鸡粪-堆肥中重金属残留、抗生素耐药基因及细菌群落变化研究 被引量：15

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作者 邓雯文 陈姝娟 +5 位作者 何雪萍 晋蕾 杨盛智 余秀梅 刘书亮 邹立扣 《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期439-450,共12页

研究鸡粪及其堆肥过程中养分变化、重金属残留、抗生素耐药基因消减情况以及细菌群落演替规律,探讨细菌菌群与养分、重金属、抗生素耐药基因之间的相关性。采集鸡粪及其堆肥过程样品,测定样品中养分、重金属含量,检测抗生素耐药基因相... 研究鸡粪及其堆肥过程中养分变化、重金属残留、抗生素耐药基因消减情况以及细菌群落演替规律,探讨细菌菌群与养分、重金属、抗生素耐药基因之间的相关性。采集鸡粪及其堆肥过程样品,测定样品中养分、重金属含量,检测抗生素耐药基因相对丰度,采用16S rRNA高通量测序技术研究鸡粪堆肥过程细菌群落变化。从鲜鸡粪(组FM)到二次发酵(组SC),样品中有机质含量下降,全氮和全磷含量有不同程度增加,全钾及pH值显著升高(P<0.05)。重金属在不同组中的浓度呈波动变化,与组FM相比,在组SC中砷(As)、镉(Cd)浓度升高,铜(Cu)、锰(Mn)、铅(Pb)浓度下降,其中锌(Zn)下降显著(P<0.05)。堆肥后,抗生素耐药基因aac(6′)-Ib-cr、tet M(P<0.05)、erm B(P<0.05)和bla CTX-M(P<0.05)的相对丰度呈现不同程度的下降,而基因sul1相对丰度增加。高通量测序结果表明,在门水平,各组均以Firmicutes、Proteobacteria和Bacteroidetes 3个菌门为主。在属水平,各组具有不同的优势物种,同时潜在病原菌属的相对丰度均随堆肥过程降低。通过相关性分析发现,大部分优势菌属与全磷、pH值、重金属Cr及耐药基因sul1、tet M、erm B和bla CTX-M有显著相关性(P<0.05)。鸡粪经堆肥后可降低病原菌及抗生素耐药基因相对丰度,但仍存在一定风险,该研究可为实际生产中鸡粪的高效、安全堆肥处理提供参考。 展开更多

关键词 鸡粪 堆肥 细菌群落 重金属 抗生素耐药基因

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鸡蛋生产链中沙门氏菌对抗生素及消毒剂的耐药性研究 被引量：13

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作者 杨盛智 吴国艳 +3 位作者 龙梅 邓雯文 王红宁 邹立扣 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期948-956,共9页

