分子对接和动力学模拟提高嗜热蛋白酶PhpI的活力 被引量：7

1

作者 詹冬玲 高楠 +1 位作者 韩葳葳 冯雁 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2013年第3期628-633,共6页

通过分子对接和动力学模拟对嗜热蛋白酶的分子进行改造,确定蛋白酶PH1704(PhpI)定点突变残基,并通过分子生物学实验进行验证.突变体K43C的蛋白酶活力提高了5.8倍.分子动力学模拟结果表明,经过8 ns的动力学模拟后,K43C突变体二级结构由... 通过分子对接和动力学模拟对嗜热蛋白酶的分子进行改造,确定蛋白酶PH1704(PhpI)定点突变残基,并通过分子生物学实验进行验证.突变体K43C的蛋白酶活力提高了5.8倍.分子动力学模拟结果表明,经过8 ns的动力学模拟后,K43C突变体二级结构由野生型的S2片层(F11-E12-D13)变成环状结构.E12和K43均是活性位点的重要残基,这种变化将导致活性位点的柔性增强,有利于催化反应的发生. 展开更多

关键词 嗜热蛋白酶PhpI 分子对接 动力学模拟 定点突变

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嗜热菌Pyrococcus horikoshii OT3蛋白酶基因的原核表达、纯化和性质表征 被引量：5

2

作者 詹冬玲 白挨玺 +2 位作者 白鹤 韩葳葳 冯雁 《吉林大学学报（理学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期1065-1069,共5页

将来源于嗜热菌Pyrococcus horikoshii OT3的蛋白酶(PH1704)基因在大肠杆菌BLP-CodonPlus中高效表达.采用超声、热失活和HiTrap Q Sepharose柱层析等方法对产物进行分离纯化.通过SDS-PAGE,Native-PAGE和Western-blot对表达产物进行鉴定... 将来源于嗜热菌Pyrococcus horikoshii OT3的蛋白酶(PH1704)基因在大肠杆菌BLP-CodonPlus中高效表达.采用超声、热失活和HiTrap Q Sepharose柱层析等方法对产物进行分离纯化.通过SDS-PAGE,Native-PAGE和Western-blot对表达产物进行鉴定,发现该重组酶以十二聚体为主的寡聚体形式存在,并具有SDS抗性.蛋白酶活力染色表明,其六聚体以上有活力.以azo-gelation为底物,对其酶学性质进行初步研究表明,其最适温度为85℃,最适pH=8.0,并且具有良好的热稳定性. 展开更多

关键词 嗜热蛋白酶 表达 纯化 性质

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人参β-香树素合成酶同源模建及高通量虚拟筛选抑制剂的研究 被引量：6

3

作者 詹冬玲 王嵩 +1 位作者 韩葳葳 刘景圣 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2012年第3期217-222,共6页

人参β-香树素合成酶(β-AS)能催化氧鲨烯环化生成齐墩果烷型皂苷,从而减少植物固醇的生成量,有助于获得高效的人参皂苷.因β-AS的三维结构是未知的,我们以氧鲨烯环化酶为模板,对β-AS进行三维结构搭建.以抑制剂10-aza-10,11-dihydro-2,... 人参β-香树素合成酶(β-AS)能催化氧鲨烯环化生成齐墩果烷型皂苷,从而减少植物固醇的生成量,有助于获得高效的人参皂苷.因β-AS的三维结构是未知的,我们以氧鲨烯环化酶为模板,对β-AS进行三维结构搭建.以抑制剂10-aza-10,11-dihydro-2,3-oxidosqualene为先导化合物,通过AutoDockvina进行分子对接,选取结合能量最低的新化合物进行研究.研究结果表明:新抑制剂8442257比先导化合物10-aza-10,11-dihydro-2,3-oxidosqualene的抑制效果更好.Leu287与新抑制剂结合时能量最低,是重要的残基位点;Ser413和Trp613通过氢键与新抑制剂结合,在抑制过程中起重要作用.我们的研究结果为人参β-香树素合成酶抑制剂的研究提供一个有利的依据. 展开更多

关键词 同源模建 β-香树素合成酶 虚拟筛选 分子对接

原文传递

嗜热蛋白酶PH1704别构中心量子化学计算与突变体动力学 被引量：6

4

作者 詹冬玲 高楠 +1 位作者 韩葳葳 冯雁 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2014年第1期146-153,共8页

