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陕西省HIV-1流行株膜蛋白基因C2-V3区序列特征和亚型分析 被引量:3

Subtype and Sequence Analysis of the C2 - V3 Region of gp120 Gene among HIV - 1 Strains in Shanxi Province
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摘要 目的 了解陕西省HIV-1毒株的流行情况和亚型特征。方法 用套式聚合酶链式反应(Nested-PCR)对6份采集于陕西省经确认为HIV-1感染者或艾滋病病人外周血淋巴细胞(PBMC)提取核酸,从6份样品中获得了HIV-1膜蛋白(ENV)基因的核酸片段进行扩增,并测定和分析了C2-V3及其邻区共312个核苷酸序列。结果6份血样中,2份为HIV-1A亚型毒株感染(SHX7、SHX8);4份为HIV-1B’亚型(泰国B’亚型)毒株感染(SHX1、SHX5、SHX6、SHX9)。SHX1、SHX5、SHX6、SHX9彼此间基因离散率为5.62%,SHX7与来自卢旺达的U08794之间的基因离散率仅为2.41%。结论 陕西省目前存在HIV-1A、B’两种亚型的毒株,HIV-1B’亚型由邻近地区传入,HIV-1A亚型为与非洲人接触传入。 Objective To study the epidemic situation and characteristics of subtypes of HIV-1 strains prevalent in Shanxi Province. Methods Six DNA fragments of HIV-1 ENV gene were amplified by nested PCR from uncultured peripheral blood mononuclear cells(PBMCs)obtained from six HIV- 1 seropositive individuals or AIDS patients identified in Shanxi Province.The C2 - V3 region (about 450bp) was sequenced.Results There were two strains of HIV-1 subtype A and four strains of HIV-1 subtype B', and the gene divergence of B' subtype was 5.62% .The 2 strains of HIV-1 subtype A were closely related to the U08794 from Rwanda, while the 4 strains of HIV - 1 subtypes B' were closest to those of subtype B in Thailand.Conclusion The study and epidemiological data showed that strains of HIV-1 subtype A and B' were prevailing in Shanxi Province.
出处 《中国性病艾滋病防治》 2001年第3期158-160,共3页 Chinese Journal of Std & Aids Prevention and Control
关键词 艾滋病病毒 序列分析 亚型 HIV-1 膜蛋白基因 HIV-1 Sequence analysis Subtype
  • 相关文献

参考文献4

二级参考文献10

  • 1邵一鸣,病毒学报,1993年,9卷,261页 被引量:1
  • 2邵一鸣,中华微生物和免疫学杂志,1993年,13卷,1页 被引量:1
  • 3邵一鸣,中华流行病学杂志,1991年,12卷,129页 被引量:1
  • 4马瑛,中华流行病学杂志,1990年,11卷,184页 被引量:1
  • 5马瑛,中华流行病学杂志,1990年,11卷,184页 被引量:1
  • 6于红,中华流行病学杂志,1997年,17卷,99页 被引量:1
  • 7邵一鸣,病毒学报,1996年,12卷,9页 被引量:1
  • 8Luo C C,Lancet,1995年,345卷,1051页 被引量:1
  • 9Cheng H,Lancet,1994年,344卷,953页 被引量:1
  • 10邵一鸣,病毒学报,1994年,10卷,291页 被引量:1

共引文献76

同被引文献34

引证文献3

二级引证文献15

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