利用中药网络药理学和分子对接技术初步探索"清肺排毒汤"抗新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease2019,COVID-19)作用机制。结合中国药典(2015版)以及中药系统药理学数据库及分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems P...利用中药网络药理学和分子对接技术初步探索"清肺排毒汤"抗新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease2019,COVID-19)作用机制。结合中国药典(2015版)以及中药系统药理学数据库及分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology,TCMSP)、OMIM(Online Mendelian Inheritance in Man)、GeneCard、STRING等在线数据库,进行一系列网络构建、核心靶点筛选以及信号通路富集分析,最后对重要化合物进行分子对接预测。结果发现,清肺排毒汤化合物-肺炎靶点网络包含292个化合物和相应靶点214个,核心靶点涉及AKT1(AKT serine/threonine kinase 1)、IL6(interleukin 6)、MAPK8(mitogen-activated protein kinase 8)、MAPK1(mitogen-activated protein kinase 1)和JUN(jun proto-oncogene)等。应用GO(Gene Ontology)数据库功能富集分析得到858个GO条目,应用KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库富集筛选得到122条有关通路,其中包含低氧诱导因子-1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)通路、Toll样受体(Toll-like receptors,TLRs)通路等已报道与肺炎相关的通路,也包括T细胞受体(T-cell receptor,TCR)通路等与肺损伤保护相关的通路。分子对接结果显示,清肺排毒汤中药材部分核心化合物对新型冠状病毒(2019-nCoV)的3C类似蛋白酶(3C-like protease,3CLpro)和血管紧张素转换酶2(angiotensin-converting enzyme 2,ACE2)蛋白具有一定的亲和力。本文初步探索了清肺排毒汤抗COVID-19的作用机制,且预测了其药效物质基础,期待本结果能为进一步确证清肺排毒汤抗COVID-19有效成分和作用机制提供帮助。展开更多
文摘利用中药网络药理学和分子对接技术初步探索"清肺排毒汤"抗新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease2019,COVID-19)作用机制。结合中国药典(2015版)以及中药系统药理学数据库及分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology,TCMSP)、OMIM(Online Mendelian Inheritance in Man)、GeneCard、STRING等在线数据库,进行一系列网络构建、核心靶点筛选以及信号通路富集分析,最后对重要化合物进行分子对接预测。结果发现,清肺排毒汤化合物-肺炎靶点网络包含292个化合物和相应靶点214个,核心靶点涉及AKT1(AKT serine/threonine kinase 1)、IL6(interleukin 6)、MAPK8(mitogen-activated protein kinase 8)、MAPK1(mitogen-activated protein kinase 1)和JUN(jun proto-oncogene)等。应用GO(Gene Ontology)数据库功能富集分析得到858个GO条目,应用KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库富集筛选得到122条有关通路,其中包含低氧诱导因子-1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)通路、Toll样受体(Toll-like receptors,TLRs)通路等已报道与肺炎相关的通路,也包括T细胞受体(T-cell receptor,TCR)通路等与肺损伤保护相关的通路。分子对接结果显示,清肺排毒汤中药材部分核心化合物对新型冠状病毒(2019-nCoV)的3C类似蛋白酶(3C-like protease,3CLpro)和血管紧张素转换酶2(angiotensin-converting enzyme 2,ACE2)蛋白具有一定的亲和力。本文初步探索了清肺排毒汤抗COVID-19的作用机制,且预测了其药效物质基础,期待本结果能为进一步确证清肺排毒汤抗COVID-19有效成分和作用机制提供帮助。
