目的:基于网络药理学联合分子对接技术探究驻春胶囊治疗骨质疏松症的作用机制。方法:应用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)数据库筛选出本处...目的:基于网络药理学联合分子对接技术探究驻春胶囊治疗骨质疏松症的作用机制。方法:应用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)数据库筛选出本处方6味中药活性成分及作用靶点;从GeneCards,TTD和OMIM数据库查询疾病骨质疏松症靶点;利用R语言将药物活性成分相关的靶点和疾病靶点进行匹配映射取得交集靶点,运用Cytoscape 3.8.0软件构建“药物活性成分-作用靶点基因”网络,运用STRING软件构建蛋白相互作用网络,对所得网络进行计算,筛选发挥治疗作用的关键靶点;同时利用R语言相关数据包进行基因本体(Gene Ontology,GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路分析;使用AutodockVina进行分子对接,计算核心靶点和驻春胶囊重要活性成分的结合度,利用LigPlot软件绘图。结果:①筛选得出驻春胶囊治疗骨质疏松症的核心活性成分,包括槲皮素、木犀草素、山柰酚、川皮苷、柚皮素、脱水淫羊藿素等,驻春胶囊治疗骨质疏松症的关键靶点蛋白包括丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、雌激素受体1(Estrogen Receptor 1,ESR1)、白细胞介素(Interleukin,IL)-6等,分子对接结果显示驻春胶囊核心化合物与关键靶点蛋白结合稳定;②GO和KEGG分析结果显示,驻春胶囊可能通过影响P13KAkt信号通路、HIF-1信号通路、IL-17信号通路等通路,集中于调控细胞凋亡、细胞增殖、免疫等多生物功能来发挥其治疗骨质疏松症的作用;③结果证实驻春胶囊可通过多成分-多靶点-多途径的治疗特点干预骨质疏松症。展开更多
文摘目的:基于网络药理学联合分子对接技术探究驻春胶囊治疗骨质疏松症的作用机制。方法:应用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)数据库筛选出本处方6味中药活性成分及作用靶点;从GeneCards,TTD和OMIM数据库查询疾病骨质疏松症靶点;利用R语言将药物活性成分相关的靶点和疾病靶点进行匹配映射取得交集靶点,运用Cytoscape 3.8.0软件构建“药物活性成分-作用靶点基因”网络,运用STRING软件构建蛋白相互作用网络,对所得网络进行计算,筛选发挥治疗作用的关键靶点;同时利用R语言相关数据包进行基因本体(Gene Ontology,GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路分析;使用AutodockVina进行分子对接,计算核心靶点和驻春胶囊重要活性成分的结合度,利用LigPlot软件绘图。结果:①筛选得出驻春胶囊治疗骨质疏松症的核心活性成分,包括槲皮素、木犀草素、山柰酚、川皮苷、柚皮素、脱水淫羊藿素等,驻春胶囊治疗骨质疏松症的关键靶点蛋白包括丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、雌激素受体1(Estrogen Receptor 1,ESR1)、白细胞介素(Interleukin,IL)-6等,分子对接结果显示驻春胶囊核心化合物与关键靶点蛋白结合稳定;②GO和KEGG分析结果显示,驻春胶囊可能通过影响P13KAkt信号通路、HIF-1信号通路、IL-17信号通路等通路,集中于调控细胞凋亡、细胞增殖、免疫等多生物功能来发挥其治疗骨质疏松症的作用;③结果证实驻春胶囊可通过多成分-多靶点-多途径的治疗特点干预骨质疏松症。
