期刊文献+

蛋白质序列比对算法的研究 被引量:2

下载PDF
导出
摘要 Needleman-Wunsch算法和Smith-Waterman算法是蛋白质序列比对的两种重要方法,根据实际需要选择不同的计分矩阵和算法可以达到较好的比对结果。但这两种算法有其缺陷,本文在此两种算法的基础上提出以链队列的形式遍历所有最优匹配的算法,并优化了得分矩阵的计算方法,提出双路并行计算得分矩阵的方法。
作者 林敏
出处 《福建电脑》 2010年第1期79-80,共2页 Journal of Fujian Computer
  • 相关文献

参考文献1

  • 1(美)[J.O.伯杰]JamesO.Berger著,贾乃光.统计决策论及贝叶斯分析[M]中国统计出版社,1998. 被引量:1

同被引文献38

  • 1吴祖建,高芳銮,沈建国等.生物信息学分析实践[M].北京:科学出版社,2010:222. 被引量:12
  • 2Benson DA, Cavanaugh M, Clark K, et al. GenBank[ J]. Nucleic Acids Res, 2013, 41 ( D1 ) : D36-D42. 被引量:1
  • 3Rodriguez-Tom6 P. EBI Databases and Services[ J]. Mol Biotech- nol, 2001, 18(3) : 199-212. 被引量:1
  • 4Hingamp P, van den Broek AE, Stoesser G, et al. The EMBL Nucleotide Sequence Database [ J ]. Mol Biotechnol, 1999, 12 ( 3 ) : 255-267. 被引量:1
  • 5Zertg SI, Wang D, Fang L, et al. Completecoding sequences and phylogeneticanalysis of porcine boeavirus [ J]. J Gen Mol Virol, 2011, 92(Pt 4): 784-788. 被引量:1
  • 6Taylor WR. Multiple sequence alignment by a pair wise [ J ]. CABIOS, 1987, 3(2) : 81-87. 被引量:1
  • 7孙之荣译.生物信息学与功能基因组学[M].北京:化学工业出版社,2009:37-379. 被引量:1
  • 8Needleman SB, Wunsch CD. A general method applicable to the search for similarities in the amino acid sequences of two Proteins [J]. JMolBiol, 1970, 48(3):443-453. 被引量:1
  • 9Smith T, Waterman M. Identification of common molecular se- quence[J]. JMolBiol, 1981, 147(1): 195-197. 被引量:1
  • 10Feng DF, Doolittle RF. Progressive Sequence Alignment as a Prerequisite to Correct[J]. J Mol Evol, 1987, 25 (4) : 351- 360. 被引量:1

引证文献2

二级引证文献2

相关作者

内容加载中请稍等...

相关机构

内容加载中请稍等...

相关主题

内容加载中请稍等...

浏览历史

内容加载中请稍等...
;
使用帮助 返回顶部