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陕西省一起炭疽暴发疫情的调查处置及病原学分析 被引量:16
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作者 刘峰 邓勇 +14 位作者 志成 梁旭东 马国柱 周体操 曹磊 柴自超 石一 马琳 齐光明 贺莉 贺江 魏建春 李伟 刘东立 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期850-854,共5页
目的分析陕西省甘泉县炭疽暴发流行病学特征,提出控制措施。方法对甘泉县炭疽暴发开展流行病学调查,收集暴发地区历史疫情资料,采集病例标本及环境样本开展实验室检测,对炭疽病例个案资料进行统计学分析,描述病例三间分布,分析影响暴发... 目的分析陕西省甘泉县炭疽暴发流行病学特征,提出控制措施。方法对甘泉县炭疽暴发开展流行病学调查,收集暴发地区历史疫情资料,采集病例标本及环境样本开展实验室检测,对炭疽病例个案资料进行统计学分析,描述病例三间分布,分析影响暴发流行的自然因素与社会因素。结果甘泉县炭疽疫情暴发系一次同源感染的多点暴发,共计19例病例,以青壮年为主,分子分型为MLVA15-31基因型。结论及时发现疫情,采取扑杀病畜、隔离治疗病人、环境消毒等综合措施是快速扑灭炭疽疫情的关键。 展开更多
关键词 炭疽 暴发 流行病学调查 病原学分析
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中国鼠疫菌种资源遗传特征分析 被引量:12
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作者 俞东征 海荣 +10 位作者 董兴齐 李敏 夏连续 史献明 魏建春 崔百忠 王鹏 孙连芝 志凯 胡源 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第11期1005-1009,共5页
目的 建立《中国甲类传染病菌种资源库》 ,选择适当的指标 ,以反映中国鼠疫菌种的遗传背景。方法 使用传统的和分子生物学方法 ,测定中国鼠疫菌种代表菌株的遗传特征。并对遗传特征的分布及其意义进行分析。结果 利用 6项指标 ,将中... 目的 建立《中国甲类传染病菌种资源库》 ,选择适当的指标 ,以反映中国鼠疫菌种的遗传背景。方法 使用传统的和分子生物学方法 ,测定中国鼠疫菌种代表菌株的遗传特征。并对遗传特征的分布及其意义进行分析。结果 利用 6项指标 ,将中国的鼠疫菌划分成 15种遗传型 ,每一型占据一片相对独立的而又自相延续的地理空间。分析遗传型之间的亲缘关系 ,并根据菌株间的差异 ,追溯鼠疫耶尔森菌作为一个生物种形成后的进化过程。结论 中国各鼠疫自然疫源地存在着不同特征的鼠疫菌株 ,但为达到对菌株认同的目标 。 展开更多
关键词 中国 菌种 资源 遗传特征 鼠疫菌 鼠疫
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鼠疫F1抗体胶体金检测试剂的研制和现场评价 被引量:13
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作者 徐冬蕾 魏邵振 +20 位作者 史献明 忠兵 蔡虹 唐永娇 徐兵 秦迎旭 耿英芝 赵斌 黄富 黄德蕙 汪立茂 石国祥 王月 王鹏 夏连续 马凤琴 建华 俞东征 海荣 《疾病监测》 CAS 2007年第3期150-152,共3页
目的为建立鼠疫诊断和监测所需的快速检测F1抗体水平的方法,研制并评价金标检测试剂。方法胶体金标记和实验室检测,14个省17个监测点现场监测中检测了动物和人的血清样本4789份。结果金标检测试剂特异性强,敏感性、稳定性好,现场检测结... 目的为建立鼠疫诊断和监测所需的快速检测F1抗体水平的方法,研制并评价金标检测试剂。方法胶体金标记和实验室检测,14个省17个监测点现场监测中检测了动物和人的血清样本4789份。结果金标检测试剂特异性强,敏感性、稳定性好,现场检测结果与间接血凝方法无差异。结论鼠疫F1抗体胶体金检测试剂可以用于鼠疫病例诊断和动物监测。 展开更多
关键词 鼠疫 F1抗体 胶体金
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聚合酶链反应方法检测鼠疫耶尔森菌的内部对照研究 被引量:10
