果幼苗雌雄鉴别的方法,并可为品种的鉴别提供依据。 展开更多
关键词 罗汉果 dna指纹图谱 雌雄鉴别
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烟草品种的DNA指纹图谱和品种鉴定 被引量：21
16
作者 梁明山 刘煜 +1 位作者 侯留记 李霞桥 《烟草科技》 EI CAS 2001年第1期34-37,共4页
随机扩增多态性DNA(RAPD)是目前常用的DNA指纹图谱技术。采用改进的“ROSE法”提取DNA ,并建立了重复性较好的RAPD标准分析条件。在此标准条件下 ,检测了烟草 10个品种材料基因组的多态性。经 10个引物扩增 ,在得到的 53条扩增带中 ,有... 随机扩增多态性DNA(RAPD)是目前常用的DNA指纹图谱技术。采用改进的“ROSE法”提取DNA ,并建立了重复性较好的RAPD标准分析条件。在此标准条件下 ,检测了烟草 10个品种材料基因组的多态性。经 10个引物扩增 ,在得到的 53条扩增带中 ,有 10个片段为 10个材料所共有 ,多态性达81.1%。其中引物P7的扩增图谱 ,各品种间可以互相区别 ,差异明显 ,可用作烟草 展开更多
关键词 烟草 RAPD dna指纹图谱 品种鉴定
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小麦区试品系DUS测试的分子标记 被引量：34
17
作者 王立新 常利芳 +3 位作者 李宏博 季伟 刘丽华 赵昌平 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第7期1114-1125,共12页
为了确定测试小麦(Triticum aestivumL.)区试品系特异性、一致性、稳定性(DUS)的分子标记,采用156个来自我国不同麦区的品种对SSR、EST-SSR和AFLP-SCAR标记的1334对引物进行筛选,根据在染色体上分布均匀、多态性信息指数较高、带型清晰... 为了确定测试小麦(Triticum aestivumL.)区试品系特异性、一致性、稳定性(DUS)的分子标记,采用156个来自我国不同麦区的品种对SSR、EST-SSR和AFLP-SCAR标记的1334对引物进行筛选,根据在染色体上分布均匀、多态性信息指数较高、带型清晰、不同等位变异的带型易于区分及PCR产物稳定的原则,筛选出105对小麦品种DUS测试的分子标记引物,包括63对SSR引物、21对EST-SSR引物和21对AFLP-SCAR引物,可以检测122个位点的754个等位变异,平均每条染色体上被检测位点5.8个,平均每个位点包含7.2个等位变异。根据DUS测试的需求、引物的染色体分布、PIC值大小和带型特点,将105对引物分为21对核心引物、29对一级备用引物和55对二级备用引物。核心引物分辨力较高,可以完成约80%品系的特异性检测,约95%品系的种子纯度检测和约60%品系的一致性、稳定性检测;备用引物用于确定品系DNA位点纯合率和相似品种(系)之间的遗传相似系数,以判断DNA指纹相同或相似的品种(系)之间的相似性和特异性,评价核心标记中具有非纯位点的品系的DNA位点纯合度,同时完成核心引物未能完成的少数品系的种子纯度检测。通过在2006—2007、2007—2008、2008—2009年度对464个冬小麦区试品系DUS测试中的应用,证明105对引物具有很好的代表性和实用性,可以完成90%以上参试品系的DUS检测。 展开更多
关键词 小麦 DUS测试 分子标记 dna指纹
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利用SNP标记构建茶树品种资源分子身份证 被引量：33
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作者 樊晓静 于文涛 +5 位作者 蔡春平 林浥 王泽涵 房婉萍 张见明 叶乃兴 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期1751-1760,I0006-I0017,共22页