为研究鸡蛋生产链中沙门氏菌的污染情况及抗生素、消毒剂耐药情况,本文鉴定了鸡蛋生产链中分离得到的111株沙门氏菌（Salmonella）血清型,并测定了抗生素和消毒剂对沙门氏菌的最小抑菌浓度（Minimum inhibitory concentrations,MICs）,... 为研究鸡蛋生产链中沙门氏菌的污染情况及抗生素、消毒剂耐药情况,本文鉴定了鸡蛋生产链中分离得到的111株沙门氏菌（Salmonella）血清型,并测定了抗生素和消毒剂对沙门氏菌的最小抑菌浓度（Minimum inhibitory concentrations,MICs）,检测了其对抗生素和消毒剂的耐药基因的表达情况。研究结果表明,沙门氏菌对甲氧苄啶（Trimethoprim,TMP）耐药率最高（N=100,P=90.09%）,对阿莫西林/克拉维酸（Amoxicillin and clavulanate,AMC）、头孢噻呋钠（Sodium ceftiofur,CFS）、庆大霉素（Gentamicin,CN）敏感。沙门氏菌共产生6种不同的耐药谱型,TMP是最主要的耐药谱型（N=36,P=32.43%）,52.25%的菌株（N=58）具有多重耐药性。苯扎氯铵（Benzalkonium chloride,BC）与氯化十六烷基吡啶（Cetylpyridinium chloride,CPC）对沙门氏菌的MIC的范围分别为：8～128μg/m L、8～256μg/m L。相对于质控菌株Escherichia coli ATCC10536,101株沙门氏菌对BC和CPC同时具有较高的耐药性（P=90.99%）,109株沙门氏菌对抗生素和消毒剂具有共同耐药性（P=98.20%）。抗生素耐药基因检出率最高为bla TEM（N=49,P=44.14%）,未检测出qnr A、qnr B、qep A基因,仅检测出qac EΔ1消毒剂耐药基因（N=63,P=56.76%）。抗生素耐药基因sul1和消毒剂耐药基因qac EΔ1具有显著相关性（P〈0.01）。S.Derby对TMP、土霉素（Oxytetracycline,OTC）、阿莫西林（Amoxicillin,AML）、环丙沙星（Ciprofloxacin,CIP）同时表现较高的耐药性,S.Derby检出了11种抗生素耐药基因,消毒剂耐药基因qac EΔ1的检出率为81.25%（N=52）。鸡场中养殖内环境沙门氏菌对抗生素和消毒剂的耐药率以及耐药基因检出率均高于养殖外环境,鸡蛋包装、储存及销售等环节中沙门氏菌耐药率及耐药基因检出率均较高。由此可见,鸡蛋生产链中沙门氏菌对抗生素、消毒剂耐药性较严重,且存在共同耐药的现象。因此,需要进一步规范防� 展开更多

关键词 沙门氏菌 抗生素 消毒剂 耐药性 鸡蛋生产链

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提壶揭盖法治疗肾性水肿的研究进展 被引量：8

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作者 杨盛智 吕静 《实用中医内科杂志》 2021年第5期37-39,共3页

肾性水肿是因各种因素导致肾脏损伤,脏腑功能失调,导致津液运行障碍,以致水湿停聚,泛溢人体各部而形成以水肿为主证的疾病。肺肾关系密切,共同维持人体内的正常水液代谢。当肺肾功能失调时,水液输布、排泄功能不能正常进行,水湿留在体内... 肾性水肿是因各种因素导致肾脏损伤,脏腑功能失调,导致津液运行障碍,以致水湿停聚,泛溢人体各部而形成以水肿为主证的疾病。肺肾关系密切,共同维持人体内的正常水液代谢。当肺肾功能失调时,水液输布、排泄功能不能正常进行,水湿留在体内,发为水肿。提壶揭盖法是一种特色的中医治疗方法,通过开上焦以通下焦。应用提壶揭盖法治疗肾性水肿在临床应用广泛,疗效显著。文章旨在研究进展进行讨论,为其应用提供理论支持。 展开更多

关键词 肾性水肿 提壶揭盖 研究进展

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大熊猫源致病大肠杆菌CCHTP全基因组测序及耐药和毒力基因分析 被引量：8

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作者 邓雯文 李才武 +7 位作者 赵思越 李仁贵 何永果 吴代福 杨盛智 黄炎 张和民 邹立扣 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期1138-1147,I0004,共11页

