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猪生殖与呼吸综合征病毒TaqMan荧光定量RT-PCR检测方法的建立 被引量:44
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作者 宋志军 宋长绪 +6 位作者 杨增岐 朱道中 武占银 蒋智勇 林志雄 刘燕玲 张福良 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期98-102,共5页
根据GenBank登录的PRRSV保守基因序列设计合成了引物和探针,并对其进行了筛选;对荧光定量PCR的反应条件进行了优化,建立了TaqMan荧光定量RT-PCR检测方法。同时用建立的检测方法对组织病料进行了检测,并与常规RT-PCR做了对比。结果显示,... 根据GenBank登录的PRRSV保守基因序列设计合成了引物和探针,并对其进行了筛选;对荧光定量PCR的反应条件进行了优化,建立了TaqMan荧光定量RT-PCR检测方法。同时用建立的检测方法对组织病料进行了检测,并与常规RT-PCR做了对比。结果显示,所建立的TaqMan荧光定量RT-PCR方法灵敏度可达5.0×100拷贝/μL,比常规RT-PCR灵敏度高100倍。用该方法对东莞、增城、湛江等地的猪血清和多种组织样品进行了检测。结果,该方法与常规RT-PCR检测方法的阳性符合率为100%。用该方法对3份不同的组织样品进行了重复检测,结果表明,该方法具有良好的重复性,可满足当前PRRS的诊断需要。 展开更多
关键词 猪生殖与呼吸综合征病毒 实时定量rt-pcr TaqMan荧光探针
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实时定量RT-PCR的原理及方法 被引量:34
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作者 阳成波 印遇龙 +3 位作者 黄瑞林 李铁军 单计光 唐志如 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第S1期145-150,共6页
实时定量RT-PCR广泛应用于定量检测mRAN表达水平,为基础研究、分子药物学和生物技术研究提供了一种有力的方法。该法具有易操作、高通量、敏感性高和特异性强的特点,随着新酶、新探针和新仪器的发展而得到快速的发展。本文将对实时定量R... 实时定量RT-PCR广泛应用于定量检测mRAN表达水平,为基础研究、分子药物学和生物技术研究提供了一种有力的方法。该法具有易操作、高通量、敏感性高和特异性强的特点,随着新酶、新探针和新仪器的发展而得到快速的发展。本文将对实时定量RT-PCR的定量原理、仪器应用、探针种类的研究进展以及细胞因子mRNA表达水平检测上的应用作一综述。 展开更多
关键词 细胞因子 定量 实时定量rt-pcr
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水稻胚乳RNA定量RT-PCR分析中参照基因选择 被引量:36
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作者 李钱峰 蒋美艳 +3 位作者 于恒秀 辛世文 顾铭洪 刘巧泉 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期61-66,共6页
以6个籼粳稻品种胚乳总RNA为研究材料,检测包括eEF-1a、eIF-4a、UBC、GAPDH、UBQ-5、TBL和ACT1在内的7个常用管家基因的表达稳定性情况,通过geNorm软件分析选择最佳参照基因。结果表明:不同的品种间,eEF-1a和ACT1的表达最为稳定,UBC的... 以6个籼粳稻品种胚乳总RNA为研究材料,检测包括eEF-1a、eIF-4a、UBC、GAPDH、UBQ-5、TBL和ACT1在内的7个常用管家基因的表达稳定性情况,通过geNorm软件分析选择最佳参照基因。结果表明:不同的品种间,eEF-1a和ACT1的表达最为稳定,UBC的表达变化最为明显。当利用多基因作为内参基因时,使用两个最稳定表达的管家基因即可达到准确校正的目的。该结果为水稻等植物中基因表达分析时内参基因的选择提供了参考。 展开更多
关键词 水稻 实时定量rtpcr 参照基因 基因表达 胚乳
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实时定量RT-PCR检测鱼类传染性造血器官坏死病毒方法的建立与应用 被引量:26
