目的:构建了一种从科研文献提取关键信息建立化学知识库的流程。方法:使用名称转化技术和光学结构识别软件提取化合物结构,使用文献管理软件End Note X8获取文献题录信息,使用机器学习工具Chem Data Extractor和人工注释方法提取文献内...目的:构建了一种从科研文献提取关键信息建立化学知识库的流程。方法:使用名称转化技术和光学结构识别软件提取化合物结构,使用文献管理软件End Note X8获取文献题录信息,使用机器学习工具Chem Data Extractor和人工注释方法提取文献内信息,使用计算模拟平台Pipeline Pilot 7.5获取可预测属性,关联开源数据库Ch EMBL获取已知生物活性。结果:成功建立起一种合理、高效的化学知识库构建策略,并采用该策略构建了北京大学海洋天然产物库PKU-MNPD。结论:提出了一种化学知识库的数据汇聚策略,提高了化学知识库构建效率,并且基于原始文献使得构建的数据库内容准确、全面、易于检索。展开更多
盐胁迫是影响植物生长发育的主要非生物胁迫之一。金属蛋白酶FtsH(Filamentation Temperature-Sensitive H)是一种ATP和Zn2+依赖型蛋白酶,广泛存在于真核生物和原核生物中,属于AAA蛋白酶家族(ATPase associated with various cellular a...盐胁迫是影响植物生长发育的主要非生物胁迫之一。金属蛋白酶FtsH(Filamentation Temperature-Sensitive H)是一种ATP和Zn2+依赖型蛋白酶,广泛存在于真核生物和原核生物中,属于AAA蛋白酶家族(ATPase associated with various cellular activities),在植物叶绿体发育、光合系统蛋白合成和修复、非生物胁迫的应答和抵抗、植物叶片杂色的调控等重要植物生长发育过程中起到了重要的作用。FtsH在拟南芥、油菜、大豆等植物中多有研究,但在紫花苜蓿中的功能还尚未有详细报导。本研究克隆且分析了紫花苜蓿MsFtsH8基因的表达模式,并对该基因进行生物信息学分析,通过在拟南芥中过表达发现,过表达的拟南芥植株在盐胁迫条件下,种子发芽率、根长和鲜重显著提高。研究结果表明,MsFtsH8具有调控耐盐的功能。本研究为苜蓿耐盐分子育种提供了重要候选基因和理论参考。展开更多
文摘目的:构建了一种从科研文献提取关键信息建立化学知识库的流程。方法:使用名称转化技术和光学结构识别软件提取化合物结构,使用文献管理软件End Note X8获取文献题录信息,使用机器学习工具Chem Data Extractor和人工注释方法提取文献内信息,使用计算模拟平台Pipeline Pilot 7.5获取可预测属性,关联开源数据库Ch EMBL获取已知生物活性。结果:成功建立起一种合理、高效的化学知识库构建策略,并采用该策略构建了北京大学海洋天然产物库PKU-MNPD。结论:提出了一种化学知识库的数据汇聚策略,提高了化学知识库构建效率,并且基于原始文献使得构建的数据库内容准确、全面、易于检索。
文摘盐胁迫是影响植物生长发育的主要非生物胁迫之一。金属蛋白酶FtsH(Filamentation Temperature-Sensitive H)是一种ATP和Zn2+依赖型蛋白酶,广泛存在于真核生物和原核生物中,属于AAA蛋白酶家族(ATPase associated with various cellular activities),在植物叶绿体发育、光合系统蛋白合成和修复、非生物胁迫的应答和抵抗、植物叶片杂色的调控等重要植物生长发育过程中起到了重要的作用。FtsH在拟南芥、油菜、大豆等植物中多有研究,但在紫花苜蓿中的功能还尚未有详细报导。本研究克隆且分析了紫花苜蓿MsFtsH8基因的表达模式,并对该基因进行生物信息学分析,通过在拟南芥中过表达发现,过表达的拟南芥植株在盐胁迫条件下,种子发芽率、根长和鲜重显著提高。研究结果表明,MsFtsH8具有调控耐盐的功能。本研究为苜蓿耐盐分子育种提供了重要候选基因和理论参考。