致病性大肠杆菌是引起动物泌尿系统感染的重要病原菌,本研究对泌尿生殖道感染出现潜血的大熊猫尿液中分离的一株致病性大肠杆菌(Escherichia coli CCHTP)进行全基因组测序,检测其中耐药基因和毒力因子的情况,同时对基因岛上耐药和毒力... 致病性大肠杆菌是引起动物泌尿系统感染的重要病原菌,本研究对泌尿生殖道感染出现潜血的大熊猫尿液中分离的一株致病性大肠杆菌(Escherichia coli CCHTP)进行全基因组测序,检测其中耐药基因和毒力因子的情况,同时对基因岛上耐药和毒力基因及其基因环境进行研究。研究发现,大肠杆菌CCHTP中存在多种类型的耐药基因,其中外排泵系统基因数量最多,包括mdf A、emr E和mdt N等介导多重耐药外排泵的基因。此外,该菌还携带166种毒力因子及563个相关毒力基因,其中属于黏附与侵袭类的毒力因子及相关基因数量最多。对19个基因岛分析发现,基因岛GIs011和GIs017中各有一段包含耐药和毒力基因的序列,两侧与可移动遗传元件(转座酶和插入序列)相连,这些结构可能介导耐药及毒力基因水平转移。本研究通过全基因组测序分析了大熊猫源致病性大肠杆菌中存在的耐药及毒力基因情况,对大熊猫相关疾病的科学治疗、合理用药有重要意义。 展开更多

关键词 大熊猫 大肠杆菌 全基因组测序 耐药基因 毒力因子

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牛粪发酵过程中抗生素耐药基因及相关菌群组成变化规律 被引量：6

5

作者 邓雯文 杨盛智 +4 位作者 何雪萍 晋蕾 龙梅 陈姝娟 邹立扣 《生态毒理学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期153-163,共11页

随着规模化奶牛养殖迅速发展,牛粪带来的环境污染问题日益严重。实验探究牛粪及其堆肥过程中养分变化、抗生素耐药基因消减情况以及细菌群落演替规律,探讨细菌菌群与养分、抗生素耐药基因之间的相关性。采集牛粪及其堆肥过程样品,测定... 随着规模化奶牛养殖迅速发展,牛粪带来的环境污染问题日益严重。实验探究牛粪及其堆肥过程中养分变化、抗生素耐药基因消减情况以及细菌群落演替规律,探讨细菌菌群与养分、抗生素耐药基因之间的相关性。采集牛粪及其堆肥过程样品,测定样品中养分、检测抗生素耐药基因相对丰度,采用16S rRNA高通量测序技术研究牛粪堆肥过程细菌群落变化。结果表明,从新鲜牛粪(组FM)到发酵牛粪(组C),样品中有机质含量下降,全氮和全磷含量有不同程度增加,全钾(TK)显著升高(P<0.05)。堆肥发酵后,抗生素耐药基因erm B、tet M、bla CTX-M和aac(6′)-Ib-cr的相对丰度呈现不同程度的下降,而基因sul 1相对丰度增加。高通量测序结果表明,在门水平,各组均以Firmicutes、Proteobacteria和Bacteroidetes这3个菌门为主,在属水平,各组具有不同的优势物种,其中发现Bacteroides、Paeniclostridium和Pseudomonas等7个潜在病原菌属的相对丰度在堆肥后有效降低。通过相关性分析发现,潜在病原菌属与基因tet M和sul 1呈显著正相关(P<0.05),此外,大部分优势菌属与养分TK有显著相关性(P<0.05)。研究结果表明,牛粪经堆肥发酵后,病原菌相对丰度有效降低,抗生素耐药基因相对丰度的下降与细菌菌群结构变化存在相关关系。 展开更多

关键词 抗生素耐药基因 病原菌 牛粪 堆肥

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双歧杆菌对慢性腹泻猕猴肠道微生物组的影响 被引量：3

6

作者 宋佳蓉 尚可 +5 位作者 雷光伦 刘旭 杨盛智 胡刚 岳碧松 范振鑫 《四川大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期158-165,共8页

