基于分子对接及动力学模拟的红曲橘霉素合成小分子抑制剂的高通量筛选

1

作者 李居行 葛佳琦 +6 位作者 张志宇 何苗 崔萌菲 郭庆彬 李贞景 王昌禄 刘欢欢 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第17期52-62,共11页

通过计算机模拟技术,对红曲橘霉素合成关键酶CitE的抑制剂进行高通量筛选。首先,采用Alphafold 2对CitE蛋白进行同源建模,并与相似序列比对以预测配体结合区域;随后,在Arthor数据库中检索天然配体和黄酮骨架类似物,构建了一个包含20000... 通过计算机模拟技术,对红曲橘霉素合成关键酶CitE的抑制剂进行高通量筛选。首先,采用Alphafold 2对CitE蛋白进行同源建模,并与相似序列比对以预测配体结合区域;随后,在Arthor数据库中检索天然配体和黄酮骨架类似物,构建了一个包含20000个化合物的配体库;之后,通过Maestro对CitE蛋白和小分子化合物库进行分子对接,筛选出潜在的CitE配体;并采用Gromacs动力学模拟评估结合稳定性,通过MM/PBSA计算结合自由能,之后对蛋白-配体的结合模式进行分析,进一步确定了槲皮素、木犀草素、芹菜素、染料木素、5,4’-二羟基黄酮、漆黄素6个小分子配体具有较强的CitE结合性能。固态及液态发酵结果表明,上述化合物具有显著的橘霉素抑制活性。其中,固态发酵(20mg/28g干物料)添加上述化合物分别使橘霉素产量降低42.52%、48.81%、32.54%、32.57%、21.02%和13.67%,液态发酵添加(0.1 g/L)上述化合物分别使橘霉素产量降低33.77%、15.58%、33.33%、62.34%、58.87%、50.22%。本研究对建立高效、安全的红曲发酵体系具有借鉴意义。 展开更多

关键词 红曲霉 橘霉素 抑制剂 分子对接 分子动力学模拟 CitE

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利用海底磁场观测数据估算海浪运动方向 被引量：1

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作者 潘林冬 李予国 葛佳琦 《中国海洋大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期132-140,共9页

本文提出一种利用海底磁场观测数据获得海浪运动方向信息的方法。首先,基于电磁感应原理,推导出海底地形水平条件下三维海浪感应磁场表达式,据此可以计算海浪感应磁场,并可以得到海浪感应磁场方向。理论分析表明,海浪感应磁场的方向与... 本文提出一种利用海底磁场观测数据获得海浪运动方向信息的方法。首先,基于电磁感应原理,推导出海底地形水平条件下三维海浪感应磁场表达式,据此可以计算海浪感应磁场,并可以得到海浪感应磁场方向。理论分析表明,海浪感应磁场的方向与海浪运动方向一致,这为利用海浪感应磁场估计海浪运动方向提供了方法理论基础。本文从南黄海海底观测磁场数据中提取了海浪感应磁场,然后采用时频方向谱方法(Spectral-Directionalogram,简称SD)估算出海浪运动方向谱,即海浪运动方向,并与第三代海浪模式WAVEWATCHⅢ的海浪运动方向进行对比。在平潮期内两者吻合较好,误差在10°以内,但在涨落潮时,基于海底磁场数据估计的海浪运动方向谱精度较低。 展开更多

关键词 海浪运动方向 海浪感应磁场 海底磁场 时频方向谱方法

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萧山:从“千万工程”到“共富标杆”的梅林故事

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作者 葛佳琦 《杭州》 2023年第13期71-73,共3页

从“千村示范、万村整治”到“千村精品、万村美丽”,再到开启“千村未来、万村共富”新阶段,20年来,“千万工程”不断迭代升级,万干美丽乡村因这项工程焕发新风采。而作为“千万工程”起笔之处的萧山区瓜沥镇梅林村,从美丽乡村示范地... 从“千村示范、万村整治”到“千村精品、万村美丽”,再到开启“千村未来、万村共富”新阶段,20年来,“千万工程”不断迭代升级,万干美丽乡村因这项工程焕发新风采。而作为“千万工程”起笔之处的萧山区瓜沥镇梅林村,从美丽乡村示范地到未来乡村实践地,不断拓展乡村生活的打开方式,始终走在乡村蝶变的前沿。 展开更多

