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可乐猪乳头数性状全基因组关联分析 被引量:8
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作者 谢健 +3 位作者 许瑶 牛熙 冉雪琴 王嘉福 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2016年第11期2866-2872,共7页
乳头数性状是猪最重要的繁殖性状之一,与养猪业的经济效益密切相关。本试验以Illunima Porcine SNP60K芯片对22头可乐猪进行基因分型,通过Plink 1.07软件,基于混合线性模型对左乳头数、右乳头数和总乳头数性状进行全基因组关联分析。经... 乳头数性状是猪最重要的繁殖性状之一,与养猪业的经济效益密切相关。本试验以Illunima Porcine SNP60K芯片对22头可乐猪进行基因分型,通过Plink 1.07软件,基于混合线性模型对左乳头数、右乳头数和总乳头数性状进行全基因组关联分析。经过严格的质量控制和多重检验之后,共鉴定出全基因组水平潜在关联的SNPs位点4个(P<2.06E-5);染色体水平显著关联位点3个,潜在关联位点18个;在关联SNP位点可能连锁的上、下游1cM区间内检索到304个基因,其中Wnt及Fgf信号通路中的候选基因BTRC、FGF5、FGF8和BMP3、RASGEF1B、HMGB3可能影响猪的乳头数性状或繁殖性状。通过全基因组关联分析策略发掘出的关联SNP位点及潜在候选基因,将为可乐猪的选育保种奠定基础。 展开更多
关键词 SNP芯片 全基因组关联分析 乳头数
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Comparative analysis of structural characteristics and cardiomyocyte protective effects of glucomannan extracted from Bletilla striata using varied methods
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作者 Feng Pan Nan Yang +5 位作者 Guoyong Ruan Changyan Yu Jianbo Yang Dongxue Suo Ying Qin Yun Liu 《Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences》 CAS CSCD 2024年第8期686-704,共19页
Doxorubicin(DOX)is a widely employed tumor therapy,yet its substantial toxic side effects pose a considerable challenge.Bletilla striata has demonstrated efficacy in preventing and treating these toxic side effects in... Doxorubicin(DOX)is a widely employed tumor therapy,yet its substantial toxic side effects pose a considerable challenge.Bletilla striata has demonstrated efficacy in preventing and treating these toxic side effects in clinical practice,with polysaccharides identified as the principal active component.In the present study,16 fractions of B.striata polysaccharides(BsPs)were extracted using diverse methods,including hot-water extraction(HWE),ultrasonic-assisted extraction(UAE),enzyme-assisted extraction(EAE),dilute acid-water extraction(ACWE),and dilute alkali-water extraction(ALWE).These extractions were subsequently precipitated at final ethanol concentrations of 80%and 95%,respectively.The investigation encompassed yields,total