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两株抗肝癌细胞单链抗体三维结构的同源模建

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摘要 目的模建特异性抗肝癌单链抗体Hsc Fv 4-16和sc Fv DM的三维结构,比较两者结构的异同,为高亲和力的抗肝癌单链抗体的人源化设计提供结构信息。方法采用同源模建技术,在SGI图形工作站上,通过Accelrys公司InsightⅡ软件包的Homology模建分子结构,用Discover进行分子力学和动力学优化,最后用Prostat验证模拟结构的合理性。结果 Hsc Fv 4-16和sc Fv DM六个CDR襻位于Fv段的N端,形成一个与抗原结合的口袋,口袋分别深15.6和16.1。其中CDRL3和CDRH3与抗原最接近,有较多接触。sc Fv DM的CDRL3和CDRH3两个襻比sc Fv 4-16的更靠近中央。结论采用同源模建技术成功模建特异性抗肝癌单链抗体Hsc Fv 4-16和sc Fv DM的三维结构,sc Fv DM的三维结构显示与抗原的结合更紧密,亲和力比Hsc Fv 4-16高,与实验检测结果一致。
出处 《中国老年学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第14期3826-3828,共3页 Chinese Journal of Gerontology
基金 广东省科技计划项目基金(No.2006B19901014)
  • 相关文献

参考文献3

  • 1Yuan Zhang,Ze-Sheng Li,Miao Sun,Qing-Chuan Zheng,Chia-Chung Sun.Molecular simulation studies of a selenium-containing scFv catalytic antibody that mimics glutathione peroxidase[J]. BBA - Proteins and Proteomics . 2004 (1) 被引量:1
  • 2Nathalie Germain,Karine Mérienne,Sophie Zinn-Justin,Jean-Claude Boulain,Frédéric Ducancel,André Mén.Molecular and Structural Basis of the Specificity of a Neutralizing Acetylcholine Receptor-mimicking Antibody, Using Combined Mutational and Molecular Modeling Analyses. Journal of Biological Chemistry . 2000 被引量:1
  • 3Huang, Mingdong,Furie, Barbara C.,Furie, Bruce.Crystal Structure of the Calcium-stabilized Human Factor IX Gla Domain Bound to A Conformation-specific Anti-factor IX Antibody. Journal of Biological Chemistry . 2004 被引量:1

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