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作者 志凯 海荣 +1 位作者 俞东征 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期36-38,共3页
目的 避免聚合酶链反应 (PCR)方法检测鼠疫菌发生假阴性。方法 通过克隆 ,将16SrRNA引物的扩增产物与鼠疫菌F1抗原基因克隆子相连 ,并以其作为内部对照模板进行PCR试验。结果 得到了在包含F1抗原基因中连接有 16SrRNA扩增产物的质粒 ... 目的 避免聚合酶链反应 (PCR)方法检测鼠疫菌发生假阴性。方法 通过克隆 ,将16SrRNA引物的扩增产物与鼠疫菌F1抗原基因克隆子相连 ,并以其作为内部对照模板进行PCR试验。结果 得到了在包含F1抗原基因中连接有 16SrRNA扩增产物的质粒 ,并初步确立了作为内部对照质粒的参照标准浓度。结论 在采用PCR方法检测鼠疫菌时 ,加入适宜浓度的内部对照质粒作为模板与待检样品同时扩增 ,可避免假阴性的发生。 展开更多
关键词 鼠疫菌 对照研究 鼠疫耶尔森菌 质粒 假阴性 聚合酶链反应 抗原基因 扩增产物 适宜浓度 引物
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基因预测方法的研究进展 被引量:8
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作者 海荣 俞东征 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 2009年第3期271-273,共3页
基因预测一般指预测DNA序列中编码蛋白质的部分。其方法主要有两大类:一类是基于相似性的预测方法,即利用已知的mRNA或蛋白质序列为线索在DNA序列中搜寻所对应的片段,达到基因预测的目的;另一类是基于统计学模型的从头预测方法,即利用... 基因预测一般指预测DNA序列中编码蛋白质的部分。其方法主要有两大类:一类是基于相似性的预测方法,即利用已知的mRNA或蛋白质序列为线索在DNA序列中搜寻所对应的片段,达到基因预测的目的;另一类是基于统计学模型的从头预测方法,即利用统计学模型训练出相应参数,再对基因进行预测,这种方法可不依赖已知的DNA序列进行预测。现就基因预测的方法、基因预测中存在的一些问题等做一概述。 展开更多
关键词 基因预测 剪接联配 开放读码框 马尔可夫模型
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ANSYS在多列往复压缩机轴系扭振分析中的应用 被引量:9
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作者 许增金 王世杰 +2 位作者 杨树华 肖忠会 《压缩机技术》 2009年第2期1-5,9,共6页
随着石油化工流程规模的不断扩大,往复压缩机向超大型多列方向发展。压缩机列数的增加,导致轴系扭转固有频率降低,轴系出现扭转振动的可能性变大;经验表明,研制6列以上大型往复压缩机,必须进行轴系扭振分析。有限元技术的发展,为压缩机... 随着石油化工流程规模的不断扩大,往复压缩机向超大型多列方向发展。压缩机列数的增加,导致轴系扭转固有频率降低,轴系出现扭转振动的可能性变大;经验表明,研制6列以上大型往复压缩机,必须进行轴系扭振分析。有限元技术的发展,为压缩机轴系的动力分析提供了新的解决方案。以6M50型往复压缩机为分析对象,利用ANSYS软件对轴系进行了静力分析、模态分析和动态响应分析。结果表明,该分析技术可以全面系统地分析轴系各项动力特性,可以直观准确地获得轴系不同部位、不同时刻的应力分布,为大型往复压缩机轴系设计提供可靠的理论依据。 展开更多
关键词 往复压缩机 有限元分析 曲轴扭转振动 ANSYS软件
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慢性萎缩性胃炎24h胃内pH值监测及血清胃泌素含量的意义 被引量:9
7
作者 袁华魏 李雪雁 +1 位作者 徐鸰鸽 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2006年第26期2649-2651,共3页
