不同动物宿主小肠结肠炎耶尔森氏菌分离及结果分析 被引量：26

1

作者 肖玉春 梁俊容 +6 位作者 古文鹏 邱海燕 王树坤 罗隆泽 王化彬 景怀琦 王鑫 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期418-420,共3页

目的了解中国不同地区小肠结肠炎耶尔森氏菌在不同动物宿主中分布状况。方法采集我国不同地区的家畜家禽以及啮齿动物等标本进行小肠结肠炎耶尔森氏菌分离,并对分离到的菌株进行血清分型、生物分型及毒力基因检测。结果从3 386份标本中... 目的了解中国不同地区小肠结肠炎耶尔森氏菌在不同动物宿主中分布状况。方法采集我国不同地区的家畜家禽以及啮齿动物等标本进行小肠结肠炎耶尔森氏菌分离,并对分离到的菌株进行血清分型、生物分型及毒力基因检测。结果从3 386份标本中分离出134株小肠结炎耶尔森氏菌,分离率为3.96%;其中致病性菌株(ystA+ail+virF+yadA+ystB-)30株(22.39%),均为O∶3/3型。非致病性菌104株(ystA-ail-virF-yadA-ystB+或者ystB-)(77.61%)。结论结果表明,我国致病性小肠结肠炎耶尔森菌以O:3/3型为主,猪的分离率最高为6.28%;依次为旱獭、鼠,分别为4.05%、3.41%。 展开更多

关键词 小肠结肠炎耶尔森氏菌 宿主 毒力基因

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不同病原体导致感染性腹泻的症状特征与差异研究 被引量：13

2

作者 贺兆锴 汪静 +18 位作者 孙昊 苏佳 刘翔 古文鹏 于德山 罗隆泽 王鸣柳 胡彬 胡万富 童晶 杨梦 王少玲 汪春翔 王艳玲 湛志飞 段然 秦帅 景怀琦 王鑫 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第8期1328-1334,共7页

目的了解不同病原体导致感染性腹泻相关症状的特征与区别。方法基于2010-2016年我国20个省份的腹泻症候群感染性腹泻病原学监测,收集因急性腹泻就诊的门急诊病例,调查病例基本信息、采集粪便标本,进行共22种常见致泻病原体的病原学检测... 目的了解不同病原体导致感染性腹泻相关症状的特征与区别。方法基于2010-2016年我国20个省份的腹泻症候群感染性腹泻病原学监测,收集因急性腹泻就诊的门急诊病例,调查病例基本信息、采集粪便标本,进行共22种常见致泻病原体的病原学检测,分析不同病原体导致患者腹泻的临床症状模式特征。结果共收集腹泻就诊病例38950例。分别对5种致泻病毒核酸检测,轮状病毒阳性率最高(18.29%),其次为诺如病毒(13.06%);对17种致泻细菌分离培养,致泻性大肠埃希菌分离率最高(6.25%)。细菌性与病毒性腹泻的临床特征差异主要体现在粪便性状与便常规检验结果,但致病性弧菌感染与病毒性腹泻较为相似。结论不同病原体导致感染性腹泻的症状存在不同的特征,可为临床诊断提供依据。 展开更多

关键词 感染性腹泻 细菌 病毒 症状

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云南省非O1/O139群霍乱弧菌分子特征分析 被引量：12

3

作者 廖凤 古文鹏 +1 位作者 徐闻 伏晓庆 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期53-56,66,共5页

