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基于SNP标记的黄瓜遗传多样性分析
被引量:
9
1
作者
姚丹青
楼坚锋
+2 位作者
朱文莹
张微微
夏建明
《上海农业学报》
CSCD
2017年第1期21-30,共10页
通过查询NCBI、葫芦科基因组网站数据库获得42个黄瓜候选SNP位点。应用高分辨率溶解曲线技术对71个市售黄瓜品种进行SNP位点筛选,并通过焦磷酸测序进行SNP基因分型分析,探索SNP标记在黄瓜品种鉴定中的应用前景。结果表明:42个SNP位点中...
通过查询NCBI、葫芦科基因组网站数据库获得42个黄瓜候选SNP位点。应用高分辨率溶解曲线技术对71个市售黄瓜品种进行SNP位点筛选,并通过焦磷酸测序进行SNP基因分型分析,探索SNP标记在黄瓜品种鉴定中的应用前景。结果表明:42个SNP位点中有30个位点的多态信息量为0.027-0.528,平均为0.247;71个黄瓜品种两两间的遗传相似系数分布在0.4032-0.9839,即30个SNP位点的基因分型数据信息可以将71份黄瓜品种区分开。
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关键词
黄瓜
遗传多样性
SNP标记
高分辨率溶解曲线
焦磷酸测序
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职称材料
射血分数保留的心力衰竭患者血清MMP_2,NT-proBNP与HCY的表达变化
被引量:
7
2
作者
郭建峰
朱婵虹
+2 位作者
郑锦利
王若涛
陈宏斌
《中国实验诊断学》
2016年第12期2052-2054,共3页
目的探讨射血分数保留的心力衰竭(HF-PEF)与血清基质金属蛋白酶2(MMP_2)、B型钠尿肽前体N端(NT-proBNP)及血清同型半胱氨酸(HCY)之间的相关性。方法通过临床病例整体抽样选取射血分数保留的心力衰竭患者72例,作为HF-PEF组,按照纽约心脏...
目的探讨射血分数保留的心力衰竭(HF-PEF)与血清基质金属蛋白酶2(MMP_2)、B型钠尿肽前体N端(NT-proBNP)及血清同型半胱氨酸(HCY)之间的相关性。方法通过临床病例整体抽样选取射血分数保留的心力衰竭患者72例,作为HF-PEF组,按照纽约心脏病协会(NYHA)心功能分级分为Ⅱ-Ⅳ级,同期从体检中心体检者中选取心功能正常者作为对照组,26例,两组均采用酶联免疫吸附法(ELISA)测定MMP_2,同时测定血清中NT-proBNP及HCY水平,并对HF-PEF组与对照组之间三项指标进行分析比较。结果1.与心功能正常者对照组相比,HF-PEF组中的MMP_2,NT-proBNP与HCY水平均有显著性升高(P<0.05),且不同NYHA心功能分组中,三者水平也存在显著性差异(P<0.05);2.HF-PEF组患者血清中MMP_2与NT-proBNP、HCY呈明显正相关,相关系数分别为0.842、0.650(P<0.01),NT-proBNP与HCY之间呈明显正相关(r=0.592,P<0.01)。结论 HF-PEF患者血清中MMP_2,NT-proBNP与HCY水平与心功能分级与疾病的发展呈正相关,联合检测三者对HF-PEF患者的诊断和心衰程度的评估具有指导意义。
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关键词
射血分数保留
心力衰竭
基质金属蛋白酶2
B型钠尿肽前体N端
同型半胱氨酸
Matrix
METALLOPROTEINASE
2
全文增补中
ROC曲线评价NLR、PLR、CEA、NSE对肺癌的诊断价值
被引量:
9
3
作者
余建洪
李峰
朱晓丽
《中国实验诊断学》
2016年第11期1863-1865,共3页
目的探讨中性粒细胞/淋巴细胞比值(NLR)、血小板/淋巴细胞比值(PLR)、癌胚抗原(CEA)和神经元特异性烯醇化酶(NSE)在肺癌的诊断价值。方法对186例肺癌患者及114例健康体检者进行血常规及血清CEA和NSE检测,并利用ROC曲线分析NLR、PLR、CEA...