【目的】建立茶树品种的SNP分子标记数据库,结合茶树品种基本信息,将SNP位点组成的DNA指纹图谱构建28位数字组成的茶树品种资源分子身份证,便于茶树品种资源的保护与精准管理,避免“同名异物、同物异名”的现象。【方法】通过挖掘茶树... 【目的】建立茶树品种的SNP分子标记数据库,结合茶树品种基本信息,将SNP位点组成的DNA指纹图谱构建28位数字组成的茶树品种资源分子身份证,便于茶树品种资源的保护与精准管理,避免“同名异物、同物异名”的现象。【方法】通过挖掘茶树的表达序列标签,获得大量的高质量表达序列标签,将其进行装配后,开发候选位点,将候选位点与茶树全基因组进行BLAST,得到其在全基因组染色体上的位置与具体关联基因。以铁观音、福鼎大白茶、龙井43、云抗10号等103份国内外不同类型的茶树品种资源为供试材料,提取基因组DNA,利用预扩增技术和微流体芯片法对供试茶树品种资源进行SNP基因分型,获得SNP位点数据及候选SNP位点的信息指数、观测杂合度、期望杂合度等信息,将多态性从高到低进行排序,进行SNP位点组合筛选,得到最优SNP位点组合后,结合茶树品种基本信息构建茶树品种资源分子身份证。【结果】从茶树的表达序列标签数据库中挖掘出1786个候选SNP位点。根据序列保守性,筛选出96个SNP标记位点,与最新茶树基因组比对发现候选位点较均匀地分布于茶树全基因组的15条染色体上;对茶树品种资源的候选SNP位点的多态性信息进行分析,剔除10个不具多态性的位点,剩余86个位点的信息指数平均值为0.517,观测杂合度平均值为0.370,期望杂合度平均值为0.346,固定指数平均值为-0.036,次等位基因频率平均值为0.269。从86个SNP位点中筛选出24个多态性高的SNP位点,组成DNA指纹图谱,可区分出全部参试茶树品种资源。对24个SNP位点组成的DNA指纹图谱并结合茶树品种资源基本信息进行数字编码,最终形成由28位数字组成的茶树品种资源分子身份证。【结论】依据SNP标记的多态性信息,筛选SNP位点,精准区分全部供试茶树品种,并将24个SNP位点所构建的茶树品种资源DNA指纹图谱及品� 展开更多
关键词 茶树 品种资源 SNP 分子身份证 dna指纹图谱
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9种鱼类非放射性DNA指纹图谱 被引量：30
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作者 王进科 夏德全 《中国水产科学》 CAS CSCD 2000年第2期14-17,共4页
用DIG标记Jeffreys人源小卫星 33.6和 33.15为探针 ,与青鱼、草鱼、鲢、鳙、鲤、团头鲂、鳜鱼、尼罗罗非鱼、奥利亚罗非鱼基因组DNA进行Southern杂交 ,获得多态性丰富的个体特异性DNA指纹图谱 ,建立了 9种鱼类的非放射性DNA指纹图谱。用... 用DIG标记Jeffreys人源小卫星 33.6和 33.15为探针 ,与青鱼、草鱼、鲢、鳙、鲤、团头鲂、鳜鱼、尼罗罗非鱼、奥利亚罗非鱼基因组DNA进行Southern杂交 ,获得多态性丰富的个体特异性DNA指纹图谱 ,建立了 9种鱼类的非放射性DNA指纹图谱。用DIG标记小卫星探针制作鱼类DNA指纹图谱安全可靠 ,克服了用放射性元素标记探针制作鱼类DNA指纹图谱的限制和不足 ,拓宽了鱼类DNA指纹图谱的应用范围。 9种鱼类的非放射性DNA指纹图谱研究也表明不同的DNA指纹探针在不同的鱼类上揭示的遗传信息不同 ,对鱼类的DNA指纹图谱研究应选择数个适宜的限制酶 展开更多
关键词 鱼类 非放射性 dna指纹图谱 遗传育种
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水稻品种DNA指纹检测技术体系及其应用 被引量：26
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作者 程本义 施勇峰 +2 位作者 沈伟峰 庄杰云 杨仕华 《杂交水稻》 CSCD 北大核心 2008年第1期54-59,共6页
在前期研究工作基础上,初步建立了一套水稻品种DNA指纹检测技术体系,主要内容包括选择标记类型、筛选标记、检测平台、确定标记等位基因、配制标记标准带型对照和记录带型。利用该技术体系对2005—2006年南方水稻区试品种进行了DNA指纹... 在前期研究工作基础上,初步建立了一套水稻品种DNA指纹检测技术体系,主要内容包括选择标记类型、筛选标记、检测平台、确定标记等位基因、配制标记标准带型对照和记录带型。利用该技术体系对2005—2006年南方水稻区试品种进行了DNA指纹鉴定,新发现等位基因8个,构建了442个(次)水稻区试品种×12个首选标记的DNA指纹数据库,并在不同品种间的特异性及同一品种年度间的一致性鉴定方面取得良好的应用效果。对有关评判标准进行了讨论。 展开更多
关键词 水稻 dna指纹 微卫星标记 品种鉴定 区域试验
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