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作者 岳志芹 刘荭 +4 位作者 梁成珠 高宏伟 徐彪 邓明俊 江育林 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期91-95,共5页
建立了Taqman实时定量RT-PCR方法检测传染性造血器官坏死病毒(IHNV)。选取IHNV病毒的N蛋白基因保守序列,利用PrimerExpress2.0软件设计引物和探针。以梯度稀释的含有IHNV目的扩增片段的质粒作为标准品,进行定量RT-PCR反应以确定检测灵... 建立了Taqman实时定量RT-PCR方法检测传染性造血器官坏死病毒(IHNV)。选取IHNV病毒的N蛋白基因保守序列,利用PrimerExpress2.0软件设计引物和探针。以梯度稀释的含有IHNV目的扩增片段的质粒作为标准品,进行定量RT-PCR反应以确定检测灵敏度。病毒浓度在5×106—5个拷贝,共7个数量级的范围内,定量RT-PCR反应有"S"型扩增曲线,检测灵敏度为5个拷贝。根据病毒拷贝数与定量反应Ct值的关系,绘制了标准曲线。该方法具有特异性,对鲤春血症病毒(SVCV)、病毒性出血性败血症(VHSV)、传染性胰脏坏死病毒(IPNV)、草鱼呼肠孤病毒(GCRV)、流行性造血器官坏死病毒(EHNV)、EPC细胞系、牙鲆的核酸都没有扩增反应。在50批待检样品中,有3批鱼类感染IHNV,利用标准曲线进行了定量分析。实时定量RT-PCR检测IHNV方法,灵敏度高,特异性好,可以进行定量分析,在鱼病的快速检测上具有重要意义。 展开更多
关键词 传染性造血器官坏死病毒(IHNV) 实时定量rt-pcr TAQMAN探针
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乳腺癌差异表达的MicroRNA的筛选研究 被引量:25
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作者 黄秀芳 邵建永 +4 位作者 颜黎栩 李晓霞 杜紫明 邓玲 梁小曼 《中山大学学报(医学科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期69-73,77,共6页
【目的】应用miRNA芯片技术筛选乳腺癌及癌旁组织差异表达的miRNA,发现与乳腺癌相关的miRNA,为进一步阐明其在乳腺癌发病机制中的作用打下基础。【方法】收集8例新鲜的乳腺癌及其癌旁组织,抽提总RNA并分离出小RNA进行Cy3荧光标记,将标... 【目的】应用miRNA芯片技术筛选乳腺癌及癌旁组织差异表达的miRNA,发现与乳腺癌相关的miRNA,为进一步阐明其在乳腺癌发病机制中的作用打下基础。【方法】收集8例新鲜的乳腺癌及其癌旁组织,抽提总RNA并分离出小RNA进行Cy3荧光标记,将标记的小RNA在miRNA芯片上进行杂交反应,应用实时定量RT-PCR方法验证miRNAs芯片结果的可靠性。【结果】对芯片数据进行SAM分析,结果筛选获得16个乳腺癌相关miRNAs,相对于癌旁组织,在乳腺癌组织中9个miRNAs表达上调,7个miRNAs表达下调。其中显著上调的有miR-21,miR-365,显著下调的有miR-497,miR-31。【结论】筛选得到乳腺癌miRNA差异表达谱,其可能与乳腺癌的发生发展有关。 展开更多
关键词 MIRNA 乳腺癌 MIRNA芯片 实时定量rt-pcr
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碳水化合物、脂肪对翘嘴红鲌PEPCK基因表达的影响 被引量:20
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作者 俞菊华 戈贤平 +1 位作者 唐永凯 刘波 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期369-373,共5页
使用实时定量RT-PCR测定了摄食无糖(脂肪9.13%,蛋白63.38%)、高糖(糖23.93%,脂肪9.94%,蛋白40.53%)、低脂(中糖)(脂肪9.92%,糖14.45%,蛋白50.14%)、高脂(脂肪19.93%,糖14.98%,蛋白40.88%)饲料的翘嘴红鲌在摄食后0、3、6、12、24hPEPCK... 使用实时定量RT-PCR测定了摄食无糖(脂肪9.13%,蛋白63.38%)、高糖(糖23.93%,脂肪9.94%,蛋白40.53%)、低脂(中糖)(脂肪9.92%,糖14.45%,蛋白50.14%)、高脂(脂肪19.93%,糖14.98%,蛋白40.88%)饲料的翘嘴红鲌在摄食后0、3、6、12、24hPEPCK的表达水平。