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桂花OfABFs基因克隆和表达分析
被引量：
1
1
作者
洪方蕾
陆瑶
+4 位作者
俞世姣
胡芷诺
缪
云
锋
钟诗蔚
赵宏波
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期481-491,共11页
【目的】研究OfABFs基因家族成员在桂花‘堰虹桂’Osmanthus fragrans ‘Yanhonggui’不同组织和花开放进程中的表达模式,筛选参与调控花开放的关键成员。【方法】在桂花基因组数据库中筛选出相关OfABFs基因序列,克隆序列全长并对其进...
【目的】研究OfABFs基因家族成员在桂花‘堰虹桂’Osmanthus fragrans ‘Yanhonggui’不同组织和花开放进程中的表达模式,筛选参与调控花开放的关键成员。【方法】在桂花基因组数据库中筛选出相关OfABFs基因序列,克隆序列全长并对其进行生物信息学分析,通过荧光定量PCR分析OfABFs基因在‘堰虹桂’不同组织及花开放进程中的时空表达模式。【结果】筛选得到5条OfABFs基因序列。生物信息学分析得出:桂花OfABFs蛋白具有亲水性,较不稳定,无信号肽段;预测其蛋白二、三级结构具有相似的特性,无规则卷曲和α-螺旋为其结构组成的主要元件;5条OfABFs转录因子均含有bZIP转录因子家族保守结构域。亚细胞定位预测表明:5条OfABFs编码蛋白均定位在细胞核。荧光定量PCR结果表明:OfABF1、OfABF2、OfABF3、OfABF4和OfABF6在桂花中的表达具有组织特异性,其中OfABF1、OfABF4和OfABF6在花中有较高表达。OfABF1在顶壳期被转录激活,表达显著升高;铃梗期后表达水平虽呈下降趋势,但仍保持较高水平。OfABF2的表达在顶壳期到达峰值,且相对表达水平明显高于其他时期。OfABF3、OfABF4和OfABF6在花朵衰老期的相对表达量最高。【结论】OfABF1、OfABF2可能与桂花花开放进程有关,而OfABF3、OfABF4和OfABF6参与调控桂花花朵衰老的可能性较大。图10表4参32。
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关键词
桂花
ABF转录因子
表达分析
花开放
下载PDF
职称材料
桂花OfNAC转录因子鉴定及在花开放阶段的表达分析
被引量：
3
2
作者
缪
云
锋
周丹
+1 位作者
董彬
赵宏波
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第3期433-444,共12页
【目的】研究OfNAC基因对桂花Osmanthus fragrans花开放的调控作用。【方法】从桂花品种‘堰虹桂’O.fragrans ‘Yanhonggui’转录组数据中,筛选获得相关OfNAC基因序列,分析预测其理化性质和结构,运用实时荧光定量PCR技术分析花开放过...
【目的】研究OfNAC基因对桂花Osmanthus fragrans花开放的调控作用。【方法】从桂花品种‘堰虹桂’O.fragrans ‘Yanhonggui’转录组数据中,筛选获得相关OfNAC基因序列,分析预测其理化性质和结构,运用实时荧光定量PCR技术分析花开放过程的表达特性。【结果】筛选得到22条OfNAC序列。生物信息学分析发现:22条OfNAC转录因子均含有NAM结构域,氨基酸序列含有5个保守的亚结构域(A~E),其保守性由强到弱依次为C、A、D、B、E;二级结构中不同结构的占比由大到小表现为无规则卷曲、α-螺旋、延伸链、β-折叠;亚细胞定位及跨膜结构预测表明:OfNAC17、OfNAC17-X2、OfNAC53、OfNAC91、OfNTM1-9是膜结合转录因子,且大多数OfNAC定位在细胞核。在桂花花开放进程中,OfNAC100-2、OfNAC43、OfNAC73相对表达量在铃梗期(S4)到达顶峰,在此之后相对表达降低;OfNAC43在铃梗期(S4)骤然升高,并且在此时期相对表达最大;OfNAC71、OfNAC29-1、OfNAC21/22从起始期(S1)呈缓慢上升趋势,在顶壳期(S3)到达最高,随后整体呈现下降趋势;OfNAC29-2在圆珠期(S2)相对表达量陡然上升,在铃梗期(S4)相对表达最低。【结论】推测OfNAC100-2、 OfNAC43、 OfNAC73、 OfNAC71、 OfNAC29-1、 OfNAC21/22、OfNAC29-2等成员极有可能参与调控桂花的花开放。
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关键词
植物学
桂花
花开放
NAC转录因子
表达分析
下载PDF
职称材料
题名
桂花OfABFs基因克隆和表达分析
被引量：
1
1
作者
洪方蕾
陆瑶
俞世姣
胡芷诺
缪
云
锋
钟诗蔚
赵宏波
机构
浙江农林大学浙江省园林植物种质创新与利用重点实验室
浙江农林大学南方园林植物种质创新与利用国家林业和草原局重点实验室
浙江农林大学风景园林与建筑学院
出处
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期481-491,共11页
基金