通过量子化学计算，确定嗜热菌PyrococcushorikoshiiOT3的PHl704蛋白酶别构位点的关键残基为Argll3，Tyrl20和Asnl29．其中，Argll3及Asnl29与别构抑制剂结合，参与别构调控．Tyrl20残基位于亚基交界面附近，并与亲核残基Cys100之间以... 通过量子化学计算，确定嗜热菌PyrococcushorikoshiiOT3的PHl704蛋白酶别构位点的关键残基为Argll3，Tyrl20和Asnl29．其中，Argll3及Asnl29与别构抑制剂结合，参与别构调控．Tyrl20残基位于亚基交界面附近，并与亲核残基Cys100之间以氢键相连，可通过影响亚基聚合来影响酶的亲核催化．DJ-1超家族的4种构建蛋白的结构显示，120位点位于亚基交界面处，影响亚基的聚合，进而影响蛋白酶的活力，并间接参与别构调控．分子生物学实验显示，突变体R113T／Y120P／N129D的kcat/km（L·μmol^-1·min^-1）值是野生型kcat/km。值的6倍，h系数由野生型的0．86转变为1．3，负协同效应消失．113和129位点处阴离子别构剂脱离，从而破坏113，120和129位点间的封闭环结构，使AC交界面胡螺旋（124～129，524—529）间聚合度增强；120位点残基由rryr转变为Pro，与Cys100间氢键断裂，亲核进攻的阻力减小，从而使酶活力提高，别构负调控消失． 展开更多

关键词 嗜热蛋白酶 量子化学计算 别构中心 定点突变

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大肠杆菌中高丝氨酸琥珀酰基转移酶的同源模建与对接研究 被引量：5

5

作者 周奕含 李泽生 +1 位作者 韩葳葳 姚远 《分子科学学报》 CAS CSCD 2008年第2期144-148,共5页

利用同源模建和分子动力学模拟方法,模建了大肠杆菌中高丝氨酸琥珀酰基转移酶的三维结构.分析了活性位点的组成,从结构上佐证了Cys142而不是Lys47为亲核进攻的残基,并通过与其天然底物琥珀酰-辅酶A的对接研究,从理论上确认了对复合物形... 利用同源模建和分子动力学模拟方法,模建了大肠杆菌中高丝氨酸琥珀酰基转移酶的三维结构.分析了活性位点的组成,从结构上佐证了Cys142而不是Lys47为亲核进攻的残基,并通过与其天然底物琥珀酰-辅酶A的对接研究,从理论上确认了对复合物形成起到重要作用的氨基酸残基. 展开更多

关键词 同源模建 高丝氨酸琥珀酰基转移酶 琥珀酰基-辅酶A 分子动力学

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新的α/β水解酶W14和W15的三维结构模建及分子对接研究 被引量：3

6

作者 周奕含 罗全 +2 位作者 韩葳葳 姚远 李泽生 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2009年第7期1423-1426,共4页

利用同源模建和分子动力学模拟方法,模建了两个新发现的α/β水解酶超家族成员W14和W15的三维结构,并通过与α-醋酸萘酯的对接研究,从理论上提出Gly82和Val13为形成"氧洞"的关键残基,有利于稳定水解过程中的带负电的过渡态,... 利用同源模建和分子动力学模拟方法,模建了两个新发现的α/β水解酶超家族成员W14和W15的三维结构,并通过与α-醋酸萘酯的对接研究,从理论上提出Gly82和Val13为形成"氧洞"的关键残基,有利于稳定水解过程中的带负电的过渡态,以及其它对复合物形成起到重要作用的氨基酸残基. 展开更多

关键词 分子动力学 α/β水解酶 分子对接

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利用Markov模型研究Aβ突变体的构象转变过程

7

作者 姚星宇 刘璎锐 +1 位作者 韩葳葳 万由衷 《吉林大学学报（理学版）》 CAS 北大核心 2024年第1期174-180,共7页

为抑制淀粉样β多肽(Aβ)从无规卷曲或α-螺旋转变为β-折叠结构,研究野生型Aβ及其数组突变体的构象变化,结合Markov模型与分子动力学模拟,对野生型、A4型和D7N型Aβ的构象变化过程进行研究,明确3种Aβ构象的转变路径.实验结果表明,野... 为抑制淀粉样β多肽(Aβ)从无规卷曲或α-螺旋转变为β-折叠结构,研究野生型Aβ及其数组突变体的构象变化,结合Markov模型与分子动力学模拟,对野生型、A4型和D7N型Aβ的构象变化过程进行研究,明确3种Aβ构象的转变路径.实验结果表明,野生型Aβ出现一个区域的β-折叠,A4型Aβ构象几乎无变化,而D7N型Aβ出现两个区域的β-折叠,说明D7N型突变体具有促β-折叠特性,该结果为阿尔兹海默症的治疗方法探索提供理论依据. 展开更多