结果显示,饲料中糖含量一致的情况下,高脂组和低脂组翘嘴红鲌PEPCK的表达差异不显著;脂肪水平一致时,高糖(23.93%)和中糖(14.45%)饲料组翘嘴红鲌PEPCK的表达,除了在0、3h时高糖组显著高外,6、12、24h没显著差异,但12、24h高糖组PEPCK相对较低,分别是中糖组的75%和65%;无糖组PEPCK的表达量除了在12h和其他各组一致(均较低)外,在其他时间均明显高,特别是摄食后24h其表达量为其他组同期的2.5~4.7倍。由此可见,当饲料中至少含14.45%糖但又低于23.93%时,饲料中的营养成分对PEPCK的表达没显著影响,而无糖饲料PEPCK的表达明显较高,和无糖饲料会引起较强的糖异生作用一致。 展开更多
关键词 翘嘴红鲌 磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶 碳水化合物 脂肪 实时定量rt-pcr
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菊花FT类似基因的克隆与表达分析 被引量:20
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作者 潘才博 张启翔 +1 位作者 潘会堂 孙明 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期769-776,共8页
以地被菊(Chrysanthemum morifolium Ramat.)'七月桃花'为材料,利用同源基因克隆法结合RACE技术克隆了光周期调控开花重要基因FLOWERING LOCUS T(FT)的类似基因(基因登陆号GQ925916,命名为CmFT)。该基因开放阅读框有525bp,可编... 以地被菊(Chrysanthemum morifolium Ramat.)'七月桃花'为材料,利用同源基因克隆法结合RACE技术克隆了光周期调控开花重要基因FLOWERING LOCUS T(FT)的类似基因(基因登陆号GQ925916,命名为CmFT)。该基因开放阅读框有525bp,可编码174个氨基酸。蛋白比对发现,CmFT所推测的氨基酸序列包含FT类蛋白保守基序和两个关键性氨基酸残基。通过系统遗传进化树分析进一步表明CmFT属于FT亚家族成员。SYBR GREEN法实时荧光定量RT-PCR表达分析结果表明CmFT在花芽的表达量最高,茎的表达量次之,叶片表达量最低。在短日条件下,该基因的表达量呈昼夜节律表达型,在光照期间呈下降趋势,在夜间逐渐上升,光照前4h时达到最高水平。在长日条件下,其相对表达量显著低于短日条件下且趋于零。由此推测,该基因主要与菊花光周期敏感性密切相关,可能在光周期促进开花中发挥一定的作用。 展开更多
关键词 菊花 光周期敏感性 FT类似基因 实时定量rt-pcr
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定量RT-PCR及其在植物学研究中的应用 被引量:15
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作者 胡丹丹 顾金刚 +1 位作者 姜瑞波 董金皋 《植物营养与肥料学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期520-525,共6页
定量RT-PCR(Quantitative reverse transcriptase-PCR)是在反转录和定量PCR的基础上发展起来的一种特异性检测基因表达的技术。主要包括相对定量RT-PCR(Relative quantitative RT-PCR)、竞争性定量RT-PCR(Competitive quan-titative RT-... 定量RT-PCR(Quantitative reverse transcriptase-PCR)是在反转录和定量PCR的基础上发展起来的一种特异性检测基因表达的技术。主要包括相对定量RT-PCR(Relative quantitative RT-PCR)、竞争性定量RT-PCR(Competitive quan-titative RT-PCR)、比较定量RT-PCR(Comparative quantitative RT-PCR)和实时定量RT-PCR(Real time quantitative RT-PCR)四种。目前定量RT-PCR在植物学研究中的应用越来越广泛,如植物营养学研究、植物发育学研究、植物抗逆机理研究、转基因植物的检测、病原菌的检测、植物与微生物互作机理研究、植物抗病性检测等方面。本文综述了定量RT-PCR的原理及在植物学中的应用。 展开更多
关键词 相对定量rtpcr 竞争性定量rt-pcr 比较定量rt-pcr 实时定量rt-pcr 植物学