本研究旨在结合高通量测序和平板计数实验探索含活性双歧杆菌(Bifidobacterium spp)的饲料对慢性腹泻猕猴(Macaca mulatta)肠道微生物多样性及其腹泻症状的影响.通过16S rRNA高通量测序对比分析添加双歧杆菌前后饲料的菌群组成,发现添... 本研究旨在结合高通量测序和平板计数实验探索含活性双歧杆菌(Bifidobacterium spp)的饲料对慢性腹泻猕猴(Macaca mulatta)肠道微生物多样性及其腹泻症状的影响.通过16S rRNA高通量测序对比分析添加双歧杆菌前后饲料的菌群组成,发现添加组双歧杆菌的相对丰度显著高于未添加组(P<0.05).向慢性腹泻猕猴投喂该饲料,一个月后收集粪便进行宏基因组测序,并与前期研究获得的未添加组慢性腹泻猕猴和健康猕猴的肠道宏基因组数据对比分析,发现添加组的肠道菌群中乳杆菌(Lactobacillus spp)相对丰度较未添加组显著上调(P<0.05),与健康组无显著差异(P>0.05).最后对饲喂双歧杆菌后好转及持续腹泻猕猴的粪便进行乳杆菌平板计数实验.发现经饲喂,猕猴肠道中乳杆菌数量增加,验证了宏基因组测序分析的结果. 展开更多

关键词 猕猴 双歧杆菌 腹泻 宏基因组 肠道菌群

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蛋鸡场中大肠杆菌对抗生素及消毒剂的耐药性 被引量：4

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作者 杨盛智 吴国艳 +3 位作者 龙梅 邓雯文 王红宁 邹立扣 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期312-317,共6页

为了解蛋鸡场中抗生素、消毒剂的耐药情况,从蛋鸡场的环境(粪便、土壤、水体等)和鸡蛋中分离大肠杆菌,测定7种抗生素和2种季铵盐消毒剂对大肠杆菌的最低抑制浓度(Minimum inhibitory concentration,MIC),检测18种抗生素耐药基因和5种季... 为了解蛋鸡场中抗生素、消毒剂的耐药情况,从蛋鸡场的环境(粪便、土壤、水体等)和鸡蛋中分离大肠杆菌,测定7种抗生素和2种季铵盐消毒剂对大肠杆菌的最低抑制浓度(Minimum inhibitory concentration,MIC),检测18种抗生素耐药基因和5种季铵盐消毒剂耐药基因,并对大肠杆菌进行脉冲场凝胶电泳(Pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)分析.共得到44株大肠杆菌;大肠杆菌对抗生素耐药率为6.82%-90.91%,对土霉素(OTC)耐药率最高,对庆大霉素(CN)耐药率最低,所有大肠杆菌对头孢噻呋钠(CFS)表现敏感,一共产生14种不同的耐药谱型,其中,AMLTMP-OTC是最主要的谱型(N=10,P=23.81%);抗生素耐药基因检出率为2.27%-84.09%,tet C检出率最高,qnr A检出率最低.消毒剂苯扎氯铵(Benzalkonium chloride,BC)、氯化十六烷基吡啶(Cetylpyridinium chloride,CPC)对大肠杆菌的MIC范围分别为8-64μg/m L、4-256μg/m L,仅检测出qac EΔ1耐药基因(N=18,P=40.91%),qac EΔ1阳性大肠杆菌与甲氧苄啶(TMP)耐药表型存在显著相关性(P<0.05);44株大肠杆菌PFGE基因型相似性在32.11%-96.62%之间.本研究表明蛋鸡场中大肠杆菌存在交叉传播的情况,对部分抗生素耐药性严重,同时对消毒剂出现耐药性,应引起足够重视. 展开更多

关键词 大肠杆菌 耐药性 抗生素 消毒剂 蛋鸡场

原文传递

燃料棒相变导热模型开发与污垢传热恶化应用

8

作者 赵鑫海 陈鹏 +2 位作者 贺东钰 厉井钢 杨盛智 《核科学与工程》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期270-277,共8页