carbohydrate content(TCC),total protein content(TPC),preliminary structural properties,and anti-DOX myocardial cytotoxic activity.Results indicated that the extraction method significantly influenced the physicochemical properties,associated functional properties,and anti-DOX myocardial cytotoxic activity of BsPs.HWE and UAE yielded higher BsPs quantities.The relative molecular weight(RMW)distribution of BsPs differed notably between HWE or UAE,EAE,ACWE,and ALWE.The RMW of primary BsPs obtained from HWE and UAE(1.9×10^(7)-1.7×10^(7) Da)exceeded that from EAE(7.5×10^(3)-2.8×10^(4) Da)and ALWE(5.1×10^(4)-1.7×10^(4) Da),with smaller molecular weights primarily precipitated by higher ethanol concentrations.BsPs were composed of Man and Glu,with partial fractions containing small amounts of Gal or Ara,displaying varying molar ratios.Notably,BsPs from ACWE exhibited the most significant structural differences,lacking 1,4-α-D-Glcp and a triple-helical structure.Furthermore,BsPs obtained from HWE,UAE,and EAE demonstrated heightened anti-DOX myocardial cytotoxic activity compared to other methods.This study underscored the influence of extraction methods on BsPs’structure and myocardial protective activity,offering a foundation for exploring structural diversity and employing specific extr 展开更多
关键词 Bletilla striata(Thunb.)Rchb.f. POLYSACCHARIDE Extraction methods Structural characteristics Myocardial protection
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长顺绿壳蛋鸡绿壳基因SLCO1B3多态性分析 被引量:2
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作者 谢健 +3 位作者 王洋 林家栋 陈眷华 张福平 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期2816-2820,共5页
为了筛选出产绿壳蛋的纯合子基因型鸡群。本试验采用双重PCR方法检测长顺绿壳蛋鸡群体中EAV-HP在SLCO1B3基因中的插入频率,结果显示,该群体中包含3种基因型:N/N、LC/N和LC/LC,其基因型频率分别为5.23%、52.33%和42.44%;LC基因频率为68.6... 为了筛选出产绿壳蛋的纯合子基因型鸡群。本试验采用双重PCR方法检测长顺绿壳蛋鸡群体中EAV-HP在SLCO1B3基因中的插入频率,结果显示,该群体中包含3种基因型:N/N、LC/N和LC/LC,其基因型频率分别为5.23%、52.33%和42.44%;LC基因频率为68.60%,绿壳蛋频率达到94.77%。该插入位点在长顺绿壳蛋鸡群体中处于Hardy-Weinberg不平衡状态(p<0.01)。表明长顺绿壳蛋鸡群体拥有大量EAV-HP插入整合的个体,其基因纯合度较高,是优良的地方品种资源。 展开更多
关键词 长顺绿壳蛋鸡 EVA-HP SLCO1B3
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6个猪品种CD53基因中结构变异SV184分布频率的研究