关键词 阿尔兹海默症 淀粉样β多肽 分子动力学模拟 MARKOV模型

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Furcatin水解酶的三维结构模建和与furcatin的对接研究 被引量：2

8

作者 韩葳葳 李泽生 +2 位作者 潘秀梅 郑清川 孙家钟 《分子科学学报》 CAS CSCD 2005年第6期60-64,共5页

利用同源模建和动力学模拟方法,模建了furcatin水解酶(FH)的三维结构.并在这基础上,分析了活性位点的组成和结构.研究了furcatin与FH的对接.结果表明,Ser84,Arg146,Thr189,Thr234和Gly372在复合物的形成过程中起重要的作用.其中,Ser84,A... 利用同源模建和动力学模拟方法,模建了furcatin水解酶(FH)的三维结构.并在这基础上,分析了活性位点的组成和结构.研究了furcatin与FH的对接.结果表明,Ser84,Arg146,Thr189,Thr234和Gly372在复合物的形成过程中起重要的作用.其中,Ser84,Arg146和Thr189是在FH的活性口袋的二糖部分的亚单位-1中重要的氨基酸,Thr234和Gly372是亚单位-2中重要的氨基酸. 展开更多

关键词 同源模建 furcatin水解酶 分子动力学

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角鲨烯合成酶抑制剂的高通量虚拟筛选 被引量：2

9

作者 詹冬玲 韩葳葳 刘景圣 《吉林大学学报（理学版）》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期361-364,共4页

以SQS抑制剂CP-320473为先导物,在60%结构相似性的基础上,先通过AutoDockVina软件进行分子对接,再选取结合能量最低的新化合物进行分子对接研究.结果表明:zinc_8442249比先导化合物CP-320473的抑制效果更好;SQS活性位点的Lys52通过与氢... 以SQS抑制剂CP-320473为先导物,在60%结构相似性的基础上,先通过AutoDockVina软件进行分子对接,再选取结合能量最低的新化合物进行分子对接研究.结果表明:zinc_8442249比先导化合物CP-320473的抑制效果更好;SQS活性位点的Lys52通过与氢键与抑制剂结合,在抑制过程中具有重要作用. 展开更多

关键词 角鲨烯合成酶 高通量虚拟筛选 分子对接 抑制剂

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基于分子动力学模拟的VmoLac非特异性底物催化活性的理论研究 被引量：1

10

作者 李聪聪 刘明皓 +3 位作者 韩佳睿 朱镜璇 韩葳葳 李婉南 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2021年第8期2518-2528,共11页

采用分子动力学模拟方法研究了VmoLac的非特异性底物催化活性,模拟了VmoLac/3-oxo-C10-AHL,VmoLac/3-oxo-C6-AHL,VmoLac/γ-nonalacton和VmoLac/ethyl-paraoxon 4个复合物.分析了分子动力学模拟过程中不同底物结合引起VmoLac构象变化的... 采用分子动力学模拟方法研究了VmoLac的非特异性底物催化活性,模拟了VmoLac/3-oxo-C10-AHL,VmoLac/3-oxo-C6-AHL,VmoLac/γ-nonalacton和VmoLac/ethyl-paraoxon 4个复合物.分析了分子动力学模拟过程中不同底物结合引起VmoLac构象变化的主要原因.结果表明,3-oxo-C10-AHL和γ-nonalacton的结合会使VmoLac活性口袋附近的Loop8结构域运动明显,利于底物结合在Loop8疏水通道外侧进而引起催化反应;VmoLac活性口袋周围的门控残基W264和Y230之间距离的变化会影响底物的结合;Y98与长链内酯、壬内酯的羰基碳之间形成的进攻距离较小,而与短链内酯的羰基碳以及对氧磷的磷原子之间形成的进攻距离较大,短的距离更有利于发生亲核进攻反应;D257是引发VmoLac催化反应的关键残基;当VmoLac催化3-oxo-C10-AHL和γ-nonalacton时,D257与极化水以及底物形成更多的氢键,使底物与酶更容易结合.从理论催化机制角度解释了VmoLac催化长链内酯(3-oxo-C10-AHL)比短链内酯(3-oxo-C6-AHL)的能力强,催化壬内酯(γ-nonalacton)比对氧磷(ethyl-paraoxon)能力强的原因,为实验结果提供了理论证明. 展开更多