污垢材料在堆芯中迁移和沉积,在包壳表面附着有可能引起传热恶化甚至出现燃料棒局部熔化现象。国内自主开发的压水堆燃料棒分析程序BIRCH暂未考虑潜热,保守假定芯块温度超过熔点3 K完全熔化,导致计算得到的芯块熔化份额非常接近放射物... 污垢材料在堆芯中迁移和沉积,在包壳表面附着有可能引起传热恶化甚至出现燃料棒局部熔化现象。国内自主开发的压水堆燃料棒分析程序BIRCH暂未考虑潜热,保守假定芯块温度超过熔点3 K完全熔化,导致计算得到的芯块熔化份额非常接近放射物质释放超标验收准则,且存在陡边效应。为解决程序计算过于保守问题,本文采用固定网格等效热容法开发了燃料棒熔化相变导热模型。相比于焓方法,等效热容法仅需对热容进行特殊处理,对整体程序代码改动较小。但传统等效热容法在跨越相变区时易出现数值不稳定性问题,导致计算结果出错。本文首先对等效热容法数值不稳定性产生的原因进行分析,同时基于能量守恒原则建立预测-修正相变求解算法,改进现有等效热容法,并采用不同边界条件解析解、Stefan精确解和焓方法数值解对改进等效热容法进行验证。计算分析结果表明预测-修正相变算法可提升传统等效热容法计算稳定性,且与Stefan精确解数值误差在5%以内,将其应用到污垢传热恶化事故中可提升现有计算结果安全分析裕量。 展开更多

关键词 熔化相变算法 改进等效热容法 BIRCH 陡边效应

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一株猕猴源唾液乳杆菌对DSS诱导的结肠炎小鼠的影响

9

作者 尚可 杨盛智 +4 位作者 刘旭 宋佳蓉 范振鑫 岳碧松 李静 《四川动物》 北大核心 2023年第3期280-287,共8页

目的基于课题组先前分离获得的一株猕猴Macaca mulatta源唾液乳杆菌Lactobacillus salivarius MK0901,探究该菌对动物结肠炎的影响。方法通过葡聚糖硫酸钠(DSS)构建结肠炎小鼠模型,比较MK0901组(DSS处理+MK0901菌液)、LGG组(DSS处理+LG... 目的基于课题组先前分离获得的一株猕猴Macaca mulatta源唾液乳杆菌Lactobacillus salivarius MK0901,探究该菌对动物结肠炎的影响。方法通过葡聚糖硫酸钠(DSS)构建结肠炎小鼠模型,比较MK0901组(DSS处理+MK0901菌液)、LGG组(DSS处理+LGG菌液)、模型组(DSS处理+无菌生理盐水)和空白对照组(灌胃无菌生理盐水)的生理生化表现和肠道菌群之间的差异。结果与模型组比较,MK0901组的体重增加、脾脏指数下降、结肠组织溃疡程度降低、炎症因子(TNF-α和IL-6)水平显著下降(P<0.01)、肠道菌群结构更趋近于正常水平、肠道细菌多样性和益生性菌群丰度增高。结论MK0901可抑制由DSS诱导产生的炎症反应,改善肠道菌群结构,具有良好的益生性能,是具有开发潜力的益生菌候选菌株,为防治圈养猕猴的溃疡性结肠炎提供了一个潜在的解决方案。 展开更多

关键词 唾液乳杆菌MK0901 益生菌 结肠炎 肠道菌群

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芪蓟肾康汤对AngⅡ诱导人肾小球系膜细胞IL-6、TNF-α表达的影响 被引量：3

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作者 栾佳 吕静 +2 位作者 丁晓欢 杨盛智 马铭悦 《辽宁中医杂志》 CAS 2019年第10期2192-2194,共3页

