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转录组平台技术及其在代谢工程中的应用 被引量:23
1
作者 史硕博 陈涛 赵学明 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第9期1187-1198,共12页
组学技术在系统水平上对细胞代谢进行全面的分析,极大地促进了代谢工程的发展和应用。全基因组水平的转录分析可以使研究者更加精确地评估细胞表型,加深对细胞代谢的理解。而且转录组分析也有助于研究者鉴定菌种改良的目标基因,加速对... 组学技术在系统水平上对细胞代谢进行全面的分析,极大地促进了代谢工程的发展和应用。全基因组水平的转录分析可以使研究者更加精确地评估细胞表型,加深对细胞代谢的理解。而且转录组分析也有助于研究者鉴定菌种改良的目标基因,加速对微生物细胞工厂的合理设计及构建。文中介绍了3种主要转录组平台技术的原理,并总结了转录组学在代谢工程领域中应用的最新进展和未来发展趋势。 展开更多
关键词 转录组 代谢工程 基因芯片 SERIAL analysis of gene expression(SAGE) massively parallel signature sequencing(MPSS) RNA-seq
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合成生物学在医药及能源领域的应用 被引量:21
2
作者 刘夺 杜瑾 +1 位作者 赵广荣 元英进 《化工学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第9期2391-2397,共7页
合成生物学是以工程学思想为指导,对天然生物系统进行重新设计与改造,同时设计并合成新的生物元件、模块和系统的崭新学科。合成生物学是自然科学发展到现阶段的产物,并已经在医药、能源等领域取得了一些显著成果。本文综述了在工程细... 合成生物学是以工程学思想为指导,对天然生物系统进行重新设计与改造,同时设计并合成新的生物元件、模块和系统的崭新学科。合成生物学是自然科学发展到现阶段的产物,并已经在医药、能源等领域取得了一些显著成果。本文综述了在工程细胞中利用合成生物学方法构建抗疟疾药物青蒿素的前体物青蒿二烯,抗癌药物紫杉醇的前体物紫杉二烯,以及脂肪酸酯、脂肪醇、高级醇的合成途径等研究进展。此外,一些重要的合成生物学相关技术,大大加速工程细胞的重构与进化,为构建应用于生产领域的新功能细胞提供方便实用的工具。 展开更多
关键词 合成生物学 基因模块 医药 能源 合成生物技术
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微生物修复混凝土裂缝的试验观测 被引量:17
3
作者 练继建 王昶力 +2 位作者 闫玥 付登锋 齐浩 《天津大学学报(自然科学与工程技术版)》 EI CSCD 北大核心 2019年第7期669-679,共11页
微生物修复技术所需的菌液流动性好,修复过程中微生物代谢物与水泥基材料有着良好的相容性和界面强度,因此,具备能耗低、绿色环保、施工简便的潜力.针对微生物修复混凝土裂缝问题,通过试验研究了环境碱度对细菌生长和微生物矿化的影响,... 微生物修复技术所需的菌液流动性好,修复过程中微生物代谢物与水泥基材料有着良好的相容性和界面强度,因此,具备能耗低、绿色环保、施工简便的潜力.针对微生物修复混凝土裂缝问题,通过试验研究了环境碱度对细菌生长和微生物矿化的影响,探讨了胶结溶液的最优浓度配比和胶结时间,并将这些参数运用于后续微生物修复混凝土裂缝的试验中.试验中考虑了裂缝表观形状(裂缝深度、宽度及延伸角度)的差异,观察了碳酸钙沉淀的沉积方式,并采用X射线衍射仪(XRD)和扫描电子显微镜(SEM)手段监测其沿裂缝界面的晶体组成和形貌.结果表明:菌体自身对环境碱性突变具有自适应能力,当环境碱性并非过高时(pH≤12),菌体在生长代谢过程中能够驱使环境pH值向着最适宜菌体自身生长的pH值(约为8.7)发展;快速诱导碳酸钙沉积修复混凝土裂缝的最佳胶结液有效浓度为0.83 mol/L,最优微生物矿化间隔时间为5 h;裂缝表观形状的差异导致细菌在裂纹表面上的吸附不均匀性,其中裂缝的宽度不直接影响微生物修复的机理,而裂缝深度和裂缝倾角会影响碳酸钙沉淀的均匀性;使用注射和漫灌胶结液的方式修复具有不同表观形状的裂缝的混凝土最好的修复效果能将混凝土的渗透性降低4个数量级(从10^(-4)m/s到10^(-8)m/s). 展开更多
