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温度对菘蓝基因组DNA甲基化的影响 被引量:8

Rapid Genome DNA Methylation Changes in Isatis indigotica after Exposure to Elevated Temperature
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摘要 目的:分析高温对菘蓝基因组DNA甲基化模式的影响。方法:采用甲基化敏感扩增多态性(methylation sensitiveamplification polymorphism,MSAP)方法,筛选36对选择性引物进行扩增。结果:扩增共得到1 612条清晰的带纹,共检测到82(5.1%)个CCGG位点在高温胁迫后发生了甲基化状态的改变,其中58(3.6%)个位点发生了超甲基化,24(1.5%)个位点发生了去甲基化。结论:温度是调节菘蓝基因组DNA甲基化模式的一个重要环境因子。 Objective: To investigate the effect of elevated temperature in genome cytosine methylation changes in Isatis indigotica. Method: Methylation sensitive amplification polymorphism (MSAP) approach and 36 pairs of selective primers combinations were used in this study. Result: A total of 1 612 bands were obtained.In all, 82(5.1%) CCGG sites displayed cytosine methylation changes after exposure to elevated temperature.Among these sites, 58(3.6%) CCGG sites had undergone hypermethylation changes and 24(1.5%) CCGG sites undergone demethylation changes. Conclusion: This result provided evidence for genome-wide DNA methylation remodeling occurring immediately after exposure to elevated temperature in I.indigotica.
作者 杨飞 徐延浩
出处 《中国实验方剂学杂志》 CAS 北大核心 2013年第6期113-116,共4页 Chinese Journal of Experimental Traditional Medical Formulae
基金 教育部高等学校博士学科点专项科研基金课题(20114220120003 20114220120005) 湖北省自然科学基金(2012FFB00104) 湖北省教育厅科研项目(Q20111307)
关键词 菘蓝 DNA甲基化 高温 甲基化敏感扩增多态性 Isatis indigotica DNA methylation high temperature methylation sensitive amplification polymorphism(MSAP)
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