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题名芍药等8种植物COMT基因的生物信息学分析
被引量：3
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作者
许聪
石文波
高天祥
胡蕴钰
陶俊
赵大球
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机构
扬州大学园艺与植物保护学院
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出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第8期2468-2474,共7页
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基金
国家自然科学基金(31972448
31772341)
+2 种基金
江苏省科协青年科技人才托举工程
扬州大学研究生科研创新计划(XKYCX19_114)
扬州大学大学生科创基金(X20190595)共同资助。
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文摘
植物咖啡酸-O-甲基转移酶(caffeic acid O-methyltransferase,COMT)基因对木质素的合成具有重要的调控作用。本研究采用生物信息学方法对芍药等8种植物COMT基因编码的氨基酸序列进行比对,进而对其蛋白理化性质、信号肽、跨膜结构域、磷酸化位点、亚细胞定位、二级结构与三级结构进行了预测与分析。结果表明,芍药等8种植物COMT基因编码氨基酸的一致性可达65.91%,平均相对分子量为39437.79 Da,带有酸性等电点,含量最丰富的氨基酸为亮氨酸(Leu)和丙氨酸(Ala),无信号肽,无跨膜结构域,磷酸化位点数量最多的为丝氨酸和苏氨酸,定位于细胞骨架和细胞质中可能性最大,二级结构则以α-螺旋和无规则卷曲为主,三维结构具有一定的相似性。这一结果为今后深入开展植物COMT基因功能研究提供了科学依据。
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关键词
芍药
咖啡酸-O-
甲基转移酶
生物信息学
木质素
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Keywords
Herbaceous peony
Caffeic acid O-methyltransferase
Bioinformatics
Lignin
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分类号
S682.12
[农业科学—观赏园艺]
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题名芍药花茎强度与褪黑素含量的关系分析
被引量：1
- 2
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作者
石文波
高天翔
胡蕴钰
许聪
陶俊
赵大球
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机构
扬州大学园艺与植物保护学院
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出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2021年第4期632-639,共8页
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基金
国家自然科学基金(31772341,31972448)
江苏省科协青年科技人才托举工程
+1 种基金
扬州大学研究生科研创新计划(XKYCX19_114)
扬州大学大学生科创基金(X20190595)。
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文摘
花茎挺直程度是影响芍药切花品质的重要指标,而花茎强度是衡量茎秆挺直程度的物理学标准。为了明确芍药花茎强度与褪黑素含量的关系,以高、低花茎强度的2组芍药品种为材料,测定了花茎强度、植株形态指标、植株光合参数、花茎木质素含量和褪黑素含量。结果表明:与低花茎强度芍药品种相比,高花茎强度芍药品种具有较高的茎粗、茎质量、光合能力、木质素含量和褪黑素含量,并且花茎强度与褪黑素含量之间呈正相关,两者均与木质素含量达显著正相关,表明褪黑素可能通过调控木质素合成来间接影响花茎强度,这为芍药花茎强度的调控奠定了理论基础。
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关键词
芍药
花茎强度
褪黑素
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Keywords
herbaceous peony
stem strength
melatonin
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分类号
S682.12
[农业科学—观赏园艺]
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