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作者 徐倩 岑永秀 +3 位作者 刘畅 冉雪琴 王嘉福 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第4期1079-1086,共8页
基于香猪全基因组重测序数据,在白细胞表面抗原CD53基因中筛选到一个结构变异(structure variant,SV)184,为了探索不同猪品种间此结构变异是否存在多态性变化,本试验选择香猪、大白猪、糯谷猪、柯乐猪、江口萝卜猪和荣昌猪作为试验动物... 基于香猪全基因组重测序数据,在白细胞表面抗原CD53基因中筛选到一个结构变异(structure variant,SV)184,为了探索不同猪品种间此结构变异是否存在多态性变化,本试验选择香猪、大白猪、糯谷猪、柯乐猪、江口萝卜猪和荣昌猪作为试验动物,采用PCR方法对猪群中SV184的分布频率进行比较研究,应用RT-PCR技术,分析CD53基因的原初转录本序列结构,研究SV184对CD53基因的转录是否有直接影响。结果显示,6个猪品种中SV184的分布频率存在明显差异,香猪以VN基因型为主,其他5个猪品种是NN基因型占优势;计算两种等位基因的频率,香猪以缺失的V等位基因为主,其他5个猪品种以正常的N等位基因为主。选择3种基因型个体的血液样本,逆转录后分析CD53基因的原初转录本的序列,从中检测到缺失型和不缺失的两种转录本形式,提示SV184对CD53基因的转录无直接影响。SV184可作为分子标记用于区分香猪和其他猪品种。 展开更多
关键词 猪品种 CD53基因 结构变异 多态性 转录本前体
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香猪ADAMTS-1基因克隆及遗传效应分析
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作者 赵永霞 许瑶 +1 位作者 谢健 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期1145-1151,共7页
为了研究繁殖候选基因ADAMTS-1对香猪繁殖性状的调控机理,本研究以高产、低产两个香猪群体为实验材料,克隆ADAMTS-1基因全长,分析其存在的多态性位点,并对第七外显子5996位进行产仔数的遗传效应分析,同时检测两个香猪群体中该基因... 为了研究繁殖候选基因ADAMTS-1对香猪繁殖性状的调控机理,本研究以高产、低产两个香猪群体为实验材料,克隆ADAMTS-1基因全长,分析其存在的多态性位点,并对第七外显子5996位进行产仔数的遗传效应分析,同时检测两个香猪群体中该基因的拷贝数变异。结果表明,ADAMTS-1基因包含8个内含子和9个外显子区域。该基因第七外显子5996位存在多态性,香猪品种中以B等位基因为主,基因型频率BB〉AB,未检测到纯合AA基因型的个体,而西方猪种中以AA或AB型为主。高产和低产两个香猪群体中的ADAMTS-1基因的拷贝数都是复制型为主,但存在拷贝数的差异,高产香猪群体中的拷贝数增加较多,多为3个或3个以上拷贝,而低产群体中多为双拷贝,低产群体中的拷贝数明显低于高产群体。结果提示,ADAMTS-1基因的拷贝数变异以及第7外显子5996位的多态性可能是影响香猪繁殖力的重要因素之一。 展开更多
关键词 香猪 ADAMTS-1 繁殖 遗传效应 拷贝数
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黔北人群TGFα基因多态性与非综合征性唇腭裂的相关性研究
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作者 李三华 +2 位作者 姜念 姚涛 陈全利 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期1438-1443,共6页
本研究旨在探讨黔北地区人群TGFα基因3个SNP位点的多态性及其与非综合征性唇腭裂的相关性。采用PCR和测序方法对86个对照儿童(其中核心家系41例)和116个NSCL/P儿童(其中核心家系52例)的TGFα基因rs11466297、rs473698和rs115055578 3个... 本研究旨在探讨黔北地区人群TGFα基因3个SNP位点的多态性及其与非综合征性唇腭裂的相关性。采用PCR和测序方法对86个对照儿童(其中核心家系41例)和116个NSCL/P儿童(其中核心家系52例)的TGFα基因rs11466297、rs473698和rs115055578 3个SNP位点进行扩增和测序;对样本群体进行Hardy-weinberg平衡检测,对2组人群进行基因型频率、等位基因频率比较及OR分析;对病例组核心家系进行HHRR和TDT检验。对照组与病例组人群rs11466297基因型均为AA野生型,rs473698位点包含GG型、GC型和CC型,rs115055578位点基因型均为GG野生型。对于rs473698位点,对照组和病例组均符合Hardy-Weinberg平衡法则(p>0.05),2组人群的基因型和等位基因频率分布差异均无统计学意义(p<0.05);rs473698位点未发现传递不平衡现象(p>0.05)。黔北地区人群TGFα基因rs11466297和rs115055578位点以野生纯合型为主,rs473698位点具有多态性,但其多态性与黔北地区人群区非综合征性唇腭裂的发生可能没有相关性。 展开更多