目的:探讨在慢性萎缩性胃炎(chronicatrophicgastritis,CAG)患者中应用24h胃内pH值监测及血清胃泌素含量的临床意义.方法:126例经内镜联合病理诊断慢性胃炎患者,根据病理结果分为非萎缩性胃炎组、轻度、中度和重度萎缩组,应用便携式pH... 目的:探讨在慢性萎缩性胃炎(chronicatrophicgastritis,CAG)患者中应用24h胃内pH值监测及血清胃泌素含量的临床意义.方法:126例经内镜联合病理诊断慢性胃炎患者,根据病理结果分为非萎缩性胃炎组、轻度、中度和重度萎缩组,应用便携式pH测定仪进行24h胃内pH值测定、ELISA法检测血清胃泌素、快速尿素酶和14C-尿素呼吸试验监测幽门螺杆菌(HPylori)感染.结果:HPylori感染患者73例,其中CAG患者阳性52例,感染率在各组中无差异.重度CAG组患者在24h中位pH值、平均pH值以及夜间中位pH值均高于其他各组,具有显著性统计学差异(P<0.05);萎缩性胃炎胃泌素含量较非萎缩组低(59.21±17.36,54.67±15.84,50.78±13.13nmol/Lvs74.24±19.52nmol/L,P<0.05).结论:诊断CAG除胃镜和病理外,结合胃内pH值和胃泌素测定有助于进行诊断分级和提高诊断准确率,指导治疗. 展开更多
关键词 萎缩性胃炎 胃酸 胃泌素 pH值
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2017-2019年我国炭疽流行特征及炭疽芽胞杆菌分子分型分析 被引量:8
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作者 慧娟 +2 位作者 贺金荣 李伟 魏建春 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期422-426,共5页
目的探讨2017—2019年我国炭疽流行特征及发病规律,对部分省份(自治区)的炭疽芽胞杆菌进行分子分型分析。方法收集中国疾病预防控制传染病监测信息系统和突发公共卫生事件报告管理信息系统中2017—2019年报告的炭疽发病资料,采用描述性... 目的探讨2017—2019年我国炭疽流行特征及发病规律,对部分省份(自治区)的炭疽芽胞杆菌进行分子分型分析。方法收集中国疾病预防控制传染病监测信息系统和突发公共卫生事件报告管理信息系统中2017—2019年报告的炭疽发病资料,采用描述性流行病学方法分析流行特征和时间、地区及人群分布情况;以2017—2019年分离的47株炭疽芽胞杆菌作为研究对象,应用经典单核苷酸多态性分析(canSNP)和15个位点的可变数量串联重复序列分析(MLVA15)方法对炭疽芽胞杆菌进行分子分型分析。结果2017—2019年共报告的炭疽病例数为951例,其中938例是皮肤炭疽,达到总报告数的98.63%,分布地区主要在我国西部和东北地区,累计病例数前三位的省份是甘肃(215例)、四川(202例)和青海(191例);全年均有病例报告,夏秋季发病较多,8月份达到发病高峰,2017—2019年的6至10月份发病数分别占全年发病数的66.35%(211/318)、72.32%(243/336)和68.01%(202/297);年龄范围分布主要在20~59岁,约占总病例数的80%以上;男性病例明显多于女性,男女性别比约为3∶1。职业以牧民和农民为主,牧民病例占当年全部报告发病数的49.70%~58.18%,农民病例占当年全部报告发病数的31.45%~36.70%。每年均有突发公共卫生事件报告,2017—2019年共报告29起突发公共卫生事件。canSNP分析显示,47株菌中有37株属于A.Br.001/002亚群,10株属于A.Br.Ames亚群。MLVA15分析显示,测试菌株可以分成17个基因型,其中有10个基因型只包括1株菌。结论我国2017—2019年炭疽主要以皮肤炭疽为主,有明显地区性、季节性和人群分布特征;canSNP和MLVA15等分子分型方法可以在传染病溯源工作中发挥作用,为炭疽的预防控制提供技术支持。 展开更多
关键词 炭疽 流行病学 分子分型
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我国新发现的鼠疫自然疫源地鼠疫菌基因组序列测定及分析 被引量:8
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作者 申小娜 王琪 +16 位作者 夏连续 梁莹 徐冬蕾 蔡虹 魏建春 慧娟 王艳华 志凯 王宇萌 王娜 武利涛 宋志忠 洪涛 陈晨 俞东征 海荣 《中国地方病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期476-480,共5页
