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黑麦MIKC型MADS-box家族基因的鉴定和表达分析
1
作者 汪凯旋 车永和 +3 位作者 杨赟杰 杨静 杨燕萍 魏莱 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期46-55,共10页
MIKC是MADS-box蛋白家族中一类保守的转录因子家族,参与调控植物的开花时间和花器官发育。通过对黑麦MIKC基因家族的分析,为研究黑麦各时期组织器官的功能奠定基础。利用PFam和BLASTP两种方法确定黑麦MIKC家族共47个蛋白序列,将以上蛋... MIKC是MADS-box蛋白家族中一类保守的转录因子家族,参与调控植物的开花时间和花器官发育。通过对黑麦MIKC基因家族的分析,为研究黑麦各时期组织器官的功能奠定基础。利用PFam和BLASTP两种方法确定黑麦MIKC家族共47个蛋白序列,将以上蛋白序列利用TBtools软件进行理化性质、进化关系、保守基序和基因结构、共线性及聚类分析等生物信息学分析。将黑麦47个MIKC基因分为12个亚家族,共线性分析发现黑麦与小麦的共线性基因多于黑麦与水稻间的共线性基因,说明黑麦与小麦的亲缘关系更近。聚类结果结合黑麦物种内共线性分析发现,ScMIKC31基因仅在穗子表达,于其他植物组织器官及发育时期均无表达,选用课题组材料进行RNA-seq验证,结果与生物信息学结果一致,推测ScMIKC31基因为黑麦中与开花有关的基因。以上结果说明MIKC家族基因在黑麦中存在功能分化,为进一步研究该家族基因的功能提供信息参考。 展开更多
关键词 生长因子 黑麦 进化分析 表达分析 MIKC基因
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黑麦GIF基因家族全基因组鉴定及其表达分析 被引量：1
2
作者 杨赟杰 苗涵 +2 位作者 魏莱 杨燕萍 车永和 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期696-704,共9页
生长调节互作因子(GRF-interacting factor,GIF)是植物体内一类转录共激活因子,在植物生长发育过程中起重要作用。为挖掘和利用黑麦GIF家族基因,利用同源比对方法对黑麦GIF基因家族进行了鉴定,并系统分析了黑麦与其他禾本科植物及模式... 生长调节互作因子(GRF-interacting factor,GIF)是植物体内一类转录共激活因子,在植物生长发育过程中起重要作用。为挖掘和利用黑麦GIF家族基因,利用同源比对方法对黑麦GIF基因家族进行了鉴定,并系统分析了黑麦与其他禾本科植物及模式植物拟南芥GIF基因的系统发育关系、蛋白结构域、基因结构和共线性关系。结果显示,在黑麦基因组中共鉴定到3个GIF基因家族成员,分布在4R和5R染色体上;系统进化分析发现,黑麦GIF基因家族成员与小麦和大麦的亲缘关系更近。蛋白结构域和基因结构分析发现,GIF基因家族成员在黑麦及其他禾本科植物中的蛋白结构域和基因结构相对保守,均含有4个外显子。共线性分析发现,黑麦ScGIF1基因与其他禾本科植物GIF基因间均存在共线性关系,其中与小麦间共线基因数最多。Ka/Ks分析发现,黑麦GIF基因家族成员在进化中受到纯化选择。此外,在黑麦穗部鉴定到一个特异性高表达的GIF基因(ScGIF1),其编码的蛋白含有多个磷酸化位点,推测ScGIF1蛋白可能是通过磷酸化来调控黑麦麦穗的发育和粒型的。 展开更多
关键词 黑麦 GIF基因家族 生物信息学分析
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黑麦全基因组GRF基因家族的鉴定和表达分析
3
作者 杨静 杨赟杰 +3 位作者 汪凯旋 杨燕萍 魏莱 车永和 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期1933-1942,共10页