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环境水体中肠道病毒的膜吸附-洗脱浓缩方法研究 被引量:19
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作者 张崇淼 刘永军 +1 位作者 王晓昌 薛小平 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第7期1543-1547,共5页
在膜吸附-洗脱和洗脱液浓缩相结合的基础上,建立了一种简便实用的水中肠道病毒浓缩方法.通过实时定量RT-PCR检测,比较了不同材料和不同孔径的微孔滤膜对病毒的吸附效果;对膜洗脱方式进行了改进;研究了在洗脱液浓缩过程中,PEG浓度对于病... 在膜吸附-洗脱和洗脱液浓缩相结合的基础上,建立了一种简便实用的水中肠道病毒浓缩方法.通过实时定量RT-PCR检测,比较了不同材料和不同孔径的微孔滤膜对病毒的吸附效果;对膜洗脱方式进行了改进;研究了在洗脱液浓缩过程中,PEG浓度对于病毒回收率的影响.最后确定了最佳的浓缩方法.选择效果好而且来源广泛的0.22μm孔径的混合纤维素酯微孔滤膜,采用磁力搅拌来洗脱滤膜上吸附的病毒;洗脱液浓缩步骤中,PEG最佳质量浓度为130 g/L.系统比较了不同病毒接种量下,方法中各步骤的病毒回收率.对接种已知量的肠道病毒的生活污水、二级处理出水和地表水等样品的试验结果表明,该方法效果稳定,适合不同水样中肠道病毒的浓缩分离. 展开更多
关键词 道病毒 浓缩 膜吸附-洗脱 微孔滤膜 实时定量rt-pcr
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环境水体中肠道病毒浓缩方法的比较 被引量:18
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作者 张崇淼 刘永军 +2 位作者 王晓昌 薛小平 王春 《中国给水排水》 CAS CSCD 北大核心 2007年第7期36-39,共4页
向水样中接种已知量的脊髓灰质炎病毒,然后利用微孔滤膜吸附—洗脱法、滑石粉—硅藻土吸附层吸附—洗脱法、化学絮凝沉淀法和滑石粉—硅藻土絮凝沉淀法等4种不同的浓缩方法对水样中的病毒进行浓缩,并采用实时定量RT-PCR技术对各方法浓... 向水样中接种已知量的脊髓灰质炎病毒,然后利用微孔滤膜吸附—洗脱法、滑石粉—硅藻土吸附层吸附—洗脱法、化学絮凝沉淀法和滑石粉—硅藻土絮凝沉淀法等4种不同的浓缩方法对水样中的病毒进行浓缩,并采用实时定量RT-PCR技术对各方法浓缩后样品中的病毒进行扩增和检测。综合考虑病毒回收率和浓缩方法的可靠性与简便性等因素,确定微孔滤膜吸附—洗脱法为最优的浓缩方案。此外,还比较了三种洗脱液和两种二次浓缩方法的效果,并对各步骤的回收率进行了分析。 展开更多
关键词 肠道病毒 脊髓灰质炎病毒 浓缩方法 微孔滤膜吸附-洗脱法 实时定量rtpcr
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三七皂苷Rg_1对大鼠脑缺血再灌注损伤中BDNF mRNA含量的影响 被引量:18
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作者 杨克红 葛树星 +2 位作者 许冰莹 闫俊岭 吴兰鸥 《中药材》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期313-316,共4页
目的:探讨三七皂苷Rg1对大鼠局灶性脑缺血再灌注损伤大脑组织中脑源性神经营养因子(brain-de-rived neurotroph ic factor,BDNF)mRNA表达的影响。方法:雄性SD大鼠36只,随机分为脑缺血再灌注模型组、药物治疗组(100 mg/kg)和阳性药物对照... 目的:探讨三七皂苷Rg1对大鼠局灶性脑缺血再灌注损伤大脑组织中脑源性神经营养因子(brain-de-rived neurotroph ic factor,BDNF)mRNA表达的影响。方法:雄性SD大鼠36只,随机分为脑缺血再灌注模型组、药物治疗组(100 mg/kg)和阳性药物对照组(尼莫地平,1 mg/kg),采用线栓法制作大鼠局灶性脑缺血再灌注损伤模型,各组分别于术后1、3、5天随机取4只大鼠处死后取出脑组织。提取脑组织的总RNA,进行RT-PCR扩增BDNFmRNA特异性片段,构建重组质粒并测序。以倍比稀释后的重组质粒作为阳性标准模板,使用Taqm an探针法对BDNF mRNA进行实时定量PCR检测,分析各组大鼠脑组织中BDNF mRNA的变化。结果:与模型组及阳性对照组相比,三七皂苷Rg1组能明显改善脑缺血的神经缺失症状,并在各时间段均能上调脑缺血再灌注损伤大鼠的脑组织中BDNF mRNA的含量(P<0.05)。结论:三七皂苷Rg1通过上调大鼠脑缺血再灌注损伤时脑组织中BDNF mR-NA的含量,促进脑组织内BDNF蛋白的合成,BDNF与其特异性受体TrkB相结合,产生相应的效应分子而对缺血神经元起保护作用,从而发挥其对脑缺血损伤的治疗作用。 展开更多