目的测定和分析我国新发现的鼠疫自然疫源地鼠疫菌株(耶尔森菌)的全基因组序列,探讨玉龙疫情菌株(D106004)与邻近两个疫源地剑川菌株(D182038)和西藏菌株(Z176003)的亲缘关系。方法采用全基因鸟枪法及Solexa方法对3株鼠疫菌株... 目的测定和分析我国新发现的鼠疫自然疫源地鼠疫菌株(耶尔森菌)的全基因组序列,探讨玉龙疫情菌株(D106004)与邻近两个疫源地剑川菌株(D182038)和西藏菌株(Z176003)的亲缘关系。方法采用全基因鸟枪法及Solexa方法对3株鼠疫菌株进行全基因组测序.并进行比较基因组学分析。基因组间编码序列比较分析采用BLAST软件进行,基因组间重排分析采用MAUVE软件进行。结果鼠疫菌株D106004、D182038、Z176003均具有1个染色体和3个质粒,菌株间染色体、质粒特征基本相似;3株菌株间编码序列的蛋白相邻类的聚簇(COG)功能分类及插入序列数目比较差异无统计学意义(x2值分别为3.03、0.257,P均〉O.05)。菌株间编码序列、单核苷酸多态性(SNPs)和基因组重排结果显示,在3株菌株中,有2882个基因具有100%的同源性。其中D106004菌株预测的3636个基因中与D182038菌株一致的基因有2994个,90%以上相似的基因有240个;与Z176003菌株一致的基因有3113个,90%以上相似的基因有200个;D106004菌株与Z176003、D182038菌株的同义SNPs数为59、68个,非同义SNPs数为104、203个;D106004与Z176003菌株之间可分为11个重排片段,较之D106004与D182038菌株之间的16个重排片段数目明显减少。结论3株鼠疫菌株基因之间具有高度同源性,D106004与Z176003菌株之间的亲缘关系较之与D182038菌株更为接近.玉龙疫源地菌株可能是由西藏疫源地菌株进化而来。 展开更多
关键词 耶尔森菌 鼠疫 比较基因组学分析
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广州市2004年某野生动物市场动物携带SARS-CoV监测 被引量:6
10
作者 王鸣 景怀琦 +19 位作者 徐慧芳 蒋秀高 阚飙 刘起勇 万康林 崔步云 郑翰 崔志刚 闫梅英 梁未丽 王洪霞 齐小保 李振军 李马超 陈凯 守印 海荣 俞东征 徐建国 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期84-87,共4页
目的 了解广州市某野生动物市场动物携带严重急性呼吸综合征冠状病毒 (SARS CoV)的动态变化 ,预测 2 0 0 4 - 2 0 0 5年冬季当地发生动物源性SARS的危险性。方法 在SARS发病相关月份采集广州市某野生动物市场动物的肛拭子和咽拭子标... 目的 了解广州市某野生动物市场动物携带严重急性呼吸综合征冠状病毒 (SARS CoV)的动态变化 ,预测 2 0 0 4 - 2 0 0 5年冬季当地发生动物源性SARS的危险性。方法 在SARS发病相关月份采集广州市某野生动物市场动物的肛拭子和咽拭子标本 ,使用实时荧光聚合酶链反应 (PCR)初筛 ,使用RT PCR和序列分析方法核实。结果 在 2 0 0 4年 1月 5日广东省开始清除野生动物行动前采集的 31只动物 (5只赤狐、2 0只猫、6只黄毛鼠 )中 ,有 8只动物SARS CoV检测阳性 (2 5 .8% ) ,包括 3只赤狐、4只猫、1只黄毛鼠。在 2 0 0 4年 1月 2 0日采集的 119只动物 (6只兔、13只猫、4 6只原鸡、13只斑嘴鸭、10只灰雁、31只鹧鸪 )中 ,仅 1只灰雁的肛拭子检测阳性。 2 - 11月份采集的 10 2只动物 (14只灰雁、3只猫、5只兔、9只斑嘴鸭、2只鹧鸪、8只雉鸡、6只鸽、9只黄麂、19只山猪、16只黄毛鼠、5只犬、1只水貂、3只山羊、2只绿孔雀 )中 ,仅 4月份采集的 1只山猪的肛拭子标本阳性。 11- 12月份在广东省采集的 2 2只果子狸标本均为阴性。结论 和SARS流行或出现散发病例 2 0 0 3年 5月、2 0 0 4年 1月5日某野生动物市场动物的SARS CoV的RT PCR检测情况相比 ,2 0 0 4年 1月 2 0日至 12月广州市某野生动物市场的动物携带SARS CoV的比? 展开更多