目的非O1/O139群霍乱弧菌能够引起人类急性腹泻性疾病,但与O1群和O139群相比,人们往往容易忽视其危害性。因此,我们对分离于云南省的31株非O1/O139群霍乱弧菌开展了分子特征分析。方法采用纸片法(K-B)开展抗生素敏感试验;多聚酶链反应(P... 目的非O1/O139群霍乱弧菌能够引起人类急性腹泻性疾病,但与O1群和O139群相比,人们往往容易忽视其危害性。因此,我们对分离于云南省的31株非O1/O139群霍乱弧菌开展了分子特征分析。方法采用纸片法(K-B)开展抗生素敏感试验;多聚酶链反应(PCR)扩增检测毒力基因;同时,我们对菌株进行了脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分析(MLST)分子分型研究。结果药敏实验结果显示,67.74%的菌株对利福平耐药,对萘啶酸和复方新诺明的耐药率为29.03%,所有的菌株对庆大霉素和环丙沙星敏感;PCR结果显示,所有菌株的ompW基因为阳性,87.10%的菌株hly基因为阳性,25.81%的菌株rstREl tor为阳性,16.13%的菌株rstRClassical和tcpAEl tor为阳性,而CT、rfbO1和rfbO139基因全为阴性;PFGE结果显示,31株非O1/O139群霍乱弧菌呈现出高度的离散趋势,几乎没有相同带型的菌株出现;在MLST结果分析中,发现了1个gyrB新的等位基因,mdh基因发现了4个新的等位基因,metE基因发现了6个新的等位基因,pntA中发现了2个新的等位基因,purM中发现了3个新等位基因,pyrC中发现了4个新等位基因。经过排列组合后,共发现了17个新的霍乱弧菌ST型别(ST273-ST289)。结论非O1/O139群霍乱弧菌呈现出高度的多样性特征,同时,云南省的非O1/O139群霍乱弧菌具有一定的地域特点,丰富了现有的霍乱弧菌分子分型数据库。 展开更多

关键词 非O1/O139群霍乱弧菌 脉冲场凝胶电泳 多位点序列分析

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云南省发现1株携带NDM-1基因的产酸克雷伯菌 被引量：9

4

作者 尹建雯 徐闻 +4 位作者 古文鹏 周永民 李超群 杨建斌 伏晓庆 《疾病监测》 CAS 2012年第3期211-213,217,共4页

目的研究1株产酸克雷伯菌的相关耐药机制。方法对菌株进行了生化鉴定、PCR检测、序列测定、药敏试验。结果经过鉴定,证明此菌株为携带NDM-1基因的产酸克雷伯菌;但不是多重耐药菌。结论耐药问题形势严峻,需要加强监测力度。

关键词 产酸克雷伯菌 NDM-1基因 耐药

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一起由B群沙门菌污染聚餐食品所致食物中毒调查分析 被引量：9

5

作者 韦蝶心 常利涛 +5 位作者 郝林会 徐闻 古文鹏 字桂升 马永梅 徐然 《中国食品卫生杂志》 北大核心 2018年第6期659-662,共4页

目的调查一起农村婚宴聚餐引起食物中毒的致病因子、致病食品及其污染来源,采取有效措施控制事件蔓延,预防今后类似事件的发生。方法开展现场流行病学调查,制定病例定义并主动搜索病例,采用描述流行病学方法分析本次事件病例的流行病学... 目的调查一起农村婚宴聚餐引起食物中毒的致病因子、致病食品及其污染来源,采取有效措施控制事件蔓延,预防今后类似事件的发生。方法开展现场流行病学调查,制定病例定义并主动搜索病例,采用描述流行病学方法分析本次事件病例的流行病学特征。通过个案调查访谈,对参加聚餐的108人开展病例对照研究,分析可能的致病食品。现场勘查和访谈厨师,了解婚宴菜品的制作过程、原料来源和所用水源等,并采集病例肛拭子、婚宴剩余食品、饮用水样进行实验室检测。结果本次食物中毒罹患率为21.6%(138/640),临床表现以腹泻、腹痛、发热为主。单因素分析结果显示94.4%(51/54)的病例和66.7%(36/54)的对照食用过由灌肚、里脊肉片、炸排骨、萝卜丝四种食品组成的凉菜拼盘,食用凉菜拼盘增加发病风险(比值比=8.50, 95%置信区间:2.32～31.02)。叉生分析结果显示同时食用拼盘中两种以上凉菜将增加发病风险(比值比=9.25, 95%置信区间:2.46～34.82)。4份病例肛拭子和1份凉菜拼盘中灌肚均检出B群沙门菌。5株检出的沙门菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)指纹图谱为同一带型,提示病例和食品分离株在分子水平具有高度的同源性,为同一暴露源。结论本次事件是一起由B群沙门菌污染聚餐食品导致的食物中毒。凉菜拼盘是主要的致病食品,食品加工卫生环境与制作过程不规范操作是导致本次食物中毒发生的危险因素。当前农村自办宴席仍存在诸多食源性疾病发生的风险环节,应加强监管。 展开更多

关键词 沙门菌 食源性疾病 农村聚餐 暴发调查 潜伏期 脉冲场凝胶电泳

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昆明市腹泻人群肠致病性大肠杆菌流行特征研究 被引量：7

6

作者 杨春利 张顺先 +10 位作者 艾琳 蔡玉春 卢艳 陈韶红 徐闻 古文鹏 胡薇 陈军虎 李石柱 陈家旭 周晓农 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期321-325,共5页

