摘要
近年来,随着基因测序技术的高速发展,获取基因表达量的数据越来越容易,相应的数据分析方法也应运而生。在众多的分析方法中,加权基因共表达网络分析(Weighted Gene Co-expression Network Analysis,WGCNA)能对多个样本的众多基因进行综合分析,并能进行表型关联分析,相比于单基因的研究模式更具优势。该文对WGCNA的构建、分析及其在疾病研究、生理功能研究和基因功能注释3方面的应用进行总结和论述。
The rapid development of gene sequencing technology in recent years facilitate gene expression data.The corresponding data analysis methods have,therefore,emerged.Among these analytical methods,weighted gene co-expression network analysis(WGCNA)can comprehensively analyze many genes in multiple samples and can be associated with phenotype.It is superior to the single gene research model.This paper summarizes and discusses the construction,analysis and application of WGCNA in disease research,physiological function research and gene function annotation.
作者
王京
米芳
高慧杰
郑惠玲
WANG Jing;MI Fang;GAO Huijie;ZHENG Huiling(College of Animal Science and Technology,Northwest A&F University,Yangling,Shaanxi 712100,China)
出处
《家畜生态学报》
北大核心
2023年第3期92-96,共5页
Journal of Domestic Animal Ecology
基金
陕西省重点研发计划项目(2022ZDLNY01-02)。
关键词
加权基因共表达网络分析
关联分析
聚类分析
基因功能注释
differential weighted gene co-expression network analysis
association analysis
clustering analysis
gene function annotation