关键词 携带 SARS-COV 阳性 标本 采集 阴性 监测 黄毛鼠 月份 赤狐
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TaqMan-LNA探针多重实时荧光定量PCR检测炭疽芽胞杆菌的研究 被引量:8
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作者 刘东立 李文涓 +4 位作者 石一 马国柱 李伟 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2018年第3期244-248,258,共6页
目的设计检测多个靶基因的炭疽多重荧光定量PCR反应系统,建立快速准确的基因诊断方法,解决蜡样芽胞菌群基因诊断交叉反应问题。方法选择炭疽杆菌PX01毒素质粒基因pagA,PX02毒素质粒基因capB,以及染色体上的前噬菌体λBa03基因PL3作为靶... 目的设计检测多个靶基因的炭疽多重荧光定量PCR反应系统,建立快速准确的基因诊断方法,解决蜡样芽胞菌群基因诊断交叉反应问题。方法选择炭疽杆菌PX01毒素质粒基因pagA,PX02毒素质粒基因capB,以及染色体上的前噬菌体λBa03基因PL3作为靶基因,利用在线荧光定量PCR引物设计软件设计、优化多重PCR引物以及相应的TaqMan探针序列,对探针进行LNA标记并优化荧光PCR反应体系,构建多重实时荧光定量PCR反应系统。以3对引物PCR扩增并克隆靶基因的质粒标准品,倍比稀释后进行敏感度试验,以炭疽、蜡样芽胞杆菌、苏云金杆菌、蕈状杆菌以及常见肠道致病菌进行特异度试验,利用炭疽弱毒株污染土壤及奶粉进行模拟检测。结果 TaqMan-LNA多重实时荧光定量PCR可迅速检出3个炭疽杆菌靶基因,常用的探针法荧光定量PCR反应液均适用;pagA、CapB、PL3基因克隆标准品序列正确;该方法对pagA、CapB、PL3基因的检出限分别为63、398、114copies/μl,且仅检出炭疽杆菌基因,其余4种蜡样芽胞菌扩增均阴性。土壤及奶粉样品检测均阳性,其中pagA近检出限为6.6×104/ml,PL3基因检出限为6.6×105/ml。结论 TaqMan-LNA多重实时荧光定量PCR方法具有适用性广,检测迅速,灵敏度及特异度高等特点,能够将炭疽杆菌与蜡样芽胞菌群中其他细菌相鉴别,可试用于炭疽杆菌的感染检测。 展开更多
关键词 炭疽 TaqMan-LNA探针 多重实时荧光定量PCR 锁核酸 前噬菌体
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多重PCR检测方法在鼠疫监测中的应用 被引量:8
12
作者 志凯 海荣 +13 位作者 忠兵 赵斌 史献明 石国祥 秦迎旭 魏绍振 黄富 唐永姣 夏连续 蔡虹 建华 马凤琴 俞东征 《中国地方病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期475-477,共3页
目的 验证在鼠疫疫源地调查中应用多重PCR方法快速检测鼠疫菌的实用性。方法在14个省的17个鼠疫监测点采集标本2524份。选用针对鼠疫菌特异序列的引物,并加入内部对照模板.直接从鼠肝、脾等脏器标本中进行鼠疫核酸检测,与细菌分离培... 目的 验证在鼠疫疫源地调查中应用多重PCR方法快速检测鼠疫菌的实用性。方法在14个省的17个鼠疫监测点采集标本2524份。选用针对鼠疫菌特异序列的引物,并加入内部对照模板.直接从鼠肝、脾等脏器标本中进行鼠疫核酸检测,与细菌分离培养结果相比较并进行统计学分析。结果 两种检测方法的符合率为92.67%。PCR方法阳性检出率为10.38%,较细菌培养阳性检出率(4.48%)高(Х^2=682.25,P〈0.01)。结论 多重PCR方法可应用于鼠疫监测中,比传统方法迅速、灵敏,但还有待于优化。 展开更多
关键词 耶尔森菌 鼠疫 聚合酶链反应 内部对照
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中国蜡样芽胞杆菌脉冲场凝胶电泳标准化技术的建立与应用 被引量:8
13
作者 慧娟 潘琢 +5 位作者 魏建春 梁旭东 杜小莉 崔志刚 李伟 《疾病监测》 CAS 2015年第5期411-414,共4页
