为厘清马泰勒虫的生物媒介及分子进化特征,对收集的新疆部分区域蜱进行基因组DNA提取,利用989/990引物对上述基因组进行梨形虫18S rRNA的PCR检测,并对阳性产物测序。利用MEGA 11.0软件包中的Alignment Explorer CLUSTAL X进行多序列比对...为厘清马泰勒虫的生物媒介及分子进化特征,对收集的新疆部分区域蜱进行基因组DNA提取,利用989/990引物对上述基因组进行梨形虫18S rRNA的PCR检测,并对阳性产物测序。利用MEGA 11.0软件包中的Alignment Explorer CLUSTAL X进行多序列比对,Bootstrap Test of Phylogeny模块下的NJ法构建马泰勒虫不同地理株的进化树。PCR检测结果显示,在收集的80只草原革蜱中有4只感染了马泰勒虫,感染率为5.00%。序列分析表明,马泰勒虫分为2个主要基因型,1个亚型。世界范围内流行的主要是Ⅰ型,Ⅱ型在南非以及苏丹等地流行。此次检测到的新疆马泰勒虫与国内四川株以及哈萨克斯坦、西班牙、沙特阿拉伯、爱尔兰分离株处于相同的进化分支,其基因型均隶属于Ⅰ型。同样的隶属于Ⅰ型的还存在1个亚型(Ⅰ-A),该基因亚型的虫株在肯尼亚和意大利均有分布。马泰勒虫18S rRNA基因V4变异区多序列比对表明,15位点Ⅱ型较Ⅰ型有A的缺失,而且在18~22位点处有TCGAG到ACAGT的突变,48位点处存在G到T的突变。上述研究表明,首次检测到草原革蜱中马泰勒虫的感染。而此次检测到的马泰勒虫隶属于马泰勒虫Ⅰ型,该基因型的马泰勒虫是世界主要流行虫株。展开更多
基金supported by grants from the National Natural Science Foundation of China (No. 31301880)Program for Liaoning Excellent Talents in University (No. LJQ2015057)+1 种基金Dalian High Level Talent Innovation Support Plan China (No. 2015R067)
基金supported by grants from the National Natural Science Foundation of China(No.31301880)Program for Excellent Talents in University of Liaoning Province+2 种基金China(No.LJQ2015057)High Level TalentInnovation Support Plan of Dalian CityChina(No.2015R067)
文摘为厘清马泰勒虫的生物媒介及分子进化特征,对收集的新疆部分区域蜱进行基因组DNA提取,利用989/990引物对上述基因组进行梨形虫18S rRNA的PCR检测,并对阳性产物测序。利用MEGA 11.0软件包中的Alignment Explorer CLUSTAL X进行多序列比对,Bootstrap Test of Phylogeny模块下的NJ法构建马泰勒虫不同地理株的进化树。PCR检测结果显示,在收集的80只草原革蜱中有4只感染了马泰勒虫,感染率为5.00%。序列分析表明,马泰勒虫分为2个主要基因型,1个亚型。世界范围内流行的主要是Ⅰ型,Ⅱ型在南非以及苏丹等地流行。此次检测到的新疆马泰勒虫与国内四川株以及哈萨克斯坦、西班牙、沙特阿拉伯、爱尔兰分离株处于相同的进化分支,其基因型均隶属于Ⅰ型。同样的隶属于Ⅰ型的还存在1个亚型(Ⅰ-A),该基因亚型的虫株在肯尼亚和意大利均有分布。马泰勒虫18S rRNA基因V4变异区多序列比对表明,15位点Ⅱ型较Ⅰ型有A的缺失,而且在18~22位点处有TCGAG到ACAGT的突变,48位点处存在G到T的突变。上述研究表明,首次检测到草原革蜱中马泰勒虫的感染。而此次检测到的马泰勒虫隶属于马泰勒虫Ⅰ型,该基因型的马泰勒虫是世界主要流行虫株。