目的了解云南省昆明市肠致病性大肠杆菌(enteropathogenic Escherichia coli,EPEC)的流行特征,为我国EPEC感染引起的腹泻提供科学依据。方法在云南省昆明市4家哨点医院收集腹泻病例粪便样本1 121份,非腹泻人群粪便样本319份,进行细菌培... 目的了解云南省昆明市肠致病性大肠杆菌(enteropathogenic Escherichia coli,EPEC)的流行特征,为我国EPEC感染引起的腹泻提供科学依据。方法在云南省昆明市4家哨点医院收集腹泻病例粪便样本1 121份,非腹泻人群粪便样本319份,进行细菌培养,选择单个菌落,提取DNA,并采用荧光定量PCR检测EPEC,同时使用结构化问卷收集研究对象基本信息。结果 EPEC在腹泻病例中的检出率高于非腹泻研究对象中的检出率(5.53%,1.88%,χ~2=7.36,P<0.05)。EPEC的检出率在不同年龄组腹泻病例中有统计学差异(χ~2=17.27,P<0.05),其中在2—5岁腹泻病例最高(12.12%,16/132);EPEC的检出率在腹泻病例中有明显的季节分布趋势(χ~2=12.82,P<0.05),其中EPEC在夏季最高(9.00%,18/200),冬季最低(3.05%,12/394)。EPEC阳性的腹泻病例水样便占61.3%(38/62),出现脱水症状占12.9%(8/62)。结论 EPEC是昆明市人群腹泻的重要细菌性病原体之一,且EPEC感染以5岁以下儿童为主,EPEC感染容易造成脱水。 展开更多

关键词 腹泻病例 非腹泻研究对象 肠致病性大肠杆菌 流行病学特征

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昆明2014-2015年腹泻儿童杯状病毒分子流行病学研究 被引量：6

7

作者 李颖颖 古文鹏 +6 位作者 张顺先 向以斌 杨景晖 周晓芳 伏晓庆 李利 徐闻 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2015年第5期430-433,共4页

目的 了解杯状病毒在昆明的分子流行病学特征,为预防和控制腹泻提供科学的参考依据.方法 收集云南省第一人民医院和昆明市儿童医院2014年7月至2015年6月5岁以下腹泻患儿的粪便标本321份,采用RT-PCR的方法检测杯状病毒,并选取部分阳性扩... 目的 了解杯状病毒在昆明的分子流行病学特征,为预防和控制腹泻提供科学的参考依据.方法 收集云南省第一人民医院和昆明市儿童医院2014年7月至2015年6月5岁以下腹泻患儿的粪便标本321份,采用RT-PCR的方法检测杯状病毒,并选取部分阳性扩增产物经序列测定分析其基因型.结果 321份粪便标本中HuCV的阳性率为10.59％（34/321）,感染无明显的季节性,检出率在患者性别和年龄组间的差异均无统计学意义;34份HuCV阳性标本中以NoV为主,占94.12％ （32/34）,其中绝大多数为GⅡ型（31/32,96.88％）,仅1株为GⅠ型;SaY共2株,占5.88％（2/34）,分别为GⅠ型和GⅡ型.结论 HuCV是昆明地区5岁以下腹泻患儿的重要病原体之一,GⅡ.4/Sydney2012株是流行优势株. 展开更多

关键词 杯状病毒 腹泻 分子流行病学 序列分析

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鼠伤寒沙门菌致幼儿腹泻的病例检测与调查分析 被引量：6

8

作者 周永明 张顺先 +6 位作者 古文鹏 尹建雯 张京云 周晓农 阚飙 徐闻 李利 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期1018-1020,共3页

腹泻是危害儿童身体健康和生命安全的重要公共卫生问题之一。据估计2011年全球约有70万儿童死于腹泻，在一些发展中国家迁延性腹泻所致死亡占儿童腹泻死亡的比例高达50％以上。国内外调查显示，沙门菌感染是5岁以下儿童急性腹泻的主要... 腹泻是危害儿童身体健康和生命安全的重要公共卫生问题之一。据估计2011年全球约有70万儿童死于腹泻，在一些发展中国家迁延性腹泻所致死亡占儿童腹泻死亡的比例高达50％以上。国内外调查显示，沙门菌感染是5岁以下儿童急性腹泻的主要原因之一。本研究于2014年在云南昆明某综合医院儿科开展腹泻监测时，从1例迁延性腹泻患儿粪便标本中先后3次检出鼠伤寒沙门菌。本研究对患儿进行了回顾性调查、随访和实验室检测，对其发病情况、诊治经过、病原特征和转归等进行了综合分析。 展开更多