关键词 三七皂苷RG1 脑缺血再灌注损伤 BDNF mRNA 实时定量rt-pcr
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白桦抗坏血酸过氧化物酶(APX)基因克隆及表达分析 被引量:18
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作者 王超 杨传平 王玉成 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期79-81,88,共4页
从白桦(Betula platyphylla Suk.)cDNA文库中获得一个抗坏血酸过氧化物酶(APX)基因全长cDNA序列,该序列去除polyA后长1049bp,其ORF全长750bp,编码250个氨基酸,编码蛋白的相对分子质量为27712.7,理论等电点6.08,保守区分析确定其含有APX... 从白桦(Betula platyphylla Suk.)cDNA文库中获得一个抗坏血酸过氧化物酶(APX)基因全长cDNA序列,该序列去除polyA后长1049bp,其ORF全长750bp,编码250个氨基酸,编码蛋白的相对分子质量为27712.7,理论等电点6.08,保守区分析确定其含有APX蛋白保守序列,属于植物POD超家族。利用实时定量RT-PCR进一步分析白桦苗木在0.8%NaCl胁迫处理下不同时间点APX基因的表达情况。结果表明,盐胁迫处理诱导了APX基因在白桦叶片中的表达,说明APX基因与植物抗盐相关。 展开更多
关键词 白桦 抗坏血酸过氧化物酶 基因表达 实时定量rtpcr
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绵羊防御素(sBD1)mRNA在不同发育阶段的组织分布和定量分析 被引量:16
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作者 盛金良 陈创夫 +5 位作者 杨霞 王远志 张辉 曹旭东 史前伟 赵民 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期20-25,共6页
为确定绵羊防御素(Sheep beta defensin-1,sBD1)mRNA在组织器官中的分布和不同发育阶段的表达是否存在差异。利用RT-PCR(Reverse Transcription PCR)方法检测绵羊防御素sBD1 mRNA在组织器官的分布情况,通过荧光定量RT-PCR(Fluorescence ... 为确定绵羊防御素(Sheep beta defensin-1,sBD1)mRNA在组织器官中的分布和不同发育阶段的表达是否存在差异。利用RT-PCR(Reverse Transcription PCR)方法检测绵羊防御素sBD1 mRNA在组织器官的分布情况,通过荧光定量RT-PCR(Fluorescence quantitative RT-PCR)检测不同发育阶段绵羊防御素的表达差异。结果表明:在胎羊的舌、皱胃、十二指肠、空肠、盲肠检测到绵羊防御素sBD1 mRNA,在羔羊和成年羊消化道的舌、食道、瘤胃、皱胃、十二指肠、空肠、回肠、盲肠、直肠和呼吸道的气管、肺均检测到绵羊防御素sBD1 mRNA,在各发育阶段的心、肝、肾以及羔羊、成年羊的淋巴结和体外培养的羔羊肺泡巨噬细胞均未检测到sBD1 mRNA;实时定量PCR比较表明,sBD1 mRNA在不同发育阶段皱胃、十二指肠和空肠表达量的高低为sBD1 mRNA表达量(羔羊)>sBD1 mRNA表达量(成年羊)>sBD1 mRNA表达量(胎羊)。绵羊防御素sBD1 mRNA主要分布在消化道和呼吸道,且在整个发育过程中是持续表达的,其在消化道表达量高低为sBD1 mRNA表达量(羔羊)>sBD1 mRNA表达量(成年羊)>sBD1 mRNA表达量(胎羊)。 展开更多
关键词 绵羊防御素1 组织分布 实时定量rt-pcr 定量分析
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胃癌腹膜转移中GALECTIN-3MRNA的表达与意义 被引量:10
