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题名大麦籽粒β-葡聚糖含量的全基因组关联分析
被引量：6
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作者
耿腊
黄业昌
李梦迪
谢尚耿
叶玲珍
张国平
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机构
浙江大学作物科学研究所
温州科技职业学院
浙江大学新农村发展研究院
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出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第7期1205-1214,共10页
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基金
浙江省自然科学基金项目(LGN20C130007)
国家自然科学基金项目(31701411)
国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-05)资助。
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文摘
葡聚糖是大麦籽粒的一个重要品质性状,其含量高低影响大麦啤用、饲用和食用品质。虽然有关大麦β-葡聚糖合成的相关基因已有报道,但关于大麦籽粒β-葡聚糖积累的遗传调控机制仍不十分清楚。本研究以前期收集的全球119份大麦基因型为材料,种植在土壤与气候条件有一定差异的两试点,利用混合线性模型(MLM)和一般线性模型(GLM)对不同大麦材料籽粒β-葡聚糖含量进行GWAS分析。结果表明,大麦籽粒β-葡聚糖含量的基因型差异显著,其在2个环境下的广义遗传力为73.9%。利用MLM和GLM模型分别检测到8个和40个显著位点,合并2个模型重叠位点后共得到44个显著位点,其中HORVU5Hr1G022710基因在2个模型、2个地点均被鉴定到,故被认为是与β-葡聚糖含量显著相关的候选基因。2个模型中最佳等位基因数与β-葡聚糖含量均呈显著正相关。此外,基于基因注释,共鉴定到10个与糖合成、转运及分解相关的酶类基因,这些基因可能与籽粒中β-葡聚糖的合成、积累和分解紧密相关。本研究结果为阐明β-葡聚糖的遗传调控机制提供了新的视角,亦为大麦籽粒β-葡聚糖的遗传改良奠定了一定的理论基础。
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关键词
大麦
Β-葡聚糖
全基因组关联分析
SNP位点
最佳等位基因
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Keywords
barley
β-glucan
genome-wide association study(GWAS)
SNP loci
favorable allele
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分类号
S512.3
[农业科学—作物学]
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