关键词 沙门菌 鼠伤寒 腹泻 婴儿

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感染性腹泻患者肠道菌群失衡特征分析

9

作者 古文鹏 吕迪 +7 位作者 周晓芳 贾森泉 赵晓南 张勇 周永明 尹建雯 黄莉 伏晓庆 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期408-414,共7页

目的研究不同病原体感染造成的感染性腹泻患者肠道菌群失衡特征,以及拟杆菌属在维持肠道内环境稳态中的作用,为后续感染性腹泻的治疗提供新思路。方法采用三代全长16S rRNA扩增子方法,测定由病毒和细菌等病原感染引起的腹泻患者肠道菌群... 目的研究不同病原体感染造成的感染性腹泻患者肠道菌群失衡特征,以及拟杆菌属在维持肠道内环境稳态中的作用,为后续感染性腹泻的治疗提供新思路。方法采用三代全长16S rRNA扩增子方法,测定由病毒和细菌等病原感染引起的腹泻患者肠道菌群,同时与健康人群肠道进行对比分析。按照单一细菌感染、单一病毒感染、混合感染以及艰难梭菌感染等对腹泻患者进行分组和分析。结果拟杆菌在健康人群肠道环境中占据绝对的数量和丰度水平,而感染性腹泻患者的拟杆菌门/纲/目/科/属等各分类水平的相对丰度均有下降。α多样性分析结果显示不同组别之间无统计学差异;β多样性中,NMDS和PCoA分析显示健康对照组与感染性腹泻各组中形成了明显的不同聚类群。健康人群肠道菌群的多样性水平高于各感染性腹泻组。物种差异分析表明,由不同病原体感染造成的感染性腹泻患者具有各自不同的优势肠道菌群。单一病毒感染之后以双歧杆菌属作为其优势菌群;单一细菌感染之后以链球菌属为优势菌群;混合感染组中以拉氏梭菌属为优势菌群。艰难梭菌感染组中的埃希菌属和克雷伯菌属是该组中的优势菌群。同时,健康人群肠道中的优势菌群是拟杆菌属。COG功能预测结果显示,健康对照组与各感染组形成了明显不同的聚类群。感染性腹泻各组中的防御机制功能、细胞壁合成、蛋白修饰、细胞分化以及复制和重组等功能均明显降低。结论由不同病原感染造成的感染性腹泻患者出现不同程度的菌群失调特征,肠道菌群的多样性降低,并出现各自的优势菌群。同时,拟杆菌属在维持人体肠道内环境稳态中具有关键作用,为后续感染性腹泻的治疗和研究等领域提供了新的思路。 展开更多

关键词 感染性腹泻 肠道菌群 拟杆菌属

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昆明市一起聚集性发热疫情中腺病毒3型Penton base、Hexon和Fiber基因遗传进化分析

10

作者 刘艳艳 古文鹏 +5 位作者 段忠文 王钰 龚娇 茶琦雁 吴林蔚 侯敏 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期241-248,共8页

目的对昆明市一起聚集性发热疫情样本进行腺病毒检测和遗传进化分析。方法采集典型发热患者咽拭子标本,使用微流体芯片技术进行30种常见呼吸道传染病病原体核酸检测。对腺病毒核酸阳性标本使用Nanopore三代高通量测序技术进行Penton bas... 目的对昆明市一起聚集性发热疫情样本进行腺病毒检测和遗传进化分析。方法采集典型发热患者咽拭子标本,使用微流体芯片技术进行30种常见呼吸道传染病病原体核酸检测。对腺病毒核酸阳性标本使用Nanopore三代高通量测序技术进行Penton base、Hexon和Fiber三个重要基因全长序列扩增、测定和分型鉴定,构建系统进化树,开展分子变异、遗传进化等分析。结果共采集5份标本,均检出呼吸道腺病毒及流感嗜血杆菌。对腺病毒进行Nanopore三代基因测序最终均获得Penton base、Hexon和Fiber基因全长编码区核苷酸序列,5份标本之间3个基因核苷酸相似性依次为100.0%、99.9%~100.0%和100.0%,氨基酸同源性均为100.0%;与HAdV3原型株(AY599834)核苷酸相似性最高,分别为98.6%、98.7%和98.9%。系统发育分析表明,3个基因系统进化树分析结果基本一致,人腺病毒3型(HAdV3)原型株单独一支,本研究中HAdV3序列均划分在同一进化分支上,与较早年份国外及中国台湾毒株亲缘关系较远,与近年国内外毒株亲缘关系较近,与2019年日本株(LC703523)和中国广州株(MZ540961)高度同源。与原型株比较分析昆明HAdV3氨基酸突变位点,Penton base有5处变异;Hexon有10处变异;Fiber有11处变异。结论本起疫情中的腺病毒在Penton base、Hexon和Fiber基因全长序列中型别分型结果一致,为P3H3F3型,与包括原型株在内的国内外HAdV3毒株显示出非常小的遗传变异。与原型株相比发生了多处氨基酸位点突变,并且多数氨基酸位点变异发生在蛋白质的高变区或功能区,其中Hexon蛋白中M7L为昆明序列独有氨基酸突变位点。 展开更多