关键词 混凝土 裂缝 微生物诱导碳酸钙沉淀 修复 渗透性
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ABC转运蛋白及其在合成生物学中的应用 被引量:13
4
作者 曲俊泽 陈天华 +3 位作者 姚明东 王颖 肖文海 李炳志 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第9期1754-1766,共13页
ABC转运蛋白(ATP-binding cassette transporter,ABC transporter)作为一种超大膜转运蛋白家族,在大多数生物体中发挥着重要作用。文中从结构特征、转运机制以及生理功能等方面论述了ABC转运蛋白的研究进展,进而着重综述了近些年来ABC... ABC转运蛋白(ATP-binding cassette transporter,ABC transporter)作为一种超大膜转运蛋白家族,在大多数生物体中发挥着重要作用。文中从结构特征、转运机制以及生理功能等方面论述了ABC转运蛋白的研究进展,进而着重综述了近些年来ABC转运蛋白在合成生物学领域中的应用,并为今后进一步的研究提出了展望,希望为扩展其应用提供指导。 展开更多
关键词 膜转运蛋白 ABC转运蛋白 结构特征 转运机制 生理功能
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木质纤维素预处理及高值化技术研究进展 被引量:13
5
作者 翟旭航 李霞 元英进 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期162-174,共13页
木质纤维素生物质是地球上最丰富的可再生生物资源。随着化石能源的消耗及环境的污染,以取代石化燃料为目标的由生物质向生物燃料的转化受到了广泛的关注。木质纤维素有很强的天然抗降解屏障,需先通过物理、化学及微生物等手段进行预处... 木质纤维素生物质是地球上最丰富的可再生生物资源。随着化石能源的消耗及环境的污染,以取代石化燃料为目标的由生物质向生物燃料的转化受到了广泛的关注。木质纤维素有很强的天然抗降解屏障,需先通过物理、化学及微生物等手段进行预处理,进而以更低的成本和更高的效率转化为生物燃料及其他高附加值产品。本文在总结酸碱等传统预处理方法优缺点的基础上,综述了各种组合预处理对这些传统预处理方法的改进,以及γ-戊内酯预处理、低共熔溶剂预处理、微生物联合体生态位预处理这些新型预处理技术的研究进展,总结了木质素高值化过程中木质素的保护、解聚、改性的新方法,指出了预处理方法在工业生产中的应用及不足,以期为木质纤维素生物质转化的研究提供参考。 展开更多
关键词 木质纤维素 生物质 预处理 木质素高值化 工业应用
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大肠杆菌乙酰辅酶A代谢调控及其应用研究进展 被引量:8
6
作者 陈露 刘丁玉 +4 位作者 汪保卫 赵玉姣 贾广韬 陈涛 王智文 《化工进展》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第9期4218-4226,共9页
利用生物法合成生物基化学品具有高效、绿色、可持续发展等优势。乙酰辅酶A作为细胞内物质代谢的重要中间产物,是利用生物转化法合成许多生物基化学品的重要前体,在微生物碳代谢过程中发挥着枢纽作用。本文综述了大肠杆菌乙酰辅酶A的合... 利用生物法合成生物基化学品具有高效、绿色、可持续发展等优势。乙酰辅酶A作为细胞内物质代谢的重要中间产物,是利用生物转化法合成许多生物基化学品的重要前体,在微生物碳代谢过程中发挥着枢纽作用。本文综述了大肠杆菌乙酰辅酶A的合成、代谢调控策略及其重要应用,重点总结了乙酰辅酶A的合成途径及近期发展的提高乙酰辅酶A胞内通量的代谢调控策略,包括乙酸途径的代谢调控、丙酮酸合成乙酰辅酶A途径的代谢调控、中心碳代谢途径的代谢调控、β氧化合成乙酰辅酶A途径的代谢调控和乙酰辅酶A合成新途径的发掘,进一步展望了提高乙酰辅酶A供给的策略,利用基因组编辑技术构建合成乙酰辅酶A为前体化学品细胞工厂的方法。 展开更多