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作者 杨志明 伍晓汀 +3 位作者 何涛 达明绪 罗婷 钱昆 《四川大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期105-108,共4页
目的探讨GALECTIN-3基因在胃癌腹膜转移中的作用。方法通过实时定量RT-PCR方法,对35例同期伴腹膜转移病人的胃癌原发灶、淋巴结转移灶、腹膜转移灶、正常胃粘膜组织中GALECTIN-3MRNA的表达水平进行实时定量RT-PCR检测。结果胃癌原发灶(3... 目的探讨GALECTIN-3基因在胃癌腹膜转移中的作用。方法通过实时定量RT-PCR方法,对35例同期伴腹膜转移病人的胃癌原发灶、淋巴结转移灶、腹膜转移灶、正常胃粘膜组织中GALECTIN-3MRNA的表达水平进行实时定量RT-PCR检测。结果胃癌原发灶(385.639±98.534)、腹膜转移灶(368.589±93.431)、淋巴结转移灶(375.920±94.346)中GALECTIN-3MRNA表达量同正常胃粘膜(2.158±0.896)中的表达量相比,差异具有统计学意义(P<0.05),胃癌原发灶、腹膜转移灶及淋巴结转移灶三者中的表达量两两相比,差异无统计学意义(P>0.05)。GALECTIN-3MRNA在胃癌原发灶与腹膜转移灶中的表达呈正相关(R=0.997,P=0.000)。结论GALECTIN-3MRNA在胃癌中的高表达与胃癌腹膜转移密切相关。胃癌病灶的GALECTIN-3MRNA检测可作为术前判断胃癌已伴腹膜转移或具有腹膜转移潜能的生物学标记。 展开更多
关键词 胃癌 腹膜转移 GALECTIN-3 实时定量rt-pcr
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实时荧光定量RT-PCR检测良性前列腺增生与前列腺癌相关基因表达的临床意义 被引量:11
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作者 钟惟德 李俊玲 +6 位作者 何慧婵 江福能 刘文华 毕学成 彭志强 刘良式 魏鸿蔼 《中华泌尿外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第9期615-618,共4页
目的应用实时荧光定量RT-PCR检测良性前列腺增生(BPH)与前列腺癌相关基因表达。方法通过实时荧光定量RT-PCR对9个前列腺癌相关基因(KLK3、KLK2、KLK11,pim-1,hepsin,PSMA,AR,p27,IGF-1)在前列腺正常组织、BPH组织和癌组织(PCa)定量表达... 目的应用实时荧光定量RT-PCR检测良性前列腺增生(BPH)与前列腺癌相关基因表达。方法通过实时荧光定量RT-PCR对9个前列腺癌相关基因(KLK3、KLK2、KLK11,pim-1,hepsin,PSMA,AR,p27,IGF-1)在前列腺正常组织、BPH组织和癌组织(PCa)定量表达,分析其特异性的差异。结果检测9个选定相关基因中发现KLK2,pim-1,AR和IGF-1在这3种组织中的表达差异有统计学意义(P<0.01)。结论KLK2,pim-1,AR和IGF-1作为前列腺癌组织特异性的分子标记物组合,有望提高前列腺癌早期诊断的准确性。 展开更多
关键词 前列腺肿瘤 实时定量rt-pcr 肿瘤学 基因表达 良性前列腺增生(BPH) 实时荧光定量rt-pcr 定量rt-pcr检测 相关基因表达 前列腺癌 临床意义
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数字RT-PCR检测鲤春病毒血症的方法建立与应用 被引量:12
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作者 吴斌 申翠翠 +3 位作者 张晨曦 胡德聪 肇慧君 张琳 《中国动物检疫》 CAS 2015年第7期72-76,共5页
[目的]通过实时定量RT-PCR和数字RT-PCR两种方法的比对试验,建立快速检测鲤春病毒血症的数字RT-PCR方法。[方法]利用同一对引物和探针,以梯度稀释的方法测定两种方法针对SVCV的灵敏性、特异性及重现性。[结果]两种方法均能够检测出104... [目的]通过实时定量RT-PCR和数字RT-PCR两种方法的比对试验,建立快速检测鲤春病毒血症的数字RT-PCR方法。[方法]利用同一对引物和探针,以梯度稀释的方法测定两种方法针对SVCV的灵敏性、特异性及重现性。[结果]两种方法均能够检测出104倍稀释的SVCV,而数字RT-PCR可以检测出单个微滴中的SVCV,其灵敏度性高于实时定量RT-PCR。同时,两种方法的特异性都很强,对其他病毒,如传染性胰腺坏死病毒(IPNV)、传染性造血器官坏死病毒(IHNV)、病毒性出血败血病毒(VHSV)均未有扩增反应。两种方法的重现性也较好。[结论]数字RT-PCR方法比实时定量RT-PCR具有更高的灵敏度,在鲤春病毒血症的早期快速诊断方面具有重要作用。 展开更多