关键词 嗜热磷酸三酯酶样内酯酶 VmoLac 分子对接 分子动力学模拟

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极光激酶A抗癌抑制剂的高通量筛选及对接研究 被引量：1

11

作者 杨锐 韩葳葳 王嵩 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2011年第12期1399-1402,共4页

极光激酶(aurora kinases)A是负责调控细胞有丝分裂的一类重要的丝氨酸/苏氨酸激酶.用极光激酶A的一种抑制剂H-89作为先导化合物,通过AutoDock vina软件进行虚拟筛选,选取能量打分最低的抑制剂(命名为H-89-1)做进一步的深入研究.理论对... 极光激酶(aurora kinases)A是负责调控细胞有丝分裂的一类重要的丝氨酸/苏氨酸激酶.用极光激酶A的一种抑制剂H-89作为先导化合物,通过AutoDock vina软件进行虚拟筛选,选取能量打分最低的抑制剂(命名为H-89-1)做进一步的深入研究.理论对接研究揭示H-89-1是一种比H-89更好的抑制剂,并且Thr217和Arg137是H-89-1和酶作用中的重要残基,因为它们和H-89-1形成了氢键.我们的研究将为极光激酶A专有抑制剂的设计提供可靠的理论线索. 展开更多

关键词 极光激酶A 分子对接 H-89 抑制剂

原文传递

嗜热酯酶EstTs1的远源三维结构模建及分子对接

12

作者 詹冬玲 邵鸿泽 +1 位作者 韩葳葳 刘景圣 《吉林大学学报（理学版）》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期1131-1135,共5页

利用Phyre网络服务器,构建嗜热酯酶EstTs1的三维结构,并通过分子动力学优化构型,得到了可靠的构型.分子对接研究表明,p-硝基苯基丁酸酯是EstTs1的最适底物,其大小正适合EstTs1的活性口袋.Thr111是底物与酶结合的重要残基,与底物形成了氢... 利用Phyre网络服务器,构建嗜热酯酶EstTs1的三维结构,并通过分子动力学优化构型,得到了可靠的构型.分子对接研究表明,p-硝基苯基丁酸酯是EstTs1的最适底物,其大小正适合EstTs1的活性口袋.Thr111是底物与酶结合的重要残基,与底物形成了氢键;Ser85是重要的催化残基. 展开更多

关键词 远源三维结构模建 分子对接 嗜热酯酶EstTs1

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基于拉伸分子动力学模拟的黄嘌呤氧化酶抑制剂解离途径的理论研究

13

作者 齐人睿 李明昊 +5 位作者 常浩 付学奇 高波 韩葳葳 韩璐 李婉南 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2021年第3期758-766,共9页

采用拉伸分子动力学模拟的方法研究了黄嘌呤氧化酶(Xanthine oxidase,XO)抑制剂别嘌呤醇(Allopuri⁃nol)和葛根素(Puerarin)从XO离去通道解离的动态过程.分子对接结果表明,别嘌呤醇和葛根素均结合在XO的钼蝶呤中心(Molybdopterin,Mo-pt)... 采用拉伸分子动力学模拟的方法研究了黄嘌呤氧化酶(Xanthine oxidase,XO)抑制剂别嘌呤醇(Allopuri⁃nol)和葛根素(Puerarin)从XO离去通道解离的动态过程.分子对接结果表明,别嘌呤醇和葛根素均结合在XO的钼蝶呤中心(Molybdopterin,Mo-pt);丙氨酸扫描的结果显示,Val789,Arg880,Phe911,Phe914和Val1081在XO与抑制剂的结合中起到非常重要的作用.拉伸分子动力学模拟结果显示,相比于葛根素,别嘌呤醇需要更大的外力和更长的时间才能从XO中解离,拉伸过程中Arg880,Phe1009,Thr1010,Val1011和Ala1079均对维持2种复合物的结构稳定起到重要作用,Phe649和Phe1013在抑制剂解离过程中起到门控的作用,His875起到阻碍抑制剂解离的作用. 展开更多