关键词 乙酰辅酶A 大肠杆菌 代谢工程 通量
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多烯大环内酯类抗生素的研究进展 被引量:8
7
作者 曾繁旭 乔建军 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期171-181,共11页
多烯大环内酯类抗生素是最有效的抗真菌素之一,在临床和食品工业中都得到广泛的应用。本文综述了多年来多烯大环内酯类抗生素的研究成果及进展。包括:多烯大环内酯类抗生素完整的生物合成流程;该类抗生素杀灭真菌核心机制的最新发现;通... 多烯大环内酯类抗生素是最有效的抗真菌素之一,在临床和食品工业中都得到广泛的应用。本文综述了多年来多烯大环内酯类抗生素的研究成果及进展。包括:多烯大环内酯类抗生素完整的生物合成流程;该类抗生素杀灭真菌核心机制的最新发现;通过生物工程手段对多烯大环内酯类抗生素进行结构改造的研究,目前人们已实现通过有目的性的理性设计,调整生物合成相关基因来获得预期产物;多烯大环内酯类抗生素从属的聚酮类抗生素相关基因的进化方式和特点等。在介绍多烯大环内酯类抗生素各个方面的研究进展的同时,还对多烯大环内酯类抗生素的研究与应用前景进行了展望。 展开更多
关键词 多烯大环内酯类抗生素 生物合成 作用机理 聚酮类抗生素进化
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合成生物学学科发展概况 被引量:8
8
作者 杜瑾 刘夺 +1 位作者 赵广荣 元英进 《中国科学基金》 CSCD 北大核心 2011年第3期143-147,共5页
合成生物学是一门新兴的综合性学科。它的研究工作已在全世界蓬勃开展,并受到多个国家政府及研究机构的重视和大力支持。我国在该领域的工作刚刚起步,面临着许多机遇与挑战,有待我国科研工作者们抓住机遇、取得突破。
关键词 合成生物学 前沿展望 底盘生物 功能模块
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合成生物学展望 被引量:7
9
作者 贾斌 李炳志 元英进 《中国科学:化学》 CSCD 北大核心 2014年第9期1455-1460,共6页
近年来,合成生物学快速发展成为一个新兴交叉学科领域,研究重点逐渐由基因线路、简单元件和模块的设计构建转向设计与构建复杂的人工生物系统.本文阐述了合成生物学与化学工程学科的内在联系,并从基因组的人工设计合成与编辑、人工细胞... 近年来,合成生物学快速发展成为一个新兴交叉学科领域,研究重点逐渐由基因线路、简单元件和模块的设计构建转向设计与构建复杂的人工生物系统.本文阐述了合成生物学与化学工程学科的内在联系,并从基因组的人工设计合成与编辑、人工细胞的设计合成、人工合成多细胞体系及其应用等方面展望了未来合成生物学的发展趋势. 展开更多
关键词 合成生物学 化学工程 基因组编辑 人工合成基因组 人工合成细胞 人工多细胞体系
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产蒎烯人工酵母细胞的构建 被引量:7
10
作者 陈天华 张若思 +5 位作者 姜国珍 姚明东 刘宏 王颖 肖文海 元英进 《化工学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第1期179-188,共10页