关键词 鲤春病毒血症(SVC) 数字rt-pcr 实时定量rt-pcr 灵敏性 特异性 重现性
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实时定量RT-PCR技术及在植物基因表达分析中的应用 被引量:9
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作者 程强 张新叶 黄敏仁 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第B04期82-86,共5页
近年来实时定量RT-PCR(real-time quantitative RT-PCR,qPCR)由于其具有敏感性,广阔的 动力学范围,可靠性的特点,成为基因表达研究的标准方法。介绍了实时定量RT-PCR的原理和 实验过程中的潜在问题,并且讨论了实时定量RT-PCR在植物基因... 近年来实时定量RT-PCR(real-time quantitative RT-PCR,qPCR)由于其具有敏感性,广阔的 动力学范围,可靠性的特点,成为基因表达研究的标准方法。介绍了实时定量RT-PCR的原理和 实验过程中的潜在问题,并且讨论了实时定量RT-PCR在植物基因表达研究中的应用。 展开更多
关键词 实时定量rt-pcr 基因表达
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广州市水体中诺如病毒检测及分型 被引量:13
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作者 蒋力云 曹毅敏 +6 位作者 许杨 耿进妹 谢华萍 刘于飞 吴新伟 狄飚 杨智聪 《江苏预防医学》 CAS 2012年第3期25-27,共3页
目的掌握广州市水体中诺如病毒污染状况。方法 2010年间按月采集广州市内河涌和市场售卖贝类产品的水体用PEG浓缩后,用Realtime PCR检测,阳性标本再进行序列测定。结果除7-10月间的样品为阴性外,其余月份均有阳性检出。测得的11份序列,... 目的掌握广州市水体中诺如病毒污染状况。方法 2010年间按月采集广州市内河涌和市场售卖贝类产品的水体用PEG浓缩后,用Realtime PCR检测,阳性标本再进行序列测定。结果除7-10月间的样品为阴性外,其余月份均有阳性检出。测得的11份序列,与国内北京、深圳测得的序列相近。结论广州市水体中存在诺如病毒的污染,且污染的时间分布上与诺如病毒胃肠炎暴发的分布相吻合。GⅡ型诺如病毒是引起广州市诺如病毒暴发和流行的基因型。 展开更多
关键词 诺如病毒 分子流行病学 PEG浓缩 实时定量rt-pcr
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GNAI1 Suppresses Tumor Cell Migration and Invasion and is Post-Transcriptionally Regulated by Mir-320a/c/d in Hepatocellular Carcinoma 被引量:13
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作者 Jian Yao Lin-hui Liang +4 位作者 Yu Zhang Jie Ding Qi Tian Jin-jun Li Xiang-huo He 《Clinical oncology and cancer researeh》 CAS CSCD 2012年第4期234-241,共8页
Objective To explore the role and regulation of guanine nucleotide-binding protein G(i), a-1 subunit (GNAI1) in hepatocellular carcinoma (HCC). Methods Expression of GNAI1 in HCC samples was determined by qRT-PC... Objective To explore the role and regulation of guanine nucleotide-binding protein G(i), a-1 subunit (GNAI1) in hepatocellular