目的:观察芪蓟肾康汤对AngⅡ诱导的人肾小球系膜细胞白介素-6(IL-6)、人肿瘤坏死因子(TNF-α)表达的影响。进一步探讨芪蓟肾康汤治疗肾小球硬化的作用机制。方法:用血管紧张素Ⅱ(AngⅡ)作为刺激因子,培养人肾小球系膜细胞,使其发生增殖... 目的:观察芪蓟肾康汤对AngⅡ诱导的人肾小球系膜细胞白介素-6(IL-6)、人肿瘤坏死因子(TNF-α)表达的影响。进一步探讨芪蓟肾康汤治疗肾小球硬化的作用机制。方法:用血管紧张素Ⅱ(AngⅡ)作为刺激因子,培养人肾小球系膜细胞,使其发生增殖,采用血清药理学方法制备芪蓟肾康汤和替米沙坦含药血清。将人肾小球系膜细胞分为正常对照组、模型组(AngⅡ组)、西药组(替米沙坦组)、芪蓟肾康汤中药低剂量组、中药中剂量组和中药高剂量组6组;用免疫酶联吸附法(ELISA法)检测IL-6、TNF-α表达的情况。结果:AngⅡ刺激后人系膜细胞中IL-6、TNF-α的表达即明显增高,替米沙坦和不同浓度中药含药血清干预后,IL-6、TNF-α水平显著下降(P <0. 01),其中中药高剂量组最为显著(P <0. 01);中药组和西药组间也有一定差异(P <0. 05)。结论:芪蓟肾康汤可能通过抑制IL-6,TNF-α的表达,抑制炎症反应,最终起到防治肾小球硬化的目的。 展开更多

关键词 芪蓟肾康汤 肾小球系膜细胞 白介素-6 人肿瘤坏死因子

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幼年大熊猫断奶前后肠道微生物与血清生化及代谢物的变化 被引量：2

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作者 晋蕾 邓晴 +8 位作者 李才武 邓雯文 杨盛智 周宇 曾文 冯莉 张和民 何永果 邹立扣 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期1477-1485,共9页

采集3只幼年大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)在断奶前后15 d的粪便(N=24)和血清样品(N=24),基于高通量测序技术、生化和液相色谱-质谱检测,对其肠道菌群、血清生化指标和代谢物质的组成变化进行研究.结果显示,断奶后大熊猫肠道菌群丰富... 采集3只幼年大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)在断奶前后15 d的粪便(N=24)和血清样品(N=24),基于高通量测序技术、生化和液相色谱-质谱检测,对其肠道菌群、血清生化指标和代谢物质的组成变化进行研究.结果显示,断奶后大熊猫肠道菌群丰富度下降,肠道内细菌由Firmicutes变为Proteobacteria为主要门.在细菌属水平,Escherichia-Shigella、Streptococcus、Clostridium、Enterococcus和Lactobacillus的相对丰度显著下降,但Pseudomonas、Leuconostoc和Sphingobacterium则上升(LDA>4).肠道真菌由Ascomycota和Basidiomycota变为Basidiomycota和Zygomycota为主要门.在真菌属水平,Microidium的相对丰度显著下降,但Cystofilobasidium、Guehomyces和Cryptococcus显著上升(P<0.05).此外肌酸激酶和乳酸脱氢酶断奶后显著下降,而总胆红素则上升(P<0.05).断奶前后发现有54个(正模式)和46个(负模式)显著性差异代谢物(P<0.05),如Heme和Allantoic acid等,这些差异物质和肌酸激酶和乳酸脱氢酶有显著相关性(P<0.05).本研究表明断奶后大熊猫肠道中高丰度的纤维素或半纤维素降解菌种类增加,为研究大熊猫肠道微生物对竹子的利用提供数据支撑;肌酸激酶、乳酸脱氢酶和总胆红素可作为大熊猫断奶时健康状况的备选标志生理指标,有助于大熊猫断奶过程中健康状态的维护.(图6表3参43) 展开更多

关键词 幼年大熊猫 断奶 肠道菌群 血清生理指标 血清代谢物质

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β-内酰胺酶耐药基因bla_(OKP)进化及其侧翼序列特征研究

12

作者 邓雯文 龙梅 +1 位作者 杨盛智 邹立扣 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期591-598,共8页