国家自然科学基金资助项目(32072615)
浙江省农业新品种选育重大专项(2021C02071-1)
国家级大学生创新创业训练计划项目(202010341024)。
文摘
【目的】研究OfABFs基因家族成员在桂花‘堰虹桂’Osmanthus fragrans ‘Yanhonggui’不同组织和花开放进程中的表达模式,筛选参与调控花开放的关键成员。【方法】在桂花基因组数据库中筛选出相关OfABFs基因序列,克隆序列全长并对其进行生物信息学分析,通过荧光定量PCR分析OfABFs基因在‘堰虹桂’不同组织及花开放进程中的时空表达模式。【结果】筛选得到5条OfABFs基因序列。生物信息学分析得出:桂花OfABFs蛋白具有亲水性,较不稳定,无信号肽段;预测其蛋白二、三级结构具有相似的特性,无规则卷曲和α-螺旋为其结构组成的主要元件;5条OfABFs转录因子均含有bZIP转录因子家族保守结构域。亚细胞定位预测表明:5条OfABFs编码蛋白均定位在细胞核。荧光定量PCR结果表明:OfABF1、OfABF2、OfABF3、OfABF4和OfABF6在桂花中的表达具有组织特异性,其中OfABF1、OfABF4和OfABF6在花中有较高表达。OfABF1在顶壳期被转录激活,表达显著升高;铃梗期后表达水平虽呈下降趋势,但仍保持较高水平。OfABF2的表达在顶壳期到达峰值,且相对表达水平明显高于其他时期。OfABF3、OfABF4和OfABF6在花朵衰老期的相对表达量最高。【结论】OfABF1、OfABF2可能与桂花花开放进程有关,而OfABF3、OfABF4和OfABF6参与调控桂花花朵衰老的可能性较大。图10表4参32。
关键词
桂花
ABF转录因子
表达分析
花开放
Keywords
Osmanthus fragrans
ABF transcription factor
expression analysis
flower opening
分类号
S722.3 [农业科学—林木遗传育种]
下载PDF
职称材料
题名
桂花OfNAC转录因子鉴定及在花开放阶段的表达分析
被引量：
3
2
作者
缪
云
锋
周丹
董彬
赵宏波
机构
浙江农林大学浙江省园林植物种质创新与利用重点实验室
浙江农林大学南方园林植物种质创新与利用国家林业和草原局重点实验室
浙江农林大学风景园林与建筑学院
出处
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第3期433-444,共12页
基金
国家自然科学基金面上项目(32072615)。
文摘
【目的】研究OfNAC基因对桂花Osmanthus fragrans花开放的调控作用。【方法】从桂花品种‘堰虹桂’O.fragrans ‘Yanhonggui’转录组数据中,筛选获得相关OfNAC基因序列,分析预测其理化性质和结构,运用实时荧光定量PCR技术分析花开放过程的表达特性。【结果】筛选得到22条OfNAC序列。生物信息学分析发现:22条OfNAC转录因子均含有NAM结构域,氨基酸序列含有5个保守的亚结构域(A~E),其保守性由强到弱依次为C、A、D、B、E;二级结构中不同结构的占比由大到小表现为无规则卷曲、α-螺旋、延伸链、β-折叠;亚细胞定位及跨膜结构预测表明:OfNAC17、OfNAC17-X2、OfNAC53、OfNAC91、OfNTM1-9是膜结合转录因子,且大多数OfNAC定位在细胞核。在桂花花开放进程中,OfNAC100-2、OfNAC43、OfNAC73相对表达量在铃梗期(S4)到达顶峰,在此之后相对表达降低;OfNAC43在铃梗期(S4)骤然升高,并且在此时期相对表达最大;OfNAC71、OfNAC29-1、OfNAC21/22从起始期(S1)呈缓慢上升趋势,在顶壳期(S3)到达最高,随后整体呈现下降趋势;OfNAC29-2在圆珠期(S2)相对表达量陡然上升,在铃梗期(S4)相对表达最低。【结论】推测OfNAC100-2、 OfNAC43、 OfNAC73、 OfNAC71、 OfNAC29-1、 OfNAC21/22、OfNAC29-2等成员极有可能参与调控桂花的花开放。
关键词
植物学
桂花
花开放
NAC转录因子
表达分析
Keywords
botany
Osmanthus fragrans
flower opening
NAC transcription factor
expression analysis
分类号
S718.3 [农业科学—林学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
桂花OfABFs基因克隆和表达分析
洪方蕾
陆瑶
俞世姣
胡芷诺
缪
云
锋
钟诗蔚
赵宏波
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
下载PDF
职称材料
2
桂花OfNAC转录因子鉴定及在花开放阶段的表达分析
缪
云
锋
周丹
董彬
赵宏波
《浙江农林大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
3
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职称材料
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