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基于关联规则挖掘的蛋白质相互作用的预测
1
作者
林
合同
龚云路
+2 位作者
秦殿刚
冯铁男
王翼飞
《上海大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期265-270,共6页
利用蛋白质的一级结构信息,采用三肽频数方法刻画蛋白质序列,将关联规则(association rule,AR)挖掘应用于蛋白质相互作用(protein-protein interactions,PPIs)的预测.计算结果表明,提出的方法在半胱氨酸不同分类的情况下都能够准确地预...
利用蛋白质的一级结构信息,采用三肽频数方法刻画蛋白质序列,将关联规则(association rule,AR)挖掘应用于蛋白质相互作用(protein-protein interactions,PPIs)的预测.计算结果表明,提出的方法在半胱氨酸不同分类的情况下都能够准确地预测蛋白质相互作用.最后,比较半胱氨酸的不同分类对预测结果的影响.
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关键词
关联规则挖掘
蛋白质相互作用
序列编码
氨基酸分类
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职称材料
题名
基于关联规则挖掘的蛋白质相互作用的预测
1
作者
林
合同
龚云路
秦殿刚
冯铁男
王翼飞
机构
上海大学理学院
出处
《上海大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期265-270,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(30871341)
上海市重点学科建设资助项目(S30104)
上海市教委重点学科建设资助项目(J50101)
文摘
利用蛋白质的一级结构信息,采用三肽频数方法刻画蛋白质序列,将关联规则(association rule,AR)挖掘应用于蛋白质相互作用(protein-protein interactions,PPIs)的预测.计算结果表明,提出的方法在半胱氨酸不同分类的情况下都能够准确地预测蛋白质相互作用.最后,比较半胱氨酸的不同分类对预测结果的影响.
关键词
关联规则挖掘
蛋白质相互作用
序列编码
氨基酸分类
Keywords
association rule mining
protein-protein interactions （PPIs）
sequential coding
classification of amino acids
分类号
Q516 [生物学—生物化学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于关联规则挖掘的蛋白质相互作用的预测
林
合同
龚云路
秦殿刚
冯铁男
王翼飞
《上海大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2012
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职称材料
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