关键词 非综合征性唇腭裂 TGFΑ SNP 单倍型相对风险分析 传递不平衡检验
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蟾皮化学成分和药理活性的研究进展 被引量:25
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作者 孟令杰 +3 位作者 姜念 李三华 肖毅 刘云 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期1206-1220,共15页
蟾皮为蟾蜍科动物中华大蟾蜍Bufo bufo gargarizans或黑眶蟾蜍B.melanosticus的干燥全皮,已纳入壮药名录。作为一种民族药,常用于满族、回族和朝鲜族的民间药方,具有清热解毒和利水消肿之功效。目前已从蟾皮中发现100多个化合物,包括蟾... 蟾皮为蟾蜍科动物中华大蟾蜍Bufo bufo gargarizans或黑眶蟾蜍B.melanosticus的干燥全皮,已纳入壮药名录。作为一种民族药,常用于满族、回族和朝鲜族的民间药方,具有清热解毒和利水消肿之功效。目前已从蟾皮中发现100多个化合物,包括蟾蜍二烯羟酸内酯类、吲哚生物碱类、蟾蜍环酰胺类以及甾体类等成分。随着国内外药理学研究的不断深入,蟾皮单体成分呈现诸多药理作用,如抗肿瘤、抗炎、免疫调节、抗乙肝病毒、强心等,并且对特异的药物代谢酶具有较高的敏感性。通过查阅近20年来的国内外文献,对蟾皮的化学成分、药理活性、单体成分与药物代谢酶的相互作用等方面进行综述,以期为蟾皮更好的开发和应用提供参考。 展开更多
关键词 中华大蟾蜍 黑眶蟾蜍 民族药 蟾皮 蟾蜍二烯羟酸内酯类 抗肿瘤 免疫调节 药物代谢酶
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佩兰乙醇提取物对结肠癌RKO细胞的抑制作用研究 被引量:8
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作者 姜念 宋长伟 +3 位作者 魏凌凯 秦颖 刘云 《中国民族民间医药》 2018年第16期32-35,共4页
目的:研究佩兰乙醇提取物对结肠癌RKO细胞的体外抗肿瘤作用。方法:SRB法检测细胞的生长抑制率;倒置显微镜观察细胞形态的变化;免疫印迹法检测结肠癌RKO细胞中Bcl-2蛋白、Cleaved Caspase-3蛋白的表达情况。结果:佩兰乙醇提取物在3μg/m ... 目的:研究佩兰乙醇提取物对结肠癌RKO细胞的体外抗肿瘤作用。方法:SRB法检测细胞的生长抑制率;倒置显微镜观察细胞形态的变化;免疫印迹法检测结肠癌RKO细胞中Bcl-2蛋白、Cleaved Caspase-3蛋白的表达情况。结果:佩兰乙醇提取物在3μg/m L时对结肠癌RKO细胞已具有抑制生长作用,而且随着浓度的增加其抑制率也逐渐升高,到20μg/m L浓度时表现为完全抑制。形态学观察结果显示佩兰乙醇提取物处理后结肠癌RKO细胞后,细胞明显皱缩变圆。免疫印迹法检测到佩兰乙醇提取物能降低结肠癌RKO细胞中Bcl-2的表达、增加Cleaved caspase-3的表达。结论:佩兰乙醇提取物对结肠癌RKO细胞具有抑制生长、促进凋亡的作用。 展开更多
关键词 佩兰乙醇提取物 结肠癌 RKO细胞 凋亡 BCL-2 Cleaved CASPASE-3
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鸡粪对黑水虻幼虫生长及脂肪酸和蛋白质等营养成分积累影响
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作者 潘峰 彭松崟 +3 位作者 朱欣婷 李三华 刘云 《应用昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期358-369,共12页