蒎烯可衍生为高能量密度燃料,但在酿酒酵母中的全生物合成却未见报道。酿酒酵母由于拥有强大的蛋白表达和翻译后修饰系统以及完整的内膜系统,相比于大肠杆菌等原核生物更适于P450等蛋白的表达,因此将酿酒酵母作为宿主细胞,对于蒎烯或者... 蒎烯可衍生为高能量密度燃料,但在酿酒酵母中的全生物合成却未见报道。酿酒酵母由于拥有强大的蛋白表达和翻译后修饰系统以及完整的内膜系统,相比于大肠杆菌等原核生物更适于P450等蛋白的表达,因此将酿酒酵母作为宿主细胞,对于蒎烯或者其他物质实现如"疯狂碳环"的高能量化是至关重要的。本研究在酿酒酵母底盘中表达内源焦磷酸香叶酯合成酶(ERG20)的突变体ERG20ww和火炬松来源的蒎烯合酶(PtPS)构建了蒎烯的合成路径。通过截短PtPS N端2~51位氨基酸残基(tPtPS),蒎烯产量较初始产量(0.329 mg·L^(-1))提高了2.23倍。在过表达异戊二烯焦磷酸异构酶(IDI1)和RNA聚合酶Ш负调控因子(MAF1)的基础上,表达ERG20ww和tPtPS的融合蛋白,蒎烯产量进一步提高了5.16倍。通过将内源基因ERG20启动子原位替换为弱启动子HXT1,下调ERG20的转录,蒎烯的产量提高了26.0%。最终通过调节发酵过程中的培养基pH使蒎烯产量达11.7 mg·L^(-1),较初始产量提高了34.5倍。本研究在酿酒酵母中实现蒎烯的从头合成,并获得已知蒎烯摇瓶水平的最高产量。 展开更多
关键词 代谢工程 合成生物学 蒎烯 酿酒酵母
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合成类胡萝卜素细胞工厂的快速构建和定向进化 被引量:6
11
作者 王颖 曲俊泽 +2 位作者 梁楠 郝鹤 元英进 《化工进展》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第3期1187-1201,共15页
类胡萝卜素具有丰富的颜色和强抗氧化活性,这赋予了该类产品较高的商业价值,加速了该类产品合成路径在异源底盘中的构建进程,使之成为发展非理性设计策略的有效研究对象。本文主要针对微生物合成类胡萝卜素细胞工厂构建中的瓶颈问题,从... 类胡萝卜素具有丰富的颜色和强抗氧化活性,这赋予了该类产品较高的商业价值,加速了该类产品合成路径在异源底盘中的构建进程,使之成为发展非理性设计策略的有效研究对象。本文主要针对微生物合成类胡萝卜素细胞工厂构建中的瓶颈问题,从增强合成类胡萝卜素前体GGPP的供给利用以及缓解各类胡萝卜素产品对微生物底盘细胞的胁迫压力两个角度,系统综述非理性设计策略对元件优化、模块适配和多维调控等路径构建优化方法的丰富,以及对不同尺度的DNA变异和适应性进化等底盘进化手段的推动作用。并从扩展类胡萝卜素合成底盘物种的多样性和丰富非天然类胡萝卜素产品结构的可获得性的需求出发,对构建合成该类产品微生物细胞工厂自动化和智能化的发展趋势进行展望。 展开更多
关键词 合成生物学 细胞工厂 类胡萝卜素 非理性设计 路径构建 底盘进化
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渗透剂的分子体积和极性表面积分率对胰凝乳蛋白酶抑制剂2热稳定性的影响 被引量:6
12
作者 刘夫锋 纪络 董晓燕 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2010年第10期2813-2820,共8页
渗透剂对蛋白质的稳定能力不仅与其极性表面积分率(fpSA)有关,而且也与其分子体积(V)密切相关.因此对于渗透剂稳定蛋白质能力的分析,需要同时考虑渗透剂的fpSA和V.为了考察渗透剂的fpSA和V对稳定蛋白质能力的影响,本文以胰凝乳蛋白酶抑... 渗透剂对蛋白质的稳定能力不仅与其极性表面积分率(fpSA)有关,而且也与其分子体积(V)密切相关.因此对于渗透剂稳定蛋白质能力的分析,需要同时考虑渗透剂的fpSA和V.为了考察渗透剂的fpSA和V对稳定蛋白质能力的影响,本文以胰凝乳蛋白酶抑制剂2(CI2)为模型蛋白,首先利用分子动力学模拟,考察了数种典型渗透剂对CI2热稳定性的影响;并根据模拟数据计算得到了渗透剂影响蛋白质热稳定性的一维结构参数;然后利用统计学双参数拟合,同时引入渗透剂的fpSA和V,建立了用于分析渗透剂稳定蛋白质能力的模型;最后利用模型分析了渗透剂的fpSA和V与其稳定蛋白质能力的关系.研究发现:利用分子动力学模拟结果定义并计算得到的一维结构参数能够较好地描述在热变性条件下渗透剂对CI2的稳定能力;所建立的模型能够很好地分析渗透剂对蛋白质的稳定能力;并且由于V和fpSA二次项的引入,可大大提高仅以fpSA为参数的模型的精度;另外,渗透剂对蛋白质的热稳定能力与其V成正比;由于拟合公式中引入了fpSA二次项,在fpSA小于0.7时,fpSA与渗透剂的稳定能力呈现负相关,但当fpSA大于0.7时,其与渗透剂的稳定能力反而呈现正相关. 展开更多
