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基于网络药理学研究追风伞治疗骨关节炎物质基础及作用机制 被引量：2
1
作者 黄华进 李红美 +1 位作者 何雅风 李煦照 《山东化工》 CAS 2022年第5期71-74,84,共5页
目的:探讨追风伞(Lysimachia paridiformis Franch)治疗骨关节炎(OA)的物质基础和作用机制。方法:通过液相色谱-质谱(LC-MS)预测追风伞的主要有效成分,用Pubchem下载成分的2D结构随后使用SwissTargetPrediction数据库预测成分的靶点。使... 目的:探讨追风伞(Lysimachia paridiformis Franch)治疗骨关节炎(OA)的物质基础和作用机制。方法:通过液相色谱-质谱(LC-MS)预测追风伞的主要有效成分,用Pubchem下载成分的2D结构随后使用SwissTargetPrediction数据库预测成分的靶点。使用TTD、GeneCards、CTD数据库获取OA相关靶点,并通过Venny2.1.0筛选追风伞有效成分靶点与OA的交集靶点,采用Cytoscape v3.8.0软件构建“药物-活性成分-药靶-骨关节炎”网络,用String数据库作蛋白互作网络(PPI)分析。最后通过DAVID数据库对核心靶点进行基因本体(GO)注释和基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果:筛选出追风伞有效成分9个,与OA交集靶点30个。“药物-活性成分-药靶-骨关节炎”网络中Degree排前5的成分为杨梅素、山萘酚、漆黄素、肉豆蔻酸、腺苷。GO功能注释与KEGG通路富集分析共得到35个GO注释条目、10条KEGG信号通路。结论:结果显示追风伞治疗OA的主要有效成分与治疗潜能机制具有多靶点、多通路特点,为后续深入追风伞的作用机制提供了思路和基础。 展开更多
关键词 网络药理学 追风伞 骨关节炎 物质基础 作用机制 靶点
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基于组学和信息学探索山豆根干预血液系统的毒性轮廓 被引量：1
2
作者 张帅男 何雅风 李煦照 《中华中医药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期6738-6741,共4页
目的:基于组学和信息学探索山豆根干预血液系统的毒性轮廓。方法:代谢组学和蛋白质组学被用于分析山豆根干预后小鼠血清中差异表达的代谢物和蛋白质。MetaboAnalyst数据库被用于分析这些内源性靶点的联合通路。基于这些靶点,生物信息学... 目的:基于组学和信息学探索山豆根干预血液系统的毒性轮廓。方法:代谢组学和蛋白质组学被用于分析山豆根干预后小鼠血清中差异表达的代谢物和蛋白质。MetaboAnalyst数据库被用于分析这些内源性靶点的联合通路。基于这些靶点,生物信息学数据库被用于筛选山豆根干预血液系统的物质基础。化学信息学数据库被用于预测化学成分的体内分布情况。结果:组学分析表明,经山豆根干预后,小鼠血清中的30个代谢物和83个蛋白质发生差异表达。其中,4个差异表达的代谢物和13个差异表达的蛋白质参与了15个显著调节通路。在成分靶点的介导下,32个成分有可能干预了13个毒性靶点的表达。根据VDss指数,大部分的成分分子趋向于分布在血液中。结论:在毒性剂量下,山豆根有促使细胞凋亡、癌症发展及预后不良、血液疾病、代谢性疾病、炎症等发生的趋势。 展开更多
关键词 山豆根 血液系统 毒性轮廓 代谢组学 蛋白质组学 生物信息学 化学信息学
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通过网络药理学探讨山豆根干预肺癌的作用机制及物质基础
3
作者 何雅风 黄华进 +2 位作者 李红美 张帅男 李煦照 《贵州科学》 2023年第3期6-11,共6页
目的:研究山豆根(Sophora tonkinensis Gagnep)治疗肺癌的物质基础和作用机制。方法:首先对山豆根进行液相色谱-质谱联用分析,获得有效成分,随后通过数据库Pubchem,获得山豆根成分的2D结构,然后将这些2D结构导入到Swiss Target Predict... 目的:研究山豆根(Sophora tonkinensis Gagnep)治疗肺癌的物质基础和作用机制。方法:首先对山豆根进行液相色谱-质谱联用分析,获得有效成分,随后通过数据库Pubchem,获得山豆根成分的2D结构,然后将这些2D结构导入到Swiss Target Prediction数据库,预测其作用靶点。在CTD数据库中,查找出与肺癌相关的靶点,采用韦恩图对山豆根化学成分的靶点与其肺癌相关靶点进行结合,得出二者相互交叉的部分,即为交集靶点。采用Cytoscape v3.8.0软件构建“成分-靶点-疾病”的网络关系,采用DAVID数据库对交集靶点进行KEGG通路分析。最后对交集靶点进一步分析,获得山豆根治疗肺癌的有效成分。结果:获得44个交集靶点,进一步挑选出核心靶点5个,筛选出8条KEGG信号通路和8个山豆根治疗肺癌的活性成分。结论:本文对山豆根具有多成分、多靶点、多通路等特点的肺癌治疗方法进行了研究和分析,为今后的肺癌治疗提供了理论依据。 展开更多
关键词 网络药理学 山豆根 肺癌 物质基础 作用机制 靶点
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基于生物化学网络探讨山豆根干预哮喘的作用机制及物质基础
4
作者 何雅风 李红美 +3 位作者 魏明星 唐文雅 张帅男 李煦照 《药物化学》 2022年第3期265-274,共10页
目的:研究山豆根(Sophora tonkinensis Gagnep)治疗哮喘的物质基础和作用机制。方法:首先对山豆根进行液相色谱–质谱联用分析,获得山豆根的化学成分,随后通过数据库TCMIP,获得山豆根成分所能预测的靶点。在CTD数据库中,查找出与哮喘相... 目的:研究山豆根(Sophora tonkinensis Gagnep)治疗哮喘的物质基础和作用机制。方法:首先对山豆根进行液相色谱–质谱联用分析,获得山豆根的化学成分,随后通过数据库TCMIP,获得山豆根成分所能预测的靶点。在CTD数据库中,查找出与哮喘相关靶点,通过韦恩图对山豆根化学成分的靶点与其哮喘相关靶点进行结合,得出二者相互交叉的部分,即为交集靶点。采用Cytoscape v3.8.0软件构建“成分–靶点–疾病”的网络关系,采用DAVID数据库对交集靶点进行KEGG通路分析。最后对交集靶点进一步分析,获得山豆根治疗哮喘的核心靶点。结果:获得127个交集靶点与12个山豆根治疗哮喘的活性成分,筛选出31条KEGG信号通路,进一步挑选出核心靶点7个。结论:本文对山豆根具有多成分、多靶点、多通路等特点的哮喘治疗方法进行了研究和分析,为今后哮喘的治疗提供了理论依据。 展开更多
关键词 生物化学网络 山豆根 哮喘 物质基础 作用机制 靶点
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