【目的】明确饲料中添加鸡粪对黑水虻Hermetia illucens幼虫生长的影响,确定最适添加比例。【方法】通过添加不同比例的鸡粪至豆粕饲养黑水虻幼虫,通过称量体重及干物质变化评估其生长状况;使用石油醚和蒸馏水结合超声波法分别提取幼虫... 【目的】明确饲料中添加鸡粪对黑水虻Hermetia illucens幼虫生长的影响,确定最适添加比例。【方法】通过添加不同比例的鸡粪至豆粕饲养黑水虻幼虫,通过称量体重及干物质变化评估其生长状况;使用石油醚和蒸馏水结合超声波法分别提取幼虫脂肪酸和水溶性成分,并采用二喹啉甲酸法和苯酚-硫酸法分别测定水提物中的水溶性蛋白和糖类含量,评价主营养成分积累;运用GC-MS和HPGPC-ELSD技术分别分析脂肪酸化学组成和水溶性大分子化合物分子量分布,以判断鸡粪添加对幼虫生长的影响。【结果】黑水虻幼虫生长测定显示,饲料中鸡粪比例超30%时,体重增长显著减少;超过50%时,折干率显著下降(P<0.05)。营养成分积累分析揭示,鸡粪比例≤30%时,幼虫脂肪酸含量显著升高,但比例增加后,含量下降,而可溶性蛋白质和糖类成分含量稳定(P<0.05),说明适量鸡粪促进脂肪酸积累。GC-MS分析未发现油脂化学成分显著变化,主要成分为月桂酸、油酸和棕榈酸,且均为共有成分。HPGPC-ELSD结果显示,鸡粪≤30%时,色谱图上,在保留时间16.5和20 min处均有明显的色谱峰,40%和50%时第一个主峰出现峰裂,比例达到80%时,第二个主峰消失,表明高比例鸡粪可能导致大分子断裂或抑制低分子聚合或产生。【结论】黑水虻幼虫的生长和营养积累受鸡粪豆粕配比影响,过高的鸡粪比例对幼虫生长不利,而鸡粪含量不超过30%时,对幼虫生长和营养积累的影响不显著。因此,综合考虑鸡粪利用率的前提下,30%鸡粪添加比例最适宜黑水虻幼虫饲养。 展开更多
关键词 黑水虻 鸡粪 饲料 营养成分 GC-MS HPGPC-ELSD
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医学基础综合实验技术教学现状与对策 被引量:6
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作者 刘云 李三华 +1 位作者 姜念 《基础医学教育》 2018年第11期991-993,共3页
培养一名适应科研需求的医、药类硕士研究生是医学院校的重要任务。医学基础综合实验技术是研究生学习阶段的重要课程。为了培养具有一定科研素养的研究生,以医学基础综合实验技术课程教学为例,分析了研究生的学习现状,并从优化教学内... 培养一名适应科研需求的医、药类硕士研究生是医学院校的重要任务。医学基础综合实验技术是研究生学习阶段的重要课程。为了培养具有一定科研素养的研究生,以医学基础综合实验技术课程教学为例,分析了研究生的学习现状,并从优化教学内容、加强师资队伍建设、丰富教学手段、建立合理评价体系等方面探讨如何以学生为主体,通过教学改革激发学生的学习主动性和创造性。 展开更多
关键词 医学基础综合实验技术 研究生教学 教学改革
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耐锰细菌鉴定与锰胁迫下的生理响应 被引量:5
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作者 田群 许瑶 +2 位作者 王嘉福 冉雪琴 《山地农业生物学报》 2017年第3期23-28,共6页
为了探究细菌对锰的适应机制,从松桃的锰冶炼区寨英镇采集的土样中分离得到7株耐锰能力达到1 800mg/L的细菌,其中S7和S16两株菌对锰的耐受能力高达2 200 mg/L。形态学、生理生化和16S rDNA基因测序等分析结果表明,这些菌分属于根癌土壤... 为了探究细菌对锰的适应机制,从松桃的锰冶炼区寨英镇采集的土样中分离得到7株耐锰能力达到1 800mg/L的细菌,其中S7和S16两株菌对锰的耐受能力高达2 200 mg/L。形态学、生理生化和16S rDNA基因测序等分析结果表明,这些菌分属于根癌土壤杆菌、沙福芽孢杆菌、根瘤菌属和氧化节杆菌。在锰胁迫条件下,测定菌株S7的生长曲线、超氧化物歧化酶(Superoxide Dismutase,SOD)、过氧化氢酶(Catalase,CAT)活性和电导率。结果表明:在无锰条件下,细菌的生长速度很快,14~18小时后就进入稳定期,在锰胁迫条件下,菌株的生长速度明显减慢,S7菌株的SOD、CAT酶活性在10~18小时时升高,但电导率变化不大。推测耐锰细菌可能通过上调氧化还原酶的活性适应锰胁迫。这对揭示细菌耐受锰的生理机制和锰污染的微生物修复技术奠定理论基础。 展开更多
关键词 锰抗性细菌 超氧化物歧化酶 过氧化氢酶 锰适应
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香猪SNP位点rs80894395的多态性及其与体尺指标之间的关联研究 被引量:3
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作者 王洋 梅子凌 +6 位作者 牛熙 谢玲玲 牛秋锦 仇志浪 王嘉福 冉雪琴 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2016年第5期1294-1301,共8页