carcinoma (HCC). Methods Expression of GNAI1 in HCC samples was determined by qRT-PCR and immunohistochemical (IHC) staining. Huh-7 and SNU-387 cells stably expressing GNAI1 were established by the infection of lentivirus transducing unit containing GNAI1. siRNA against GNAI1 was transfected into SMMC-7721 cells to knock down the GNAI1 expression in HCC cells. Mir-320a/c/d mimics were transfected into SMMC-7721 and SK-Hep-1 cells and the expression of GNAll was determined by Western blot. The migration and invasion of Huh-7, SNU-387, SK-Hep-1 and SMMC-7721 cells were investigated by Transwell assays. Results The GNAI1 protein was significantly downregulated in HCC samples without changes in its mRNA levels. GNAI1 could inhibit the migration and invasion of HCC cells in vitro. Further investigations indicated that GNAI1 was a target of miR-320a/c/d in HCC cells. Transwell assays demonstrated that these microRNAs could promote the migratory ability and invasivesess of HCC cells in vitro. Conclusions GNAII is downregulated in HCC and inhibits the migration and invasion of HCC cells. This study is the first to investigate the role of GNAI1 in cancer. Regulation of GNAI1 by miR-320a/c/d indicates new therapeutic avenues for targeting HCC metastasis. 展开更多
关键词 GNAI1 HCC miR-320 migration INVASION
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家蚕丝素基因表达水平的定量分析 被引量:9
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作者 孙霞 朱晨 +2 位作者 汪生鹏 沈小绢 郭锡杰 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期30-35,共6页
采用实时定量RT-PCR方法,对丝素轻链基因(fib-L)、丝素重链基因(fib-H)、P25基因在家蚕幼虫不同组织和不同发育时期的表达进行了定量分析。结果发现3种丝素基因除主要在5龄幼虫的后部丝腺中表达外,在其它组织如脂肪体和中部丝腺中也有... 采用实时定量RT-PCR方法,对丝素轻链基因(fib-L)、丝素重链基因(fib-H)、P25基因在家蚕幼虫不同组织和不同发育时期的表达进行了定量分析。结果发现3种丝素基因除主要在5龄幼虫的后部丝腺中表达外,在其它组织如脂肪体和中部丝腺中也有一定程度的表达;在4龄眠期的后部丝腺中3种丝素基因也有一定的表达水平,其中fib-L在这一时期的表达量较高。同时发现在5龄第3天和第5天的后部丝腺中,fib-H、fib-L与P25在mR-NA水平上的摩尔比分别为9∶18∶1和19∶32∶1,推测丝素基因的表达可能具有转录后调控,此结果说明家蚕丝素基因的表达可能具有更加精细的调控机制。 展开更多
关键词 家蚕 丝素基因 表达 实时定量rt-pcr 组织 发育时期
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