关键词 分子动力学模拟 蛋白质稳定性 渗透剂 极性表面积分率 分子体积
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微囊藻毒素生物治理技术研究进展 被引量:6
13
作者 柴玉婕 冯佳 +1 位作者 周见庭 蒋建兰 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期109-127,共19页
近年来,随着全球气候变暖和水体富营养化程度加深,蓝藻水华频繁暴发。微囊藻毒素是有害蓝藻产生及释放的危害最大的一类蓝藻毒素,对生态环境和公众健康造成了严重的威胁。因此,寻求有效的微囊藻毒素降解方法已成为全球科学领域的研究热... 近年来,随着全球气候变暖和水体富营养化程度加深,蓝藻水华频繁暴发。微囊藻毒素是有害蓝藻产生及释放的危害最大的一类蓝藻毒素,对生态环境和公众健康造成了严重的威胁。因此,寻求有效的微囊藻毒素降解方法已成为全球科学领域的研究热点。针对微囊藻毒素生物治理技术展开综述,阐述了微囊藻毒素的产生、理化性质及生物毒性,总结了微生物、水生植物、浮游动物等自然生物降解微囊藻毒素的能力。在此基础上概述了生物滤池、人工湿地、生态浮床、膜生物膜反应器等生物治理技术对微囊藻毒素的去除效果,分析了现有微囊藻毒素生物处理方法的优势和局限性,并对今后的研究方向提出展望,为解决水环境中微囊藻毒素的污染问题提供思路。 展开更多
关键词 微囊藻毒素 生物降解 生物治理技术 蓝藻水华
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基于QbD理念优化苦参生物碱的分离工艺 被引量:6
14
作者 蒋建兰 单潇潇 +1 位作者 孙露 张凯旋 《天津大学学报(自然科学与工程技术版)》 EI CSCD 北大核心 2020年第11期1204-1210,共7页
将质量源于设计(QbD)理念应用于苦参生物碱的纯化工艺,建立稳定可控的操作空间.以苦参总生物碱(TASF)、苦参碱(MT)和氧化苦参碱(OMT)的解吸量为工艺评价指标,静态吸附和解吸试验选取性能最优的大孔树脂作为纯化过程中的吸附剂,单因素和... 将质量源于设计(QbD)理念应用于苦参生物碱的纯化工艺,建立稳定可控的操作空间.以苦参总生物碱(TASF)、苦参碱(MT)和氧化苦参碱(OMT)的解吸量为工艺评价指标,静态吸附和解吸试验选取性能最优的大孔树脂作为纯化过程中的吸附剂,单因素和多因素显著性试验(PBD)筛选并确定关键工艺参数(CPPs),中心点复合试验(CCD)进一步优化工艺参数,建立工艺参数和工艺评价指标之间的数学模型,以此获得操作空间,在空间内、外选点,对模型及设计空间进行验证.NK-109型大孔树脂吸附性能良好,为该试验的最优树脂.上样液pH值、洗脱剂乙醇浓度和洗脱流速为该试验的显著性影响因素.关键工艺参数与工艺评价指标之间回归方程的P值均小于0.05,而失拟项均大于0.05,表明回归方程显著.在苦参总生物碱解吸量≥0.87 mg/g,苦参碱解吸量≥32.50μg/g,氧化苦参碱解吸量≥244.10μg/g的工艺指标下,设计空间为:洗脱流速≤25.0 m L/h,洗脱剂乙醇体积分数82.0%~87.0%,上样液pH值5.3~6.2.验证结果表明模型的预测能力良好,空间内的点满足工艺指标,而空间外的点无法达到生产要求,设计空间稳定.质量源于设计理念的引用可以为中药的分离纯化过程提供稳定可控的操作空间,在确定工艺指标的基础上,灵活设置工艺参数,保证产品质量可控. 展开更多
关键词 质量源于设计 苦参 纯化过程 优化
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人工合成微生物混菌体系的研究进展 被引量:6
15
作者 杜瑾 贾晓强 元英进 《化工学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第2期390-395,共6页