为了探究影响香猪生长发育的功能基因,本试验利用Illumina Porcine SNP60K芯片筛选出N-乙酰氨基半乳糖转移酶2(polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2,GALNT2)基因内含子10中一个与腹围呈弱相关的单核苷酸多态性(single nucl... 为了探究影响香猪生长发育的功能基因,本试验利用Illumina Porcine SNP60K芯片筛选出N-乙酰氨基半乳糖转移酶2(polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2,GALNT2)基因内含子10中一个与腹围呈弱相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点rs80894395。在此基础上应用等位基因特异性PCR(allele-specific PCR,AS-PCR)技术检测520头雌性香猪群体中该位点的基因型,并与43头大白猪、36头柯乐猪相比较。结果表明,从3个猪群体中检测到rs80894395位点的CC、CT和TT 3种基因型;其中香猪群体以CT为优势基因型,且基因型与香猪的体重、体长和腹围呈弱的正相关;大白猪群体以CC基因型为主,T等位基因频率较香猪极显著减少(P<0.01);柯乐猪群体中CC与CT基因型频率相等,与香猪和大白猪的基因频率间的差异不显著(P>0.05)。生物信息学分析表明,rs80894395位点可能影响GALNT2基因的剪接过程。rs80894395与香猪的生长发育可能有一定的联系。 展开更多
关键词 香猪 体尺 内含子剪接 SNP GALNT2基因
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遵义朝天椒的化学成分研究 被引量:2
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作者 宋长伟 覃成 +4 位作者 李三华 孟令杰 姜念 刘云 《云南民族大学学报(自然科学版)》 CAS 2018年第6期451-454,共4页
采用硅胶、凝胶及中高压反相色谱等多种分离方法,从遵义朝天椒乙醇提取物的乙酸乙酯萃取部位分离得到了9个化合物,经核磁共振、质谱等波谱方法分别鉴定出其结构为:capsaicin(1),dihydrocapsaicin(2),acetovanillone(3),(-)-epiloliolide... 采用硅胶、凝胶及中高压反相色谱等多种分离方法,从遵义朝天椒乙醇提取物的乙酸乙酯萃取部位分离得到了9个化合物,经核磁共振、质谱等波谱方法分别鉴定出其结构为:capsaicin(1),dihydrocapsaicin(2),acetovanillone(3),(-)-epiloliolide(4),(+) dehydrovomifoliol(5),Ferulic acid(6),vanillin(7),acetosyringone(8),2-(4-Hydroxy-3-methoxyphenyl)-3-(2-hydroxy-5-methoxyphenyl)-3-oxo-1-propanol (9).其中化合物9首次从该植物中分离获得. 展开更多
关键词 CapsicumannuumL. 遵义朝天椒 分离纯化 结构鉴定
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7个猪品种IBSP基因结构变异SV13的群体分析 被引量:1
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作者 刘畅 +2 位作者 徐倩 王嘉福 冉雪琴 《畜牧与兽医》 北大核心 2017年第4期29-32,共4页
应用Hiseq 2000平台测定了香猪的全基因组序列,从中发现整合素结合涎蛋白(IBSP)基因内含子4中存在结构变异,命名为SV13,为了进一步探究SV13在猪群体中的分布,采用PCR技术检测了7个猪品种的SV13基因型。7个猪品种群体中均存在DD、DA和AA... 应用Hiseq 2000平台测定了香猪的全基因组序列,从中发现整合素结合涎蛋白(IBSP)基因内含子4中存在结构变异,命名为SV13,为了进一步探究SV13在猪群体中的分布,采用PCR技术检测了7个猪品种的SV13基因型。7个猪品种群体中均存在DD、DA和AA三种基因型,对纯合的DD和AA基因型测序,明确D等位基因缺失了227 bp。香猪、可乐猪和糯谷猪群体以DD为优势基因型,大白猪以AA基因型为主,6个地方猪品种群体中D的基因频率明显高于大白猪品种(P<0.01),香猪和大白猪群体基因型频率处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.05)。SV13可以作为辅助鉴别6个地方猪品种和大白猪的分子标记。 展开更多
关键词 地方猪品种 结构变异 IBSP
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