关键词 人腺病毒3型 五邻体基座蛋白 六邻体蛋白 纤维蛋白 遗传进化

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昆明市腹泻人群中肠黏附性大肠埃希菌的流行特征 被引量：6

11

作者 张顺先 杨春利 +13 位作者 艾琳 陈木新 蔡玉春 卢艳 陈韶红 徐闻 古文鹏 周永明 夏尚 陈军虎 李石柱 陈家旭 胡薇 周晓农 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2017年第4期298-301,共4页

目的了解昆明地区肠黏附性大肠埃希菌(Enteroaggregative Escherichia coli,EAEC)的流行特征,为防治EAEC感染提供科学参考。方法收集云南省昆明市4家哨点医院的腹泻患者粪便标本1 121份,非腹泻者的粪便标本319份,进行细菌培养(麦康凯培... 目的了解昆明地区肠黏附性大肠埃希菌(Enteroaggregative Escherichia coli,EAEC)的流行特征,为防治EAEC感染提供科学参考。方法收集云南省昆明市4家哨点医院的腹泻患者粪便标本1 121份,非腹泻者的粪便标本319份,进行细菌培养(麦康凯培养基),无菌挑选单个菌落(8-12个),采用热提取法提取细菌DNA,采用荧光定量PCR检测EAEC,同时使用结构化问卷收集研究对象的基本信息。结果 EAEC在腹泻患者和非腹泻者中的检出率分别为5.4%和1.3%,差异有统计学意义(χ2=10.104,P<0.05)。男、女腹泻患者EAEC检出率分别为5.2%和5.7%,差异无统计学意义(χ~2=0.140,P>0.05);不同年龄组腹泻患者中EAEC检出率差异无统计学意义(χ~2=10.865,P>0.05);腹泻患者EAEC检出率有明显的季节分布特征(χ~2=12.819,P<0.05),夏季检出率最高(10.5%,21/200);冬季最低(2.0%,8/394)。EAEC阳性腹泻患者水样便占26.2%(16/61),黏液样便占70.5%(43/61)。EAEC腹泻患者易出现呕吐症状(χ~2=12.819,P<0.05)。结论 EAEC是腹泻的重要细菌性病原体,开展和加强EAEC的监测,可为EAEC相关腹泻的预防和控制提供科学依据。 展开更多

关键词 腹泻病例 肠黏附性大肠埃希菌 流行特征 昆明市

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昆明地区2018-2020年腹泻患者中艰难梭菌感染特征分析 被引量：1

12

作者 李桂满 古文鹏 +8 位作者 侯敏 贾森泉 王媛媛 白璐璐 尹建雯 周永明 伏晓庆 卢金星 吴媛 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期624-628,共5页