目的本研究旨在选择不同的内切酶和电泳条件对蜡样芽胞杆菌(蜡样杆菌)脉冲场凝胶电泳(PFGE)方法进行评价,建立中国蜡样杆菌标准PFGE方法。方法蜡样ATCC国际标准菌株及分离自我国不同地区和来源的蜡样杆菌,制备胶块用溶菌酶和蛋白酶K分... 目的本研究旨在选择不同的内切酶和电泳条件对蜡样芽胞杆菌(蜡样杆菌)脉冲场凝胶电泳(PFGE)方法进行评价,建立中国蜡样杆菌标准PFGE方法。方法蜡样ATCC国际标准菌株及分离自我国不同地区和来源的蜡样杆菌,制备胶块用溶菌酶和蛋白酶K分别裂解后,选用不同的内切酶对胶块内DNA进行酶切,比较PFGE电泳结果的分离度,评价获得最佳操作方案,选取51株蜡样杆菌菌株进行PFGE实验,对此实验方法进行评价分析。结果确立的蜡样杆菌PFGE分型方法的标准操作程序,可以较好地对蜡样杆菌进行分子分型研究,初步描述了51株蜡样杆菌菌株PFGE型别特征。结论实验确定的蜡样杆菌PFGE方法,可以为蜡样杆菌引起的食源性疾病及医院感染的溯源控制提供技术手段。 展开更多
关键词 蜡样芽胞杆菌 脉冲场凝胶电泳 食物中毒
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基因和抗原检测技术在鼠疫监测中的应用与评价 被引量:6
14
作者 海荣 俞东征 +22 位作者 史献明 忠兵 唐永娇 王鹏 夏连续 魏绍振 徐兵 秦迎旭 志凯 石国祥 徐冬蕾 蔡虹 魏建春 耿英芝 黄德惠 赵斌 汪立茂 马凤琴 黄富 王月 建华 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期426-429,共4页
目的 对鼠疫特异性基因和抗原检测新技术进行鼠疫监测现场的应用及评价。方法检测来自鼠疫自然疫源地的各类标本中鼠疫菌DNA和F1抗原,采用多重PCR、胶体金免疫技术和酶联免疫吸附试验,与鼠疫菌培养和反向间接血凝试验进行平行对照。结果... 目的 对鼠疫特异性基因和抗原检测新技术进行鼠疫监测现场的应用及评价。方法检测来自鼠疫自然疫源地的各类标本中鼠疫菌DNA和F1抗原,采用多重PCR、胶体金免疫技术和酶联免疫吸附试验,与鼠疫菌培养和反向间接血凝试验进行平行对照。结果 使用5种方法平行检测鼠类、蚤类标本1798份,共判定鼠疫标本132份,总阳性率为7.34%;与单纯鼠疫菌培养阳性相比(113份,阳性率为6.28%),其中鼠疫菌培养与基因、抗原检测的总阳性率为7.34%,与单纯检菌阳性率比较检出率提高16.81%,符合率达到97.13%。结论 在鼠疫监测中增加基因与抗原联合检测,可以提高鼠疫的确诊率。 展开更多
关键词 鼠疫耶尔森菌 基因 抗原 监测
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鼠疫菌基因组与脉冲场电泳图型 被引量:6
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作者 志凯 海荣 +7 位作者 宋志忠 夏连续 梁云 蔡虹 梁莹 申小娜 俞东征 《国外医学(医学地理分册)》 CAS 2009年第3期113-116,119,共5页
目的利用PFGE图形来了解鼠疫菌基因组重排现象。方法PFGE分析并与全基因组序列进行比较。结果计算PFGE各条带大小可初步判断鼠疫菌基因组序列重排结构。结论利用PFGE图型来判断鼠疫菌基因组序列重排结构,可以大大节约测序所需花费的成本。
关键词 鼠疫 基因重排 脉冲场电泳
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蜡样芽胞杆菌在不同标本中的毒力基因分布特征 被引量:6
16
作者 慧娟 +2 位作者 贺金荣 李伟 魏建春 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期683-687,共5页
目的 研究蜡样芽胞杆菌毒力基因在不同标本中的分布特征。方法 分离自环境监测标本(米粉、奶粉、土壤)和疾病相关标本(米饭、凉皮、眼内炎和肿瘤患者)的蜡样杆菌333株,PCR扩增蜡样杆菌11个毒力基因,包括溶血性BL基因(hblC、hblD、hblA、... 目的 研究蜡样芽胞杆菌毒力基因在不同标本中的分布特征。方法 分离自环境监测标本(米粉、奶粉、土壤)和疾病相关标本(米饭、凉皮、眼内炎和肿瘤患者)的蜡样杆菌333株,PCR扩增蜡样杆菌11个毒力基因,包括溶血性BL基因(hblC、hblD、hblA、hblB)、非溶血性基因(nheA、nheB、nheC)、肠毒素FM基因和T基因(entFM、bceT)、细胞毒素K基因(cytK)和呕吐毒素相关基因(ces),统计不同标本菌株中毒力基因的携带数目和各毒力基因的携带率,方差分析和卡方检验比较毒力基因在不同标本中,尤其是在疾病相关标本与环境监测标本中的携带差异。