关键词 美丽乡村 打开方式 共富 瓜沥镇 萧山区 乡村实践 示范

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改进加权投票的PCA-Net多特征融合SSFR

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作者 赵淑欢 葛佳琦 +1 位作者 梁晓林 刘帅奇 《计算机仿真》 北大核心 2023年第4期223-230,共8页

单样本人脸识别是人脸识别在实际应用中面临的挑战性问题之一,虽然深度学习在人脸识别方面取得突破性进展但其性能依赖海量标注性数据,故其在单样本上性能有限。而传统浅层特征对有标注的数据量需求不高,但因单样本数据缺少类内变化其... 单样本人脸识别是人脸识别在实际应用中面临的挑战性问题之一,虽然深度学习在人脸识别方面取得突破性进展但其性能依赖海量标注性数据,故其在单样本上性能有限。而传统浅层特征对有标注的数据量需求不高,但因单样本数据缺少类内变化其性能有限,提出一种改进加权投票的PCA-Net多特征融合算法。在数据集方面,利用LU分解生成虚拟样本扩展数据集;根据PCA-Net特征下样本的相关性细化数据集,实现对数据集初步特征提取和筛选;在细化数据集上提取多LBP特征并与PCA-Net特征进行加权投票。在AR、Extended Yale B、CMU-PIE三个数据库上的实验结果表明,所提方法提高了单样本人脸识别性能。 展开更多

关键词 单样本人脸识别 局部二值模式 虚拟样本 特征融合 加权投票

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浅水区海浪电磁噪声对大地电磁阻抗估计的影响

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作者 潘林冬 李予国 +1 位作者 葛佳琦 吴云具 《地球物理学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2023年第11期4742-4752,共11页

在浅水区海洋大地电磁(MT)勘探中,海浪运动频带范围内(约0.05~0.8 Hz)阻抗估计结果欠佳,这一直是困扰地球物理工作者的难题.本文基于三层海洋地电模型推导了二维和三维海浪运动感应电磁场(简称海浪感应电磁场)表达式,分析了海浪感应电... 在浅水区海洋大地电磁(MT)勘探中,海浪运动频带范围内(约0.05~0.8 Hz)阻抗估计结果欠佳,这一直是困扰地球物理工作者的难题.本文基于三层海洋地电模型推导了二维和三维海浪运动感应电磁场(简称海浪感应电磁场)表达式,分析了海浪感应电磁场的平面波传播特性.借鉴MT场趋肤深度和阻抗的概念,推导出海浪感应电磁场的趋肤深度和阻抗表达式,分析了浅水区海浪感应电磁场和MT场趋肤深度和阻抗的差异.在海底介质中,海浪感应电磁场的衰减速度要比MT场衰减速度大约快2个量级,因而它无法用于探测海底深部电性结构.海浪感应电磁场阻抗幅值比MT阻抗幅值小2~3个量级.海浪感应电噪声强度约为大地电场强度的10%,而海浪感应磁噪声比地球变化磁场大1~2个量级,故海浪感应电噪声对大地电场的影响较小,但海浪感应磁噪声对地球变化磁场的影响较大.海浪感应电磁阻抗相位在-90°(TE模式)和90°(TM模式)附近,偏差小于0.06°,而均匀半空间介质MT阻抗相位为-45°(TE模式)和135°(TM模式).通过引入"复合阻抗"概念,探讨了海浪感应电磁场对海洋MT阻抗估计结果的影响. 展开更多

关键词 浅水区 海浪感应电磁场 MT场 趋肤深度 复合阻抗

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菱和龙葵提取物对致病性细菌的抑制作用 被引量：3

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作者 葛佳琦 《金陵科技学院学报》 2019年第1期88-92,共5页