目的探讨中性粒细胞/淋巴细胞比值(NLR)、血小板/淋巴细胞比值(PLR)、癌胚抗原(CEA)和神经元特异性烯醇化酶(NSE)在肺癌的诊断价值。方法对186例肺癌患者及114例健康体检者进行血常规及血清CEA和NSE检测,并利用ROC曲线分析NLR、PLR、CEA、NSE单独和联合检测的诊断效能,并找出其cutoff值。结果 1.肺癌组全血NLR、PLR及血清CEA、NSE水平均高于健康对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。2.NLR、PLR、CEA和NSE的ROC曲线下面积(AUC)分别为0.867、0.802、0.889和0.842,诊断临界点分别为2.61、123.19、2.54μg/L和12.54μg/L,灵敏度分别为72.04%、65.59%、70.97%和72.04%,特异性分别为96.49%、89.46%、94.47%和84.21%,诊断指数分别为168.53%、155.06%、165.44%和156.25%。3.CEA+NLR、CEA+PLR、CEA+NSE和CEA+NLR+PLR+NSE四种组合的灵敏度分别为89.25%、90.32%、89.25%和95.70%,特异性分别为94.74%、91.23%、78.95%和68.42%,诊断指数分别为183.99%、181.55%、168.20%和164.12%。结论 NLR、PLR、CEA和NSE不宜单独用于肺癌的诊断,需联合使用。
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关键词
肺癌
中性粒细胞/淋巴细胞比值
血小板/淋巴细胞比值
癌胚抗原
神经元特异性烯醇化酶
ROC曲线
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职称材料
题名
基于SNP标记的黄瓜遗传多样性分析
被引量:
9
1
作者
姚丹青
楼坚锋
朱文莹
张微微
夏建明
机构
上海市种子管理总站
上海交通大学农业与生物学院
上海农林职业技术学校
出处
《上海农业学报》
CSCD
2017年第1期21-30,共10页
基金
"十二五"国家863现代农业技术领域项目(2012AA100101)
上海市科委重点科技攻关项目(12391901500)
上海市科技兴农项目[沪农科攻字(2012)第2-1号]
文摘
通过查询NCBI、葫芦科基因组网站数据库获得42个黄瓜候选SNP位点。应用高分辨率溶解曲线技术对71个市售黄瓜品种进行SNP位点筛选,并通过焦磷酸测序进行SNP基因分型分析,探索SNP标记在黄瓜品种鉴定中的应用前景。结果表明:42个SNP位点中有30个位点的多态信息量为0.027-0.528,平均为0.247;71个黄瓜品种两两间的遗传相似系数分布在0.4032-0.9839,即30个SNP位点的基因分型数据信息可以将71份黄瓜品种区分开。
关键词
黄瓜
遗传多样性
SNP标记
高分辨率溶解曲线
焦磷酸测序
Keywords
Cucumber
Genetic diversity
Single nucleotide polymorphism(SNP)
High resolution melting(HRM)
Pyrosequencing technology
分类号
S642.2 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
射血分数保留的心力衰竭患者血清MMP_2,NT-proBNP与HCY的表达变化
被引量:
7
2
作者
郭建峰
朱婵虹
郑锦利
王若涛
陈宏斌
机构
福建医科大学附属闽东医院检验科
出处
《中国实验诊断学》
2016年第12期2052-2054,共3页
文摘
