目的:筛选胃癌血清差异表达蛋白,寻找胃癌血清标志物.方法:采集胃癌患者血清和正常对照人群血清各45例,所有血清样本去除高丰度血清蛋白质后,采用相对和绝对定量同位素标志(isobaric tags for relative and absolute q u a n t i t a t ...目的:筛选胃癌血清差异表达蛋白,寻找胃癌血清标志物.方法:采集胃癌患者血清和正常对照人群血清各45例,所有血清样本去除高丰度血清蛋白质后,采用相对和绝对定量同位素标志(isobaric tags for relative and absolute q u a n t i t a t i o n,i T R A Q)技术联合二维液相色谱-串联质谱(two-dimensional liquid chromatography/tandem mass spectrometry,2D-LC-MS/MS)分析和鉴定两组间的差异表达蛋白;采用生物信息学对差异蛋白进行分析;用Western blot对蛋白组中的代表性血清差异表达蛋白进行表达验证.结果:iTRAQ标记联合2D-LC-MS/MS分析一共鉴定出10540条独特肽段,对应199个非冗余蛋白,其中符合条件的差异蛋白17个,其中12个蛋白在胃癌患者中表达上调,5个蛋白在胃癌患者中表达下调.17种差异表达蛋白参与10种生物学过程、9种分子作用和2种细胞组分,涉及的5个生物代谢途径.Western blot结果显示,与正常对照人群相比,代表性差异表达蛋白ITIH4在胃癌患者血清中表达量上调,差异具有统计学意义(1.7517±0.247 vs 1±0,P<0.05).结论:ITIH4可能是诊断胃癌新的潜在生物标志物.展开更多
文摘目的:筛选胃癌血清差异表达蛋白,寻找胃癌血清标志物.方法:采集胃癌患者血清和正常对照人群血清各45例,所有血清样本去除高丰度血清蛋白质后,采用相对和绝对定量同位素标志(isobaric tags for relative and absolute q u a n t i t a t i o n,i T R A Q)技术联合二维液相色谱-串联质谱(two-dimensional liquid chromatography/tandem mass spectrometry,2D-LC-MS/MS)分析和鉴定两组间的差异表达蛋白;采用生物信息学对差异蛋白进行分析;用Western blot对蛋白组中的代表性血清差异表达蛋白进行表达验证.结果:iTRAQ标记联合2D-LC-MS/MS分析一共鉴定出10540条独特肽段,对应199个非冗余蛋白,其中符合条件的差异蛋白17个,其中12个蛋白在胃癌患者中表达上调,5个蛋白在胃癌患者中表达下调.17种差异表达蛋白参与10种生物学过程、9种分子作用和2种细胞组分,涉及的5个生物代谢途径.Western blot结果显示,与正常对照人群相比,代表性差异表达蛋白ITIH4在胃癌患者血清中表达量上调,差异具有统计学意义(1.7517±0.247 vs 1±0,P<0.05).结论:ITIH4可能是诊断胃癌新的潜在生物标志物.