抗生素是人类健康的卫士,但其使用也产生了一系列的问题,如用量、频次、忽略停药期等。为了解决这些问题,寻求天然的药物控制高发传染性疾病成为当务之急。菱(Trapa bispinosa)和龙葵(Solanum nigrum)是典型的湿地植物,它们具有独特的... 抗生素是人类健康的卫士,但其使用也产生了一系列的问题,如用量、频次、忽略停药期等。为了解决这些问题,寻求天然的药物控制高发传染性疾病成为当务之急。菱(Trapa bispinosa)和龙葵(Solanum nigrum)是典型的湿地植物,它们具有独特的抑菌特性。采用乙醇对菱和龙葵进行活性成分提取,发现菱和龙葵对金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、大肠杆菌(Escherichia coli)、温和气单胞菌(Aeromonas sobria)有较强抑菌作用,可辅助代替抗生素控制传染性疾病,进而减少对抗生素的使用。 展开更多

关键词 抗生素 菱 龙葵 抑菌作用

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基于Wikidata和标签云的搜索算法研究 被引量：1

7

作者 夏瑀 葛佳琦 +2 位作者 马秀 曹际全 李海巍 《软件导刊》 2016年第8期42-46,共5页

知识库是一种结构化、易于操作、有组织的知识集群。针对Wikidata这一开放知识库的内容及结构,提出一种构建标签云的方法,对信息进行标签化处理,并将转换得到的标签向量应用于信息检索和页面排序。首先,提取Wikidata中的结构化数据,构... 知识库是一种结构化、易于操作、有组织的知识集群。针对Wikidata这一开放知识库的内容及结构,提出一种构建标签云的方法,对信息进行标签化处理,并将转换得到的标签向量应用于信息检索和页面排序。首先,提取Wikidata中的结构化数据,构建以实体为单位的标签云;然后,将需要检索的文档和用户的检索语句映射为相应的标签,并采用处理向量的相关方法实现网页的排序算法;最后,采用信息检索常用的标准对该算法进行验证。实验结果表明,与传统的基于关键词的搜索方法相比,新算法在一定程度上能够提高页面排序的准确率。 展开更多

关键词 知识库 Wikidata 网页检索 页面排序 标签云 搜索引擎

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中韩两国古代文化交流的印证——语言学视角 被引量：2

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作者 潘悟云 王奕桦 葛佳琦 《广西师范大学学报（哲学社会科学版）》 2018年第1期76-83,共8页

通过韩语的有关历史音变,提出辨认韩语中汉语上古借词的若干方法,并通过"丝"、"麦"、"力"、"臿"等借词例子,探索中韩两国的古代文化交流。同时,文章还通过历史比较,以同源词"土地"为... 通过韩语的有关历史音变,提出辨认韩语中汉语上古借词的若干方法,并通过"丝"、"麦"、"力"、"臿"等借词例子,探索中韩两国的古代文化交流。同时,文章还通过历史比较,以同源词"土地"为例,论证汉语与韩语的发生学关系。 展开更多

关键词 上古汉语 借词 韩汉同源词 文化交流

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孪生网络模型在多人种人脸认证中的性能研究

9

作者 赵淑欢 葛佳琦 +1 位作者 刘文 刘帅奇 《小型微型计算机系统》 CSCD 北大核心 2022年第2期362-366,共5页

深度学习网络在模式识别领域性能优异,但需要大量有标注样本对网络进行训练,而对于人脸认证情况下训练样本有限,且已有网络模型在不同人种间的性能差异大,往往会导致人脸认证失效.针对以上问题,本文首先在几种预训练深度网模型上构造孪... 深度学习网络在模式识别领域性能优异,但需要大量有标注样本对网络进行训练,而对于人脸认证情况下训练样本有限,且已有网络模型在不同人种间的性能差异大,往往会导致人脸认证失效.针对以上问题,本文首先在几种预训练深度网模型上构造孪生网络,并设计相似度度量网络;其次,选用多人种的人脸数据库(Racial Faces in-the-Wild,RFW)中不同人种构造正负样本对作为训练集,扩展数据分布,提高模型泛化能力,且在训练过程中采用循环训策略练提高模型的稳定性;最后,在测试集上采用ROC曲线及AUC值对不同模型性能进行评估,测试集与训练集样本无身份交叉,根据实验结果得出结论:VGG16作为主干网络的孪生网络模型更适合多人种人脸认证问题,PCANet提取的特征对African地区的人脸认证更有效. 展开更多

