摘要
线粒体基因组广泛应用于昆虫系统发育、分子进化、种群遗传学及谱系地理学等众多研究领域.半翅目是昆虫纲外翅部中最大的一个目,具有重要的经济意义.目前,已对100种半翅目昆虫进行了线粒体基因组测序,其中81种在中国完成测序.本文综述了半翅目昆虫线粒体基因学研究的已有成果,比较分析了半翅目昆虫线粒体基因组的基本特征,包括基因组大小、基因含量、基因重排、碱基组成、密码子使用、蛋白质编码基因的进化模式、RNA基因及非编码区,并系统总结了线粒体基因组数据在半翅目昆虫系统进化研究中的应用现状.最后,针对线粒体基因组的获得、注释和应用过程中存在的问题进行了讨论,并提出了今后半翅目昆虫线粒体基因组学的研究重点.
Insect mitochondrial genome（mitogenome） has been extensively used in phylogeny, molecular evolution, population genetics and phylogeographics. Hemiptera is the biggest order among Exopterygota and has important economic significance. To date, mitogenomes from 100 hemipterans have been sequenced, of which 81 were sequenced in China. In this study, we reviewed the current results of hemipteran mitogenomes, provided a comparative analysis for general features of hemipteran mitogenomes（including genome size, gene content, gene rearrangement, base composition, codon usage, evolutionary patterns of protein-coding genes, RNA genes and non-coding regions）, and summarized the research status of hemipteran systematic evolution based mitogenomic data. Finally, we discussed some problems in mitogenome sequencing, sequence annotation and application in phylogenetic analysis, and prospected the research focuses of hemipteran mitogenomics in the future.
出处
《中国科学：生命科学》
CSCD
北大核心
2016年第2期151-166,共16页
Scientia Sinica(Vitae)
基金
长江学者和创新团队发展计划(批准号:IRT13019)
高等学校博士学科点专项科研基金(批准号:20120211120043)
兰州大学大学生创新创业行动计划项目(批准号:20141073001011和20151073001013)资助
关键词
半翅目
异翅亚目
线粒体基因组
基因重排
分子进化
系统发育
Hemiptera
Heteroptera
mitochondrial genome
gene rearrangement
molecular evolution
phylogeny