关键词 黄嘌呤氧化酶 别嘌呤醇 葛根素 痛风 拉伸分子动力学模拟

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嗜热菌Thermaerobacter subterraneus DSM13965磷酸三酯酶的原核表达、纯化及性质表征

14

作者 林禹欣 刘惠麟 +2 位作者 韩葳葳 詹冬玲 刘景圣 《吉林大学学报（理学版）》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期1182-1186,共5页

将来源于嗜热菌Thermaerobacter subterraneus DSM13965的磷酸三酯酶基因在大肠杆菌BL21中高效表达,并采用超声、热失活和组氨酸标签镍柱对产物进行分离纯化,通过SDS-PAGE和Western-blot对表达产物进行鉴定.结果表明:该重组酶以二聚体... 将来源于嗜热菌Thermaerobacter subterraneus DSM13965的磷酸三酯酶基因在大肠杆菌BL21中高效表达,并采用超声、热失活和组氨酸标签镍柱对产物进行分离纯化,通过SDS-PAGE和Western-blot对表达产物进行鉴定.结果表明:该重组酶以二聚体的寡聚体形式存在;其最适温度为70℃,最适pH=10.0,具有良好的热稳定性. 展开更多

关键词 嗜热菌Thermaerobacter subterraneus DSM13965 磷酸三酯酶 原核表达 性质

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基于分子动力学模拟提高嗜热磷酸三酯酶样内酯酶非特异性底物活力的理论研究

15

作者 朱镜璇 于正飞 +4 位作者 刘野 詹冬玲 韩佳睿 田晓翩 韩葳葳 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2019年第1期138-146,共9页

采用分子动力学模拟和拉伸分子动力学模拟方法,结合分子力学-广义玻恩表面积(MM-GB/SA)方法进行自由能计算和结构交互指纹分析,研究了模拟过程中非特异性底物(对氧磷/内酯)分别与嗜热磷酸三酯酶样内酯酶(SsoPox)野生型和突变体(W263F/W2... 采用分子动力学模拟和拉伸分子动力学模拟方法,结合分子力学-广义玻恩表面积(MM-GB/SA)方法进行自由能计算和结构交互指纹分析,研究了模拟过程中非特异性底物(对氧磷/内酯)分别与嗜热磷酸三酯酶样内酯酶(SsoPox)野生型和突变体(W263F/W263T)结合的构象变化,分析了Loop8中重要残基Trp263的突变提高SsoPox非特异性底物活力的原因,发现其能够影响门控残基Phe229的构象变化,导致活性口袋入口变宽(Phe229与Tyr99之间的距离变大),使对氧磷和内酯更容易结合到蛋白质的活性位点上; Asp256和Arg223形成盐桥的几率高于野生型(WT) SsoPox,在Arg223(位于Loop7)的协助下质子更加高效地从活性中心的Asp256(位于Loop8)传递到溶剂中去,因而能够提高SsoPox水解底物的效率.通过比较2个野生型复合物的结构稳定性和结合自由能差异,发现在模拟过程中SsoPox与内酯的复合物体系更加稳定并且具有更低的结合自由能,有利于SsoPox识别底物并使其埋在活性部位的疏水环境中,促进氢氧化物亲核进攻底物的亲电中心.因此,底物与酶稳定的相互作用可能是SsoPox具有天然内酯酶活性的原因之一. 展开更多

关键词 嗜热类磷酸三酯酶样内酯酶 分子动力学模拟 拉伸分子动力学模拟 分子力学-广义玻恩表面积 结构交互指纹分析

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自分泌运动因子(ATX)抑制剂结合位点的预测及其与rPAI-1的分子对接

16

作者 詹冬玲 郑明珠 +1 位作者 韩葳葳 刘景圣 《吉林大学学报（理学版）》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期1100-1104,共5页

利用复合物指纹的虚拟筛选预测自分泌运动因子(ATX)抑制剂的结合位点,并通过与24个抑制剂(10个脂质和脂基抑制剂,14个小分子抑制剂)分子对接和动力学模拟表明,Thr209,Asp172,Tyr306,Phe210,Leu243,Leu213和Phe274是抑制剂结合位点的重... 利用复合物指纹的虚拟筛选预测自分泌运动因子(ATX)抑制剂的结合位点,并通过与24个抑制剂(10个脂质和脂基抑制剂,14个小分子抑制剂)分子对接和动力学模拟表明,Thr209,Asp172,Tyr306,Phe210,Leu243,Leu213和Phe274是抑制剂结合位点的重要残基,且这些残基均通过侧链与抑制剂作用.利用3D-partner预测出与ATX结合的蛋白为纤溶酶原激活物抑制剂1(rPAI-1),并通过同源模拟,得到rPAI-1的分子结构.利用软件GRAMM将ATX与rPAI-1分子结构相结合,并通过分子动力学模拟确定与大分子抑制剂rPAI-1作用的ATX重要残基Glu155和Ala158. 展开更多

