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一种外三元纯种猪、二元猪、三元猪和多元回交猪的鉴定方法研究
1
作者
郑春婷
胡云洋
+11 位作者
张春光
叶子源
张琛
罗云燕
秦蕾
彭子璇
于亦飞
冼
旺
莹
楚菡
洪亮
张建斌
蒲蕾
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期1160-1170,共11页
【目的】获得外三元猪品种鉴定的有效基因型并建立系统的猪种质鉴定方案,为外三元猪种质鉴定提供思路。【方法】本研究对613头杜洛克猪Illumina 60K芯片、503头长白猪Illumina中芯一号50K芯片及10头大白猪重测序数据进行纯合位点统计分...
【目的】获得外三元猪品种鉴定的有效基因型并建立系统的猪种质鉴定方案,为外三元猪种质鉴定提供思路。【方法】本研究对613头杜洛克猪Illumina 60K芯片、503头长白猪Illumina中芯一号50K芯片及10头大白猪重测序数据进行纯合位点统计分析,筛选获得常染色体上杜洛克猪、长白猪、大白猪的特异性单核苷酸多态性(SNP)位点。以120头不同品系不同品种猪耳组织DNA为模板进行PCR扩增,并测序验证特异性SNP位点,筛选有效的特异性基因位点,通过位点联合分析建立外三元纯种、二元、三元及多元回交猪品种鉴定方案。【结果】通过芯片数据比对共获得6个长白猪特有SNPs位点,8个杜洛克猪特有的SNPs位点,1个大白猪特有SNP位点。测序验证结果显示有效SNPs位点分别为SSC13:57293969 A>G、SSC11:47494227 T>G、SSC6:110653413 T>C和SSC6:110653219 T>C。根据位点突变类型及遗传规律,制定了三位点联合分析的种质鉴定方案,并鉴定出长白纯种猪、多元回交长白猪等多个猪种。【结论】本研究利用猪种特异性SNP位点制定了外三元纯种、二元、三元及多元回交猪品种鉴定方案。试验结果为外三元猪种质鉴定提供参考和技术支撑。
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关键词
外三元猪
芯片比对
单核苷酸多态性(SNP)
种质鉴定
下载PDF
职称材料
题名
一种外三元纯种猪、二元猪、三元猪和多元回交猪的鉴定方法研究
1
作者
郑春婷
胡云洋
张春光
叶子源
张琛
罗云燕
秦蕾
彭子璇
于亦飞
冼
旺
莹
楚菡
洪亮
张建斌
蒲蕾
机构
天津市绿色生态饲料重点实验室
天津农学院动物科学与动物医学学院
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期1160-1170,共11页
基金
天津市科技计划项目(23ZYCGSN00230)
大学生创新创业训练项目(202310061006)
+1 种基金
天津市绿色生态饲料重点实验室(TJ202302)
天津市生猪产业技术体系创新团队(ITTPRS2024006)。
文摘
【目的】获得外三元猪品种鉴定的有效基因型并建立系统的猪种质鉴定方案,为外三元猪种质鉴定提供思路。【方法】本研究对613头杜洛克猪Illumina 60K芯片、503头长白猪Illumina中芯一号50K芯片及10头大白猪重测序数据进行纯合位点统计分析,筛选获得常染色体上杜洛克猪、长白猪、大白猪的特异性单核苷酸多态性(SNP)位点。以120头不同品系不同品种猪耳组织DNA为模板进行PCR扩增,并测序验证特异性SNP位点,筛选有效的特异性基因位点,通过位点联合分析建立外三元纯种、二元、三元及多元回交猪品种鉴定方案。【结果】通过芯片数据比对共获得6个长白猪特有SNPs位点,8个杜洛克猪特有的SNPs位点,1个大白猪特有SNP位点。测序验证结果显示有效SNPs位点分别为SSC13:57293969 A>G、SSC11:47494227 T>G、SSC6:110653413 T>C和SSC6:110653219 T>C。根据位点突变类型及遗传规律,制定了三位点联合分析的种质鉴定方案,并鉴定出长白纯种猪、多元回交长白猪等多个猪种。【结论】本研究利用猪种特异性SNP位点制定了外三元纯种、二元、三元及多元回交猪品种鉴定方案。试验结果为外三元猪种质鉴定提供参考和技术支撑。
关键词
外三元猪
芯片比对
单核苷酸多态性(SNP)
种质鉴定
Keywords
foreign ternary pig
chip comparison
single nucleotide polymorphism(SNP)
germplasm identification
分类号
S813.3 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一种外三元纯种猪、二元猪、三元猪和多元回交猪的鉴定方法研究
郑春婷
胡云洋
张春光
叶子源
张琛
罗云燕
秦蕾
彭子璇
于亦飞
冼
旺
莹
楚菡
洪亮
张建斌
蒲蕾
《中国畜牧兽医》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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