目的对2018-2020年昆明地区腹泻患者中艰难梭菌感染特征进行分析,为后续监测和防治提供数据支持。方法收集2018-2020年云南省4家哨点医院腹泻患者粪便标本共388份,使用实时荧光定量PCR方法进行艰难梭菌粪便毒素基因检测,对结果阳性的粪... 目的对2018-2020年昆明地区腹泻患者中艰难梭菌感染特征进行分析,为后续监测和防治提供数据支持。方法收集2018-2020年云南省4家哨点医院腹泻患者粪便标本共388份,使用实时荧光定量PCR方法进行艰难梭菌粪便毒素基因检测,对结果阳性的粪便标本进行菌株的分离,用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱鉴定菌株。提取分离菌株的基因组DNA进行多位点序列分型(MLST)。分析毒素阳性和菌株分离阳性与患者的临床特征以及艰难梭菌阳性与其他病原共感染的情况。结果388份粪便标本中,艰难梭菌内参tpi基因阳性标本47份,总阳性率为12.11%。其中,非产毒艰难梭菌4份(8.51%),产毒艰难梭菌43份(91.49%)。47份阳性标本分离得到18株艰难梭菌,阳性标本的分离率为38.30%。其中tcdA、tcdB、tcdC、tcdR和tcdE基因均为阳性的菌株14株。18株艰难梭菌的二元毒素均为阴性。所有分离菌株的MLST结果共形成10种序列型(ST),其中ST37型5株(27.78%);ST129、ST3、ST54和ST2型各2株;ST35、ST532、ST48、ST27和ST39型各1株。粪便毒素基因阳性(tcdB+)结果与患者年龄、就诊前发热差异有统计学意义;菌株分离阳性仅与患者年龄差异有统计学意义。同时,部分腹泻患者存在艰难梭菌与其他腹泻病毒共感染的情况。结论昆明地区腹泻患者中艰难梭菌的感染多为产毒株,MLST结果具有高度的离散特征,应加强开展艰难梭菌的监测和预防。 展开更多

关键词 艰难梭菌 腹泻 毒素基因 多位点序列分型 共感染

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艰难梭菌五种实验室检测方法的评价 被引量：5

13

作者 刘笑舒 廖凤 +5 位作者 李文革 古文鹏 张文竹 陈小萍 吴媛 卢金星 《疾病监测》 CAS 2017年第4期351-354,共4页

目的比较5种艰难梭菌检测方法并进行评价。方法包括tcdB基因PCR检测、tcdB基因Real-time PCR检测、酶联免疫法、酶联免疫层析法以及环丝氨酸-头孢西丁-果糖琼脂(CCFA)常规培养法。以CCFA培养的检测结果作为参考,对以上几种方法进行评价... 目的比较5种艰难梭菌检测方法并进行评价。方法包括tcdB基因PCR检测、tcdB基因Real-time PCR检测、酶联免疫法、酶联免疫层析法以及环丝氨酸-头孢西丁-果糖琼脂(CCFA)常规培养法。以CCFA培养的检测结果作为参考,对以上几种方法进行评价。结果得到上述检测方法的敏感度、特异度、阳性预测值和阴性预测值结果以及其与参考方法的Kappa值。在125例样本中,CCFA培养法检出阳性标本11份,tcdB基因普通PCR检测、tcdB基因Real-time PCR检测、酶联免疫法、酶联免疫层析法分别检出阳性12、12、50和25例,4种方法间检出阳性率差异有统计学意义(χ~2=61.452,P<0.000 1),敏感度分别为63.64%、63.64%、63.64%和54.55%,差异无统计学意义(χ~2=0.288,P=0.962);特异度为95.61%、95.61%、62.28%和83.33%,差异有统计学意义(χ~2=63.597,P<0.000 1)。结论 PCR方法敏感度、特异度最高,成本较低,适用于有实验条件的流行病学调查和临床诊断,两种免疫方法试剂盒适用于临床先期筛查以及辅助诊断。 展开更多

关键词 艰难梭菌 检测方法 敏感度 特异度

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基于16S rRNA测序对树鼩肠道菌群特征与高级别肉瘤的相关性分析 被引量：6

