目的:基于网络药理学方法探讨当归-黄柏治疗慢性前列腺炎(chronic prostatitis,CP)的作用机制。方法:应用中药系统药理学分析平台(TCMSP)并结合文献检索,筛选当归-黄柏中的活性成分与作用靶点,利用Uniprot数据库对靶点进行校正,应用Gene...目的:基于网络药理学方法探讨当归-黄柏治疗慢性前列腺炎(chronic prostatitis,CP)的作用机制。方法:应用中药系统药理学分析平台(TCMSP)并结合文献检索,筛选当归-黄柏中的活性成分与作用靶点,利用Uniprot数据库对靶点进行校正,应用GeneCards、OMIM数据库筛选疾病CP靶点,应用R语言软件筛选药物与疾病共同靶点,应用Cytoscape3.5.1软件构建药物-活性成分-靶点-疾病可视化网络图,应用STRING平台构建共同靶点蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络,利用R语言软件通过基因功能注释(gene ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)对核心靶标进行基因功能和通路的注释分析。结果:筛选出46个当归-黄柏的活性成分,预测相关靶点212个,其中与疾病有关的靶点159个,这些靶点主要涉及异源生物刺激反应、氧化与抗氧化反应等生物学过程,并主要富集在PI3K-Akt、丝裂原活化蛋白激酶(mitogenactivated protein kinase,MAPK)、低氧诱导因子-1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)等相关信号通路上。结论:通过网络药理学证实了当归-黄柏多成分、多靶点、多途径的作用特点,预测当归-黄柏治疗CP的可能作用机制,为进一步实验验证其作用机制提供了理论依据。展开更多
目的基于网络药理学方法,以及实验研究探讨乳香-没药治疗慢性前列腺炎(Chronic prostatitis,CP)的作用机制。方法应用中药系统药理学分析平台(TCMSP)并结合文献检索,筛选乳香-没药中的活性成分和相关靶点,利用Uniprot数据库对靶点进行校...目的基于网络药理学方法,以及实验研究探讨乳香-没药治疗慢性前列腺炎(Chronic prostatitis,CP)的作用机制。方法应用中药系统药理学分析平台(TCMSP)并结合文献检索,筛选乳香-没药中的活性成分和相关靶点,利用Uniprot数据库对靶点进行校正;应用GeneCards、TTD、Drugbank等数据库筛选CP的疾病靶点;应用R语言软件筛选药物与疾病共同靶点;应用Cytoscape 3.8.0软件构建药物-活性成分-靶点-疾病可视化网络图;应用String数据库平台构建共同靶点蛋白互作网络(PPI);利用R语言软件通过基因功能注释(Gene Ontology,GO)及京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)对核心靶标进行基因功能和通路的注释分析。根据网络药理学结果进行动物作用机制实验验证。结果筛选出乳香-没药的活性成分100个,相关靶点61个,其中与CP有关的靶点41个,这些靶点主要涉及类固醇激素的反应、细胞内受体信号通路、G蛋白偶联受体信号通路等生物学过程,并主要富集在钙信号通路、IL-17信号通路、雌激素信号通路、NF-κB信号通路、PI3K-Akt等信号通路上。通过实验验证,乳香-没药可明显降低大鼠血清及前列腺组织IL-17表达水平。结论通过网络药理学及实验研究,揭示了乳香-没药多成分、多靶点、多途径的作用特点,初步预测了乳香-没药治疗CP的活性成分及靶点,实验验证与调控IL-17水平有关,为进一步研究提供了理论和实验依据。展开更多
文摘目的:基于网络药理学方法探讨当归-黄柏治疗慢性前列腺炎(chronic prostatitis,CP)的作用机制。方法:应用中药系统药理学分析平台(TCMSP)并结合文献检索,筛选当归-黄柏中的活性成分与作用靶点,利用Uniprot数据库对靶点进行校正,应用GeneCards、OMIM数据库筛选疾病CP靶点,应用R语言软件筛选药物与疾病共同靶点,应用Cytoscape3.5.1软件构建药物-活性成分-靶点-疾病可视化网络图,应用STRING平台构建共同靶点蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络,利用R语言软件通过基因功能注释(gene ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)对核心靶标进行基因功能和通路的注释分析。结果:筛选出46个当归-黄柏的活性成分,预测相关靶点212个,其中与疾病有关的靶点159个,这些靶点主要涉及异源生物刺激反应、氧化与抗氧化反应等生物学过程,并主要富集在PI3K-Akt、丝裂原活化蛋白激酶(mitogenactivated protein kinase,MAPK)、低氧诱导因子-1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)等相关信号通路上。结论:通过网络药理学证实了当归-黄柏多成分、多靶点、多途径的作用特点,预测当归-黄柏治疗CP的可能作用机制,为进一步实验验证其作用机制提供了理论依据。
文摘目的基于网络药理学方法,以及实验研究探讨乳香-没药治疗慢性前列腺炎(Chronic prostatitis,CP)的作用机制。方法应用中药系统药理学分析平台(TCMSP)并结合文献检索,筛选乳香-没药中的活性成分和相关靶点,利用Uniprot数据库对靶点进行校正;应用GeneCards、TTD、Drugbank等数据库筛选CP的疾病靶点;应用R语言软件筛选药物与疾病共同靶点;应用Cytoscape 3.8.0软件构建药物-活性成分-靶点-疾病可视化网络图;应用String数据库平台构建共同靶点蛋白互作网络(PPI);利用R语言软件通过基因功能注释(Gene Ontology,GO)及京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)对核心靶标进行基因功能和通路的注释分析。根据网络药理学结果进行动物作用机制实验验证。结果筛选出乳香-没药的活性成分100个,相关靶点61个,其中与CP有关的靶点41个,这些靶点主要涉及类固醇激素的反应、细胞内受体信号通路、G蛋白偶联受体信号通路等生物学过程,并主要富集在钙信号通路、IL-17信号通路、雌激素信号通路、NF-κB信号通路、PI3K-Akt等信号通路上。通过实验验证,乳香-没药可明显降低大鼠血清及前列腺组织IL-17表达水平。结论通过网络药理学及实验研究,揭示了乳香-没药多成分、多靶点、多途径的作用特点,初步预测了乳香-没药治疗CP的活性成分及靶点,实验验证与调控IL-17水平有关,为进一步研究提供了理论和实验依据。