合成生物学正在从设计构建基本功能元件和模块,逐步向着从头设计人工细胞及构建人工生物群落的方向发展,人工合成微生物混菌体系已经成为未来合成生物学研究的重要方向。本文综述了人工构建微生物群落生态关系、群落时空动态和分布式计... 合成生物学正在从设计构建基本功能元件和模块,逐步向着从头设计人工细胞及构建人工生物群落的方向发展,人工合成微生物混菌体系已经成为未来合成生物学研究的重要方向。本文综述了人工构建微生物群落生态关系、群落时空动态和分布式计算等基础研究的进展。同时,微生物混菌体系在医药、环境、能源等领域发挥着不可替代的作用,人工合成混菌体系在相关领域也表现出巨大的应用潜力。 展开更多
关键词 合成生物学 混菌体系 细胞间通讯 菌群生态关系 合成生物技术
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噬菌体与细菌基于群体感应的双向互作 被引量:1
16
作者 孙舒扬 吴胜波 +2 位作者 张欣乔 梁畅畅 乔建军 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期107-117,共11页
在长期的共同进化过程中,噬菌体与细菌宿主之间产生了复杂的相互作用关系。群体感应(quorum sensing,QS)机制在噬菌体和细菌的双向相互作用中扮演了重要角色。综述细菌宿主对群体感应机制的利用,群体感应对生物被膜调节、噬菌体吸附过... 在长期的共同进化过程中,噬菌体与细菌宿主之间产生了复杂的相互作用关系。群体感应(quorum sensing,QS)机制在噬菌体和细菌的双向相互作用中扮演了重要角色。综述细菌宿主对群体感应机制的利用,群体感应对生物被膜调节、噬菌体吸附过程以及调控CRISPR-Cas系统等方面所起到的效果,从噬菌体对群体感应机制的介入,总结群体感应机制在噬菌体溶原-裂解性调节以及噬菌体对群体感应机制的抑制,探讨对噬菌体QS机制的挖掘和解析,以期为群体感应机制在噬菌体治疗等领域的应用提供理论依据。 展开更多
关键词 群体感应 噬菌体-细菌宿主 溶原-裂解 微生物相互作用
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静电排斥表面诱导溶菌酶分子站立 被引量:4
17
作者 白姝 李浩 张麟 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2013年第4期849-857,共9页
抑制蛋白质聚集是应用基因重组技术生产药用蛋白质过程中的关键.实验研究发现与蛋白质带同种电荷的离子交换介质能够通过静电排斥作用有效抑制蛋白质折叠中间体的聚集.但其微观细节尚不明晰,且利用现有实验技术很难直接阐释.分子动力学... 抑制蛋白质聚集是应用基因重组技术生产药用蛋白质过程中的关键.实验研究发现与蛋白质带同种电荷的离子交换介质能够通过静电排斥作用有效抑制蛋白质折叠中间体的聚集.但其微观细节尚不明晰,且利用现有实验技术很难直接阐释.分子动力学模拟是研究微观过程的有力工具.因此,本文构建了静电排斥表面模型以模拟同电荷离子交换介质,采用分子动力学模拟和全原子模型,研究溶菌酶在静电排斥表面上的空间取向及其变化过程,并考察表面所带电荷数的影响规律.结果表明,溶菌酶受到表面的静电排斥作用而远离.在此过程中,溶菌酶逐渐"站立",形成其偶极和表面相站立垂直的空间取向.而当蛋白质远离表面时,由于静电排斥作用衰减,形成"站立"取向的趋势减弱.同时,研究发现静电排斥表面所带电荷数增加有利于蛋白质形成"站立"取向.本文的模拟结果从微观揭示蛋白质在静电排斥表面上的空间取向及其影响因素,将有助于推动蛋白质在荷电表面折叠和分子相互作用研究. 展开更多
关键词 界面行为 微观信息 电荷数 构象 分子动力学模拟
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合成8二甲基异戊烯基柚皮素的人工酿酒酵母菌株构建 被引量:5
18
作者 李博 梁楠 +5 位作者 刘夺 刘宏 王颖 肖文海 姚明东 元英进 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第9期71-81,共11页