结果 研究菌株携带毒力基因平均数目为5.97个,88.29%的菌株携带至少3个毒力基因,12.31%的菌株携带除ces外的所有基因。标本携带毒力基因数目从高到低依次为患者(8.75)、凉皮(8.20)、米饭(7.13)、土壤(6.22)、米粉(5.78)和奶粉(5.71)。患者、凉皮分别与奶粉的基因数目两两比较有统计学差异显著性。菌株各毒力基因的携带率从高到低依次为非溶血性基因(89.19%)、entFM基因(79.88%)、bceT基因(49.85%)、溶血性BL基因(48.35%)、ctyK基因(47.75%)和ces基因(1.50%)。溶血性基因在疾病相关标本中的携带率比环境监测标本高(χ2=8.230,P<0.01),其余基因携带率则在两类标本中无统计学差异。环境监测标本中,土壤的溶血性基因携带率高于米粉和奶粉(χ2=15.071,P<0.01),非溶血性基因和entFM基因的携带率则低于后两者,检验值分别为(χ2=9.603,P<0.05)和(χ2=21.634,P<0.01)。结论 蜡样杆菌毒力基因在不同标本中的分布,尤其是毒力基因数目和溶血性基因在疾病相关标本中较高的携带特点,为研究蜡样杆菌的致病性提供了一定的参考依据,具有一定的临床意义。 展开更多
关键词 蜡样芽胞杆菌 毒力基因 疾病相关标本 分布特征
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胃肠动力治疗仪联合聚乙二醇粉治疗便秘型肠易激综合征临床疗效研究 被引量:6
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作者 陈智颖 郑远明 《中国全科医学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第35期4057-4059,共3页
目的评价胃肠动力治疗仪联合聚乙二醇粉治疗便秘型肠易激综合征(IBS)的疗效。方法采用随机、开放、平行、阳性药物对照方法进行研究。入选符合罗马Ⅱ标准的便秘型IBS患者90例,分为胃肠动力治疗仪组、胃肠动力治疗仪加聚乙二醇粉联合治疗... 目的评价胃肠动力治疗仪联合聚乙二醇粉治疗便秘型肠易激综合征(IBS)的疗效。方法采用随机、开放、平行、阳性药物对照方法进行研究。入选符合罗马Ⅱ标准的便秘型IBS患者90例,分为胃肠动力治疗仪组、胃肠动力治疗仪加聚乙二醇粉联合治疗组(联合治疗组)及莫沙比利组3组,每组30例。试验包括1周基线期,2周治疗期。根据患者临床症状及生活质量进行评分。结果治疗后,3组患者腹痛、腹胀症状均有改善,联合治疗组腹胀症状改善最明显。胃肠动力治疗仪组腹痛症状改善最明显。各组患者大便Bristol分级构成及生活质量较治疗前明显改善,差异均有统计学意义(P<0.05);其中联合治疗组、胃肠动力治疗仪组与莫沙比利组比较,差异均有统计学意义(P<0.05);联合治疗组与胃肠动力治疗仪组比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论应用胃肠动力治疗仪联合聚乙二醇粉治疗便秘型IBS疗效好。 展开更多
关键词 肠易激综合征 胃肠动力治疗仪 聚乙二醇粉
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炭疽高发地区土壤样本中常见芽胞杆菌的分离及鉴定 被引量:6
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作者 慧娟 魏建春 +1 位作者 建华 《疾病监测》 CAS 2012年第4期288-290,共3页
目的通过分离鉴定炭疽可疑污染土壤样本的芽胞杆菌,评价消毒效果和了解监测地区土壤中的芽胞杆菌分布情况。方法采集炭疽监测点土壤样本60份,对炭疽芽胞杆菌和其他芽胞杆菌进行分离培养和聚合酶链反应扩增鉴定。结果在可疑污染土壤样本... 目的通过分离鉴定炭疽可疑污染土壤样本的芽胞杆菌,评价消毒效果和了解监测地区土壤中的芽胞杆菌分布情况。方法采集炭疽监测点土壤样本60份,对炭疽芽胞杆菌和其他芽胞杆菌进行分离培养和聚合酶链反应扩增鉴定。结果在可疑污染土壤样本中未分离到炭疽芽胞杆菌;从分离到的48个单克隆菌落中扩增到33个目的片段,经测序和blast比对,确定得到地衣芽胞杆菌13株,枯草芽胞杆菌8株,短小芽胞杆菌扩增11株,蜡样芽胞杆菌扩增到1株,巨大芽胞杆菌引物和环状芽胞杆菌引物特异性不好。结论本研究提示该监测点炭疽疫情消毒效果可信,但需要进一步研究验证;几种芽胞杆菌在土壤中广泛存在,在炭疽监测工作中进行病原体分离时需要加以鉴别,可通过特异基因扩增来辅助检验。 展开更多