14

作者 黄鑫 古文鹏 +4 位作者 黎晓慧 李娜 贾杰 李明学 代解杰 《中国比较医学杂志》 CAS 北大核心 2019年第8期11-16,49,共7页

目的检测高级别肉瘤的树鼩肠道微生物菌群结构,为探讨肠道微生物菌群结构的改变与肿瘤发生的相关性提供科学依据。方法选取3例患有恶性高级别肉瘤树鼩粪便为CA组,6例健康树鼩粪便为对照NO组。通过16SV3+4区引物进行细菌多样性的鉴定,通... 目的检测高级别肉瘤的树鼩肠道微生物菌群结构,为探讨肠道微生物菌群结构的改变与肿瘤发生的相关性提供科学依据。方法选取3例患有恶性高级别肉瘤树鼩粪便为CA组,6例健康树鼩粪便为对照NO组。通过16SV3+4区引物进行细菌多样性的鉴定,通过对Reads剪切过滤,OTUs聚类,并进行物种注释及丰度分析,得出两组树鼩肠道微生物结构、丰度以及多样性。结果比较CA组和NO组树鼩肠道微生物结构,多样性指数Chao1指数值、ACE指数值、Shannon指数值差异无统计学意义(P>0.05)。NO组的树鼩肠道菌群OTUs为640种,而CA组为494种,健康树鼩肠道菌群结构呈多样性。在门水平上比较,其中CA组中螺旋体门(Spirochaetes)丰度为0.03%,低于NO组(丰度为0.12%),且差异有统计学意义(P<0.05);CA组厚壁菌门(Firmicutes)丰度为77.79%高于NO组(47.65%),但差异无统计学意义;CA组的拟杆菌门(Bacteroidetes)丰度为0.75%低于NO组(8.31%),但差异无统计学意义。CA组中的乳杆菌属(lactobacillus)是具有统计学意义的生物标识。结论患有高级别肉瘤树鼩的肠道菌群结构丰度和多样性低于健康树鼩,肠道菌群的结构改变及厚壁菌门含量增加可能增加恶性肿瘤的发生。 展开更多

关键词 肠道菌群 高级别肉瘤 16srRNA测序 树鼩

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艰难梭菌感染诊断团体标准解读 被引量：4

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作者 吴媛 卢金星 +12 位作者 闫中强 刘运喜 古文鹏 伏晓庆 徐英春 吴安华 黄海辉 宗志勇 金大智 赵建宏 陈烨 刘卫平 李卫光 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期64-67,共4页

艰难梭菌是引起抗生素相关性腹泻和医疗机构相关性腹泻的重要病原,在欧美引起暴发流行,造成沉重疾病负担。然而我国艰难梭菌感染调查缺乏统一的诊断原则和检测技术规范,我国艰难梭菌感染率和疾病负担尚不明确。因此中国CDC传染病预防控... 艰难梭菌是引起抗生素相关性腹泻和医疗机构相关性腹泻的重要病原,在欧美引起暴发流行,造成沉重疾病负担。然而我国艰难梭菌感染调查缺乏统一的诊断原则和检测技术规范,我国艰难梭菌感染率和疾病负担尚不明确。因此中国CDC传染病预防控制所联合全国其他11家单位撰写《艰难梭菌感染诊断(T/CPMA 008-2020)》中华预防医学会团体标准,以"合法性、科学性、先进性、可行性"为原则,给出了艰难梭菌感染的危险因素、诊断原则、诊断和鉴别诊断。旨在提高临床感染性腹泻中艰难梭菌感染诊断的准确性,指导监测工作开展,明确我国艰难梭菌感染的风险和疾病负担。 展开更多

关键词 艰难梭菌感染 诊断 检测 团体标准

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云南省2005-2012年91株甲型副伤寒沙门菌病原学特征分析 被引量：4

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作者 陈玉娟 尹建雯 +4 位作者 古文鹏 李超群 杨建斌 徐闻 伏晓庆 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期49-53,57,共6页

目的通过对分离自云南省不同地区、不同年份的甲型副伤寒沙门菌进行病原学分析研究,弄清云南省甲型副伤寒的流行特征,为查明云南省甲型副伤寒高发原因提供科学依据。方法采用K-B纸片扩散法对所有菌株进行药物敏感试验;采用脉冲场凝胶电... 目的通过对分离自云南省不同地区、不同年份的甲型副伤寒沙门菌进行病原学分析研究,弄清云南省甲型副伤寒的流行特征,为查明云南省甲型副伤寒高发原因提供科学依据。方法采用K-B纸片扩散法对所有菌株进行药物敏感试验;采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对菌株进行分子分型研究。结果 91株甲型副伤寒沙门菌药敏试验结果表明,大多数菌株对常用多种抗生素敏感,但有部分地区的菌株出现三重及多重耐药。所有菌株的PFGE结果显示,91株甲型副伤寒沙门菌XbaI酶切结果可分为两个大的聚类群,而且经XbaI和Spe I双酶切证实云南省不同地区、年份分离的菌株具有较高的同源性关系。结论云南省的甲型副伤寒沙门菌具有2种类型的优势菌株,并且具有较高的同源性关系,提示云南省不同地区、年份的甲型副伤寒的流行可能具有相似的传播途径,而菌株的药敏试验结果则能给临床治疗提供用药参考依据。 展开更多

