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小麦属植物寒胁迫相关miRNA的生物信息学研究 被引量:2

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摘要 miRNAs(microRNAs)是一类非编码的小分子RNA,在许多生物学过程中起重要调控作用。最近研究表明,miRNA也参与植物对寒胁迫的应答,使植物耐寒性增强。本研究用已知miRNA序列,基于序列相似性分别搜索小麦属中小麦和大麦寒胁迫及非寒胁迫来源的EST数据,根据碱基错配、二级结构、(A+U)含量、能量水平等标准,鉴定可能为miRNA前体的EST序列。结果表明,在小麦中总共获得199条可能为miRNA的EST,分别属于22个miRNA家族,其中9条来源于寒胁迫相关的EST,分别属于2个miRNA家族;在大麦中一共获得31条可能为miRNA的EST,这些序列均来自于非寒胁迫相关的EST,分别属于7个miRNA家族,而在寒胁迫来源的EST中没有鉴定出候选miRNA序列。
机构地区 浙江师范大学
出处 《江苏农业科学》 CSCD 北大核心 2011年第3期20-23,共4页 Jiangsu Agricultural Sciences
基金 国家自然科学基金(编号:30900921) 浙江师范大学博士科研启动基金(编号:ZC304009154)
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参考文献20

二级参考文献92

  • 1王金祥,严小龙,潘瑞炽.不定根形成与植物激素的关系[J].植物生理学通讯,2005,41(2):133-142. 被引量:167
  • 2周德宝.植物激素与细胞骨架的排向[J].植物生理学通讯,2005,41(2):224-228. 被引量:4
  • 3BARTEL D P.MicroRNAs:genomics,biogenesis,mechanism,and function[J].Cell,2004,116(2):281-297. 被引量:1
  • 4HE L,HANNON G J.MicroRNAs:small RNAs with a big role in gene regulation[J].Nat.Rev.Genet,2004,(5):522-531. 被引量:1
  • 5LEE R C,FEINBAUM R L,AMBROS V.The C.elegans heterochronic gene lin-4 encodes small RNAs with antisense complementarity to lin-14[J].Cell,1993,75:853-854. 被引量:1
  • 6AMBROS V,LEE R C,LAVANWAY A,et al.MicroRNAs and other tiny endogenous RNAs in C.elegans[J].Curr.Biol,2003,13(10):807-818. 被引量:1
  • 7JONES-RHOADES M W,BARTEL D P.Computational identification of plant microRNAs and their targets,including a stress-induced miRNA[J].Mol.Cell,2004,14(6):787-799. 被引量:1
  • 8ADAI A,JOHNSN C,MLOSHWA S,et al.Computational prediction of miRNAs in Arabidopsis thaliana[J].Genome Res,2005,15(1):78-91. 被引量:1
  • 9WANG X J,REYESJ L,CHUA N H,et al.Prediction and identification of Arabidopsis thaliana microRNAs and their mRNA targets[J].Genome Biol,2004,5(9):65-68. 被引量:1
  • 10AMBROS V,BARYEL B,BARTEL D P,et al.A uniform system for microRNA annotation[J].RNA,2003,9:277-279. 被引量:1

共引文献19

同被引文献21

引证文献2

二级引证文献2

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