目的探讨射血分数保留的心力衰竭(HF-PEF)与血清基质金属蛋白酶2(MMP_2)、B型钠尿肽前体N端(NT-proBNP)及血清同型半胱氨酸(HCY)之间的相关性。方法通过临床病例整体抽样选取射血分数保留的心力衰竭患者72例,作为HF-PEF组,按照纽约心脏病协会(NYHA)心功能分级分为Ⅱ-Ⅳ级,同期从体检中心体检者中选取心功能正常者作为对照组,26例,两组均采用酶联免疫吸附法(ELISA)测定MMP_2,同时测定血清中NT-proBNP及HCY水平,并对HF-PEF组与对照组之间三项指标进行分析比较。结果1.与心功能正常者对照组相比,HF-PEF组中的MMP_2,NT-proBNP与HCY水平均有显著性升高(P<0.05),且不同NYHA心功能分组中,三者水平也存在显著性差异(P<0.05);2.HF-PEF组患者血清中MMP_2与NT-proBNP、HCY呈明显正相关,相关系数分别为0.842、0.650(P<0.01),NT-proBNP与HCY之间呈明显正相关(r=0.592,P<0.01)。结论 HF-PEF患者血清中MMP_2,NT-proBNP与HCY水平与心功能分级与疾病的发展呈正相关,联合检测三者对HF-PEF患者的诊断和心衰程度的评估具有指导意义。
关键词
射血分数保留
心力衰竭
基质金属蛋白酶2
B型钠尿肽前体N端
同型半胱氨酸
Matrix
METALLOPROTEINASE
2
Keywords
Preserved ejection fraction
Heart failure
N-terminal Pro-Brain Natriuretic Peptide
homocysteine
分类号
R541.6 [医药卫生—心血管疾病]
R446.1 [医药卫生—内科学]
全文增补中
题名
ROC曲线评价NLR、PLR、CEA、NSE对肺癌的诊断价值
被引量:
9
3
作者
余建洪
李峰
朱晓丽
机构
四川省自贡市第一人民医院检验科
四川省自贡市第一人民医院病理科
成都医学院检验系
出处
《中国实验诊断学》
2016年第11期1863-1865,共3页
文摘
目的探讨中性粒细胞/淋巴细胞比值(NLR)、血小板/淋巴细胞比值(PLR)、癌胚抗原(CEA)和神经元特异性烯醇化酶(NSE)在肺癌的诊断价值。方法对186例肺癌患者及114例健康体检者进行血常规及血清CEA和NSE检测,并利用ROC曲线分析NLR、PLR、CEA、NSE单独和联合检测的诊断效能,并找出其cutoff值。结果 1.肺癌组全血NLR、PLR及血清CEA、NSE水平均高于健康对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。2.NLR、PLR、CEA和NSE的ROC曲线下面积(AUC)分别为0.867、0.802、0.889和0.842,诊断临界点分别为2.61、123.19、2.54μg/L和12.54μg/L,灵敏度分别为72.04%、65.59%、70.97%和72.04%,特异性分别为96.49%、89.46%、94.47%和84.21%,诊断指数分别为168.53%、155.06%、165.44%和156.25%。3.CEA+NLR、CEA+PLR、CEA+NSE和CEA+NLR+PLR+NSE四种组合的灵敏度分别为89.25%、90.32%、89.25%和95.70%,特异性分别为94.74%、91.23%、78.95%和68.42%,诊断指数分别为183.99%、181.55%、168.20%和164.12%。结论 NLR、PLR、CEA和NSE不宜单独用于肺癌的诊断,需联合使用。
关键词
肺癌
中性粒细胞/淋巴细胞比值
血小板/淋巴细胞比值
癌胚抗原
神经元特异性烯醇化酶
ROC曲线
Keywords
Lung cancer
NLR
PLR
CEA
NSE
ROC curve
分类号
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于SNP标记的黄瓜遗传多样性分析
姚丹青
楼坚锋
朱文莹
张微微
夏建明
《上海农业学报》
CSCD
2017
9
下载PDF
职称材料
2
射血分数保留的心力衰竭患者血清MMP_2,NT-proBNP与HCY的表达变化
郭建峰
朱婵虹
郑锦利
王若涛
陈宏斌
《中国实验诊断学》
2016
7
全文增补中
3
ROC曲线评价NLR、PLR、CEA、NSE对肺癌的诊断价值
余建洪
李峰
朱晓丽
《中国实验诊断学》
2016
9
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职称材料
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