关键词 多人种人脸认证 孪生网络 预训练网络 VGG16 PCANet

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无人机在环境污染物监测中应用价值研究

10

作者 葛佳琦 陈宇航 +2 位作者 杨忠 胡文竞 王炜栋 《科技创新导报》 2021年第9期113-115,共3页

现如今,国家对生态文明建设越来越重视,高新技术在生态环境保护领域发挥着重要作用。无人机凭借自身良好的性能和优势,建立一个方位全、领域宽、层次多,覆盖广的环境污染物监控系统。本文对无人机在环境污染物监测中应用价值进行综述,... 现如今,国家对生态文明建设越来越重视,高新技术在生态环境保护领域发挥着重要作用。无人机凭借自身良好的性能和优势,建立一个方位全、领域宽、层次多,覆盖广的环境污染物监控系统。本文对无人机在环境污染物监测中应用价值进行综述,从无人机的选择,无人机在环境监管中的优势以及无人机在水质监测、森林防火、大气污染、船舶污染防治监管中的应用进行阐述,从而为无人机的发展以及在生态环境中的管理应用提供一些参考。 展开更多

关键词 无人机 环境污染物 生态管理 生态环境

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再论方言入声调值的“阴低阳高”现象

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作者 郭承禹 葛佳琦 《南开语言学刊》 2020年第1期30-40,共11页

文章尝试对方言入声调值的“阴低阳高”现象提出新的解释.文章以闽方言、客赣方言、晋方言、江淮官话的入声“阴低阳高”材料为例,归纳了各方言阴、阳入调的共性和差异.并在此基础上探讨了入声音节结构的变化,提出了先天性和后天性两种... 文章尝试对方言入声调值的“阴低阳高”现象提出新的解释.文章以闽方言、客赣方言、晋方言、江淮官话的入声“阴低阳高”材料为例,归纳了各方言阴、阳入调的共性和差异.并在此基础上探讨了入声音节结构的变化,提出了先天性和后天性两种“阴低阳高”的演变机制,最后阐释了入声“阴低阳高”调值特征从单字调扩散至连读调的过程. 展开更多

关键词 方言 入声 调值 “阴低阳高”

原文传递

信息技术纳入课堂教学态度的研究

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作者 朱洁璇 葛佳琦 《科技创新导报》 2020年第34期216-218,共3页

随着全球信息化环境的压力,将信息和通信技术融入学校、课堂已成为了全世界不可避免的趋势,这不仅要求学校要配备计算机等相关设备,还必须同时对其发展进行研究分析,以指导我们来进行教育变革。本文从信息社会中的通信技术、信息和通信... 随着全球信息化环境的压力,将信息和通信技术融入学校、课堂已成为了全世界不可避免的趋势,这不仅要求学校要配备计算机等相关设备,还必须同时对其发展进行研究分析,以指导我们来进行教育变革。本文从信息社会中的通信技术、信息和通信技术融入课堂、信息技术引入课堂教育的情感态度等三个方面综述,使得积极的信息化教育得到高度重视,并将促进中国的教育改革。 展开更多

关键词 信息技术 课堂教育 情感态度 教育改革

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满语中的朝鲜语汉字音汉源词研究

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作者 王奕桦 葛佳琦 《民族语文》 CSSCI 北大核心 2019年第1期43-54,共12页

满语中有部分汉语借词所反映的汉字读音体现出朝鲜语汉字音所特有的历史音变规律,与朝鲜语汉字音有比较严密的对应关系。文章确认这些词反映的汉字读音构成一个与朝鲜语汉字音高度相似的汉字音系统。我们推测这部分借词很有可能是通过... 满语中有部分汉语借词所反映的汉字读音体现出朝鲜语汉字音所特有的历史音变规律,与朝鲜语汉字音有比较严密的对应关系。文章确认这些词反映的汉字读音构成一个与朝鲜语汉字音高度相似的汉字音系统。我们推测这部分借词很有可能是通过朝鲜语这一媒介借入满语的。 展开更多

关键词 朝鲜语汉字音 满语汉字音 语言接触

原文传递