关键词 炭疽 芽胞杆菌 分离与鉴定
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中国炭疽芽胞杆菌多位点可变数目串联重复序列分析基因型多态性
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作者 慧娟 +2 位作者 贺金荣 李伟 魏建春 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期990-996,共7页
目的分析中国炭疽芽胞杆菌多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)基因型多态性,建立中国炭疽芽胞杆菌MLVA基因型数据库。方法收集1947年以来中国不同来源的炭疽芽胞杆菌分离菌株,采用MLVA15分型策略进行基因型鉴定,对基因型进行统一编... 目的分析中国炭疽芽胞杆菌多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)基因型多态性,建立中国炭疽芽胞杆菌MLVA基因型数据库。方法收集1947年以来中国不同来源的炭疽芽胞杆菌分离菌株,采用MLVA15分型策略进行基因型鉴定,对基因型进行统一编号和命名,分析不同来源菌株MLVA基因型的分布特征,同时通过Bionumerics软件绘制聚类图,分析不同基因型间的遗传关系。结果MLVA15分型可将533株中国炭疽芽胞杆菌分为4群91个基因型,其中54个基因型为中国独有的基因型。新命名的基因型MLVA15-CHN1~MLVA15-CHN6广泛分布于中国不同地区、不同年代和宿主,其余基因型具有地区和年代特征性。结论本研究建立了中国炭疽芽胞杆菌MLVA基因型数据库,掌握了MLVA基因型分布特征及其遗传多态性,为中国炭疽疫情防控及分子溯源技术提供了参考依据。 展开更多
关键词 炭疽芽胞杆菌 基因分型 多位点可变数目串联重复序列分析 遗传多态性
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慢性多灶萎缩性胃炎患者胃酸分泌与幽门螺杆菌感染及血清胃泌素的关系 被引量:6
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作者 陈智颖 徐鸰鸽 《临床内科杂志》 CAS 2008年第8期523-525,共3页
目的研究慢性多灶萎缩性胃炎(BAG)胃酸分泌与幽门螺杆菌(Hp)感染及血清胃泌素的关系。方法将200例确诊的慢性胃炎患者根据病理结果分为轻度、中度、重度BAG组及对照组(非萎缩性胃炎组),监测各组患者24小时胃内pH值的变化情况,并检测其... 目的研究慢性多灶萎缩性胃炎(BAG)胃酸分泌与幽门螺杆菌(Hp)感染及血清胃泌素的关系。方法将200例确诊的慢性胃炎患者根据病理结果分为轻度、中度、重度BAG组及对照组(非萎缩性胃炎组),监测各组患者24小时胃内pH值的变化情况,并检测其幽门螺杆菌及血清胃泌素的含量,各组间进行比较。结果(1)150例BAG患者中,Hp感染阳性率70%,随着胃粘膜萎缩程度的加重,Hp感染阳性率逐渐上升;(2)各组间血清胃泌素值比较:轻度萎缩组与非萎缩性胃炎组比较差异无显著性(P>0.05),其余各组间比较差异有显著性(P<0.05;(3)各组pH值分析结果:BAG胃黏膜轻度萎缩时,pH≤2时间百分比较非萎缩性胃炎组升高,pH>4时间百分比及pH平均值、pH中位值均较非萎缩性胃炎组降低,中度及重度萎缩时pH≤2时间百分比逐渐降低,pH>4时间百分比及pH平均值、pH中位值逐渐升高。结论BAG的发生与Hp感染有关,胃粘膜萎缩程度与Hp感染的严重程度有关;BAG胃黏膜轻度萎缩时,血清胃泌素含量无明显变化;中、重度萎缩时,血清胃泌素含量降低;BAG胃黏膜轻度萎缩时,胃酸分泌增多;随着胃黏膜萎缩程度的加重,胃酸分泌逐渐减少。 展开更多
关键词 慢性多灶萎缩性胃炎 胃酸 幽门螺杆菌 血清胃泌素
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