生长调节因子(growth-regulating factor,GRF)已被证实在植物生长发育和响应非生物胁迫中具有重要的调控功能。本研究从黑麦全基因组中鉴定出14个黑麦GRF基因家族成员,并进行了理化参数、基因结构、进化以及表达等分析。结果表明黑麦GR... 生长调节因子(growth-regulating factor,GRF)已被证实在植物生长发育和响应非生物胁迫中具有重要的调控功能。本研究从黑麦全基因组中鉴定出14个黑麦GRF基因家族成员,并进行了理化参数、基因结构、进化以及表达等分析。结果表明黑麦GRF基因分布在第2、4、5和6条染色体上;氨基酸序列范围为214~609 aa,等电点范围为4.72~9.77;系统发育分析将黑麦、拟南芥、小麦、大麦和水稻的GRF基因分为6个亚家族;进化分析表明黑麦GRF基因种内有一对串联重复基因对,黑麦与小麦进化关系较水稻更近;磷酸化分析表明,黑麦GRF蛋白中存在大量潜在的磷酸化位点;表达分析表明,ScGRF10和ScGRF14可能在低温以及干旱胁迫的响应中发挥重要作用。该研究为进一步探索黑麦GRF基因在黑麦生长发育、低温和干旱响应中的潜在功能提供依据。 展开更多
关键词 黑麦 GRF基因家族 进化分析 表达分析
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近似时间最优的舵机多模位置控制策略 被引量：4
4
作者 杨赟杰 朱纪洪 和阳 《控制理论与应用》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第4期468-474,共7页
高超声速飞行器要求其伺服作动系统具有高动态高精度的特性,针对传统控制方法难以兼顾系统动态和精度的难题,本文设计了一种近似时间最优的舵机多模位置控制策略.首先建立了以一阶惯性环节串联积分器表征舵机输入输出特性的特征模型.然... 高超声速飞行器要求其伺服作动系统具有高动态高精度的特性,针对传统控制方法难以兼顾系统动态和精度的难题,本文设计了一种近似时间最优的舵机多模位置控制策略.首先建立了以一阶惯性环节串联积分器表征舵机输入输出特性的特征模型.然后以相平面为分析工具,给出了其近似时间最优控制的切换区;在切换区外以快速性为目标而采用bang-bang最优控制,在切换区内以避免振荡和超调为目标而采用bang-bang次优控制;为提高稳态性能,在小误差时时采用线性控制.实验表明,该方法响应快速,避免了振荡和超调,很好地满足了对伺服作动系统高动态高精度的要求. 展开更多
关键词 伺服作动系统 特征模型 一阶惯性环节 最大值原理 时间最优 切换区
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黑麦种间杂交F_(1)代农艺性状的相关、通径及聚类分析
5
作者 杨赟杰 魏莱 +2 位作者 温晓蕾 杨燕萍 车永和 《江苏农业科学》 北大核心 2022年第24期94-99,共6页
通过分析黑麦属(Secale L.)植物主要农艺性状间的关系,筛选具有优异农艺性状的种质资源,为麦类作物育种改良提供参考,以新疆杂草黑麦(S.cereale subsp.segetale)和栽培黑麦(S.secale L.)杂交F_(1)代为材料,对群体356个单株的14个主要农... 通过分析黑麦属(Secale L.)植物主要农艺性状间的关系,筛选具有优异农艺性状的种质资源,为麦类作物育种改良提供参考,以新疆杂草黑麦(S.cereale subsp.segetale)和栽培黑麦(S.secale L.)杂交F_(1)代为材料,对群体356个单株的14个主要农艺性状进行调查和数据分析。结果表明,356个单株在14个农艺性状上均表现出明显的遗传变异(7.16%~50.73%),单株产量、生物学产量和有效穗数的变异系数分别达到了50.73%、48.68%和44.77%。相关及通径分析表明,对黑麦千粒质量性状影响最大的是单穗粒质量(r=0.534,P<0.01),直接通径系数为1.348,穗粒数对千粒质量有着制约的关系(r=-0.121,P<0.05),直接通径系数为-1.130。聚类分析在平方欧氏距离为14处将群体材料分成3大类群,其中第1类有着最多的每穗小穗数;第3类有最多有效穗数,并具备穗最长,穗质量最大,粒大、粒多和粒质量高等优异性状;可根据育种目标选择用作饲草和麦类遗传育种的优质种质资源。 展开更多
关键词 新疆杂草黑麦 农艺性状 F_(1)群体 相关分析 聚类分析
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