为研究β-内酰胺酶耐药基因bla_(OKP)进化及其侧翼序列情况,本文通过全基因组测序技术对肺炎克雷伯氏菌进行测定,分析了其中bla_(OKP)基因及其侧翼序列的特征,同时与不同亚型的bla_(SHV)侧翼序列进行了对比。研究发现,bla_(OKP)、bla_(S... 为研究β-内酰胺酶耐药基因bla_(OKP)进化及其侧翼序列情况,本文通过全基因组测序技术对肺炎克雷伯氏菌进行测定,分析了其中bla_(OKP)基因及其侧翼序列的特征,同时与不同亚型的bla_(SHV)侧翼序列进行了对比。研究发现,bla_(OKP)、bla_(SHV)基因进化差异明显,分为两个进化支,其中bla_(OKP)分为两个进化亚组(bla_(OKP-A)和bla_(OKP-B))。侧翼序列分析结果表明,bla_(OKP)基因的侧翼序列中无可移动遗传元件,与染色体介导的基因bla_(SHV)的侧翼序列结构相似,但存在差异,主要表现为bla_(OKP)基因的一侧与Kdp C相连,bla_(SHV)基因的一侧与RecF相连并具有ygbN-ygbM-ygbK结构。同时由质粒介导的bla_(SHV)基因的两侧存在多种可移动遗传元件。这些结构差异可能是导致bla_(OKP)耐药基因进化缓慢的原因之一。本研究通过对bla_(OKP)基因及其侧翼序列特征进行研究,研究发现bla_(OKP)基因及其侧翼序列结构保守是其相对bla_(SHV)基因进化速度缓慢的重要原因。 展开更多

关键词 全基因组测序 blaOKP 肺炎克雷伯氏菌 基因环境 基因进化

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大熊猫肠道噬菌体的多样性

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作者 赵思越 李才武 +6 位作者 杨盛智 李果 何永果 吴代福 黄炎 张和民 邹立扣 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期489-498,共10页

噬菌体在维持宿主肠道微环境中起着重要作用.运用宏基因组学方法全面探究大熊猫肠道噬菌体的多样性.共注释到548种噬菌体,主要来自11个科38个属548个种.大多数噬菌体主要来自长尾病毒科Siphoviridae、肌尾噬菌体科Myoviridae和短尾噬菌... 噬菌体在维持宿主肠道微环境中起着重要作用.运用宏基因组学方法全面探究大熊猫肠道噬菌体的多样性.共注释到548种噬菌体,主要来自11个科38个属548个种.大多数噬菌体主要来自长尾病毒科Siphoviridae、肌尾噬菌体科Myoviridae和短尾噬菌体科Podoviridae,所占比例分别为41.7%、27.6%和19.5%.其中未分类到科的噬菌体占10.5%.38个属主要为λ样病毒属(10.3%)、T4样病毒属(8.0%)、P1样病毒属(7.1%)、Phieco32样病毒属(5.3%)、T5样噬菌体属(3.4%)等.548个噬菌体中有22种丰度超过了1%,主要为肠细菌噬菌体P1(7.0%)、链球菌噬菌体LYGO9(6.1%)、肠细菌噬菌体λ(5.3%)、肠细菌噬菌体Phieco32(5.2%)、链球菌噬菌体phi30c(3.8%)等.此外,不同大熊猫繁育基地之间噬菌体群落结构存在显著差异(科水平:R=0.168,P<0.01;属水平:R=0.128,P<0.01;种水平:R=0.291,P<0.01),在α多样性指数方面SSP基地的Chao1指数与其他两个基地之间存在着显著差异.本研究发现大熊猫肠道噬菌体种群丰富多样,且因生境不同而显著变化;结果有助于挖掘大熊猫肠道噬菌体在疾病防控及治疗的潜力,为保障大熊猫的肠道健康提供新的思路. 展开更多

关键词 大熊猫 宏基因组学 噬菌体 肠道微生物 生境

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