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生物医学数据分析中的深度学习方法应用 被引量:17

Applications of Deep Learning in Biological and Medical Data Analysis
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摘要 生物医学数据的积累速度史无前例,为生物医学研究带来机遇的同时,也让传统数据分析技术面临巨大挑战.本文综述了深度学习方法应用在生物医学数据分析中的最新研究进展.首先阐述了深度学习方法,列举深度学习方法的主要实现模型,随后总结了目前生物医学数据分析中的深度学习方法应用情况,分析了在数据处理、模型构建和训练方法等方面共有问题的解决方法,最后给出了深度学习方法应用于生物医学数据分析时可能存在的问题及建议. The rapid accumulation of biomedical data provided unprecedented opportunities for biology and clinical research, while it also made traditional data analysis technology face enormous challenges. In this paper,we reviewed recent studies on biomedical data using deep learning. We introduced several recommended deep learning models and summarized current applications of biological and medical data analysis using deep learning,including the general procedure, model construction and training process. Finally, we made a discussion on some issues in deep learning applications.
出处 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2016年第5期472-483,共12页 Progress In Biochemistry and Biophysics
基金 国家高技术研究发展计划(2015AA020100) 国家自然科学基金重大计划(U1435222),国家自然科学基金面上项目(81273488,61402486) 传染病防控关键技术研究项目(BWS14C051)资助~~
关键词 深度学习 高通量组学 临床医学 数据挖掘 deep learning high-throughput omics clinical medicine data mining
  • 相关文献

参考文献93

  • 1Genomes Project C, Auton A, Brooks L D, etal. A global reference for human genetic variation. Nature, 2015, 526(7571): 68-74. 被引量:1
  • 2Consortium E P. The ENCODE (ENCyclopedia Of DNA Elements) Project. Science, 2004, 306(5696): 636-640. 被引量:1
  • 3Chadwick L H. The NIH roadmap epigenomics program data resource. Epigenomics, 2012, 4(3): 317-324. 被引量:1
  • 4Duan Q, Flyrm C, Niepel M, et al. LINCS Canvas Browser: interactive web app to query, browse and interrogate LINCS L1000 gene expression signatures. Nucleic Acids Research, 2014, 42(Web Server issue): W449-460. 被引量:1
  • 5Barrett T, Wilhite S E, Ledoux P, et al. NCBI GEO: archive for fimctional genomics data sets update. Nucleic Acids Research, 2013, 41(Database issue): D991-995. 被引量:1
  • 6Tomczak K, Czerwinska P, Wiznerowicz M. The cancer genome atlas (TCGA): an immeasurable source of knowledge. Contemporary Oncalogy, 2015, 19(1A): A68-77. 被引量:1
  • 7Qin J, Li Y, Cai Z, et d. A metagenome-wide association study of gut microbiota in type 2 diabetes. Nature, 2012, 490(7418): 55-60. 被引量:1
  • 8Mardis E R. The impact of next-generation sequencing technalogy on genetics. Trends in Genetics: TIG, 2008, 24(3): 133-141. 被引量:1
  • 9May M. Life science technalogies: Big bialogical impacts from big data. Science, 2014, 344(6189): 1298-1300. 被引量:1
  • 10Hinton G E, Salakhutdinov R R. Reducing the dimensionality of data with neural networks. Science (New York, NY), 2006, 313(5786): 504-507. 被引量:1

同被引文献149

引证文献17

二级引证文献133

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