关键词 甲型副伤寒 药敏试验 脉冲场凝胶电泳

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云贵川渝2012-2015年腹泻病原谱分析 被引量：4

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作者 曹亿会 向以斌 +5 位作者 姜黎黎 周晓芳 尹洁 尹建雯 古文鹏 寸建萍 《国际流行病学传染病学杂志》 CAS 2017年第5期292-295,共4页

目的 了解云南省、四川省、贵州省和重庆市腹泻病原流行特征.方法 回顾性分析2012-2015年4省市监测点对应哨点医院收集的腹泻病例特征,归纳分析4省市腹泻病原的构成情况.结果 腹泻病例约从每年的7月份开始增加,9-11月达到峰值,男性为女... 目的 了解云南省、四川省、贵州省和重庆市腹泻病原流行特征.方法 回顾性分析2012-2015年4省市监测点对应哨点医院收集的腹泻病例特征,归纳分析4省市腹泻病原的构成情况.结果 腹泻病例约从每年的7月份开始增加,9-11月达到峰值,男性为女性的1.49倍,2岁以下病例占66.49％（3 489例）.腹泻病毒和细菌检出率分别是30.90％（1 305/4223）和9.50％（364/3 830）,寄生虫检出3例.四川、云南、重庆以轮状病毒为主要的腹泻病毒,分别占43.06％、56.90％和49.87％,贵州省主要是诺如病毒（38.18％）.腹泻细菌病原谱贵州省和云南省以致泻性大肠埃希菌为主,分别占51.09％和76.30％,而四川省和重庆市是非伤寒沙门菌占优势,分别占50.41％和81.58％.仅病毒感染的腹泻患者占76.83％,细菌感染次之,病毒和细菌混合感染6.03％.结论 腹泻患者婴幼儿较多,病毒为主要病原体,应加强夏秋季节婴幼儿腹泻性疾病的防控工作. 展开更多

关键词 腹泻 细菌 病毒 寄生虫

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耶尔森菌致病机理研究 被引量：3

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作者 古文鹏 景怀琦 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第9期862-866,共5页

关键词 耶尔森菌属 致病机理 小肠结肠炎耶尔森菌 y.pestis 假结核耶尔森菌 鼠疫耶尔森菌 革兰氏染色 短小杆菌

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云南省食源性金黄色葡萄球菌脉冲场凝胶电泳分型分析 被引量：3

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作者 国译丹 杨祖顺 +4 位作者 古文鹏 汤晓召 邹颜秋硕 刘海霞 范璐 《食品安全质量检测学报》 CAS 2017年第10期3826-3830,共5页

目的采用脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)方法分析云南省2013～2015年食源性金黄色葡萄球菌分子分型带型,初步建立金黄色葡萄球菌PFGE分型的数据库。方法用限制性内切酶Smal I酶切113株金黄色葡萄球菌染色体DNA... 目的采用脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)方法分析云南省2013～2015年食源性金黄色葡萄球菌分子分型带型,初步建立金黄色葡萄球菌PFGE分型的数据库。方法用限制性内切酶Smal I酶切113株金黄色葡萄球菌染色体DNA以进行PFGE分析,并利用BioNumerics软件对分离株的指纹图谱进行聚类分析。结果 113株食源性金黄色葡萄球菌的PFGE图谱的相似性系数在56.67%～100%之间,经聚类分析得到89个PFGE型别。结论建立云南省食源性金黄色葡萄球菌PFGE分型数据库,PFGE带型呈现多样性,对今后云南省金黄色葡萄球菌引起食物中毒的诊断和溯源工作有重要意义。 展开更多

关键词 脉冲场凝胶电泳 食源性金黄色葡萄球菌 食物中毒

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2011年云南省中缅边境地区三起霍乱疫情菌株分子分型研究 被引量：3

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作者 古文鹏 伏晓庆 +6 位作者 杨建斌 尹建雯 曹亿会 李超群 杨溪 徐闻 赵世文 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期573-574,共2页

云南省德宏傣族景颇族自治州位于云南省西部，其南、西和西北与缅甸接壤，是一个少数民族聚居区，因特殊的地域环境和气候条件，历来为霍乱疫情的高发地区之一。笔者对该地区2011年3起霍乱疫情的菌株进行了分子分型研究，现报告如下。

关键词 分子分型 中缅边境地区 云南省 疫情 霍乱 菌株 少数民族 气候条件

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