关键词 虚拟筛选 蛋白和蛋白对接 自分泌运动因子

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磷酸三酯酶的同源模建及分子对接理论

17

作者 郑文琦 赵丽 +1 位作者 宋亚伟 韩葳葳 《吉林大学学报（理学版）》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期514-517,共4页

利用同源模建和分子动力学模拟方法模建了来源于Thermaerobacter marianensis的磷酸三酯酶样内酯酶(PLLs)三维结构.通过与不同底物的对接可知,Arg44与两种底物(磷酸三酯和内酯)均形成氢键,从而Arg44是两种底物与酶结合时重要的氨基酸残基.

关键词 磷酸三酯酶 同源模建 分子对接

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用响应面法优化酶水解法制备葵花盘小分子肽 被引量：2

18

作者 郭宝生 杨翊研 +2 位作者 胡峻涵 韩葳葳 李婉南 《吉林大学学报（理学版）》 CAS 北大核心 2019年第5期1275-1280,共6页

为提取并利用葵花盘中具有降尿酸和溶解痛风石作用的小分子肽,以小分子肽得率为指标,通过酶水解法优化提取条件,确定碱性蛋白酶为最理想的酶.通过单因素实验考察料液比、时间、温度、pH值和加酶量对小分子肽得率的影响,利用响应面Box-Be... 为提取并利用葵花盘中具有降尿酸和溶解痛风石作用的小分子肽,以小分子肽得率为指标,通过酶水解法优化提取条件,确定碱性蛋白酶为最理想的酶.通过单因素实验考察料液比、时间、温度、pH值和加酶量对小分子肽得率的影响,利用响应面Box-Behnken实验,优化酶水解法提取葵花盘小分子肽的工艺,得到其最佳工艺条件为:加入碱性蛋白酶,m(料)∶V(液)=1∶15,酶的用量为2%,pH=9.0,温度为55℃,时间为2h,葵花盘小分子肽的得率最高为(42.41±0.01)%. 展开更多

关键词 葵花盘 小分子肽 提取 单因素 酶水解法 响应面法

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MEK1及其突变体的曲美替尼结合轨迹的马尔可夫模型分析

19

作者 刘明皓 李明昊 +1 位作者 陈雪 韩葳葳 《生物医学工程学进展》 CAS 2022年第4期223-229,共7页

MEK1是Ras-Raf-MEK-ERK通路中重要的信号分子,在肿瘤发生中发挥着重要的作用。通路中的Raf、MEK1等基因发生突变导致通路被持续活化被认为是导致肿瘤无限增殖的重要原因之一。曲美替尼能有效地抑制MEK1的活性,MEK1结构中α螺旋的消失会... MEK1是Ras-Raf-MEK-ERK通路中重要的信号分子,在肿瘤发生中发挥着重要的作用。通路中的Raf、MEK1等基因发生突变导致通路被持续活化被认为是导致肿瘤无限增殖的重要原因之一。曲美替尼能有效地抑制MEK1的活性,MEK1结构中α螺旋的消失会降低曲美替尼的治疗效果。该研究通过PCCA+聚类算法、马尔可夫模型和通量分析等方法,对E203K突变体和曲美替尼的作用轨迹进行分析,研究发现E203K、P124S和野生型MEK1在与曲美替尼作用时,C166-S181部分靠近曲美替尼的一端会发生解旋变为氢键转角,而远端螺旋则不会发生解旋。 展开更多

关键词 丝裂原活化蛋白激酶激酶1 曲美替尼 E203K突变体 马尔可夫模型 通量分析

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迭代目标转换因子分析法在光度分析中的应用研究

20

作者 韩葳葳 《长春师范大学学报（人文社会科学版）》 2001年第1期3-6,共4页

通过迭代目标转换因子分析法与一般因子分析相比较 ,较好地解决了由于矩阵亏秩引起的困难。在实际应用中 。

关键词 迭代目标转换因子分析法 光度分析

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