8二甲基异戊烯基柚皮素(8DN)作为生产黄酮类药物淫羊藿苷的重要前体,在医药合成领域具有重大应用潜力。由于其合成路径及相关基因的复杂性,目前主要通过饲喂8DN的直接前体(柚皮素、异黄腐酚等)的方式合成8DN,而在生物体内全合成8DN的研... 8二甲基异戊烯基柚皮素(8DN)作为生产黄酮类药物淫羊藿苷的重要前体,在医药合成领域具有重大应用潜力。由于其合成路径及相关基因的复杂性,目前主要通过饲喂8DN的直接前体(柚皮素、异黄腐酚等)的方式合成8DN,而在生物体内全合成8DN的研究工作还未见报道。为了实现8DN在酿酒酵母体内的生物全合成,通过组合筛选8DN前体物柚皮素合成所需的多种外源基因(TAL、4CL、CHS、CHI),获得30株柚皮素生产菌,发现不同来源的基因组合使柚皮素产量的具有明显差异(0.37~22.33mg/L)。并且利用Delta位点将较优的基因组合整合至酵母基因组,实现了稳定的柚皮素高产菌株(Sy BE_Sc02050031)构建。在此基础上进一步导入带有苦参来源的异戊烯基转移酶基因(N8DT)多拷贝质粒,实现8DN合成的完整反应过程,8DN的摇瓶发酵产量达到36.7μg/L。另外,通过关键限速酶N8DT的序列优化策略,发现截断定位信号肽序列的N8DT明显提高了从柚皮素到8DN这一关键反应的催化效果,8DN的产量提高到52.6μg/L(144.2%)。首次在酿酒酵母中成功构建高产8DN的生物全合成路径,为在微生物体内合成其他黄酮类天然产物提供了参考,具有重要的指导意义。 展开更多
关键词 8二甲基异戊烯基柚皮素 合成生物学 酿酒酵母 异源表达 蛋白质截断
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群体感应基因电路的设计与应用进展
19
作者 周永胜 王海娇 +2 位作者 乔建军 财音青格乐 吴胜波 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期4311-4326,共16页
群体感应(quorum sensing,QS)是一种细菌协调菌群行为的通信系统。自然界中广泛存在的QS系统通过对外界环境的感知来提升微生物群落生殖繁衍的能力。由于其自主感知和密度依赖的自然特性和模块化、易于工程化改造的特性在合成生物学技... 群体感应(quorum sensing,QS)是一种细菌协调菌群行为的通信系统。自然界中广泛存在的QS系统通过对外界环境的感知来提升微生物群落生殖繁衍的能力。由于其自主感知和密度依赖的自然特性和模块化、易于工程化改造的特性在合成生物学技术的推动下,取得了快速的发展和应用。QS机制的阐明为基因回路的设计及验证和执行预期的生物功能奠定了基础。然而,如何保证QS基因回路的有效性和功能稳定性是合成生物学应用的重大挑战。因此,本综述中先对自然常见的QS调控机制和基因电路的发展进行整理,然后对其在细胞之间通信中的组装优化进行分析和概括,接着对其在群落中的应用进展进行梳理,最后对QS基因电路如何更好地应用于微生物改造提出了建议和展望。 展开更多
关键词 群体感应 细胞通信 基因回路 人工合成菌群 动态调控
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代谢工程合成5-氨基乙酰丙酸的研究进展 被引量:4
20
作者 张双虹 邹亚兰 +3 位作者 宋鑫 冯丽丽 陈涛 王智文 《生物加工过程》 CAS 2017年第5期65-70,共6页
5-氨基乙酰丙酸(5-ALA)是生物体内吡咯类物质生物合成的前体物质,在医药和农业领域显示出广阔的市场潜力。随着代谢工程的发展以及对5-ALA生物合成途径的研究,利用微生物合成5-ALA成为研究的新方向。与传统的化学法合成相比,利用微生物... 5-氨基乙酰丙酸(5-ALA)是生物体内吡咯类物质生物合成的前体物质,在医药和农业领域显示出广阔的市场潜力。随着代谢工程的发展以及对5-ALA生物合成途径的研究,利用微生物合成5-ALA成为研究的新方向。与传统的化学法合成相比,利用微生物合成5-ALA具有低污染、高产率和低成本等优势。本文中,笔者介绍了5-ALA生物合成的最新研究进展,分析了5-ALA代谢途径的关键影响因素,并对未来的研究方向进行了展望。 展开更多
关键词 5-氨基乙酰丙酸 C4途径 C5途径 生物合成
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